Haploskupina L5 (mtDNA) - Haplogroup L5 (mtDNA) - Wikipedia

Haploskupina L5
Možná doba vzniku	114 200–126 200 YBP
Možné místo původu	východní Afrika, Údolí horního Nilu
Předek	L2-6
Potomci	L5a, L5c
Definování mutací	3423, 7972, 12432, 12950

Haploskupina L5 je lidská mitochondriální DNA (mtDNA) clade. To bylo dříve známé jako L1e.

Původ

Rozdělení

L5 je malá haploskupina se středem východní Afrika. Nejvyšší frekvence je v Mbuti Pygmejové z východní střední Afriky na 15%.^[3]V Tanzanii je přítomen na relativně malých frekvencích (Sandawe a další), Keňa, Etiopie, Súdán, Núbie, Egypt^[4]^{[Poznámka 1]} a Saúdská Arábie.^[5]

Haploskupina L5 byla pozorována u exemplářů na ostrovním hřbitově v Kulubnarti, Súdán, které pocházejí z raně křesťanského období (550–800 nl).^[6]

Subclades

Strom

Tento fylogenetický strom podskupin haploskupin L5 je založen na příspěvku Mannisa van Ovena a Manfreda Kaysera Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA^[2] a následný publikovaný výzkum.

Nejnovější společný předek (MRCA)
- L1-6
  - L2-6
    - L5
      - L5a
        L5a1
        L5a1a
        L5a1b
        L5a1c
        L5a2
      - L5c
        L5c1
        L5c2

Reference

^ Soares, P; Ermini, L; Thomson, N; Mormina, M; Rito, T; Röhl, A; Salas, A; Oppenheimer, S; MacAulay, V (2009). „Oprava pro čištění výběru: Vylepšené lidské mitochondriální molekulární hodiny“. American Journal of Human Genetics. 84 (6): 740–59. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773.
^ ^A ^b van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13. října 2008). „Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA“. Lidská mutace. 30 (2): E386 – E394. doi:10.1002 / humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749. Archivovány od originál dne 4. prosince 2012. Citováno 2009-05-20.
^ Sarah A. Tishkoff a kol. 2007, Historie populací Afriky mluvících kliknutím Odvozeno od mtDNA a genetické variace chromozomu Y. Molecular Biology and Evolution 2007 24 (10): 2180-2195
^ Stevanovitch, A; A. Gilles; E. Bouzaid; R. Kefi; F. Paříž; R. P. Gayraud; J. L. Spadoni; F. El-Chenawi; E. Béraud-Colomb (29. ledna 2004). „Mitochondriální DNA sekvenční rozmanitost v sedavé populaci z Egypta“. Annals of Human Genetics. 68 (1): 23–39. doi:10.1046 / j.1529-8817.2003.00057.x. PMID 14748828. S2CID 44901197.
^ Abu-Amero a kol. 2008 únor. „Struktura mitochondriální DNA na Arabském poloostrově“, BMC Evoluční biologie. 8 (45): 52.
^ Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). Abstract Book of the IUAES Inter-Congress 2016 - A community split? Odhalení komunitního genomu (genomů) Medieval Kulubnarti pomocí sekvenování nové generace. IUAES.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)

Poznámky

^ Vzorek UPE52 je subclade L5a.

externí odkazy

Všeobecné
- Iana Logana Haploskupiny L5.
- Mannis van Oven's Phylotree

Fylogenetický strom haploskupiny lidské mitochondriální DNA (mtDNA)

Mitochondriální Eva (L )

L1–6

Tento genetika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[soares-1] Soares, P; Ermini, L; Thomson, N; Mormina, M; Rito, T; Röhl, A; Salas, A; Oppenheimer, S; MacAulay, V (2009). „Oprava pro čištění výběru: Vylepšené lidské mitochondriální molekulární hodiny“. American Journal of Human Genetics. 84 (6): 740–59. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773.

[vanOven-2] A ^b van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13. října 2008). „Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA“. Lidská mutace. 30 (2): E386 – E394. doi:10.1002 / humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749. Archivovány od originál dne 4. prosince 2012. Citováno 2009-05-20.

[3] Sarah A. Tishkoff a kol. 2007, Historie populací Afriky mluvících kliknutím Odvozeno od mtDNA a genetické variace chromozomu Y. Molecular Biology and Evolution 2007 24 (10): 2180-2195

[Stevanovitch-4] Stevanovitch, A; A. Gilles; E. Bouzaid; R. Kefi; F. Paříž; R. P. Gayraud; J. L. Spadoni; F. El-Chenawi; E. Béraud-Colomb (29. ledna 2004). „Mitochondriální DNA sekvenční rozmanitost v sedavé populaci z Egypta“. Annals of Human Genetics. 68 (1): 23–39. doi:10.1046 / j.1529-8817.2003.00057.x. PMID 14748828. S2CID 44901197.

[6] Abu-Amero a kol. 2008 únor. „Struktura mitochondriální DNA na Arabském poloostrově“, BMC Evoluční biologie. 8 (45): 52.

[7] Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). Abstract Book of the IUAES Inter-Congress 2016 - A community split? Odhalení komunitního genomu (genomů) Medieval Kulubnarti pomocí sekvenování nové generace. IUAES.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)

[5] Vzorek UPE52 je subclade L5a.

[1]

[2]

[3]

[4]

[Poznámka 1]

[5]

[6]

Haploskupina L5
Možná doba vzniku	114 200–126 200 YBP^[1]
Možné místo původu	východní Afrika, Údolí horního Nilu
Předek	L2-6
Potomci	L5a, L5c
Definování mutací	3423, 7972, 12432, 12950^[2]