Haploskupina V (mtDNA) - Haplogroup V (mtDNA)

Haploskupina V
Možná doba vznikuVíce než 14 000 YBP [1]
Možné místo původuBlízký východ
PředekHV0a
PotomciV1, V2, V3, V4, V5, V6, V7, V8, V9
Definování mutací4580[2]

Haploskupina V je lidská mitochondriální DNA (mtDNA) haploskupina. Předpokládá se, že klade vznikl před více než 14 000 lety v Blízký východ.

Původ

Haploskupina V je odvozena z subkladu HV0a z haploskupina HV. V roce 1998 se tvrdilo, že se V rozšířilo po Evropě z útočiště doby ledové v Iberia.[3] Novější odhady data V by jej však zařadily do Neolitický.[1]

Rozdělení

Haploskupina V je relativně vzácná haploskupina mtDNA, vyskytující se přibližně u 4% původních Evropanů.[4] Jeho nejvyšší koncentrace je mezi Saami lidé ze severu Skandinávie (~ 59%). Bylo zjištěno, že s frekvencí přibližně 10% mezi Maris v oblasti Volga-Ural, což vede k domněnce, že tato oblast může být zdrojem V mezi Saami.[5][6] Haploskupina V byla pozorována na vyšší než průměrné úrovni Kantaberský lid (15%) severní Iberia,[7] a mezi sousedními Baskičtina (10.4%).[8]

Haploskupina V se také nachází v částech Severozápadní Afrika. Je soustředěna hlavně mezi Tuaregu obývající Gorom-Gorom oblast v Burkina Faso (21%),[9] Sahrawi v západní Sahara (17.9%),[10] a Berbeři z Matmata, Tunisko (16.3%).[11] Vzácná subclade V7a se vyskytuje mezi Alžířané v Oran (1,08%) a Reguibovat Sahrawi (1,85%).[12]

Starověká DNA

Haploskupina MtDNA V byla hlášena u neolitických pozůstatků Kultura lineární keramiky v Halberstadtu, Německo c. 5 000 př[13] a Derenburg Meerenstieg, Německo c. 4910 př.[14] Haploskupina V7 byla nalezena jako reprezentativní Maykopská kultura vzorky z vykopávek provedených Alexej Rezepkin.[15] Haploskupina V byla detekována u zástupců Trypil'sky a Unetice.[16][17]

Haploskupina V byla také nalezena mezi Iberomaurusian vzorky pocházející z Epipaleolitické na Taforalt prehistorické místo 14 000 let BP.[18]

Strom

Tento fylogenetický strom subcladů haploskupiny V je založen na příspěvku Mannisa van Ovena a Manfreda Kaysera Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA[2] a následný publikovaný výzkum.

  • HV0a
    • PROTI
      • V1
        • V1a
          • V1a1
          • V1a2
      • V2
        • V2a
          • V2a1
            • V2a1a
        • V2b
          • V2b1
      • V3
      • V4
      • V5
      • V6
      • V7
        • V7a
      • V8
      • V9
        • V9a
      • V10
      • V11
      • V12
      • V14
      • V15
      • V16
      • V17
      • V18
      • V22
      • V23
      • V24
      • V25
      • V26
      • V27
      • V28

Viz také

Fylogenetický strom haploskupiny lidské mitochondriální DNA (mtDNA)

 Mitochondriální Eva (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEGQ ÓASR JáŽXY
CZBFR0 před JT P U
HVJTK.
HPROTIJT

Reference

  1. ^ A b Behar DM a kol. (2012). „Koperníkovské“ přehodnocení stromu lidské mitochondriální DNA z jeho kořene “. American Journal of Human Genetics. 90 (4): 675–684. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.03.002. PMC  3322232. PMID  22482806.
  2. ^ A b van Oven M, Kayser M (únor 2009). „Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA“. Lidská mutace. 30 (2): E386–94. doi:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749. Archivovány od originál dne 2012-12-04.
  3. ^ Torroni A a kol. (1998). „Analýza mtDNA odhaluje významnou pozdní paleolitickou expanzi populace z jihozápadní do severovýchodní Evropy“. American Journal of Human Genetics. 62 (5): 1137–1152. doi:10.1086/301822. PMC  1377079. PMID  9545392.
  4. ^ Bryan Sykes (2001). Sedm dcer Evy. Londýn; New York: Bantam Press. ISBN  978-0393020182.
  5. ^ Ingman M, Gyllensten U (2007). „Nedávná genetická souvislost mezi Sami a ruskou oblastí Volga-Ural“. European Journal of Human Genetics. 15 (1): 115–120. doi:10.1038 / sj.ejhg.5201712. PMID  16985502.
  6. ^ Tambets K, Rootsi S, Kivisild T, Help H, Serk P a kol. (2004). „Západní a východní kořeny saámů - příběh genetických„ odlehlých hodnot “, které sdělila mitochondriální DNA a Y chromozomy“. American Journal of Human Genetics. 74 (4): 661–682. doi:10.1086/383203. PMC  1181943. PMID  15024688.
  7. ^ Maca-Meyer N, Sánchez-Velasco P, Flores C, Larruga JM, González AM, Oterino A, Leyva-Cobián F (červenec 2003). „Charakterizace chromozomu Y a mitochondriální DNA Pasiegosu, lidského izolátu z Kantábrie (Španělsko)“ (PDF). Annals of Human Genetics. 67 (Pt 4): 329–39. CiteSeerX  10.1.1.584.4253. doi:10.1046 / j.1469-1809.2003.00045.x. PMID  12914567. S2CID  40355653. Archivovány od originál (PDF) dne 04.04.2007. Citováno 2012-08-08.
  8. ^ Soares P, Ermini L, Thomson N, Mormina M, Rito T, Röhl A, Salas A, Oppenheimer S, Macaulay V, Richards MB (2009). „Dodatečná korekce dat pro čištění výběru: Vylepšené lidské mitochondriální molekulární hodiny“. American Journal of Human Genetics. 84 (6): 82–93. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. PMC  2694979. PMID  19500773.
  9. ^ Luísa Pereira; Viktor Černý; María Cerezo; Nuno M Silva; Martin Hájek; Alžběta Vašíková; Martina Kujanová; Radim Brdička; Antonio Salas (17. března 2010). „Propojení subsaharských a západoasijských genových fondů: mateřské a otcovské dědictví kočovníků Tuaregů z afrického Sahelu“. European Journal of Human Genetics. 18 (8): 915–923. doi:10.1038 / ejhg.2010.21. PMC  2987384. PMID  20234393.
  10. ^ S. Plaza; F. Calafell; A. Helal; N. Bouzerna; G. Lefranc; J. Bertranpetit; D. Comas (červenec 2003). „Joining the Pillars of Hercules: mtDNA Sequences Show Multidirectional Gene Flow in the Western Mediterranean“. Annals of Human Genetics. 67 (4): 312–328. doi:10.1046 / j.1469-1809.2003.00039.x. PMID  12914566. S2CID  11201992.
  11. ^ Fadhlaoui-Zid K, Plaza S, Calafell F, Ben Amor M, Comas D, Bennamar El gaaied A (květen 2004). "Heterogenita mitochondriální DNA u tuniských Berberů". Annals of Human Genetics. 68 (Pt 3): 222–33. doi:10.1046 / j.1529-8817.2004.00096.x. PMID  15180702. S2CID  6407058.
  12. ^ Asmahan Bekada; Lara R. Arauna; Tahria Deba; Francesc Calafell; Soraya Benhamamouch; David Comas (24. září 2015). „Genetická heterogenita u alžírských lidských populací“. PLOS ONE. 10 (9): e0138453. Bibcode:2015PLoSO..1038453B. doi:10.1371 / journal.pone.0138453. PMC  4581715. PMID  26402429.; Tabulka S5
  13. ^ W. Haak et al., Ancient DNA from the First European Farmers in 7500-Year-Old Neolithic Sites, Věda, sv. 310, č. 5750 (2005), str. 1016-1018.
  14. ^ W. Haak a kol., Starodávná DNA evropských raných neolitických farmářů odhaluje jejich blízkovýchodní příbuznosti, PloS Biology, sv. 8, č. 11 (listopad 2010), e1000536.
  15. ^ A. V. Nedoluzhko, E. S. Boulygina, A. S. Sokolov, S. V. Tsygankova, N. M. Gruzdeva, A. D. Rezepkin, E. B. Prokhortchouk. Analýza mitochondriálního genomu představitele kultury Novosvobodnaya pomocí sekvenování nové generace a jeho vztahu ke kultuře trychtýřové kádinky
  16. ^ A. G. Nikitin a kol. (2010) Komplexní chronologie stránek a analýza starověké mitochondriální DNA z jeskyně Verteba - místo trypilliánské kultury eneolitické Ukrajiny
  17. ^ Unetice Culture (c. 2300-1600 BCE)
  18. ^ Bernard Secher; Rosa Fregel; José M Larruga; Vicente M Cabrera; Phillip Endicott; José J Pestano; Ana M González (2014). „Historie toku severní africké mitochondriální DNA haploskupiny U6 do afrického, euroasijského a amerického kontinentu“. BMC Evoluční biologie. 14: 109. doi:10.1186/1471-2148-14-109. PMC  4062890. PMID  24885141.
  19. ^ http://phylotree.org/tree/R0.htm

externí odkazy