Haploskupina R (mtDNA) - Haplogroup R (mtDNA)
Haploskupina R. | |
---|---|
Možná doba vzniku | 66.8±14,2 kya [1] |
Možné místo původu | Jížní Asie[2][3] Jihovýchodní Asie[4] |
Předek | N |
Potomci | R0, R1, R1b, R2'JT, R3, R5, R6'7, R8, R9, R11 'B, R12'21, R14, R22, R23, R30, R31, P, U |
Definování mutací | 12705, 16223[5] |
Haploskupina R. je široce distribuován lidská mitochondriální DNA (mtDNA) haploskupina. Haploskupina R je spojena s osídlení Eurasie asi před 70 000 lety a je distribuován v moderních populacích po celém světě mimo subsaharská Afrika.[6]
Haploskupina R je potomkem makro-haploskupina N. Mezi potomky haploskupin R clade patří B, U (a tudíž K. ), F, R0 (a tudíž HV, H, a PROTI ), a JT (rodová haploskupina J a T ).
Původ
Soares a kol. (2009) odhadují věk haploskupiny R na 66.8±14,2 kya (95% CI ),[1] tj. před zhruba 80 000 až 50 000 lety, s nejpravděpodobnějším věkem přibližně 65 000 let.
To je v souladu s vývojem v průběhu Pobřežní migrace z východní Afriky do západní, jižní a jihovýchodní Asie.[3] Bylo navrženo, že raná linie haploskupin M, N a R podél pobřežní cesty v období zhruba před 70 000 až 60 000 lety.[7]
Haploskupina R má v domorodém obyvatelstvu jižní Asie širokou rozmanitost a starověk. Kmeny a kasty západní a jižní Indie vykazují vyšší rozmanitost než ostatní regiony, což možná naznačuje jejich autochtonní status.[2] Larruga a kol. (2017) zjistili, že mtDNA R se rozšířila do Eurasie a Austrálie z oblasti jádra podél pobřeží jihovýchodní Asie.[6]The Ust'-Ishim muž fosilie Sibiře, datováno ca. 45 000 let starý, patří do haploskupiny R * (dříve klasifikované jako U *).[8][9]
Rozdělení
Haploskupina R a její potomci jsou distribuováni po celém světě Australasie, Amerika, Jihovýchodní Asie, Jížní Asie, Střední Asie, Západní Asie, východní Asie, Evropa, Severní Afrika a Africký roh.
Bazální R * clade se nachází mezi Soqotri (1,2%), stejně jako v Severovýchodní Afrika (1,5%), střední východ (0,8%), Blízký východ (0,8%) a Arabský poloostrov (0.3%).[10]
Haploskupina R byla také pozorována mezi staroegyptský mumie vyhloubené u Abusir el-Meleq archeologické naleziště ve středním Egyptě, které pochází z doby předptolemaické / pozdě Nová říše, Ptolemaic, a římský období.[11]
Subclade R2 byl pozorován u pozůstatků neolitického člověka ze západního Íránu v Tepe Abdul Hosein.[12]
Subclades
- Haploskupina R.
- R0 nebo pre-HV
- R0a nebo (preHV) 1: Vyskytuje se běžně na Arabském poloostrově s nejvyšší frekvencí pozorovanou u Soqotri.[13] Mírné frekvence nalezeny v Severní Afrika, Africký roh, a Střední Asie.
- HV: Je to západoasijská haploskupina, která se vyskytuje převážně v celé Evropě střední východ, počítaje v to Írán.[14] To je také nalezené v Severní Afrika, Střední Asie a Jížní Asie.
- HV1: Hlavně v střední východ.[16]
- HV2: Hlavně v Jížní Asie.[14]
- HV3: Hlavně v východní Evropa.[17]
- H: v Západní Eurasie. Je to nejběžnější haploskupina mtDNA v Evropa.
- R1
- R1a * (3337): Nalezeno v Brahminové z Uttarpradéš (Indie).[7] Také v Adygei lidé (Kavkaz).
- R1a1: Nalezeno v Severozápadní Kavkaz lidé jako Kabardins a Adygei lidé. Pozorováno u východoevropských populací, jako je severozápad Rusové a Poláci.[17]
- R1b: Pozorováno v an Východní lovec sběrač z ruské Karélie datováno 5500 př. n. l.[18]
- R1b1: Pozorováno v Bulharsku, Arménii (včetně starodávného exempláře) a Indii
- R1b1a: Pozorováno u Ujgurů
- R1b1b: pozorováno ve Finsku (včetně Finsko Švédové )
- R1b2
- R1b2a: Pozorováno v Jakutech
- R1b2b: Pozorováno u Ujgurů
- R1b1: Pozorováno v Bulharsku, Arménii (včetně starodávného exempláře) a Indii
- před JT nebo R2'JT
- R2: Nalezeno hlavně v Balúčistán (Pákistán).[14]
- (13500): Nalezeno v Rádžasthán a Uttarpradéš (Indie).[3]
- (150, 303 + 1C): Vstup Írán, Gruzie a krocan.
- JT
- J: Nejvyšší frekvence je v Blízký východ (12%), 21% v Saudská arábie.[16] J klesá směrem k Evropa na 11%, Kavkaz 8%, Severní Afrika 6% a ve východní Asii prakticky chybí.[19]
- T: Nejvyšší frekvence je v Kaspický region (Kavkaz, Severní Írán, Turkmenistán ).[14] Je to důležité v Evropa (téměř 10%),[20] střední východ, Střední Asie, Pákistán a Severní Afrika. Malá frekvence v Africký roh a Indie.
- R2: Nalezeno hlavně v Balúčistán (Pákistán).[14]
- R3: Nalezeno v Arménii.[21] Pozorováno také u starodávného jedince z Maďarsko, jehož historie se datuje před 7000 lety[22]
- R5: Široce rozšířený v Indický subkontinent. Speciálně v Madhya Pradesh (Indie ) na 17%.[23]
- R6'7 (16362) Mezi nejdůležitější přítomnost patří Austroasiatický jazyk - reproduktory od Indie (10%).[24]
- R8: Nejvyšší frekvence se vyskytuje směrem k Východní Indie, zejména uvnitř Orissa (12%) a nachází se mezi Austroasiatic kmeny (Munda a Khasi Řečníci). Je také přítomen v nízké frekvenci mezi mluvčími Dravidianů, Indoevropanů a Tibeto-Burmanů (např. Nyishi, Changpa, Šerpo ).[26]
- R8a: Nalezeno hlavně v Orissa a Andhra Pradesh (Indie).
- R8b: v Orissa, Gudžarát, Andhra Pradesh (Indie).
- R9 (16304)
- R9b: Objevuje se většinou v Jihovýchodní Asie.[27] Nalezeno všude Indonésie, v Indočína, Malajsie, v Domorodí Malajci jako Semelai na 28% a Temuan 21%.[28]
- (249d)
- R9c: Všude Malajské souostroví a Tchaj-wan. Hlavně v Batak (Palawan ) na 58%,[29] the Tsou z Tchaj-wan (22.9%),[30] a Alor (Indonésie) na 11%.[31]
- F: Docela běžné v východní Asie a Jihovýchodní Asie. V některých oblastech se vyskytují vyšší frekvence Nicobar na 50% a Arunáčalpradéš 31% (Indie ),[23] a Shors lidí ze Sibiře na 44%.[32] Důležitá frekvence je také v Tchajwanští domorodci, Guangdong (Čína), Maluku (Indonésie), Thajsko a Vietnam.
- R11'B (16189)
- R11: Nalezen v Čína, hlavně v Lahuové z Yunnan na 12,5%.[33] Také v Japonsko, Korea,[34] Chams,[35] a Rádžasthán (Indie).
- B
- B4: Vyskytuje se často v východní Asie, Jihovýchodní Asie, Polynésie, Melanésie, Mikronésie, Madagaskar a Domorodé národy Ameriky.
- B5: Roztáhnout východní Asie a Jihovýchodní Asie.
- R24: Nalezen v Filipíny.[36]
- R12'21
- R14: Nalezen v Papua-Nová Guinea[39] a v Austronesian mluvčí Východní Timor a Lembata.[40]
- R22 nebo R12: velmi časté v EU Shompen (10/29 = 34.5%).[41] Jinde se nacházejí hlavně na jihu-centrální Indonésie (11.4% Mataram, 8.0% Waingapu, 7.3% Bali, 1.9% Borneo ) a dovnitř Cham z Bình Thuận, Vietnam (7/168 = 4,2%),[42] s ojedinělými nebo sporadickými výskyty v Thajsko, Sumatra, Jáva, Sulawesi, a Alor.[31]
- R23: Malý clade nalezen v Bali a Sumba (Indonésie).[31]
- R30
- R30a: Nalezeno v Andhra Pradesh, Uttarpradéš (Indie), v Tharu lidé z Nepál[43] a Sinhálci z Srí Lanka.[24]
- R30b: Nalezeno v Paňdžáb.[24]
- R30 * (1598, 16189): Nalezeno v Paňdžáb, Nepál a Japonsko.[43]
- R31
- R31a: V Brahminové z Uttarpradéš[7] a Rajputs z Rádžasthán (Indie).[24]
- R31b: v Reddys z Andhra Pradesh (Indie).[7]
- R32
- R0 nebo pre-HV
Nalezen v Mauricius
- P: Je to charakteristické pro Sahul. Nalezen v Filipíny a na východ Indonésie.
- (16176)
- P1: Rozšířený Melanésie. Vyšší frekvence se vyskytují v Papua-Nová Guinea.[44] Nalezeno také v Maluku, Nusa Tenggara a Polynésie.[45]
- P2'10
- P2: V Melanésie,[44] speciálně v Nová Guinea a Nová Kaledonie.
- P10: Nalezeno v Filipíny.[36]
- P9 (nebo AuE): v Domorodí Australani z centrální oblasti.[46]
- P3: V Austrálie a Melanésie.[44]
- P4: V Austrálie a Melanésie.[47]
- (16176)
- U
- U1: Objevuje se většinou v střední východ a Kavkaz. Nalezeno z Indie do Středomoří a do zbytku Evropy.[48]
- U5: Přibližně 11% z celkového počtu Evropané a 10% evropských Američanů. Nejvyšší frekvence je v Sami lidé.[15]
- U6: Je to běžné v Severní Afrika a Africký roh, zejména v Maghrebu.[49] Nejvyšší frekvence subclade se vyskytují mezi Alžířany Berbeři (29%)[50] a egyptský Kopti (27.6%).[51] U6 byl také nalezen mezi Iberomaurusian exempláře pocházející z epipaleolitu na Taforalt prehistorické místo.[52]
- U2'3'4'7'8'9 (1811): Široce rozšířený Západní Eurasie a Indický subkontinent.
- U8
- P: Je to charakteristické pro Sahul. Nalezen v Filipíny a na východ Indonésie.
Strom
Tento fylogenetický strom subcladů haploskupiny R je založen na příspěvku Mannisa van Ovena a Manfreda Kaysera Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA[5] a následný publikovaný výzkum.
- R
- R0 (dříve pre-HV)
- R1
- R1a
- R1a1
- R1a1a
- R1a1
- R1a
- R2'JT
- R5
- R5a
- R5a1
- R5a1a
- R5a2
- R5a2a
- R5a2b
- R5a2b1
- R5a2b2
- R5a2b3
- R5a2b4
- R5a1
- R5a
- R6'7
- R6
- R6a
- R6a1
- R6a1a
- R6a1
- R6a
- R7
- R7a
- R7a1
- R7a1a
- R7a1b
- R7a1b1
- R7a1b2
- R7a1
- R7b
- R7b1
- R7b1a
- R7b1
- R7a
- R6
- R8 - Indie
- R8a - Srí Lanka
- R8a1
- R8a1a
- R8a1a1
- R8a1a2
- R8a1a3 - Jižní Afrika, Norsko
- R8a1b
- R8a1a
- R8a2
- R8a1
- R8b
- R8b1
- R8b2
- R8a - Srí Lanka
- (16304)
- R9
- R9b - Kambodža, Thajsko (Lao Isan v Provincie Ubon Ratchathani a Provincie Roi Et ),[53] Guinea
- R9b1 - Čína, Ujgur, Thajsko (Pondělí v Střední Thajsko, Thai v Západní Thajsko ), Laos (Lao v Vientiane[53]), Vietnam (La Hủ ), Dánsko
- R9b1a
- R9b1a1 - Filipíny (Mamanwa )
- R9b1a1a - Čína, Thajsko (Karen a Thai Lue v Severní Thajsko, Lao Isan v Provincie Roi Et,[53] Thai v Střední Thajsko a Východní Thajsko ), Kambodža (Banteay Meanchey ), Malajsie (Semelai, domorodý malajština ), Singapur, Indonésie (Tengger, Palembang, Padang, Manado ), Vietnam (Giarai )
- R9b1a2 - Tchaj-wan (Tsou ), Thajsko (Lao Isan v Provincie Loei, Thai v Západní Thajsko )
- R9b1a2a - Čína (Han z Tai'an, atd.), Vietnam (Tay, atd.), Rusko (Tubalar )
- R9b1a2b - Čína, Tchaj-wan (Minnan, Hakka), Vietnam (Tay ), Thajsko (Khon Mueang z Chiang Rai provincie, Tai Khuen ze severního Thajska)
- R9b1a3 - Thajsko, Čína (Han, Dai ), Vietnam (Dao, Nùng, atd.), Kazachstán
- R9b1a1 - Filipíny (Mamanwa )
- R9b1b - Čína, Vietnam, Kambodža (Siem Reap ), Thajsko (Khon Mueang z Provincie Chiang Mai, Tai Yuan z Střední Thajsko, Pondělí z Severní Thajsko )
- R9b1a
- R9b2 - Thajsko, Kambodža, Vietnam
- R9b1 - Čína, Ujgur, Thajsko (Pondělí v Střední Thajsko, Thai v Západní Thajsko ), Laos (Lao v Vientiane[53]), Vietnam (La Hủ ), Dánsko
- R9c - Čína (Barghut z Hulun Buir ), Tchaj-wan
- R9c1
- R9c1a - Filipíny, Indonésie, Tchaj-wan (Makatao ), Thajsko (Khon Mueang z Chiang Rai provincie )
- R9c1b
- R9c1b1 - Čína (Han ), Vietnam (Kinh, Dao ), Thajsko (Tai Dam v Provincie Kanchanaburi, Khon Mueang v Provincie Mae Hong Son, Tai Yuan v Severní Thajsko, Thai Lue v Severní Thajsko ), Myanmar
- R9c1b2 - Thajsko (Khon Mueang v Chiang Rai provincie ), Tchaj-wan (Makatao, atd.), Filipíny (Ifugao, Bugkalot ), Východní Timor
- R9c1
- F
- R22
- R9b - Kambodža, Thajsko (Lao Isan v Provincie Ubon Ratchathani a Provincie Roi Et ),[53] Guinea
- R9
- R11'B (16189)
- R11
- R11a
- B
- R24
- R11
- R12'21
- R12
- R21
- R22
- R14
- R23
- R30
- R30a
- R30b
- R30b1
- R31
- R31a
- R31a1
- R31b
- R31a
- R32
- P
- U
Reference
- ^ A b Soares, Pedro; Ermini, Luca; Thomson, Noel; Mormina, Maru; Rito, Teresa; Röhl, Arne; Salas, Antonio; Oppenheimer, Stephen; MacAulay, Vincent (2009). „Oprava pro čištění výběru: Vylepšené lidské mitochondriální molekulární hodiny“. American Journal of Human Genetics. 84 (6): 740–59. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773.
- ^ A b Maji, Suvendu; Krithika, S .; Vasul, T.S. (2008). „Distribuce mitochondriální DNA makrohaploskupiny N v Indii se zvláštním zřetelem na haploskupinu R a její dílčí haploskupinu U“ (PDF). International Journal of Human Genetics. 8 (1–2): 85–96. doi:10.1080/09723757.2008.11886022. S2CID 14231815.
- ^ A b C Karmin, Monika (2005). Haploskupina lidské mitochondriální DNA R v Indii: pitva fylogenetického stromu linií specifických pro jižní Asii (M.Sc. Thesis). University of Tartu. hdl:10062/567. OCLC 692161090.[stránka potřebná ]
- ^ Larruga, Jose M (23. května 2017). „Nositelé mitochondriální DNA makrohaploskupiny R kolonizovali Eurasii a Australasii z hlavní oblasti jihovýchodní Asie“. BMC Evoluční biologie. 17 (1): 115. doi:10.1186 / s12862-017-0964-5. PMC 5442693. PMID 28535779.
- ^ A b Van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (2009). „Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA“. Lidská mutace. 30 (2): E386–94. doi:10.1002 / humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749.
- ^ A b Larruga, Jose M (23. května 2017). „Nositelé makrohaploskupiny mitochondriální DNA R kolonizoval Eurasii a Australasii z hlavní oblasti jihovýchodní Asie “. BMC Evoluční biologie. 17 (1): 115. doi:10.1186 / s12862-017-0964-5. PMC 5442693. PMID 28535779.
- ^ A b C d Palanichamy, Malliya Gounder; Sun, Chang; Agrawal, Suraksha; Bandelt, Hans-Jürgen; Kong, Qing-Peng; Khan, Faisal; Wang, Cheng-Ye; Chaudhuri, Tapas Kumar; Palla, Venkatramana (2004). „Fylogeneze mitochondriální DNA makrohaploskupiny N v Indii, založená na úplném sekvenování: důsledky pro osídlení jižní Asie“. American Journal of Human Genetics. 75 (6): 966–78. doi:10.1086/425871. PMC 1182158. PMID 15467980.
- ^ Marrero, Patricia; Abu-Amero, Khaled K; Larruga, Jose M; Cabrera, Vicente M (2016). „Nositelé lidské mitochondriální DNA makrohaploskupiny M kolonizovali Indii z jihovýchodní Asie“. BMC Evoluční biologie. 16 (1): 246. doi:10.1186 / s12862-016-0816-8. PMC 5105315. PMID 27832758.
- ^ Larruga, Jose M; Marrero, Patricia; Abu-Amero, Khaled K; Golubenko, Maria V; Cabrera, Vicente M (2017). „Nositelé mitochondriální DNA makrohaploskupiny R kolonizovali Eurasii a Australasii z hlavní oblasti jihovýchodní Asie“. BMC Evoluční biologie. 17 (1): 115. doi:10.1186 / s12862-017-0964-5. PMC 5442693. PMID 28535779.
- ^ Černý, Viktor; et al. (2009). „Z Arábie - osídlení ostrova Sokotra, jak vyplývá z genetické rozmanitosti mitochondrií a chromozomu Y“ (PDF). American Journal of Physical Anthropology. 138 (4): 439–447. doi:10.1002 / ajpa.20960. PMID 19012329. Archivovány od originál (PDF) dne 6. října 2016. Citováno 13. června 2016.
- ^ Schuenemann, Verena J .; et al. (2017). „Staroegyptské genomy mumií naznačují nárůst předků subsaharské Afriky v post-římských obdobích“. Příroda komunikace. 8: 15694. Bibcode:2017NatCo ... 815694S. doi:10.1038 / ncomms15694. PMC 5459999. PMID 28556824.
- ^ Broushaki, Farnaz; Thomas, Mark G .; Link, Vivian; López, Saioa; van Dorp, Lucy; Kirsanow, Karola; Hofmanová, Zuzana; Diekmann, Yoan; Cassidy, Lara M .; Díez-del-Molino, David; Kousathanas, Athanasios; Sell, Christian; Robson, Harry K .; Martiniano, Rui; Blöcher, Jens; Scheu, Amelie; Kreutzer, Susanne; Bollongino, Ruth; Bobo, Dean; Davoudi, Hossein; Munoz, Olivia; Currat, Mathias; Abdi, Kamyar; Biglari, Fereidoun; Craig, Oliver E .; Bradley, Daniel G .; Shennan, Stephen; Veeramah, Krishna R .; Mashkour, Marjan; Wegmann, Daniel; Hellenthal, Garrett; Burger, Joachim (29. července 2016). „Ranně neolitické genomy z východního úrodného půlměsíce“ (PDF). Věda. 353 (6298): 499–503. Bibcode:2016Sci ... 353..499B. doi:10.1126 / science.aaf7943. PMC 5113750. PMID 27417496. Citováno 17. listopadu 2019.
- ^ Non, Amy. „ANALYZACE GENETICKÝCH ÚDAJŮ V RÁMCI MEZISCIPLINÁRNÍHO ZKOUŠKY K VYŠETŘOVÁNÍ NEDÁVNÉ HISTORIE LIDSKÉ EVOLUČNÍ A KOMPLEXNÍ CHOROBY (PDF). University of Florida. Citováno 22. dubna 2016.
- ^ A b C d Quintana-Murci, Lluís; Chaix, Raphaëlle; Wells, R. Spencer; Behar, Doron M .; Sayar, Hamid; Scozzari, Rosaria; Rengo, Chiara; Al-Zahery, Nadia; Semino, Ornella (2004). „Where West Meets East: The Complex mtDNA Landscape of the Southwest and Central Asian Corridor“. American Journal of Human Genetics. 74 (5): 827–45. doi:10.1086/383236. PMC 1181978. PMID 15077202.
- ^ A b Helgason, Agnar; Hickey, Eileen; Goodacre, Sara; Bosnes, Vidar; Stefánsson, Kári; Ward, Ryk; Sykes, Bryan (2001). „MtDNA a ostrovy severního Atlantiku: Odhad podílu severských a gaelských předků“. American Journal of Human Genetics. 68 (3): 723–37. doi:10.1086/318785. PMC 1274484. PMID 11179019.
- ^ A b Abu-Amero, Khaled K; Larruga, José M; Cabrera, Vicente M; González, Ana M (2008). „Struktura mitochondriální DNA na Arabském poloostrově“. BMC Evoluční biologie. 8: 45. doi:10.1186/1471-2148-8-45. PMC 2268671. PMID 18269758.
- ^ A b Malyarchuk, B .; Grzybowski, T .; Derenko, M .; Perkova, M .; Vanecek, T .; Lazur, J .; Gomolcak, P .; Tsybovsky, I. (2008). "Mitochondriální DNA fylogeneze u východních a západních Slovanů". Molekulární biologie a evoluce. 25 (8): 1651–8. doi:10.1093 / molbev / msn114. PMID 18477584.
- ^ Mittnik, Alissa; Wang, Chuan-Chao; Pfrengle, Saskia; Daubaras, Mantas; Zariņa, Gunita; Hallgren, Fredrik; Allmäe, Raili; Chartanovič, Valery; Moiseyev, Vyacheslav; Tõrv, Mari; Furtwängler, Anja (30.01.2018). „Genetická prehistorie regionu Baltského moře“. Příroda komunikace. 9 (1): 442. Bibcode:2018NatCo ... 9..442M. doi:10.1038 / s41467-018-02825-9. ISSN 2041-1723. PMC 5789860. PMID 29382937.
- ^ Serk, Piia (2004). Lidská mitochondriální DNA Haploskupina J v Evropě a na Blízkém východě (M.Sc. Thesis). Estonsko: University of Tartu. hdl:10062/777. OCLC 692161303.[stránka potřebná ]
- ^ oxfordancestors.com Mateřský původ Archivováno 2017-07-15 na Wayback Machine
- ^ Mannis van Oven's PhyloTree.org - podstrom mtDNA R. Archivováno 2009-06-13 na Wayback Machine
- ^ Fu, Qiaomei; Posth, Cosimo; Hajdinjak, Mateja; Petr, Martin; Mallick, Swapan; Fernandes, Daniel; Furtwängler, Anja; Haak, Wolfgang; Meyer, Matthias; Mittnik, Alissa; Nikl, Birgit (červen 2016). „Genetická historie Evropy v době ledové“. Příroda. 534 (7606): 200–205. Bibcode:2016Natur.534..200F. doi:10.1038 / příroda17993. hdl:10211.3/198594. ISSN 1476-4687. PMC 4943878. PMID 27135931.
- ^ A b C Metspalu, Mait; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Parik, Jüri; Hudjashov, Georgi; Kaldma, Katrin; Serk, Piia; Karmin, Monika; Behar, Doron M; Gilbert, M Thomas P; Endicott, Phillip; Mastana, Sarabjit; Papiha, Surinder S; Skorecki, Karl; Torroni, Antonio; Villems, Richard (2004). „Většina existujících hranic mtDNA v jižní a jihozápadní Asii byla pravděpodobně formována během počátečního osídlení Eurasie anatomicky moderními lidmi“. Genetika BMC. 5: 26. doi:10.1186/1471-2156-5-26. PMC 516768. PMID 15339343.
- ^ A b C d E F G Chaubey, Gyaneshwer; Karmin, Monika; Metspalu, Ene; Metspalu, Mait; Selvi-Rani, Deepa; Singh, Vijay; Parik, Jüri; Solnik, Anu; Naidu, B Prathap; Kumar, Ajay; Adarsh, Niharika; Mallick, Chandana; Trivedi, Bhargav; Prakash, Swami; Reddy, Ramesh; Shukla, Parul; Bhagat, Sanjana; Verma, Swati; Vasnik, Samiksha; Khan, Imran; Barwa, Anshu; Sahoo, Dipti; Sharma, Archana; Rashid, Mamoon; Chandra, Vishal; Reddy, Alla G; Torroni, Antonio; Foley, Robert A; Thangaraj, Kumarasamy; Singh, Lalji (2008). "Fylogeografie mtDNA haploskupiny R7 na Indickém poloostrově". BMC Evoluční biologie. 8: 227. doi:10.1186/1471-2148-8-227. PMC 2529308. PMID 18680585.
- ^ A b C „Obrázek 4. Distribuce frekvence subtypů R7a a R7b na indickém subkontinentu“. v Chaubey, Gyaneshwer; Karmin, Monika; Metspalu, Ene; Metspalu, Mait; Selvi-Rani, Deepa; Singh, Vijay; Parik, Jüri; Solnik, Anu; Naidu, B Prathap; Kumar, Ajay; Adarsh, Niharika; Mallick, Chandana; Trivedi, Bhargav; Prakash, Swami; Reddy, Ramesh; Shukla, Parul; Bhagat, Sanjana; Verma, Swati; Vasnik, Samiksha; Khan, Imran; Barwa, Anshu; Sahoo, Dipti; Sharma, Archana; Rashid, Mamoon; Chandra, Vishal; Reddy, Alla G; Torroni, Antonio; Foley, Robert A; Thangaraj, Kumarasamy; Singh, Lalji (2008). "Fylogeografie mtDNA haploskupiny R7 na Indickém poloostrově". BMC Evoluční biologie. 8: 227. doi:10.1186/1471-2148-8-227. PMC 2529308. PMID 18680585.
- ^ Obrázek 4 v Thangaraj, Kumarasamy; Nandan, Amrita; Sharma, Vishwas; Sharma, Varun Kumar; Eaaswarkhanth, Muthukrishnan; Patra, Pradeep Kumar; Singh, Sandhya; Rekha, Sashi; Dua, Monika; et al. (2009). Ahmed, Niyaz (ed.). „Deep Rooting In-Situ Expansion of mtDNA Haplogroup R8 in South Asia“. PLOS ONE. 4 (8): e6545. Bibcode:2009PLoSO ... 4,6545T. doi:10.1371 / journal.pone.0006545. PMC 2718812. PMID 19662095.
- ^ Ian Logan 2009, Haplogrupo R9b, Mitochondriální DNA
- ^ A b Hill, C .; Soares, P .; Mormina, M .; MacAulay, V .; Meehan, W .; Blackburn, J .; Clarke, D .; Raja, J. M .; Ismail, P. (2006). „Fylogeografie a etnogeneze domorodých jihovýchodních Asiatů“. Molekulární biologie a evoluce. 23 (12): 2480–91. doi:10.1093 / molbev / msl124. PMID 16982817.
- ^ Scholes, Clarissa; Siddle, Katherine; Ducourneau, Axel; Crivellaro, Federica; Järve, Mari; Rootsi, Siiri; Bellatti, Maggie; Tabbada, Kristina; Mormina, Maru (2011). "Genetická rozmanitost a důkazy o příměsi populace v Bataku Negritosovi z Palawanu". American Journal of Physical Anthropology. 146 (1): 62–72. doi:10.1002 / ajpa.21544. PMID 21796613.
- ^ Albert Min-Shan Ko, Chung-Yu Chen, Qiaomei Fu, et al. (2014), „Early Austronesians: Into and Out Of Taiwan.“ American Journal of Human Genetics 94, 426–436, 6. března 2014.
- ^ A b C Hill, Catherine; Soares, Pedro; Mormina, Maru; MacAulay, Vincent; Clarke, Dougie; Blumbach, Petya B .; Vizuete-Forster, Matthieu; Forster, Peter; Bulbeck, David; Oppenheimer, Stephen; Richards, Martin (2007). „Mitochondriální stratigrafie pro ostrov jihovýchodní Asie“. American Journal of Human Genetics. 80 (1): 29–43. doi:10.1086/510412. PMC 1876738. PMID 17160892.
- ^ Derenko, Miroslava; Malyarchuk, Boris; Grzybowski, Tomasz; Denisova, Galina; Dambueva, Irina; Perkova, Maria; Dorzhu, Choduraa; Luzina, Faina; Lee, Hong Kyu (2007). „Fylogeografická analýza mitochondriální DNA u populací v severní Asii“. American Journal of Human Genetics. 81 (5): 1025–41. doi:10.1086/522933. PMC 2265662. PMID 17924343.
- ^ Tanaka, M .; Cabrera, VM; González, AM; Larruga, JM; Takeyasu, T; Fuku, N; Guo, LJ; Hirose, R; Fujita, Y (2004). „Variace mitochondriálního genomu ve východní Asii a osídlení Japonska“. Výzkum genomu. 14 (10a): 1832–50. doi:10,1101 / gr. 2286304. PMC 524407. PMID 15466285.
- ^ Hwan Young Lee, Ji-Eun Yoo, Myung Jin Park, Ukhee Chung, Chong-Youl Kim a Kyoung-Jin Shin, „Východoasijské stanovení haploskupiny mtDNA u Korejců: SNP analýza kódující oblasti na úrovni haploskupiny a sekvence kontrolní oblasti na úrovni podskupiny analýza." Elektroforéza (2006). DOI 10.1002 / elps.200600151.
- ^ On, J-D; Peng, M-S; Quang, HH; Dang, KP; Trieu, AV; et al. (2012). „Patrilineal Perspective on the Austronesian Diffusion in Mainland Southeast Asia“. PLOS ONE. 7 (5): e36437. Bibcode:2012PLoSO ... 736437H. doi:10.1371 / journal.pone.0036437. PMC 3346718. PMID 22586471.
- ^ A b Tabbada, K. A .; Trejaut, J .; Loo, J.-H .; Chen, Y.-M .; Lin, M .; Mirazon-Lahr, M .; Kivisild, T .; De Ungria, M. C. A. (2009). „Rozmanitost filipínské mitochondriální DNA: osídlený viadukt mezi Tchaj-wanem a Indonésií?“. Molekulární biologie a evoluce. 27 (1): 21–31. doi:10,1093 / molbev / msp215. PMID 19755666.
- ^ Pierson, M. J .; Martinez-Arias, R; Holland, BR; Gemmell, NJ; Hurles, ME; Penny, D (2006). „Dešifrování minulých pohybů lidské populace v Oceánii: prokazatelně optimální stromy o 127 genech mtDNA“. Molekulární biologie a evoluce. 23 (10): 1966–75. doi:10.1093 / molbev / msl063. PMC 2674580. PMID 16855009.
- ^ Kutanan, Wibhu; Kampuansai, Jatupol; Changmai, Piya; et al. (2018). „Kontrastní mateřská a otcovská genetická variace skupin lovců a sběračů v Thajsku“. Vědecké zprávy. 8: 1536. Bibcode:2018NatSR ... 8,1536 tis. doi:10.1038 / s41598-018-20020-0. PMC 5784115. PMID 29367746.
- ^ Haploskupina R14 „Stránky mitochondriální DNA Iana Logana
- ^ Mona, S .; Grunz, K.E .; Brauer, S .; Pakendorf, B .; Castri, L .; Sudoyo, H .; Marzuki, S .; Barnes, R. H .; Schmidtke, J. (2009). „Historie genetické příměsi východní Indonésie odhalená analýzou Y-chromozomu a mitochondriální DNA“. Molekulární biologie a evoluce. 26 (8): 1865–77. doi:10,1093 / molbev / msp097. PMID 19414523.
- ^ Trivedi, Rajni; Sitalaximi, T .; Banerjee, Jheelam; et al. (2006). „Molekulární pohledy na počátky Shompenu, klesající populace souostroví Nikobary“. J Hum Genet. 51 (3): 217–226. doi:10.1007 / s10038-005-0349-2. PMID 16453062.
- ^ Peng, Min-Sheng; Ho Quang, Huy; Pham Dang, Khoa; et al. (2010). „Sledování austronéské stopy v jihovýchodní Asii na pevnině: perspektiva z mitochondriální DNA“. Mol. Biol. Evol. 27 (10): 2417–2430. doi:10.1093 / molbev / msq131. PMID 20513740.
- ^ A b Fornarino, Simona; Pala, Maria; Battaglia, Vincenza; Maranta, Ramona; Achilli, Alessandro; Modiano, Guido; Torroni, Antonio; Semino, Ornella; Santachiara-Benerecetti, Silvana A (2009). „Diverzita mitochondrií a Y-chromozomů Tharus (Nepál): rezervoár genetické variace“. BMC Evoluční biologie. 9: 154. doi:10.1186/1471-2148-9-154. PMC 2720951. PMID 19573232.
- ^ A b C Friedlaender, J .; Schurr, T; Gentz, F; Koki, G; Friedlaender, F; Horvat, G; Babb, P; Cerchio, S; Kaestle, F (2005). „Rozšiřování mitochondriálních haploskupin P a Q v jihozápadním Pacifiku“. Molekulární biologie a evoluce. 22 (6): 1506–17. doi:10.1093 / molbev / msi142. PMID 15814828.
- ^ Kayser, M .; Brauer, S; Cordaux, R; Casto, A; Lao, O; Zhivotovsky, LA; Moyse-Faurie, C; Rutledge, RB; Schiefenhoevel, W (2006). „Melanésianský a asijský původ Polynésanů: MtDNA a Y chromozomové přechody přes Pacifik“. Molekulární biologie a evoluce. 23 (11): 2234–44. doi:10.1093 / molbev / msl093. PMID 16923821.
- ^ Harding, Rosalind 2006, Analýzy genomů domorodých Australanů. Archivováno 2009-09-20 na Wayback Machine University of Oxford
- ^ Hudjashov, G .; Kivisild, T .; Underhill, P. A .; Endicott, P .; Sanchez, J. J .; Lin, A. A .; Shen, P .; Oefner, P .; Renfrew, C .; et al. (2007). „Odhalení prehistorického osídlení Austrálie analýzou chromozomu Y a mtDNA“. Sborník Národní akademie věd. 104 (21): 8726–30. Bibcode:2007PNAS..104,8726H. doi:10.1073 / pnas.0702928104. JSTOR 25427741. PMC 1885570. PMID 17496137.
- ^ Stránka mtDNA Haplogroup U1a na cagetti.com[nespolehlivý zdroj? ]
- ^ Karima Fadhlaoui-Zid; Laura Rodríguez-Botigué; Nejib Naoui; Amel Benammar-Elgaaied; Francesc Calafell; David Comas (květen 2011). „Struktura mitochondriální DNA v severní Africe odhaluje genetickou diskontinuitu v údolí Nilu“ (PDF). American Journal of Physical Anthropology. 145 (1): 107–117. doi:10.1002 / ajpa.21472. hdl:10261/42802. PMID 21312180. Citováno 22. dubna 2016.
- ^ Maca-Meyer, Nicole; González, Ana M; Pestano, José; Flores, Carlos; Larruga, José M; Cabrera, Vicente M (2003). „Přechod mitochondriální DNA mezi západní Asií a severní Afrikou odvozen z fylogeografie U6“. Genetika BMC. 4: 15. doi:10.1186/1471-2156-4-15. PMC 270091. PMID 14563219.
- ^ Mohamed, Hisham Yousif Hassan. „Genetické vzorce variace chromozomu Y a mitochondriální DNA s důsledky pro osídlení Súdánu“ (PDF). Univerzita v Chartúmu. Citováno 22. dubna 2016.
- ^ Bernard Secher; Rosa Fregel; José M Larruga; Vicente M Cabrera; Phillip Endicott; José J Pestano; Ana M González (2014). „Historie toku severní africké mitochondriální DNA haploskupiny U6 do afrického, euroasijského a amerického kontinentu“. BMC Evoluční biologie. 14: 109. doi:10.1186/1471-2148-14-109. PMC 4062890. PMID 24885141.
- ^ A b C Citovat chybu: Pojmenovaná reference
Kutanan 2016
bylo vyvoláno, ale nikdy nebylo definováno (viz stránka nápovědy).
externí odkazy
- Mannis van Oven's PhyloTree.org - podstrom mtDNA R.
- Iana Logana Stránky mitochondriální DNA
Fylogenetický strom haploskupiny lidské mitochondriální DNA (mtDNA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mitochondriální Eva (L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | G | Q | Ó | A | S | R | Já | Ž | X | Y | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | před JT | P | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | PROTI | J | T |