Rodina glykosid hydrolázy 31 - Glycoside hydrolase family 31 - Wikipedia
Rodina glykosylhydroláz 31 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() struktura komplexu yici thiosugar michaelis | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
Symbol | Glyco_hydro_31 | ||||||||
Pfam | PF01055 | ||||||||
Pfam klan | CL0058 | ||||||||
InterPro | IPR000322 | ||||||||
STRÁNKA | PDOC00120 | ||||||||
CAZy | GH31 | ||||||||
Membranome | 523 | ||||||||
|
V molekulární biologii rodina glykosid hydrolázy 31 je rodina z glykosidové hydrolázy.
Glykosidové hydrolázy ES 3.2.1. jsou rozšířenou skupinou enzymů, které hydrolyzovat the glykosidová vazba mezi dvěma nebo více sacharidy nebo mezi sacharidovou a ne-sacharidovou skupinou. Klasifikační systém pro glykosidové hydrolázy, založený na sekvenční podobnosti, vedl k definici> 100 různých rodin.[1][2][3] Tato klasifikace je k dispozici na internetu CAZy webová stránka,[4][5] a také diskutována na CAZypedii, online encyklopedii sacharidově aktivních enzymů.[6][7]
Rodina glykosid hydrolázy 31 CAZY GH_31 obsahuje enzymy s několika známými aktivitami; alfa-glukosidáza (ES 3.2.1.20 ), alfa-galaktosidáza (ES 3.2.1.22 ); glukoamyláza (ES 3.2.1.3 ), sacharáza-izomaltáza (ES 3.2.1.48 ) (ES 3.2.1.10 ); alfa-xylosidáza (ES 3.2.1 ); alfa-glukan lyáza (ES 4.2.2.13 ).
Rodina glykosidhydrolázy 31 seskupuje řadu glykosylhydroláz na základě podobnosti sekvencí[8][9][10] An kyselina asparagová byl zapleten[11] v katalytické aktivitě sacharáza, isomaltáza, a lysozomální alfa-glukosidáza.
externí odkazy
Reference
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (červenec 1995). „Zachovalý katalytický aparát a předpověď společného záhybu pro několik rodin glykosylových hydroláz“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. doi:10.1073 / pnas.92.15.7090. PMC 41477. PMID 7624375.
- ^ Davies G, Henrissat B (září 1995). "Struktury a mechanismy glykosylhydroláz". Struktura. 3 (9): 853–9. doi:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (červen 1996). „Aktualizace klasifikace glykosylhydroláz na základě sekvence“. The Biochemical Journal. 316 (Pt 2): 695–6. doi:10.1042 / bj3160695. PMC 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Domov". CAZy.org. Citováno 2018-03-06.
- ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (leden 2014). „Databáze enzymů aktivních ze sacharidů (CAZy) v roce 2013“. Výzkum nukleových kyselin. 42 (Problém s databází): D490-5. doi:10.1093 / nar / gkt1178. PMC 3965031. PMID 24270786.
- ^ "Glycoside Hydrolase Family 31". CAZypedia.org. Citováno 2018-03-06.
- ^ Konsorcium CAZypedia (prosinec 2018). „Deset let CAZypedie: živá encyklopedie enzymů aktivních ze sacharidů“ (PDF). Glykobiologie. 28 (1): 3–8. doi:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Henrissat B (prosinec 1991). „Klasifikace glykosylhydroláz na základě podobnosti aminokyselinové sekvence“. The Biochemical Journal. 280 (2): 309–16. doi:10.1042 / bj2800309. PMC 1130547. PMID 1747104.
- ^ Kinsella BT, Hogan S, Larkin A, Cantwell BA (prosinec 1991). „Primární struktura a zpracování alfa-glukosidázy Candida tsukubaensis. Homologie s komplexem králičí intestinální sacharázy-isomaltázy a lidskou lysozomální alfa-glukosidázou.“ European Journal of Biochemistry. 202 (2): 657–64. doi:10.1111 / j.1432-1033.1991.tb16420.x. PMID 1761061.
- ^ Naim HY, Niermann T, Kleinhans U, Hollenberg CP, Strasser AW (prosinec 1991). „Stávkující strukturální a funkční podobnosti naznačují, že intestinální sacharáza-izomaltáza, lidská lysozomální alfa-glukosidáza a Schwanniomyces occidentalis glukoamyláza jsou odvozeny od běžného genu předků“. FEBS Dopisy. 294 (1–2): 109–12. doi:10.1016 / 0014-5793 (91) 81353-A. PMID 1743281. S2CID 6086792.
- ^ Hermans MM, Kroos MA, van Beeumen J, Oostra BA, Reuser AJ (červenec 1991). "Lidská lysozomální alfa-glukosidáza. Charakterizace katalytického místa". The Journal of Biological Chemistry. 266 (21): 13507–12. PMID 1856189.