Rodina glykosid hydrolázy 13 - Glycoside hydrolase family 13
| Alfa amyláza, N-koncová ig-podobná doména | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 krystalová struktura mutantu thermoactinomyces vulgaris r-47 alfa-amylázy 1 (tvai) d356n / e396q v komplexu s p2, pullulan model oligosacharid | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Alfa-amyláza_N | ||||||||
| Pfam | PF02903 | ||||||||
| InterPro | IPR004185 | ||||||||
| SCOP2 | 1sma / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| Katalytická doména alfa-amylázy | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 cyklodextrin glucanotransferáza (e.c.2.4.1.19) (cgtáza) | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Alfa-amyláza | ||||||||
| Pfam | PF00128 | ||||||||
| Pfam klan | CL0058 | ||||||||
| InterPro | IPR006047 | ||||||||
| SCOP2 | 1 ppi / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| CAZy | GH13 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii rodina glykosid hydrolázy 13 je rodina z glykosidové hydrolázy.
Glykosidové hydrolázy ES 3.2.1. jsou rozšířenou skupinou enzymů, které hydrolyzovat the glykosidová vazba mezi dvěma nebo více sacharidy nebo mezi sacharidovou a ne-sacharidovou skupinou. Klasifikační systém pro glykosidové hydrolázy, založený na sekvenční podobnosti, vedl k definici> 100 různých rodin.[1][2][3] Tato klasifikace je k dispozici na internetu CAZy webová stránka,[4][5] a také diskutována na CAZypedii, online encyklopedii sacharidově aktivních enzymů.[6][7]
Enzymy obsahující tuto doménu patří do rodiny 13 (CAZY GH_13 ) glykosylhydroláz. Maltogenní alfa-amyláza je enzym, který katalyzuje hydrolýzu (1-4) -alfa-D-glukosidových vazeb v polysacharidy aby se odstranily po sobě následující zbytky alfa-maltózy z neredukujících konců řetězců při přeměně škrob na sladový cukr. Mezi další enzymy z této rodiny patří neopullulanáza, která hydrolyzuje pullulan na panose, a cyklomaltodextrináza, který hydrolyzuje cyklodextriny.
Reference
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (červenec 1995). „Zachovalý katalytický aparát a předpověď společného záhybu pro několik rodin glykosylových hydroláz“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. doi:10.1073 / pnas.92.15.7090. PMC 41477. PMID 7624375.
- ^ Davies G, Henrissat B (září 1995). "Struktury a mechanismy glykosylhydroláz". Struktura. 3 (9): 853–9. doi:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (červen 1996). „Aktualizace klasifikace glykosylhydroláz na základě sekvence“. The Biochemical Journal. 316 (Pt 2): 695–6. doi:10.1042 / bj3160695. PMC 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Domov". CAZy.org. Citováno 2018-03-06.
- ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (leden 2014). „Databáze enzymů aktivních ze sacharidů (CAZy) v roce 2013“. Výzkum nukleových kyselin. 42 (Problém s databází): D490–5. doi:10.1093 / nar / gkt1178. PMC 3965031. PMID 24270786.
- ^ "Glykosid Hydroláza Rodina 13". CAZypedia.org. Citováno 2018-03-06.
- ^ Konsorcium CAZypedia (prosinec 2018). „Deset let CAZypedie: živá encyklopedie enzymů aktivních ze sacharidů“ (PDF). Glykobiologie. 28 (1): 3–8. doi:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
