Lektin typu C. - C-type lectin
Lektinová doména typu C. | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
Symbol | Lectin_C | ||||||||
Pfam | PF00059 | ||||||||
InterPro | IPR001304 | ||||||||
CHYTRÝ | CLECT | ||||||||
STRÁNKA | PS50041 | ||||||||
SCOP2 | 2 msb / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd00037 | ||||||||
Membranome | 52 | ||||||||
|
A Lektin typu C. (CLEC) je druh vázání sacharidů proteinová doména známý jako lektin.[3] Označení typu C je z jejich požadavku na vápník pro vázání.[4] Proteiny, které obsahují lektinové domény typu C, mají rozmanitou škálu funkcí, včetně adheze buněk k buňkám, imunitní odpovědi na patogeny a apoptóza.[5][6]
Klasifikace
Drickamer et al. klasifikoval lektiny typu C do 7 podskupin (I až VII) podle pořadí různých proteinové domény v každém proteinu.[7] Tato klasifikace byla následně aktualizována v roce 2002, což vedlo k sedmi dalším skupinám (VIII až XIV).[8] Nejnověji byly přidány další tři podskupiny (XV až XVII).[3]
Skupina | název | Přidružené domény |
---|---|---|
Já | Lecticans | EGF, Sushi, Ig a Link domény |
II | Asialoglycoprotein a DC receptory | Žádný |
III | Collectins | Žádný |
IV | Selectins | Sushi a EGF domén |
PROTI | NK - buňka receptory | Žádný |
VI | Multi-CTLD endocytické receptory | FnII a Ricin domény |
VII | Reg. Skupina | Žádný |
VIII | Chondrolectin, Layilin | Žádný |
IX | Tetranektin | Žádný |
X | Polycystin | Domény WSC, REJ, PKD |
XI | Attractin (ATRN ) | PSI, EGF a CUB domény |
XII | Eosinofil hlavní základní protein (EMBP) | Žádný |
XIII | DGCR2 | Žádný |
XIV | Trombomodulin, CD93, CD248, CLEC14A | EGF domén [9] |
XV | Bimlec | Žádný |
XVI | SEEC | SCP a EGF domén |
XVII | CBCP /Frem1 / QBRICK | CSPG opakuje a CalX-beta domén |
CLEC zahrnují:
- CLEC1A, CLEC1B
- CLEC2A, CLEC2B, CD69 (CLEC2C), CLEC2D, CLEC2L
- CLEC3A, CLEC3B
- CLEC4A, CLEC4C, CLEC4D, CLEC4E, CLEC4F, CLEC4G, ASGR1 (CLEC4H1), ASGR2 (CLEC4H2), FCER2 (CLEC4J), CD207 (CLEC4K), CD209 (CLEC4L), CLEC4M
- CLEC5A
- CLEC6A
- CLEC7A
- OLR1 (CLEC8A)
- CLEC9A
- CLEC10A
- CLEC11A
- CLEC12A, CLEC12B
- CD302 (CLEC13A), LY75 (CLEC13B), PLA2R1 (CLEC13C), MRC1 (CLEC13D), MRC2 (CLEC13E)
- CLEC14A
- CLEC16A
- CLEC17A
„Receptory podobné NK lektinu“ jsou velmi blízkou skupinou:[10]
- KLRA1
- KLRB1 (CLEC5B)
- KLRC1, KLRC2, KLRC3, KLRC4
- KLRD1
- KLRF1 (CLEC5C)
- KLRG1 (CLEC15A), KLRG2 (CLEC15B)
- KLRK1
Mezi další proteiny obsahující tuto doménu patří:
- AGC1; ATRNL1
- BCAN
- CD248; CD72; CD93; CHODL; CL-K1-Ia; CL-K1-Ib; CL-K1-Ic; CLECSF5; COLEC10; COLEC11; COLEC12; CSPG3
- FCER2; FREM1; HBXBP;
- LAYN; LOC348174; LOC728276
- MAFA; MBL2; MGC34761; MICL; MRC1L1
- OLR1
- PAP; PKD1; PKD1L2; PLA2R1; PRG2; PRG3
- REG1A; REG1B; REG3A; REG3G; REG4
- SELE; PRODAT; SELP; SFTPA1; SFTPA2; SFTPA2B; SFTPD; SRCL
- THBD
- VCAN
Reference
- ^ Walker JR, Nagar B, Young NM, Hirama T, Rini JM (duben 2004). „Rentgenová krystalová struktura lektinu specifického pro galaktózu C typu majícího novou dekamerickou kvartérní strukturu“. Biochemie. 43 (13): 3783–92. doi:10.1021 / bi035871a. PMID 15049685.
- ^ Mahla RS, Reddy MC, Prasad DV, Kumar H (září 2013). „Oslaďte PAMP: role cukru v komplexu s PAMP v přirozené imunitě a biologii vakcín“. Hranice v imunologii. 4: 248. doi:10.3389 / fimmu.2013.00248. PMC 3759294. PMID 24032031.
- ^ A b Zelensky AN, Gready JE (prosinec 2005). "Nadrodina domény typu lektinu typu C". FEBS J. 272 (24): 6179–217. doi:10.1111 / j.1742-4658.2005.05031.x. PMID 16336259.
- ^ C-typ + lektin v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
- ^ Drickamer K (říjen 1999). "Domény podobné lektinu typu C". Curr. Opin. Struct. Biol. 9 (5): 585–90. doi:10.1016 / S0959-440X (99) 00009-3. PMID 10508765.
- ^ Cambi A, Figdor C (květen 2009). „Nekróza: lektiny typu C snímají buněčnou smrt“. Curr. Biol. 19 (9): R375–8. doi:10.1016 / j.cub.2009.03.032. PMID 19439262. S2CID 17409821.
- ^ Drickamer K (1993). "Vývoj zvířecích lektinů závislých na Ca (2 +)". Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. Pokrok ve výzkumu nukleových kyselin a molekulární biologie. 45: 207–32. doi:10.1016 / S0079-6603 (08) 60870-3. ISBN 978-0-12-540045-9. PMID 8341801.
- ^ Drickamer K, Fadden AJ (2002). "Genomická analýza lektinů typu C". Biochem. Soc. Symp. 69 (69): 59–72. doi:10.1042 / bss0690059. PMID 12655774.
- ^ Khan, K. A .; McMurray, J. L .; Mohammed, F .; Bicknell, R. (2019). "Proteiny lektinové domény skupiny C typu 14 ve vaskulární biologii, rakovině a zánětu". FEBS Journal. 286 (17): 3299–3332. doi:10.1111 / febs.14985. PMC 6852297. PMID 31287944.
- ^ Receptory NK + buňky + podobné lektinu v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
externí odkazy
- Funkční glykomická brána, spolupráce mezi Konsorcium pro funkční glykomiku a Nature Publishing Group