Apolipoprotein B - Apolipoprotein B - Wikipedia
Apolipoprotein B (ApoB) je protein že u lidí je kódován APOB gen.
Funkce
Apolipoprotein B je primární apolipoprotein z chylomikrony, VLDL, IDL, a LDL částice (LDL - běžně známé pod nesprávné pojmenování "špatný cholesterol "při odkazu na oba srdeční choroba a cévní onemocnění obecně), který je odpovědný za přepravu Tlustý molekuly (lipidy ), počítaje v to cholesterol, kolem těla všem buňky ve všech papírové kapesníky. Zatímco všechny funkční role ApoB v LDL (a všech větších) částicích zůstávají poněkud nejasné, je to primární organizující protein (z celého komplexního obalu obklopujícího / přenášejícího molekuly tuku uvnitř) částice a je nezbytně nutný pro tvorbu těchto částic. Rovněž je jasné, že ApoB na částice LDL působí jako a ligand pro receptory LDL v různých buňkách celého těla (tj. méně formálně ApoB naznačuje, že částice nesoucí tuky jsou připraveny vstoupit do libovolných buněk s receptory ApoB a dodávat tuky nesen dovnitř do buněk).
Prostřednictvím mechanismů, které jsou jen částečně pochopeny, jsou vysoké hladiny ApoB, zvláště spojené s vyššími koncentracemi částic LDL, hlavním hnacím motorem plakety ta příčina cévní onemocnění (ateroskleróza ), obvykle první zjevně symptomatické tak jako srdeční choroba, mrtvice & mnoho dalších komplikací celého těla po desetiletích progrese. Existují značné důkazy o koncentracích ApoB[5][6] a zejména NMR test[7] (specifické pro koncentrace LDL-částic) jsou vynikajícími indikátory fyziologie řízení cévních / srdečních onemocnění než buď celkový cholesterol nebo LDL-cholesterol (pokud jsou podporovány NIH počátkem 70. let). Primárně však z historických důvodů nákladů / složitosti, cholesterolu a odhadů LDL-cholesterol výpočtem, zůstává nejčastěji podporovaným lipidovým testem na rizikový faktor aterosklerózy. ApoB se běžně měří pomocí imunotestů, jako je ELISA nebo nefelometrie. Rafinované a automatizované NMR metody umožňují rozdíly v měření mezi mnoha různými částicemi ApoB.
Genetické poruchy
Vysoká hladina ApoB souvisí se srdečními chorobami.Hypobetalipoproteinemie je genetická porucha které mohou být způsobeny mutací genu ApoB, APOB. Abetalipoproteinemie je obvykle způsobena mutací genu MTP, MTP.
Mutace v gen APOB100 může také způsobit familiární hypercholesterolemie, dědičná (autosomálně dominantní) forma metabolické poruchy Hypercholesterolemie.
Studie myší
Nejdůležitější informace týkající se myšího homologu ApoB, mApoB, pocházejí myš studie. Myši nadměrně exprimující mApoB mají zvýšené hladiny LDL „špatného cholesterolu“ a snížené hladiny HDL „dobrý cholesterol“.[8] Myši obsahující pouze jednu funkční kopii genu mApoB vykazují opačný účinek, jsou rezistentní vůči hypercholesterolemie. Myši neobsahující žádné funkční kopie genu nejsou životaschopné.[9]
Molekulární biologie
The protein se vyskytuje v plazma ve 2 hlavních izoformách, ApoB48 a ApoB100. První syntetizuje výhradně tenké střevo, druhý u játra.[10] ApoB-100 je největší ze skupiny proteinů apoB, která se skládá z 4563 aminokyselin.[10] Obě izoformy jsou kódovány pomocí APOB a jediným mRNA přepis větší než 16 kb. ApoB48 je generován, když a stop kodon (UAA) ve zbytku 2153 vytvořil Úpravy RNA. Zdá se, že existuje trans- působící tkáňově specifický sestřihový gen, který určuje, která izoforma se nakonec vytvoří.[Citace je zapotřebí ] Alternativně existují určité důkazy, že a cis- působící prvek několik tisíc bp upstream určuje, která izoforma se produkuje.[Citace je zapotřebí ]
Výsledkem úpravy RNA je, že ApoB48 a ApoB100 sdílejí společnou N-terminální sekvenci, ale ApoB48 postrádá C-terminál ApoB100 LDL receptor vazebná oblast. Ve skutečnosti je ApoB48 takzvaný, protože tvoří 48% sekvence pro ApoB100.
ApoB 48 je jedinečný protein pro chylomikrony z tenkého střeva. Poté, co byla většina lipidů v chylomikronu absorbována, ApoB48 se vrací do jater jako součást zbytku chylomikronu, kde je endocytován a degradován.
Klinický význam
Výhody
Role vrozeného imunitního systému
Lipoproteiny s velmi nízkou hustotou a lipoproteiny s nízkou hustotou zasahovat do snímání kvora systém, který zvyšuje regulaci genů potřebných pro invazivní Zlatý stafylokok infekce. Mechanismus antagonismu spočívá v navázání ApoB na a S. aureus autoinduktor feromon, zabraňující signalizaci přes jeho receptor. Myši s nedostatkem ApoB jsou náchylnější k invazivní bakteriální infekci.[11]
Nepříznivé účinky
Role v inzulínové rezistenci
Nadprodukce apolipoproteinu B může vést k lipidům stres endoplazmatického retikula a rezistence na inzulín v játrech.[12]
Úloha lipoproteinů a aterosklerózy
ApoB100 se nachází v lipoproteiny pocházející z jater (VLDL, IDL, LDL[13]). Důležité je, že na jeden lipoprotein odvozený od jater existuje jedna molekula ApoB100. Z tohoto důvodu lze tedy kvantifikovat číslo lipoproteinových částic zaznamenáním celkové koncentrace ApoB100 v oběhu. Protože na jednu částici je jeden a pouze jeden ApoB100, počet částic se odráží v koncentraci ApoB100. Stejná technika může být aplikována na jednotlivé třídy lipoproteinů (např.LDL) a tím umožňuje jednu počet také je.
Je dobře známo, že jsou spojeny úrovně ApoB100 ischemická choroba srdeční, jsou jeho mnohem lepším prediktorem než koncentrace LDL-C.[14][15] Důvod: LDL-C neodráží skutečné koncentrace částic a cholesterol se nemůže rozpustit nebo pohybovat (ve vodě) bez částic, které by jej mohly přenášet. Jednoduchým způsobem, jak pochopit toto pozorování, je skutečnost, že ApoB100, jeden na částici, odráží skutečnou koncentraci lipoproteinových částic (nezávisle na jejich cholesterolu nebo jiném obsahu lipidů). Tímto způsobem lze pochopit, že počet lipoproteinových částic obsahujících ApoB100, které mohou přenášet lipidy do stěn tepny, je klíčovým determinantem, hybatelem aterosklerózy a srdečních onemocnění.
Jedním ze způsobů, jak vysvětlit výše uvedené, je zvážit, že velké množství lipoproteinových částic, a zejména velké množství LDL částic, vede ke kompetici na ApoB100 receptoru (tj. LDL receptoru) periferních buněk. Protože taková konkurence prodlouží dobu setrvání částic LDL v oběhu, může to vést k větší příležitosti k jejich podstoupení oxidace a / nebo jiné chemické úpravy. Takové modifikace mohou snížit schopnost částic být vyčištěny klasickým LDL receptorem a / nebo zvýšit jejich schopnost interakce s takzvanými „scavenger“ receptory. Čistým výsledkem je posun LDL částic k těmto zachycovacím receptorům. Scavenger receptory se obvykle nacházejí na makrofágy, přičemž makrofágy plné cholesterolu jsou lépe známé jako „pěnové články ". Pěnové buňky charakterizují aterosklerotické léze. Kromě tohoto možného mechanismu tvorby pěnových buněk může zvýšení hladin chemicky modifikovaných částic LDL také vést ke zvýšení endoteliální poškození. K tomu dochází v důsledku toxického účinku modifikovaného LDL na vaskulární endotel i jeho schopnosti jak získávat imunitní efektorové buňky, tak podporovat destička aktivace.
Studie INTERHEART zjistila, že poměr ApoB100 / ApoA1 je u pacientů s akutním infarktem myokardu při predikci rizika srdečního infarktu účinnější než samotné měření ApoB100 nebo ApoA1.[16] (ApoA1 je hlavním proteinem HDL.[17]) V obecné populaci to zůstává nejasné, i když v nedávné studii byl ApoB nejsilnějším ukazatelem rizika kardiovaskulárních příhod.[18] Malá studie naznačuje, že přidáno do fluvastatin léčba, omega 3 mastné kyseliny denně, obsahující 460 mg E-EPA a 380 mg E-DHA (ethylestery), může snížit ApoB48 u hyperlipemických diabetiků typu 2.[19]
Interakce
ApoB bylo prokázáno komunikovat s apo (a),[20] PPIB,[21] Kalcitoninový receptor[21][22] a HSP90B1.[21][22] Interakce ApoB s proteoglykany, kolagen, a fibronektin věří se, že to způsobuje ateroskleróza.[23][24]
Interaktivní mapa cest
Kliknutím na geny, proteiny a metabolity níže můžete odkazovat na příslušné články. [§ 1]
- ^ Interaktivní mapu cest lze upravit na WikiPathways: „Statin_Pathway_WP430“.
Nařízení
The výraz z APOB upravuje cis-regulační prvky v APOB 5 ′ UTR a 3 'UTR.[25]
Úpravy RNA
The mRNA tohoto proteinu podléhá Cytidin na Uridin (C až U) specifické pro daný web Úpravy RNA. ApoB100 a ApoB48 jsou kódovány stejným genem, rozdíly v přeložených proteinech však nejsou způsobeny alternativním sestřihem, ale důsledkem tkáňové specifické úpravy RNA. Úpravy mRNA v ApoB byly prvním příkladem úpravy pozorované u obratlovců.[26] K úpravám mRNA ApoB dochází ve všech placentární savci.[27] K úpravám dochází po transkripci jako rodící se polynukleotidy neobsahují upravené nukleosidy.[28]
Typ
Úpravy C až U mRNA ApoB vyžadují editační komplex nebo holoenzym (editosom) sestávající z enzymu upravujícího C až U Enzym pro úpravu mRNA apolipoproteinu B, katalytický polypeptid 1 (ApoBEC-1) a další pomocné faktory. ApoBEC-1 je protein, který je u lidí kódován APOBEC1 gen.[29][1] Je členem cytidindeamináza rodina. Samotný ApoBEC-1 není dostatečný pro úpravu mRNA ApoB [30] a vyžaduje alespoň jeden z těchto pomocných faktorů, Faktor doplňování APOBEC1 (A1CF)[31] aby došlo k úpravám. A1CF obsahuje 3 neidentické opakování. Působí jako podjednotka vázající RNA a směruje ApoBEC-1 na ApoB mRNA po směru od upraveného cytidinu.[32] O dalších pomocných faktorech je známo, že jsou součástí holoenzymu. Některé z těchto proteinů byly identifikovány. jedná se o protein vázající CUG 2 (CUGBP2 ),[33] SYNCRIP (protein vázající RNA bohatý na glycin-arginin-tyrosin, GRY-RBP),[34] heterogenní jaderný ribonukleoprotein (hnRNP) -C1,[35] ApoBEC-1 vazebný protein (ABBP) 1, ABBP2,[36] Regulační vazebný protein typu KH sestřihu (KSRP), anthogen 4 spojený s Bcl-2 (BAG4),[37] a pomocný faktor (AUX) 240.[38] Všechny tyto proteiny byly identifikovány pomocí detekčních testů a bylo prokázáno, že interagují buď s ApoBEC-1, A1CF nebo ApoB RNA. Funkce těchto pomocných proteinů v editačním komplexu nejsou známy. Kromě úpravy mRNA ApoB upravuje upravující ApoBEC-1 také mRNA NF1. mRNA editace ApoB mRNA je nejlépe definovaným příkladem tohoto typu editace C až U RNA u lidí.
Umístění
Navzdory tomu, že jde o transkript dlouhý 14 000 zbytků, je zaměřen na editaci jediný cytidin. V mRNA ApoB se nachází sekvence skládající se z 26 nukleotidů nezbytných pro editaci. Toto se nazývá editační motiv. U těchto nukleotidů (6662–6 687) bylo stanoveno, že jsou nezbytné místně specifickými experimenty s mutagenezí.[39] 11 nukleotidová část této sekvence 4–5 nukleotidů po směru od místa úpravy je důležitá oblast známá jako kotvící sekvence.[40] Oblast zvaná spacer element se nachází 2–8 nukleotidů mezi upraveným nukleosidem a touto kotevní sekvencí.[41] Existuje také regulační posloupnost 3 'na stránce úprav. Předpokládá se, že aktivní místo ApoBEC-1, katalytická složka editačního holoenzymu, se váže na oblast bohaté na AU kotvící sekvence pomocí ACF při vázání komplexu na mRNA.[42]Upravený cytidinový zbytek je lokalizován na nukleotidu 6666 umístěném v exonu 26 genu. Úpravy na tomto místě vedou ke změně kodonu z glutaminového kodonu (CAA) na stopový kodon inframe (UAA).[26] Počítačové modelování zjistilo, že k úpravám dochází, upravený cytidin je umístěn ve smyčce.[40] Výběr upraveného cytidinu také velmi závisí na této sekundární struktuře okolní RNA. Existují také určité náznaky, že tato oblast smyčky je vytvořena mezi kotvící sekvencí a 3 'regulační oblastí ApoB mRNA.[43] Předpokládá se, že predikovaná sekundární struktura tvořená mRNA ApoB umožňuje kontakt mezi zbytkem, který má být editován, a aktivním místem APOBEC1, jakož i vazbu ACF a dalších pomocných faktorů spojených s editosomem.
Nařízení
Úpravy mRNA ApoB u lidí jsou regulovány tkáněmi, přičemž ApoB48 je hlavním proteinem ApoB tenkého střeva u lidí. Vyskytuje se v menším množství v tlustém střevě, ledvinách a žaludku spolu s neupravenou verzí.[44]Úpravy jsou také vývojově regulovány, přičemž neupravená verze se překládá pouze na začátku vývoje, ale upravená forma se zvyšuje během vývoje v tkáních, kde může dojít k úpravám.[45][46]Bylo prokázáno, že editační hladiny mRNA ApoB se liší v reakci na změny ve stravě. vystavení alkoholu a hladinám hormonů.[47][48][49]
Zachování
K úpravám mRNA ApoB dochází také u myší a potkanů. Na rozdíl od lidí dochází k úpravám v játrech u myší a potkanů až na frekvenci 65%.[50] Nebylo pozorováno u ptáků ani u menších druhů.[51]
Důsledky
Struktura
Úpravy vedou ke změně kodonu a vytvoření stop kodonu v rámci, který vede k translaci zkráceného proteinu ApoB48. Tento stop kodon vede k translaci proteinu, kterému chybí karboxylový konec, který obsahuje vazebnou doménu proteinu LDLR. Plný protein ApoB100, který má téměř 4500 aminokyselin, je přítomen ve VLDL a LDL. Protože mnoho částí ApoB100 je v amfipatickém stavu, struktura některých jeho domén závisí na základních lipidových podmínkách. Je však známo, že mají stejné celkové skládání v LDL majícím pět hlavních domén. Nedávno byla pomocí kryoelektronové mikroskopie s rozlišením 16 Angstrom nalezena první struktura LDL při teplotě lidského těla v nativním stavu.[52] Bylo potvrzeno celkové složení ApoB-100 a byla zmapována určitá heterogenita v místní struktuře jeho domén.
Funkce
Úpravy jsou omezeny na přepisy vyjádřené v souboru tenké střevo. Tato kratší verze proteinu má funkci specifickou pro tenké střevo. Hlavní funkce celé délky játra exprimovaný ApoB100 je jako ligand pro aktivaci LDL-R. Úpravy však vedou k tomu, že protein postrádá tuto oblast vazby LDL-R proteinu. To mění funkci proteinu a kratšího proteinu ApoB48 jako specifické funkce ve vztahu k tenkému střevu. ApoB48 je identický s aminoterminálním 48% ApoB100.[53] Funkce této izoformy spočívá v absorpci tuků v tenkém střevě a podílí se na syntéze, shromažďování a sekreci chylomikrony. Tyto chylomikrony transportují dietní lipidy do tkání, zatímco zbývající chylomikrony spolu s přidruženými reziduálními lipidy jsou za 2-3 hodiny absorbovány játry prostřednictvím interakce apolipoprotein E. (ApoE) s lipoproteinovými receptory. Jedná se o dominantní protein ApoB v tenkém střevě většiny savců. Je klíčovým proteinem v exogenní cestě metabolismu lipoproteinů. Střevní proteiny obsahující ApoB48 se metabolizují na zbytky chylomikronu, které jsou přijímány zbytky receptorů.
Viz také
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000084674 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020609 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Lim JS, Lee DH, Park JY, Jin SH, Jacobs DR (2011). „Spolehlivost měření lipoproteinového cholesterolu s nízkou hustotou, lipoproteinového cholesterolu s vysokou hustotou a měření apolipoproteinu B“. Journal of Clinical Lipidology. 5 (4): 264–272. doi:10.1016 / j.jacl.2011.05.004. PMID 21784371.
- ^ Jacobson TA (2011). „Otevření nového lipidového„ apocary “: začlenění apolipoproteinů jako potenciálních rizikových faktorů a cílů léčby ke snížení kardiovaskulárního rizika“. Mayo Clinic Proceedings. 86 (8): 762–780. doi:10,4065 / mcp.2011.0128. PMC 3146376. PMID 21803958.
- ^ Carmena R, Duriez P, Fruchart JC (2004). „Ateroskleróza: vývoj vaskulární biologie a klinické důsledky“. Oběh. 109 (23): III – 2. doi:10.1161 / 01.CIR.0000131511.50734.44. PMID 15198959.
- ^
McCormick SP, Ng JK, Véniant M, Borén J, Pierotti V, Flynn LM, Grass DS, Young SG (1996). „Transgenní myši, které nadměrně exprimují myší apolipoprotein B. Důkaz, že sekvence DNA kontrolující intestinální expresi genu pro apolipoprotein B jsou vzdálené od strukturního genu“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (20): 11963–11970. doi:10.1074 / jbc.271.20.11963. PMID 8662599. - ^ Farese RV, Ruland SL, Flynn LM, Stokowski RP, Young SG (1995). „Vyřazení genu myšího apolipoproteinu B má za následek embryonální letalitu u homozygotů a ochranu před hypercholesterolemií vyvolanou dietou u heterozygotů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (5): 1774–1778. Bibcode:1995PNAS ... 92.1774F. doi:10.1073 / pnas.92.5.1774. PMC 42602. PMID 7878058.
- ^ A b Chen SH, Yang CY, Chen PF, Setzer D, Tanimura M, Li WH, Gotto AM Jr, Chan L (1986). „Kompletní cDNA a aminokyselinová sekvence lidského apolipoproteinu B-100“. Journal of Biological Chemistry. 261 (28): 12918–12921. PMID 3759943.
- ^ Peterson MM, Mack JL, Hall PR, Alsup AA, Alexander SM, Sully EK, Sawires YS, Cheung AL, Otto M, Gresham HD (2008). „Apolipoprotein B je vrozenou bariérou proti invazivní infekci Staphylococcus aureus“. Mobilní hostitel a mikrob. 4 (6): 507–509. doi:10.1016 / j.chom.2008.10.001. PMC 2639768. PMID 19064256.
- ^ Su Q, Tsai J, Xu E, Qiu W, Bereczki E, Santha M, Adeli K (2009). „Apolipoprotein B100 působí jako molekulární vazba mezi stresem endoplazmatického retikula vyvolaným lipidy a jaterní rezistencí“. Hepatologie. 50 (1): 77–84. doi:10,1002 / hep. 22960. PMID 19434737. S2CID 205869807.
- ^ Encyklopedie MedlinePlus: Apolipoprotein B100
- ^ Cromwell WC, Otvos JD, Keyes MJ, Pencina MJ, Sullivan L, Vasan RS, Wilson PW, D'Agostino RB (prosinec 2007). „Počet částic LDL a riziko budoucích kardiovaskulárních chorob ve studii o potomcích ve Framinghamu - důsledky pro řízení LDL“. Journal of Clinical Lipidology. 1 (6): 583–592. doi:10.1016 / j.jacl.2007.10.001. PMC 2720529. PMID 19657464.
- ^ Sniderman AD, Lamarche B, Contois JH, de Graaf J (prosinec 2014). „Diskordanční analýza a gordiánský uzel LDL a non-HDL cholesterolu versus apoB“. Aktuální názor na lipidologii. 25 (6): 461–467. doi:10.1097 / MOL.0000000000000127. PMID 25340478. S2CID 23464159.
- ^ McQueen MJ, Hawken S, Wang X, Ounpuu S, Sniderman A, Probstfield J, Steyn K, Sanderson JE, Hasani M, Volkova E, Kazmi K, Yusuf S (červenec 2008). „Lipidy, lipoproteiny a apolipoproteiny jako rizikové markery infarktu myokardu v 52 zemích (studie INTERHEART): studie případové kontroly“. Lanceta. 372 (9634): 224–233. doi:10.1016 / S0140-6736 (08) 61076-4. PMID 18640459. S2CID 26567691.
- ^ van der Vorst EP (2020). „Lipoproteiny s vysokou hustotou a Apolipoprotein A1“. Obratlovci a bezobratlí respirační proteiny, lipoproteiny a další proteiny tělních tekutin. Subcelulární biochemie. 94. 399–420. doi:10.1007/978-3-030-41769-7_16. ISBN 978-3-030-41768-0. PMID 32189309.
- ^ Benn M, Nordestgaard BG, Jensen GB, Tybjaerg-Hansen A (2007). „Zlepšení predikce ischemické kardiovaskulární choroby u obecné populace s použitím apolipoproteinu B: Kodaňská městská studie srdce“. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 27 (3): 661–670. doi:10.1161 / 01.ATV.0000255580.73689.8e. PMID 17170368.
- ^ Valdivielso P, Rioja J, García-Arias C a kol. (Leden 2009) „Omega 3 mastné kyseliny indukují výrazné snížení apolipoproteinu B48 po přidání k fluvastatinu u pacientů s diabetem typu 2 a smíšenou hyperlipidemií: předběžná zpráva.“ Cardiovasc Diabetol. 8:1. Plný text zdarma
- ^ Malaguarnera M, Vacante M, Russo C, Malaguarnera G, Antic T, Malaguarnera L, Bella R, Pennisi G, Galvano F, Frigiola A (2013). „Lipoprotein (a) při kardiovaskulárních onemocněních“. BioMed Research International. 2013 (650989): 1–9. doi:10.1155/2013/650989. PMC 3591100. PMID 23484137.
- ^ A b C Zhang J, Herscovitz H (únor 2003). „Nascentní lipidovaný apolipoprotein B je transportován do Golgi jako neúplně složený meziprodukt, jak je zkoumáno jeho spojením se sítí molekulárních chaperonů endoplazmatického retikula, GRP94, ERp72, BiP, kalretikulin a cyklofilin B“. J. Biol. Chem. 278 (9): 7459–7468. doi:10,1074 / jbc.M207976200. PMID 12397072.
- ^ A b Linnik KM, Herscovitz H (srpen 1998). „Několik molekulárních chaperonů interaguje s apolipoproteinem B během jeho zrání. Síť chaperonů rezidentních v endoplazmatickém retikulu (ERp72, GRP94, kalretikulin a BiP) interaguje s apolipoproteinem b bez ohledu na jeho lipidační stav.“. J. Biol. Chem. 273 (33): 21368–21373. doi:10.1074 / jbc.273.33.21368. PMID 9694898.
- ^ Khalil MF, Wagner WD, Goldberg IJ (2004). „Lipoprotein (a) při kardiovaskulárních onemocněních“. Arterioskleróza, trombóza a vaskulární biologie. 24 (12): 2211–2218. doi:10.1161 / 01.ATV.0000147163.54024.70. PMID 15472124.
- ^ Tabas I, Williams KJ, Borén J (2007). „Zadržování subendoteliálních lipoproteinů jako iniciační proces u aterosklerózy: aktualizace a terapeutické důsledky“. Oběh. 116 (16): 1832–1844. doi:10.1161 / oběhaha.106.676890. PMID 17938300.
- ^ Pontrelli L, Sidiropoulos KG, Adeli K (2004). "Translační kontrola mRNA apolipoproteinu B: regulace prostřednictvím cis prvků v 5 'a 3' nepřekládaných oblastech". Biochemie. 43 (21): 6734–6744. doi:10.1021 / bi049887s. PMID 15157107.
- ^ A b Powell LM, Wallis SC, Pease RJ, Edwards YH, Knott TJ, Scott J (září 1987). „Nová forma zpracování tkáňově specifické RNA produkuje ve střevě apolipoprotein-B48“. Buňka. 50 (6): 831–840. doi:10.1016/0092-8674(87)90510-1. PMID 3621347. S2CID 37938313.
- ^ Fujino T, Navaratnam N, Jarmuz A, von Haeseler A, Scott J (červenec 1999). „Úpravy C → U mRNA apolipoproteinu B u vačnatců: identifikace a charakterizace APOBEC-1 z amerického vačice Monodelphus domestica“. Nucleic Acids Res. 27 (13): 2662–2671. doi:10.1093 / nar / 27.13.2662. PMC 148475. PMID 10373583.
- ^ Lau PP, Xiong WJ, Zhu HJ, Chen SH, Chan L (říjen 1991). „Úprava mRNA Apolipoproteinu B je intranukleární událost, ke které dochází posttranskripčně současně se sestřihem a polyadenylací“. J. Biol. Chem. 266 (30): 20550–20554. PMID 1939106.
- ^ „Archivovaná kopie“. Archivovány od originál dne 26. 7. 2011. Citováno 2011-02-24.CS1 maint: archivovaná kopie jako titul (odkaz)
- ^ Navaratnam N, Fujino T, Bayliss J, Jarmuz A, How A, Richardson N, Somasekaram A, Bhattacharya S, Carter C, Scott J (leden 1998). „Cytidindeamináza z Escherichia coli poskytuje molekulární model pro editaci ApoB RNA a mechanismus pro rozpoznávání RNA substrátu“. J. Mol. Biol. 275 (4): 695–714. doi:10.1006 / jmbi.1997.1506. PMID 9466941.
- ^ „Archivovaná kopie“. Archivovány od originál dne 26. 7. 2011. Citováno 2011-02-24.CS1 maint: archivovaná kopie jako titul (odkaz)
- ^ Blanc V, Kennedy S, Davidson NO (říjen 2003). „Nový signál pro lokalizaci jader v pomocné doméně komplementárního faktoru apobec-1 reguluje nukleocytoplazmatický import a pendlování“. J. Biol. Chem. 278 (42): 41198–41204. doi:10,1074 / jbc.M302951200. PMID 12896982.
- ^ Anant S, Henderson JO, Mukhopadhyay D, Navaratnam N, Kennedy S, Min J, Davidson NO (prosinec 2001). „Nová role proteinu vázajícího RNA CUGBP2 při editaci savčí RNA. CUGBP2 moduluje editaci mRNA apolipoproteinu B mRNA C na U interakcí s apobec-1 a A1CF, faktorem doplňování apobec-1“. J. Biol. Chem. 276 (50): 47338–47351. doi:10.1074 / jbc.M104911200. PMID 11577082.
- ^ Blanc V, Navaratnam N, Henderson JO, Anant S, Kennedy S, Jarmuz A, Scott J, Davidson NO (březen 2001). „Identifikace GRY-RBP jako proteinu vázajícího apolipoprotein B RNA, který interaguje s komplementačním faktorem apobec-1 i apobec-1 za účelem modulace úpravy C na U“. J. Biol. Chem. 276 (13): 10272–10283. doi:10,1074 / jbc.M006435200. PMID 11134005.
- ^ Greeve J, Lellek H, Rautenberg P, Greten H (1998). "Inhibice apolipoprotein B mRNA editační enzymový komplex pomocí hnRNP C1 proteinu a 40S hnRNP komplexů". Biol. Chem. 379 (8–9): 1063–1073. doi:10.1515 / bchm.1998.379.8-9.1063. PMID 9792439. S2CID 25911416.
- ^ Lau PP, Villanueva H, Kobayashi K, Nakamuta M, Chang BH, Chan L (prosinec 2001). „Protein DnaJ, protein vázající apobec-1-2, moduluje editaci mRNA apolipoproteinu B“. J. Biol. Chem. 276 (49): 46445–46452. doi:10,1074 / jbc.M109215200. PMID 11584023.
- ^ Lau PP, Chan L (prosinec 2003). "Zapojení chaperonového regulátoru, Bcl2-asociovaného athanogenu-4, do úpravy mRNA apolipoproteinu B". J. Biol. Chem. 278 (52): 52988–52996. doi:10,1074 / jbc.M310153200. PMID 14559896.
- ^ Schock D, Kuo SR, Steinburg MF, Bolognino M, Sparks JD, Sparks CE, Smith HC (únor 1996). „Pomocný faktor obsahující 240-kDa proteinový komplex se podílí na editaci RNA apolipoproteinu B“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93 (3): 1097–1102. Bibcode:1996PNAS ... 93.1097S. doi:10.1073 / pnas.93.3.1097. PMC 40037. PMID 8577721.
- ^ Davies MS, Wallis SC, Driscoll DM, Wynne JK, Williams GW, Powell LM, Scott J (srpen 1989). "Požadavky na sekvenci pro editaci RNA apolipoproteinu B v transfekovaných buňkách jaterního potkana". J. Biol. Chem. 264 (23): 13395–13398. PMID 2760026.
- ^ A b Shah RR, Knott TJ, Legros JE, Navaratnam N, Greeve JC, Scott J (září 1991). "Požadavky na sekvenci pro editaci mRNA apolipoproteinu B". J. Biol. Chem. 266 (25): 16301–16304. PMID 1885564.
- ^ Driscoll DM, Lakhe-Reddy S, Oleksa LM, Martinez D (prosinec 1993). "Indukce úpravy RNA na heterologních místech sekvencemi v mRNA apolipoproteinu B". Mol. Buňka. Biol. 13 (12): 7288–7294. doi:10.1128 / MCB.13.12.7288. PMC 364799. PMID 8246950.
- ^ Greeve J, Navaratnam N, Scott J (červenec 1991). „Charakterizace enzymu editujícího mRNA apolipoproteinu B: žádná podobnost s navrhovaným mechanismem editace RNA u kinetoplastidových prvoků“. Nucleic Acids Res. 19 (13): 3569–3576. doi:10.1093 / nar / 19.13.3569. PMC 328381. PMID 1649450.
- ^ Richardson N, Navaratnam N, Scott J (listopad 1998). „Sekundární struktura pro místo úpravy mRNA apolipoproteinu B. Au-vazebné proteiny interagují s kmenovou smyčkou“. J. Biol. Chem. 273 (48): 31707–31717. doi:10.1074 / jbc.273.48.31707. PMID 9822632.
- ^ Teng B, Verp M, Salomon J, Davidson NO (listopad 1990). „Úprava messengerové RNA Apolipoprotein B je vývojově regulovaná a široce exprimovaná v lidských tkáních“. J. Biol. Chem. 265 (33): 20616–20620. PMID 2243107.
- ^ Wu JH, Semenkovich CF, Chen SH, Li WH, Chan L (červenec 1990). "Editace mRNA Apolipoproteinu B. Validace citlivého testu a vývojové biologie editace RNA u krysy". J. Biol. Chem. 265 (21): 12312–12316. PMID 2373694.
- ^ Glickman RM, Rogers M, Glickman JN (červenec 1986). „Syntéza apolipoproteinu B lidskými játry a střevy in vitro“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83 (14): 5296–5300. Bibcode:1986PNAS ... 83,5296G. doi:10.1073 / pnas.83.14.5296. PMC 323938. PMID 3460091.
- ^ Baum CL, Teng BB, Davidson NO (listopad 1990). „Úprava messengerové RNA Apolipoprotein B v játrech potkana. Modulace nalačno a doplňování stravy s vysokým obsahem sacharidů“. J. Biol. Chem. 265 (31): 19263–19270. PMID 2229075.
- ^ Lau PP, Cahill DJ, Zhu HJ, Chan L (říjen 1995). "Ethanol moduluje úpravu mRNA apolipoproteinu B u krysy". J. Lipid Res. 36 (10): 2069–2078. PMID 8576634.
- ^ Chan L, Chang BH, Nakamuta M, Li WH, Smith LC (březen 1997). "Úpravy mRNA Apobec-1 a apolipoprotein B". Biochim. Biophys. Acta. 1345 (1): 11–26. doi:10.1016 / S0005-2760 (96) 00156-7. PMID 9084497.
- ^ Chan L (leden 1993). "Editace RNA: zkoumání jednoho módu s apolipoproteinem B mRNA". BioEssays. 15 (1): 33–41. doi:10,1002 / bies. 950150106. PMID 8466474. S2CID 314984.
- ^ Tarugi P, Albertazzi L, Nicolini S, Calandra S (březen 1990). „Absence apolipoproteinu B-48 u kuřat, Gallus domesticus“. J. Lipid Res. 31 (3): 417–427. PMID 2341807.
- ^ Kumar V, Butcher SJ, Öörni K, Engelhardt P, Heikkonen J, Kaski K, Ala-Korpela M, Kovanen PT (květen 2011). „Trojrozměrná kryoEM Rekonstrukce nativních částic LDL na rozlišení 16Å při fyziologické teplotě těla“. PLOS ONE. 6 (5): e18841. Bibcode:2011PLoSO ... 618841K. doi:10.1371 / journal.pone.0018841. PMC 3090388. PMID 21573056.
- ^ Knott TJ, Pease RJ, Powell LM, Wallis SC, Rall SC, Innerarity TL, Blackhart B, Taylor WH, Marcel Y, Milne R (1986). "Kompletní proteinová sekvence a identifikace strukturálních domén lidského apolipoproteinu B". Příroda. 323 (6090): 734–738. Bibcode:1986 Natur.323..734K. doi:10.1038 / 323734a0. PMID 3773997. S2CID 536926.
McCormick SP, Ng JK, Véniant M, Borén J, Pierotti V, Flynn LM, Grass DS, Young SG (1996). Další čtení
- Mahley RW, Innerarity TL, Rall SC, Weisgraber KH (1985). "Plazmatické lipoproteiny: struktura a funkce apolipoproteinu". J. Lipid Res. 25 (12): 1277–1294. PMID 6099394.
- Itakura H, Matsumoto A (1995). „[Apolipoprotein B]“. Nippon Rinsho. 52 (12): 3113–3118. PMID 7853698.
- Chumakova OS, Zateĭshchikov DA, Sidorenko BA (2006). „[Apolipoprotein B: struktura, funkce, genový polymorfismus a vztah k ateroskleróze]“. Kardiologiia. 45 (6): 43–55. PMID 16007035.
- Ye J (2007). „Spoléhání se na metabolické cesty cholesterolu hostitele pro životní cyklus viru hepatitidy C“. PLOS Pathog. 3 (8): e108. doi:10.1371 / journal.ppat.0030108. PMC 1959368. PMID 17784784.
externí odkazy
- Databáze úprav RNA (DARNED).
- Aplikovaný výzkum Apolipoproteinu-B
- Člověk APOB umístění genomu a APOB stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.