CUGBP2 - CUGBP2
CUGBP, člen rodiny podobný Elavovi 2, také známý jako Etr-3 je protein že u lidí je kódován CELF2 gen.[5][6][7]
Členy rodiny proteinů CELF / BRUNOL jsou Proteiny vázající RNA a obsahují dvě domény N-koncového rozpoznávacího motivu RNA (RRM), jednu C-koncovou RRM doménu a divergentní segment 160-230 aa mezi druhou a třetí RRM doménou. Členové této rodiny proteinů regulují pre-mRNA alternativní sestřih a mohou se také podílet na úpravách a překladech mRNA. Výsledkem alternativního sestřihu je několik variant přepisu kódujících různé izoformy.[7]
Interakce
Bylo prokázáno, že CUGBP2 komunikovat s A1CF.[8]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000048740 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002107 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Hwang DM, Hwang WS, Liew CC (březen 1995). „Jednoprůchodové sekvenování jednosměrné knihovny cDNA lidského fetálního srdce za účelem objevení nových genů kardiovaskulárního systému“. J Mol Cell Cardiol. 26 (10): 1329–33. doi:10.1006 / jmcc.1994.1151. PMID 7869393.
- ^ Lu X, Timchenko NA, Timchenko LT (březen 1999). „Srdeční protein typu Elav vázající RNA (ETR-3) se váže na opakování RNA CUG rozšířené v myotonické dystrofii“. Hum Mol Genet. 8 (1): 53–60. doi:10,1093 / hmg / 8,1,53. PMID 9887331.
- ^ A b „Entrez Gene: CELF2 CUGBP, člen rodiny podobný Elavovi 2“.
- ^ Anant, S; Henderson JO; Mukhopadhyay D; Navaratnam N; Kennedy S; Min J; Davidson N O (prosinec 2001). "Nová role proteinu vázajícího RNA CUGBP2 při editaci savčí RNA. CUGBP2 moduluje editaci mRNA apolipoproteinu B mRNA C na U interakcí s apobec-1 a ACF, faktorem doplňování apobec-1". J. Biol. Chem. Spojené státy. 276 (50): 47338–51. doi:10.1074 / jbc.M104911200. ISSN 0021-9258. PMID 11577082.
externí odkazy
- Člověk CELF2 umístění genomu a CELF2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Další čtení
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Choi DK, Ito T, Tsukahara F a kol. (1999). "Vývojově regulovaná exprese mNapor kódující apoptózou indukovaný protein vázající RNA typu ELAV". Gen. 237 (1): 135–42. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00312-1. PMID 10524244.
- Dobrý PJ, Chen Q, Warner SJ, Herring DC (2000). "Rodina lidských proteinů vázajících RNA související s translačním regulátorem Drosophila Bruno". J. Biol. Chem. 275 (37): 28583–92. doi:10,1074 / jbc.M003083200. PMID 10893231.
- Ladd AN, Charlet N, Cooper TA (2001). „Rodina CELF proteinů vázajících RNA je implikována v buněčně specifickém a vývojově regulovaném alternativním sestřihu“. Mol. Buňka. Biol. 21 (4): 1285–96. doi:10.1128 / MCB.21.4.1285-1296.2001. PMC 99581. PMID 11158314.
- Li D, Bachinski LL, Roberts R (2001). „Genomická organizace a tkáňová exprese specifická pro izoformu lidského NAPOR (CUGBP2) jako kandidátského genu pro familiární arytmogenní dysplázii pravé komory“. Genomika. 74 (3): 396–401. doi:10.1006 / geno.2001.6558. PMID 11414768.
- Anant S, Henderson JO, Mukhopadhyay D a kol. (2002). "Nová role proteinu vázajícího RNA CUGBP2 při editaci savčí RNA. CUGBP2 moduluje editaci mRNA apolipoproteinu B mRNA C na U interakcí s apobec-1 a ACF, faktorem doplňování apobec-1". J. Biol. Chem. 276 (50): 47338–51. doi:10.1074 / jbc.M104911200. PMID 11577082.
- Lichtner P, Attié-Bitach T, Schuffenhauer S a kol. (2003). „Expresní a mutační analýza BRUNOL3, kandidátského genu pro vývojové vady srdce a brzlíku spojené s parciální monosomií 10p“. J. Mol. Med. 80 (7): 431–42. doi:10.1007 / s00109-002-0331-9. PMID 12110949. S2CID 24098272.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Mukhopadhyay D, Houchen CW, Kennedy S a kol. (2003). „Spojená stabilizace mRNA a translační umlčení cyklooxygenázy-2 novým proteinem vázajícím RNA, CUGBP2“. Mol. Buňka. 11 (1): 113–26. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00012-1. PMID 12535526.
- Singh G, Charlet-B N, Han J, Cooper TA (2004). „Proteinové domény ETR-3 a CELF4 potřebné pro aktivitu vázání a sestřihu RNA in vivo“. Nucleic Acids Res. 32 (3): 1232–41. doi:10.1093 / nar / gkh275. PMC 373409. PMID 14973222.
- Mukhopadhyay D, Jung J, Murmu N a kol. (2004). „CUGBP2 hraje zásadní roli v apoptóze buněk rakoviny prsu v reakci na genotoxické poškození“. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1010: 504–9. Bibcode:2003NYASA1010..504M. doi:10.1196 / annals.1299.093. PMID 15033780. S2CID 38581539.
- Brandenberger R, Wei H, Zhang S a kol. (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
- Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M a kol. (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových regionech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
- Murmu N, Jung J, Mukhopadhyay D a kol. (2004). „Dynamický antagonismus mezi proteinem vázajícím RNA CUGBP2 a prostaglandinem E2 zprostředkovaným cyklooxygenázou-2 při radiačním poškození“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (38): 13873–8. Bibcode:2004PNAS..10113873M. doi:10.1073 / pnas.0406066101. PMC 518846. PMID 15358864.
- Han J, Cooper TA (2005). „Identifikace aktivačních a represivních domén CELF sestřih in vivo“. Nucleic Acids Res. 33 (9): 2769–80. doi:10.1093 / nar / gki561. PMC 1126903. PMID 15894795.
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- Lim J, Hao T, Shaw C a kol. (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
- Chen Z, Eggerman TL, Patterson AP (2007). „Úpravy mRNA ApoB jsou zprostředkovány koordinovanou modulací více složek enzymu upravujících mRNA apoB“. Dopoledne. J. Physiol. Gastrointest. Játra Physiol. 292 (1): G53–65. doi:10.1152 / ajpgi.00118.2006. PMID 16920700.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |