NDUFS1 - NDUFS1

NDUFS1
Identifikátory
AliasyNDUFS1, CI-75Kd, CI-75k, PRO1304, NADH: podjednotka jádra ubichinon oxidoreduktázy S1, MC1DN5
Externí IDOMIM: 157655 MGI: 2443241 HomoloGene: 3670 Genové karty: NDUFS1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 2 (lidský)
Chr.Chromozom 2 (lidský)[1]
Chromozom 2 (lidský)
Genomické umístění pro NDUFS1
Genomické umístění pro NDUFS1
Kapela2q33.3Start206,114,817 bp[1]
Konec206,159,509 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE NDUFS1 203039 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

4719

227197

Ensembl

ENSG00000023228
ENSG00000283447

ENSMUSG00000025968

UniProt

P28331

Q91VD9

RefSeq (mRNA)

NM_005006
NM_001199981
NM_001199982
NM_001199983
NM_001199984

NM_001160038
NM_001160039
NM_001160040
NM_145518

RefSeq (protein)

NP_001186910
NP_001186911
NP_001186912
NP_001186913
NP_004997

NP_001153510
NP_001153511
NP_001153512
NP_663493

Místo (UCSC)Chr 2: 206,11 - 206,16 MbChr 1: 63,14 - 63,18 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

NADH-ubichinon oxidoreduktáza 75 kDa podjednotka, mitochondriální (NDUFS1) je enzym že u lidí je kódován NDUFS1 gen.[5] Zakódováno protein, NDUFS1, je největší podjednotkou komplex I, který se nachází na vnitřní mitochondriální membrána, a je důležité pro mitochondriální oxidační fosforylace. Mutace v tomto genu jsou spojeny s nedostatkem komplexu I.[6]

Struktura

NDUFS1 se nachází na q rameno z chromozom 2 na pozici 33,3 a má 20 exony.[7] The NDUFS1 Gen produkuje 79,5 kDa protein složený z 727 aminokyseliny.[8][9] NDUFS1, protein kódovaný tímto genem, je členem rodiny podjednotek komplexu I75 kDa. Obsahuje a tranzitní peptid, 10 otáček, 19 beta vlákna, 27 alfa šroubovice, a kofaktor vazebná místa pro [2Fe-2S ] a [4Fe-4S ] shluky. Klastrové domény se skládají ze 79 aminokyselin typu 2Fe-2S ferredoxinu z pozic 30-108, 40 aminokyselin typu 4Fe-4S His (Cys) 3 ligovaného z pozic 108-147 a 57 aminokyselin 4Fe- 4S Mo / W bis-MGD typu z pozic 245-301.[10][11] Několik variant přepisu kódujících různé izoformy byly nalezeny pro tento gen.[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem patří do komplex I Rodina podjednotek 75 kDa. Savčí komplex I se skládá ze 45 různých podjednotek. Najde se na mitochondriální vnitřní membrána. Tento protein má NADH dehydrogenáza činnost a oxidoreduktáza aktivita. Přenáší elektrony z NADH do dýchací řetězec. Předpokládá se, že okamžitý akceptor elektronů pro enzym ubichinon. Tento protein je největší podjednotkou komplexu I a je součástí železo-síra (IP) fragment enzymu. Může tvořit část štěrbiny aktivního místa, kde je NADH oxidován.[6]

Klinický význam

Mutace v NDUFS1 geny jsou spojeny s deficitem mitochondriálního komplexu I, což je autosomálně recesivní. Tento nedostatek je nejčastějším enzymatickým defektem poruch oxidační fosforylace.[12][13] Nedostatek mitochondriálního komplexu I je extrémní genetická heterogenita a mohou být způsobeny mutací v genech kódovaných jaderně nebo v genech kódovaných mitochondriálně. Neexistují žádné zjevné genotyp-fenotyp korelace a odvození podkladu z klinické nebo biochemické prezentace je obtížné, ne-li nemožné.[14] Většina případů je však způsobena mutacemi v genech kódovaných jaderně.[15][16] Způsobuje širokou škálu klinických poruch, od smrtelných novorozeneckých onemocnění až po neurodegenerativní poruchy začínající u dospělých. Fenotypy zahrnují makrocefalie s progresivním leukodystrofie, nespecifické encefalopatie, Hypertrofické kardiomyopatie, myopatie, nemoc jater, Leighův syndrom, Leber dědičná optická neuropatie a některé formy Parkinsonova choroba.[17]

Interakce

Ukázalo se, že NDUFS1 má 124 binárních souborů interakce protein-protein včetně 110 společných interakcí. Zdá se, že NDUFS1 interaguje SOAT1, NDUFA9, HLA-B, ECE2, C1QTNF9, GPAA1, STOM, GDI1, ACAP2, EHBP1, MBOAT7, PRASATA.[18]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C ENSG00000283447 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000023228, ENSG00000283447 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025968 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Chow W, Ragan I, Robinson BH (listopad 1991). "Stanovení sekvence cDNA pro lidský mitochondriální 75-kDa Fe-S protein NADH-koenzym Q reduktázy". European Journal of Biochemistry. 201 (3): 547–50. doi:10.1111 / j.1432-1033.1991.tb16313.x. PMID  1935949.
  6. ^ A b C „Entrez Gene: NDUFS1 NADH dehydrogenáza (ubichinon) Fe-S protein 1, 75 kDa (NADH-koenzym Q reduktáza)“. Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
  7. ^ „Entrez Gene: Cytochrome c oxidase assembly factor 7 (putative)“. Citováno 2018-08-08. Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
  8. ^ Jao, Danieli. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. amino.heartproteome.org. Citováno 2018-08-27.
  9. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS a kol. (Říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  10. ^ „NDUFS1 - NADH-ubichinon oxidoreduktáza 75 kDa podjednotka, mitochondriální prekurzor - Homo sapiens (člověk) - gen a protein NDUFS1“. www.uniprot.org. Citováno 2018-08-27. Tento článek včlení text dostupný pod CC BY 4.0 licence.
  11. ^ „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  12. ^ Kirby DM, Salemi R, Sugiana C, Ohtake A, Parry L, Bell KM, Kirk EP, Boneh A, Taylor RW, Dahl HH, Ryan MT, Thorburn DR (září 2004). „NDUFS6 mutace jsou novou příčinou letálního deficitu neonatálního mitochondriálního komplexu I“. The Journal of Clinical Investigation. 114 (6): 837–45. doi:10,1172 / JCI20683. PMC  516258. PMID  15372108.
  13. ^ McFarland R, Kirby DM, Fowler KJ, Ohtake A, Ryan MT, Amor DJ, Fletcher JM, Dixon JW, Collins FA, Turnbull DM, Taylor RW, Thorburn DR (leden 2004). „De novo mutace v mitochondriálním genu ND3 jako příčina infantilní mitochondriální encefalopatie a deficitu komplexu I.“. Annals of Neurology. 55 (1): 58–64. doi:10,1002 / ana.10787. PMID  14705112. S2CID  21076359.
  14. ^ Haack TB, Haberberger B, Frisch EM, Wieland T, Iuso A, Gorza M, Strecker V, Graf E, Mayr JA, Herberg U, Hennermann JB, Klopstock T, Kuhn KA, Ahting U, Sperl W, Wilichowski E, Hoffmann GF , Tesarova M, Hansikova H, Zeman J, Plecko B, Zeviani M, Wittig I, Strom TM, Schuelke M, Freisinger P, Meitinger T, Prokisch H (duben 2012). „Molekulární diagnostika u deficitu mitochondriálního komplexu I pomocí sekvenování exomu“ (PDF). Journal of Medical Genetics. 49 (4): 277–83. doi:10.1136 / jmedgenet-2012-100846. PMID  22499348. S2CID  3177674.
  15. ^ Loeffen JL, Smeitink JA, Trijbels JM, Janssen AJ, Triepels RH, Sengers RC, van den Heuvel LP (2000). „Izolovaný nedostatek komplexu I u dětí: klinické, biochemické a genetické aspekty“. Lidská mutace. 15 (2): 123–34. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200002) 15: 2 <123 :: AID-HUMU1> 3.0.CO; 2-P. PMID  10649489.
  16. ^ Triepels RH, Van Den Heuvel LP, Trijbels JM, Smeitink JA (2001). "Nedostatek komplexu dýchacích řetězců I". American Journal of Medical Genetics. 106 (1): 37–45. doi:10,1002 / ajmg.1397. PMID  11579423.
  17. ^ Robinson BH (květen 1998). „Nedostatek lidského komplexu I: klinické spektrum a zapojení volných radikálů kyslíku do patogenity defektu“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bioenergetika. 1364 (2): 271–86. doi:10.1016 / s0005-2728 (98) 00033-4. PMID  9593934.
  18. ^ „Nalezeno 124 binárních interakcí pro hledaný výraz NDUFS1“. Databáze molekulárních interakcí IntAct. EMBL-EBI. Citováno 2018-08-25.

Další čtení

externí odkazy

  • Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P28331 (NADH-ubichinon oxidoreduktáza 75 kDa podjednotka, mitochondriální) na PDBe-KB.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.