Rodina glykosid hydrolázy 3 - Glycoside hydrolase family 3 - Wikipedia
| 3N terminální doména rodiny glykosylhydrolázy | |
|---|---|
| Identifikátory | |
| Symbol | Glyco_hydro_3 |
| Pfam | PF00933 |
| Pfam klan | CL0058 |
| InterPro | IPR001764 |
| STRÁNKA | PDOC00621 |
| SCOP2 | 1ex1 / Rozsah / SUPFAM |
| CAZy | GH3 |
| C-koncová doména rodiny glykosylhydrolázy 3 | |
|---|---|
 krystalová struktura ječmene isoenzymu beta-d-glukan glukohydrolázy exo1 | |
| Identifikátory | |
| Symbol | Glyco_hydro_3_C |
| Pfam | PF01915 |
| InterPro | IPR002772 |
| STRÁNKA | PDOC00621 |
| SCOP2 | 1ex1 / Rozsah / SUPFAM |
V molekulární biologii rodina glykosid hydrolázy 3 je rodina z glykosidové hydrolázy.
Glykosidové hydrolázy ES 3.2.1. jsou rozšířenou skupinou enzymů, které hydrolyzovat the glykosidová vazba mezi dvěma nebo více sacharidy nebo mezi sacharidovou a ne-sacharidovou skupinou. Klasifikační systém pro glykosidové hydrolázy, založený na podobnosti sekvencí, vedl k definici více než 100 různých rodin.[1][2][3] Tato klasifikace je k dispozici na internetu CAZy webová stránka,[4][5] a také diskutována na CAZypedii, online encyklopedii sacharidově aktivních enzymů.[6][7]
Rodina glykosid hydrolázy 3 CAZY GH_3 obsahuje enzymy s řadou známých aktivit; beta-glukosidáza (EC 3.2.1.21); beta-xylosidáza (ES 3.2.1.37 ); N-acetyl beta-glukosaminidáza (EC 3.2.1.52); glukan beta-1,3-glukosidáza (ES 3.2.1.58 ); cellodextrináza (ES 3.2.1.74 ); exo-1,3-1,4-glukanáza (ES 3.2.1 ). Tyto enzymy jsou dvoudoménové globulární proteiny, které jsou N-glykosylovaný na třech místech.[8]
externí odkazy
Reference
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (červenec 1995). „Zachovalý katalytický aparát a předpověď společného záhybu pro několik rodin glykosylových hydroláz“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. doi:10.1073 / pnas.92.15.7090. PMC 41477. PMID 7624375.
- ^ Davies G, Henrissat B (září 1995). "Struktury a mechanismy glykosylhydroláz". Struktura. 3 (9): 853–9. doi:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (červen 1996). „Aktualizace klasifikace glykosylhydroláz na základě sekvence“. The Biochemical Journal. 316 (Pt 2): 695–6. doi:10.1042 / bj3160695. PMC 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Domov". CAZy.org. Citováno 2018-03-06.
- ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (leden 2014). „Databáze enzymů aktivních ze sacharidů (CAZy) v roce 2013“. Výzkum nukleových kyselin. 42 (Problém s databází): D490–5. doi:10.1093 / nar / gkt1178. PMC 3965031. PMID 24270786.
- ^ „Glycoside Hydrolase Family 3“. CAZypedia.org. Citováno 2018-03-06.
- ^ Konsorcium CAZypedia (prosinec 2018). „Deset let CAZypedie: živá encyklopedie enzymů aktivních ze sacharidů“ (PDF). Glykobiologie. 28 (1): 3–8. doi:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Varghese JN, Hrmova M, Fincher GB (únor 1999). „Trojrozměrná struktura beta-D-glukanu exohydrolázy ječmene, rodiny 3 glykosylhydrolázy“. Struktura. 7 (2): 179–90. doi:10.1016 / S0969-2126 (99) 80024-0. PMID 10368285.
