Rodina glykosid hydrolázy 20 - Glycoside hydrolase family 20
| Glykosylhydroláza rodina 20, katalytická doména | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 divoký typ streptomyces plicatus beta-hexosaminidáza v komplexu s produktem (glcnac) | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Glyco_hydro_20 | ||||||||
| Pfam | PF00728 | ||||||||
| Pfam klan | CL0058 | ||||||||
| InterPro | IPR015883 | ||||||||
| SCOP2 | 1qba / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| CAZy | GH20 | ||||||||
| CDD | cd02742 | ||||||||
| |||||||||
| Glykosylhydroláza rodina 20, doména 2 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 krystalografická struktura lidské beta-hexosaminidázy a | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Glyco_hydro_20b | ||||||||
| Pfam | PF02838 | ||||||||
| InterPro | IPR015882 | ||||||||
| SCOP2 | 1qba / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| CAZy | GH20 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii rodina glykosidhydrolázy 20 je rodina z glykosidové hydrolázy.
Glykosidové hydrolázy ES 3.2.1. jsou rozšířenou skupinou enzymů, které hydrolyzovat the glykosidová vazba mezi dvěma nebo více sacharidy nebo mezi sacharidovou a ne-sacharidovou skupinou. Klasifikační systém pro glykosidové hydrolázy, založený na sekvenční podobnosti, vedl k definici> 100 různých rodin.[1][2][3] Tato klasifikace je k dispozici na internetu CAZy webová stránka,[4][5] a také diskutována na CAZypedii, online encyklopedii sacharidově aktivních enzymů.[6][7]
Rodina glykosid hydrolázy 20 CAZY GH_20 obsahuje enzymy s několika známými aktivitami; beta-hexosaminidáza (ES 3.2.1.52 ); lakto-N-biosidáza (ES 3.2.1.140 ). Karbonylový kyslík C-2 acetamidoskupiny substrátu působí jako katalytický nukleofil / báze v této rodině enzymů.
V mozek a další tkáně, beta-hexosaminidáza A degraduje GM2 gangliosidy; konkrétně enzym hydrolyzuje koncové neredukující N-acetyl-D-hexosaminové zbytky v N-acetyl-beta-D-hexosaminidech. Existují 3 formy beta-hexosaminidázy: hexosaminidáza A je a zastřihovač, s jedním alfa, jedním beta-A a jedním beta-B řetězcem; hexosaminidáza B je a tetramer dvou beta-A a dvou beta-B řetězců; a hexosaminidáza S je a homodimer alfa řetězců. Dva beta řetězce jsou odvozeny od štěpení prekurzoru. Mutace v beta-řetězci vedou k Sandhoffova choroba, porucha ukládání lysozomů charakterizovaná akumulací GM2 gangliozidu.[8]
Reference
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (červenec 1995). „Zachovalý katalytický aparát a předpověď společného záhybu pro několik rodin glykosylových hydroláz“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. doi:10.1073 / pnas.92.15.7090. PMC 41477. PMID 7624375.
- ^ Davies G, Henrissat B (září 1995). "Struktury a mechanismy glykosylhydroláz". Struktura. 3 (9): 853–9. doi:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (červen 1996). „Aktualizace klasifikace glykosylhydroláz na základě sekvence“. The Biochemical Journal. 316 (Pt 2): 695–6. doi:10.1042 / bj3160695. PMC 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Domov". CAZy.org. Citováno 2018-03-06.
- ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (leden 2014). „Databáze enzymů aktivních ze sacharidů (CAZy) v roce 2013“. Výzkum nukleových kyselin. 42 (Problém s databází): D490–5. doi:10.1093 / nar / gkt1178. PMC 3965031. PMID 24270786.
- ^ "Glycoside Hydrolase Family 20". CAZypedia.org. Citováno 2018-03-06.
- ^ Konsorcium CAZypedia (prosinec 2018). „Deset let CAZypedie: živá encyklopedie enzymů aktivních ze sacharidů“ (PDF). Glykobiologie. 28 (1): 3–8. doi:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Bolhuis PA, Ponne NJ, Bikker H, Baas F, Vianney de Jong JM (září 1993). „Molekulární základ dospělé formy Sandhoffovy choroby: náhrada glutaminu za arginin v poloze 505 beta řetězce beta-hexosaminidázy vede k labilnímu enzymu“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molekulární základ choroby. 1182 (2): 142–6. doi:10.1016 / 0925-4439 (93) 90134-m. PMID 8357844.
