CLEC4A - CLEC4A

CLEC4A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5B1W, 5B1X
Identifikátory
Aliasy	CLEC4A, CLECSF6, DCIR, DDB27, LLIR, CD367, HDCGC13P, rodina lektinových domén typu C, 4členná A
Externí ID	OMIM: 605306 MGI: 1349412 HomoloGene: 49291 Genové karty: CLEC4A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	8,138,607 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	123,143,999 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transmembránového signalizačního receptoru; • vázání sacharidů; • vazba iontů vápníku; • vazba manózy; • vazba kovových iontů;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • membrána;
Biologický proces	• signální dráha receptoru buněčného povrchu; • buněčná adheze; • stimulační signální dráha lektinového receptoru typu C; • adaptivní imunitní odpověď; • proces imunitního systému; • vrozený imunitní systém; • negativní regulace produkce cytokinů; • Zpracování a prezentace antigenu plazmacytoidních dendritických buněk; • negativní regulace produkce faktoru nekrózy nádorů; • Aktivace CD8-pozitivních alfa-beta T buněk; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy I.;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	50856
	26888
	ENSG00000111729
	ENSMUSG00000030148
	Q9UMR7
	Q9QZ15
	NM_016184; NM_194447; NM_194448; NM_194450
	NM_001170332; NM_001170333; NM_011999
	NP_057268; NP_919429; NP_919430; NP_919432
	NP_001163803; NP_001163804; NP_036129
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

4členná rodina domén lektinových typů typu C. je protein že u lidí je kódován CLEC4A gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena lektinu typu C / typu C. lektin superrodina podobná doméně (CTL / CTLD). Členové této rodiny sdílejí společný proteinový záhyb a mají různé funkce, jako je buněčná adheze, buněčná signalizace, glykoprotein obrat a role v zánět a imunitní odpověď. Zakódovaný transmembránový protein typu 2 může hrát roli při zánětlivé a imunitní odpovědi.

Více variant přepisu kódujících odlišně izoformy byly identifikovány pro tento gen. Tento gen je úzce spojen s dalšími členy nadčeledi CTL / CTLD na chromozomu 12p13 v oblasti komplexu přirozeného zabijáckého genu.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111729 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030148 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bates EE, Fournier N, Garcia E, Valladeau J, Durand I, Pin JJ, Zurawski SM, Patel S, Abrams JS, Lebecque S, Garrone P, Saeland S (září 1999). „APC exprimují DCIR, nový povrchový receptor lektinu typu C, který obsahuje inhibiční motiv na bázi imunoreceptoru na tyrosinu“. J. Immunol. 163 (4): 1973–83. PMID 10438934.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CLEC4A lektinová doména rodiny C typu 4, člen A“.

Další čtení

Drickamer K (1999). "Domény podobné lektinu typu C". Curr. Opin. Struct. Biol. 9 (5): 585–90. doi:10.1016 / S0959-440X (99) 00009-3. PMID 10508765.
Huang X, Yuan Z, Chen G a kol. (2001). "Klonování a charakterizace nového ITIM obsahujícího lektin-podobný imunoreceptor LLIR a jeho dvě varianty delece transmembránové oblasti". Biochem. Biophys. Res. Commun. 281 (1): 131–40. doi:10.1006 / bbrc.2001.4322. PMID 11178971.
Richard M, Veilleux P, Rouleau M a kol. (2002). „Expresní vzorec lektinu CLECSF6 nesoucího ITIM v neutrofilech naznačuje klíčovou roli při kontrole zánětu“. J. Leukoc. Biol. 71 (5): 871–80. PMID 11994513.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ebner S, Sharon N, Ben-Tal N (2003). „Evoluční analýza odhaluje kolektivní vlastnosti a specificitu u lektinu typu C a nadrodiny domén podobných lektinu“. Proteiny. 53 (1): 44–55. doi:10,1002 / prot. 10440. PMID 12945048. S2CID 30955198.
Richard M, Thibault N, Veilleux P a kol. (2003). „CLECSF6 (DCIR) nesoucí ITIM je v neutrofilech snížen modulací činidly aktivujícími neutrofily“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 310 (3): 767–73. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.09.077. PMID 14550269.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Richard M, Thibault N, Veilleux P a kol. (2006). „Faktor stimulující kolonie makrofágů kolonie granulocytů snižuje afinitu SHP-2 k ITIM CLECSF6 v neutrofilech: nový mechanismus účinku pro SHP-2“. Mol. Immunol. 43 (10): 1716–21. doi:10.1016 / j.molimm.2005.10.006. PMID 16360206.
Lorentzen JC, Flornes L, Eklöw C a kol. (2007). „Sdružení artritidy s genovým komplexem kódujícím receptory podobné lektinu typu C“. Artritida Rheum. 56 (8): 2620–32. doi:10,1002 / článek 22813. PMID 17665455.

externí odkazy

Člověk CLEC4A umístění genomu a CLEC4A stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111729 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030148 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10438934-5] Bates EE, Fournier N, Garcia E, Valladeau J, Durand I, Pin JJ, Zurawski SM, Patel S, Abrams JS, Lebecque S, Garrone P, Saeland S (září 1999). „APC exprimují DCIR, nový povrchový receptor lektinu typu C, který obsahuje inhibiční motiv na bázi imunoreceptoru na tyrosinu“. J. Immunol. 163 (4): 1973–83. PMID 10438934.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CLEC4A lektinová doména rodiny C typu 4, člen A“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]