CLEC1B - CLEC1B

CLEC1B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2C6U, 3WSR, 3 týdny
Identifikátory
Aliasy	CLEC1B, 1810061I13Rik, CLEC2, CLEC2B, PRO1384, QDED721, lektinová doména rodiny typu C 1 člen B
Externí ID	OMIM: 606783 MGI: 1913287 HomoloGene: 49468 Genové karty: CLEC1B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	10,013,424 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	129,409,335 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vázání sacharidů; • aktivita transmembránového signalizačního receptoru;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • membrána;
Biologický proces	• aktivace krevních destiček; • obranná reakce; • signální dráha receptoru buněčného povrchu; • tvorba krevních destiček; • signální transdukce fosforylací proteinů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51266
	56760
	ENSG00000165682
	ENSMUSG00000030159
	Q9P126
	Q9JL99
	NM_001099431; NM_016509
	NM_001204239; NM_001204253; NM_019985
	NP_001092901; NP_057593
	NP_001191168; NP_001191182; NP_064369
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Rodina lektinových domén typu C 1 člen B je protein že v lidé je kódován CLEC1B gen.^[5]^[6]^[7]

Buňky přirozeného zabíjení (NK) exprimují více vápník -závislé (typ C) lektin -jako receptory, jako CD94 (KLRD1; MIM 602894) a NKG2D (KLRC4; MIM 602893), které interagují s hlavním histokompatibilním komplexem třídy I molekuly a buď inhibovat nebo aktivovat cytotoxicita a cytokin vylučování. CLEC2 je receptor podobný lektinu typu C exprimovaný v myeloidní buňky a NK buňky. [dodává OMIM]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165682 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030159 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Colonna M, Samaridis J, Angman L (březen 2000). „Molekulární charakterizace dvou nových receptorů podobných lektinu typu C, z nichž jeden je selektivně exprimován v lidských dendritických buňkách“. Eur J Immunol. 30 (2): 697–704. doi:10.1002 / 1521-4141 (200002) 30: 2 <697 :: AID-IMMU697> 3.0.CO; 2-M. PMID 10671229.
^ Sobanov Y, Bernreiter A, Derdak S, Mechtcheriakova D, Schweighofer B, Duchler M, Kalthoff F, Hofer E (prosinec 2001). „Nová shluk genů receptoru podobných lektinu exprimovaný v monocytických, dendritických a endoteliálních buňkách se blíží genům receptoru NK v komplexu lidských genů NK“. Eur J Immunol. 31 (12): 3493–503. doi:10.1002 / 1521-4141 (200112) 31:12 <3493 :: AID-IMMU3493> 3.0.CO; 2-9. PMID 11745369.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CLEC1B lektinová doménová rodina typu C, člen B“.

externí odkazy

Člověk CLEC1B umístění genomu a CLEC1B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Člověk CLEC2B umístění genomu a CLEC2B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování vylučovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských vylučovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Suzuki-Inoue K, Fuller GL, García A a kol. (2006). "Nový mechanismus aktivace krevních destiček závislý na Syk receptorem lektinu typu CLEC-2 typu C". Krev. 107 (2): 542–9. doi:10.1182 / krev-2005-05-1994. PMID 16174766.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Watson AA, O'Callaghan CA (2006). "Krystalizace a rentgenová difrakční analýza lidského CLEC-2". Acta Crystallographica oddíl F. 61 (Pt 12): 1094–6. doi:10.1107 / S1744309105037991. PMC 1978148. PMID 16511244.
Scherer SE, Muzny DM, Buhay CJ a kol. (2006). „Hotová sekvence DNA lidského chromozomu 12“. Příroda. 440 (7082): 346–51. doi:10.1038 / nature04569. PMID 16541075.
Chaipan C, Soilleux EJ, Simpson P a kol. (2006). „DC-SIGN a CLEC-2 zprostředkovávají zachycení viru lidské imunodeficience typu 1 destičkami“. J. Virol. 80 (18): 8951–60. doi:10.1128 / JVI.00136-06. PMC 1563896. PMID 16940507.
Watson AA, Brown J, Harlos K a kol. (2007). „Krystalová struktura a mutační vazebná analýza extracelulární domény receptoru CLEC-2 aktivujícího destičky“. J. Biol. Chem. 282 (5): 3165–72. doi:10,1074 / jbc.M610383200. PMID 17132623.
Suzuki-Inoue K, Kato Y, Inoue O a kol. (2007). „Zapojení receptoru hadího toxinu CLEC-2 do aktivace krevních destiček zprostředkovanou podoplaninem rakovinnými buňkami“. J. Biol. Chem. 282 (36): 25993–6001. doi:10,1074 / jbc.M702327200. PMID 17616532.
Watson AA, Eble JA, O'Callaghan CA (2008). „Krystalová struktura rhodocytinu, ligandu pro receptor aktivující trombocyty CLEC-2“. Věda o bílkovinách. 17 (9): 1611–6. doi:10.1110 / ps.035568.108. PMC 2525532. PMID 18583525.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165682 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030159 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10671229-5] Colonna M, Samaridis J, Angman L (březen 2000). „Molekulární charakterizace dvou nových receptorů podobných lektinu typu C, z nichž jeden je selektivně exprimován v lidských dendritických buňkách“. Eur J Immunol. 30 (2): 697–704. doi:10.1002 / 1521-4141 (200002) 30: 2 <697 :: AID-IMMU697> 3.0.CO; 2-M. PMID 10671229.

[pmid11745369-6] Sobanov Y, Bernreiter A, Derdak S, Mechtcheriakova D, Schweighofer B, Duchler M, Kalthoff F, Hofer E (prosinec 2001). „Nová shluk genů receptoru podobných lektinu exprimovaný v monocytických, dendritických a endoteliálních buňkách se blíží genům receptoru NK v komplexu lidských genů NK“. Eur J Immunol. 31 (12): 3493–503. doi:10.1002 / 1521-4141 (200112) 31:12 <3493 :: AID-IMMU3493> 3.0.CO; 2-9. PMID 11745369.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CLEC1B lektinová doménová rodina typu C, člen B“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]