CLEC1A - CLEC1A - Wikipedia

CLEC1A
Identifikátory
Aliasy	CLEC1A, CLEC-1, CLEC1, rodina lektinových domén typu C, 1 člen A
Externí ID	OMIM: 606782 MGI: 2444151 HomoloGene: 9549 Genové karty: CLEC1A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	10,111,627 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	129,452,000 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transmembránového signalizačního receptoru; • vázání sacharidů;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • integrální součást plazmatické membrány; • intracelulární; • membrána;
Biologický proces	• signální dráha receptoru buněčného povrchu; • obranná reakce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51267
	243653
	ENSG00000150048
	ENSMUSG00000033082
	Q8NC01
	Q8BWY2
	NM_001297748; NM_001297749; NM_001297750; NM_001297751; NM_016511
	NM_175526; NM_001347475
NP_001284677; NP_001284678; NP_001284679; NP_001284680; NP_057595;
	NP_001284677.1
	NP_001334404; NP_780735
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Rodina lektinových domén typu C 1 člen A je protein že u lidí je kódován CLEC1A gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje člena Lektin typu C / doména podobná lektinu typu C. (CTL / CTLD) nadčeleď. Členové této rodiny sdílejí společný proteinový záhyb a mají různé funkce, jako je buněčná adheze, buněčná signalizace, obrat glykoproteinů a role při zánětu a imunitní odpovědi. Kódovaný protein může hrát roli při regulaci funkce dendritických buněk. Byly popsány alternativní varianty sestřihu, ale jejich biologická povaha nebyla stanovena. Tento gen je úzce spojen s dalšími členy nadrodiny CTL / CTLD na chromozomu 12p13 v oblasti komplexu přirozeného zabijáckého genu.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150048 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033082 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Colonna M, Samaridis J, Angman L (březen 2000). „Molekulární charakterizace dvou nových receptorů podobných lektinu typu C, z nichž jeden je selektivně exprimován v lidských dendritických buňkách“. Eur J Immunol. 30 (2): 697–704. doi:10.1002 / 1521-4141 (200002) 30: 2 <697 :: AID-IMMU697> 3.0.CO; 2-M. PMID 10671229.
^ Sobanov Y, Bernreiter A, Derdak S, Mechtcheriakova D, Schweighofer B, Duchler M, Kalthoff F, Hofer E (prosinec 2001). „Nová shluk genů receptoru podobných lektinu exprimovaný v monocytických, dendritických a endoteliálních buňkách se blíží genům receptoru NK v komplexu lidských genů NK“. Eur J Immunol. 31 (12): 3493–503. doi:10.1002 / 1521-4141 (200112) 31:12 <3493 :: AID-IMMU3493> 3.0.CO; 2-9. PMID 11745369.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CLEC1A lektinová doména rodiny typu C 1, člen A“.

externí odkazy

Člověk CLEC1A umístění genomu a CLEC1A stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Drickamer K (1999). "Domény podobné lektinu typu C". Curr. Opin. Struct. Biol. 9 (5): 585–90. doi:10.1016 / S0959-440X (99) 00009-3. PMID 10508765.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ebner S, Sharon N, Ben-Tal N (2003). „Evoluční analýza odhaluje kolektivní vlastnosti a specificitu v lektinu typu C a nadrodině domén podobných lektinu“. Proteiny. 53 (1): 44–55. doi:10,1002 / prot. 10440. PMID 12945048. S2CID 30955198.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování sekretovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2007). "Signální sekvence a klíčové slovo trap in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA opatřených oligo". DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150048 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033082 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10671229-5] Colonna M, Samaridis J, Angman L (březen 2000). „Molekulární charakterizace dvou nových receptorů podobných lektinu typu C, z nichž jeden je selektivně exprimován v lidských dendritických buňkách“. Eur J Immunol. 30 (2): 697–704. doi:10.1002 / 1521-4141 (200002) 30: 2 <697 :: AID-IMMU697> 3.0.CO; 2-M. PMID 10671229.

[pmid11745369-6] Sobanov Y, Bernreiter A, Derdak S, Mechtcheriakova D, Schweighofer B, Duchler M, Kalthoff F, Hofer E (prosinec 2001). „Nová shluk genů receptoru podobných lektinu exprimovaný v monocytických, dendritických a endoteliálních buňkách se blíží genům receptoru NK v komplexu lidských genů NK“. Eur J Immunol. 31 (12): 3493–503. doi:10.1002 / 1521-4141 (200112) 31:12 <3493 :: AID-IMMU3493> 3.0.CO; 2-9. PMID 11745369.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CLEC1A lektinová doména rodiny typu C 1, člen A“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]