Lambda-karagenan - Lambda-carrageenase
| Lambda-karagenan | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 3.2.1.162 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Lambda-karagenan (ES 3.2.1.162, endo-beta-1,4-karagénóza 2,6,2'-trisulfát-hydroláza) je enzym který se porouchá a polysacharid nalezeno červeně mořské řasy, lambda-karagenan. Tento enzym byl nalezen pouze v mořské bakterie.[1][2]
Distribuce druhů
Byly nalezeny dvě bakterie, které produkují lambda-karagenan. Mořská bakterie Pseudoalteromonas carrageenovora (také známý jako Alteromonas carrageenovora) kmen ATCC 43555, který byl izolován z mořská voda v nové Skotsko a hluboké moře bakteriální izolovat Pseudoalteromonas sp. CL19, který byl izolován z a usazenina vzorek z Zátoka Suruga, Japonsko.[1][2][3]
Vlastnosti enzymu
U obou Alteromonas carrageenovora a Pseudoalteromonas sp. CL19, lambda-karagenanáza je kódována cglA gen. Produktem tohoto genu je a protein skládající se z 942 aminokyseliny, tento protein obsahuje 25 aminokyselin signální peptid.[1][2] Lambda-karagenan je nalezen jako a monomer. Je to optimální pH pro aktivitu je 7,0 a optimální teplota je 35 ° C. Enzym konkrétně hydrolyzuje lambda-karagenan a není aktivní proti iota- a kappa-karagenanům, agaróza nebo porfyr.[1]
Mechanismus účinku
Lambda-karagenanáza štěpí beta 1-4 glykosidové vazby v lineární páteři lambda-karagenanu. To má za následek vznik a tetrasacharid: alpha-D-Galp2,6S (2) - (1-> 3) -beta-D-Galp2S- (1-> 4) -alfa-D-Galp2,6S (2) - (1-> 3) - D-Galp2S. Tento enzym působí prostřednictvím jediného mechanismu vytěsňování a způsobuje inverze z anomerní konfigurace z Podklad.[1][2]
Reference
- ^ A b C d E Ohta Y, Hatada Y (říjen 2006). „Nový enzym, lambda-karagenanáza, izolovaný z hlubinné bakterie“. J. Biochem. 140 (4): 475–81. doi:10.1093 / jb / mvj180. PMID 16926183.
- ^ A b C d Guibet M, Colin S, Barbeyron T a kol. (Květen 2007). „Degradace lambda-karagenanu Pseudoalteromonas carrageenovora lambda-karagenanáza: nová rodina glykosidových hydroláz nesouvisejících s kappa- a iota-karagenázami“. Biochem. J. 404 (1): 105–14. doi:10.1042 / BJ20061359. PMC 1868830. PMID 17269933.
- ^ „Standardy LGC: Certifikované referenční materiály“.
