Katherine Pollard - Katherine Pollard

Katie Pollard
narozený
Katherine Snowden Pollard
Alma materPomona College (BA)
University of California, Berkeley (MS, PhD)
OceněníČlen ISCB (2020)
Vědecká kariéra
PoleEvoluční genomika
Funkční genomika[1]
InstituceGladstone Institutes
University of California, San Francisco
University of California, Davis
University of California, Santa Cruz
TezeVýpočtově náročné statistické metody pro analýzu údajů o genové expresi  (2003)
Doktorský poradceMark van der Laan[2]
VlivySandrine Dudoit
David Haussler
webová stránkaGladstone.org/lidé/ katherine-pollard Upravte to na Wikidata

Katherine Snowden Pollard je profesorem na Gladstone Institute z datová věda a biotechnologie na University of California, San Francisco (UCSF).[1][3][4] Byla oceněna Přátelství z Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii v roce 2020 za mimořádné příspěvky do výpočetní biologie a bioinformatika.[5][6]

Vzdělávání

Pollard získal titul B.A. z Pomona College a M.S. z University of California, Berkeley (UC Berkeley). Získala titul Ph.D. v roce 2003 od UC Berkeley pro výzkum pod dohledem Mark van der Laan.[7][2]

Kariéra a výzkum

Pollard je lídrem ve vývoji statistické modely a open-source software pro velká data, speciálně v genomika.[8][9] Pollard a její tým propagovali identifikaci nejrychleji se rozvíjejících oblastí EU lidský genom, známý jako lidské zrychlené oblasti (HARs).[10][11] Pollard také navrhl metody ke studiu lidský mikrobiom[12][13] a další mikrobiální společenství, tyto studie připravily půdu pro používání metagenomika v přesná medicína.

Před prací na UCSF držela a postdoktorský výzkum pozice s Sandrine Dudoit v Berkeley a pracoval s David Haussler v Santa Cruz.[10]

Reference

  1. ^ A b Katherine Pollard publikace indexované podle Google Scholar Upravte to na Wikidata
  2. ^ A b Katherine Pollard na Matematický genealogický projekt Upravte to na Wikidata
  3. ^ Katherine Pollard publikace od Evropa PubMed Central
  4. ^ Katherine Pollard publikace indexované indexem Scopus bibliografická databáze. (vyžadováno předplatné)
  5. ^ „Členové ISCB“. www.iscb.org.
  6. ^ „19. února 2020: ISCB blahopřeje a představuje třídu Fellows 2020!“. www.iscb.org.
  7. ^ Pollard, Katherine Snowden (2003). Výpočtově náročné statistické metody pro analýzu údajů o genové expresi. berkeley.edu (Disertační práce). University of California, Berkeley. OCLC  937442296. ProQuest  305339168.
  8. ^ Konsorcium pro sekvenování a analýzu šimpanzů (2005). "Počáteční sekvence šimpanzího genomu a srovnání s lidským genomem". Příroda. 437 (7055): 69–87. doi:10.1038 / nature04072. ISSN  0028-0836. PMID  16136131.
  9. ^ Pollard, K. S .; Hubisz, M. J .; Rosenbloom, K. R .; Siepel, A. (2009). „Detekce míry neutrální substituce na fylogenezích savců“. Výzkum genomu. 20 (1): 110–121. doi:10.1101 / gr.097857.109. ISSN  1088-9051. PMC  2798823. PMID  19858363.
  10. ^ A b Pollard KS, Salama SR, King B, Kern AD, Dreszer T, Katzman S, Siepel A, Pedersen JS, Bejerano G, Baertsch R, Rosenbloom KR, Kent J, Haussler D (2006). „Síly formující nejrychleji se rozvíjející oblasti v lidském genomu“. Genetika PLOS. 2 (10): e168. doi:10.1371 / journal.pgen.0020168. PMC  1599772. PMID  17040131.
  11. ^ Kostka D, Hubisz MJ, Siepel A, Pollard KS (2012). „Role konverze genů ovlivněných GC při formování nejrychleji se rozvíjejících oblastí lidského genomu“. Molekulární biologie a evoluce. 29 (3): 1047–57. doi:10.1093 / molbev / msr279. PMC  3278478. PMID  22075116.
  12. ^ Konsorcium projektu Human Microbiome Project (2012). „Struktura, funkce a rozmanitost zdravého lidského mikrobiomu“. Příroda. 486 (7402): 207–214. doi:10.1038 / příroda11234. ISSN  0028-0836. PMC  3564958. PMID  22699609.
  13. ^ Konsorcium projektu Human Microbiome Project (2012). „Rámec pro výzkum lidských mikrobiomů“. Příroda. 486 (7402): 215–221. doi:10.1038 / příroda11209. ISSN  0028-0836. PMC  3377744. PMID  22699610.