Sarah Teichmann - Sarah Teichmann

Sarah Teichmann

FRS FMedSci
Sarah Teichmann-ISMB2016 (28960321841).jpg
Sarah Teichmann hovořící na konferenci Inteligentní systémy pro molekulární biologii (ISMB) konference v roce 2016 v Orlando na Floridě
narozený
Sarah Amalia Teichmann

(1975-04-15) 15.dubna 1975 (věk 45)[1]
Karlsruhe, Německo
Národnost
  • Němec
  • americký[1]
  • britský
VzděláváníEvropská škola, Karlsruhe
Alma materUniverzita v Cambridge (BA, MA, PhD)
Děti2[2][3][4]
Ocenění
Vědecká kariéra
Pole
Instituce
TezeEvoluce genomu: analýza proteomů novými metodami  (1999)
Doktorský poradceCyrus Chothia[12][13]
DoktorandiM. Madan Babu[14]
Vlivy
webová stránkateichlab.org

Sarah Amalia Teichmann (narozen 1975)[1] FRS FMedSci[18] je vedoucí buněčná genetika na Wellcome Sanger Institute[19] a vedoucí hostující výzkumné skupiny v Evropský bioinformatický institut (EMBL-EBI).[20][12] Působí jako ředitelka výzkumu (ekvivalent profesora)[21] v Cavendishova laboratoř,[22] na Univerzita v Cambridge a senior výzkumný pracovník na Churchill College, Cambridge.[23][15]

Vzdělávání

Teichmann byl vzděláván u Evropská škola, Karlsruhe v Německu v letech 1981 až 1993, kde dokončila Evropská maturita v roce 1993.[24] Teichmann pokračoval ve studiu Přírodní vědy Tripos na Trinity College, Cambridge a byl oceněn a první třída Bakalář umění v roce 1996. V roce 1999 ji dokončila PhD kontrolován Cyrus Chothia[25] na Laboratoř molekulární biologie (LMB) zapnuto evoluce genomu.[26]

Kariéra a výzkum

Po jejím doktorátu to udělala Teichmann postdoktorský výzkum kontrolován Janet Thornton na University College London[20] a financováno z Beit Memorial Fellowships for Medical Research. V letech 2001–2012 byla Rada pro lékařský výzkum (MRC) Vedoucí programu, studium vzorců v proteinové interakce a transkripční regulační sítě.[27][28]

V roce 2013 byl Teichmann jmenován společnou pozicí v Wellcome Trust Sanger Institute a Evropský bioinformatický institut (EMBL-EBI). Od roku 2005 do roku 2015 působila jako učitel a ředitel studií na Trinity College, Cambridge. Od roku 2016 je Teichmann vedoucím buněčné genetiky na Wellcome Trust Sanger Institute[19] a vedoucí hostující výzkumné skupiny v EBI.[12]

Teichmannův výzkum[29][30][31][32] vyšetřuje genová exprese[33][34][35] a proteinový komplex shromáždění[36] pomocí obou mokrá laboratoř a výpočetní biologie techniky.[37] Zejména její výzkumná skupina:

... usiluje o objasnění principů evoluce proteinové struktury, vyššího řádu proteinová struktura a skládání bílkovin a principy, které tvoří základ a organizaci proteinového komplexu. Máme dlouhodobý zájem o porozumění genová exprese regulace a v našem wetlab v Sanger Institute používejte myš T pomocné buňky jako model diferenciace buněk.[38]

Teichmannův výzkum byl financován z Evropská rada pro výzkum (ERC) Rada pro lékařský výzkum (MRC) Rada pro výzkum v oblasti biotechnologií a biologických věd (BBSRC),[39] the Wellcome Trust, Evropská organizace pro molekulární biologii (EMBO) Rámcové programy pro výzkum a technologický rozvoj a Evropská spolupráce ve vědě a technologii (COST).[24]

Od roku 2015 Teichmann dohlížel na dokončení několika doktorandů[40][24] počítaje v to Madan Babu,[14] Varodom Charoensawa[41] Subhajyoti De[42] Jay Han,[43] Sarah Kay Kummerfeld[44][45] Tina Perica,[46] a Jing Su,[47] a několik postdoktorandští vědci kteří se stali Hlavní vyšetřovatelé (PI).[24][48][49][50]

Ocenění a vyznamenání

Teichmann získal řadu ocenění. V roce 2010 jí byla udělena Colworth medaile z Biochemická společnost.[51][52] V roce 2012 byl Teichman oceněn Medaile a přednáška Františka Cricka, členství v Evropská organizace pro molekulární biologii (EMBO)[7] a Listerovu cenu od Lister Institute of Preventive Medicine.[6] V roce 2015 jí byla udělena Cena Michaela a Kate Bárányových pro mladé vyšetřovatele Biofyzikální společnost[53] a Zlatá medaile EMBO. Teichmann byl zvolen a Člen Akademie lékařských věd (FMedSci) v roce 2015. Její citace týkající se voleb zní:

Sarah Teichmann je vedoucí výzkumné skupiny ve společnosti EMBL - Evropský institut pro bioinformatiku a za posledních 15 let významně přispěl k biologii. Zásadním objevem byla její práce definovat klíčové biofyzikální mechanismy při sestavování proteinových komplexů, což ukazuje, že proteinové komplexy se shromažďují odlišnými uspořádanými cestami. Ukázala, že tyto cesty sestavy jsou zachovány v evoluci a jak je lze předvídat z 3D struktury. Její databáze a metody výpočetní analýzy měly široký a hluboký dopad na komunitu. Představuje nové plemeno vědců na rozhraní mezi výpočetní a experimentální molekulární biologií.[18]

Teichmann byl také aktivistou pro kariéru žen ve vědě tím, že umožnil vědcům v rodinách rozvíjet svou kariéru při práci na částečný úvazek.[17] Předsedala Sex ve vědě debata ve Wellcome Trust o vyvážení rodinného života s prací ve výzkumu.[Citace je zapotřebí ] Teichmann byl zvolen Člen ISCB v roce 2016 Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii.[10]

V roce 2020 byl Teichmann uznán dne Časy 'Science Power List' pro její práci na Atlas lidských buněk[54] a zvolen a Člen Královské společnosti.[55] Získala Cena za volební právo v roce 2012.[51]

Osobní život

Teichmann má dvě dcery.[2][4] Teichmann je spoluautorem románu pro jazykové vzdělávání dětí Teenage Detectives,[56] kterou jako teenagerka napsala spolu se svou matkou Dr. Virginií Teichmannovou, lektorkou univerzity v angličtině Karlsruhe.[57]

Reference

  1. ^ A b C Teichmann, Sarah (2007). „Sarah Amalia Teichmann PhD MA BA (Hons cantab) CV“ (PDF). mrc-lmb.cam.ac.uk. Laboratoř molekulární biologie. Archivovány od originál (PDF) dne 26.02.2013.
  2. ^ A b Greenstreet, Rosanna (2018). „Sarah Teichmann:, Budím se už ve 4 hodiny ráno a myslím na práci'". theguardian.com. Londýn: Opatrovník.
  3. ^ A b Marx, Vivien (2014). "Autorský soubor: Janet Thornton". Přírodní metody. 11 (2): 115. doi:10.1038 / nmeth.2831. PMID  24645189. S2CID  1970327.
  4. ^ A b Bolest, Elisabeth (2015). "Využití výkonu počítače k ​​pochopení biologie". Věda. doi:10.1126 / science.caredit.a1500172.
  5. ^ Perica, Tina; Marsh, Joseph A .; Sousa, Filipa L .; Natan, Eviatar; Colwell, Lucy J .; Ahnert, Sebastian E .; Teichmann, Sarah A. (2012). „Vznik proteinových komplexů: kvartérní struktura, dynamika a allostery“. Transakce biochemické společnosti. 40 (3): 475–491. doi:10.1042 / BST20120056. PMID  22616857. S2CID  21452774.
  6. ^ A b „Dr. Sarah Teichmann, EMBL-European Bioinformatics Institute & Wellcome Trust Sanger Institute“. lister-institute.org.uk. Archivovány od originál dne 2014-10-15.
  7. ^ A b „Sarah A. Teichmann EBI, Cambridge (Hinxton), Velká Británie EMBO 2012“. Evropská organizace pro molekulární biologii. Archivovány od originál dne 19. 1. 2016.
  8. ^ „Hledání vzorů v genech a proteinech: dekódování logiky molekulárních interakcí“. královská společnost. 2012. Archivovány od originál dne 10.11.2012.
  9. ^ Hledání vzorů v genech a proteinech: dekódování logiky molekulárních interakcí na Youtube, královská společnost
  10. ^ A b Anon (2017). „Členové ISCB“. iscb.org. Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii. Archivovány od originál dne 2017-03-20.
  11. ^ Sarah Teichmann publikace indexované podle Google Scholar Upravte to na Wikidata
  12. ^ A b C „Lidé a skupiny: Sarah Teichmann, vedoucí skupiny - výzkumná skupina Teichmann“. EMBL-EBI. 2013. Archivovány od originál dne 3. 4. 2013.
  13. ^ Park, J; Teichmann, S.A.; Hubbard, T.; Chothia, C. (1997). "Mezilehlé sekvence zvyšují detekci homologie mezi sekvencemi". Journal of Molecular Biology. 273 (1): 349–54. doi:10.1006 / jmbi.1997.1288. PMID  9367767. S2CID  28606158.
  14. ^ A b Mohan, Madan Babu (2004). Vývoj transkripčních regulačních sítí. jisc.ac.uk (Disertační práce). Univerzita v Cambridge. OCLC  890159758. EThOS  uk.bl.ethos.616113.
  15. ^ A b C d E Dhillon, Paraminder; Teichmann, Sarah A. (2019). „V rozhovoru se Sarah Teichmannovou“. Časopis FEBS. 286 (8): 1445–1450. doi:10.1111 / febs.14806. ISSN  1742-464X. PMID  31012289.
  16. ^ Teichmann, S.A.; Rison, S. C .; Thornton, J. M.; Riley, M; Gough, J; Chothia, C. (2001). „Vývoj a strukturní anatomie metabolických drah malých molekul v Escherichia coli“. Journal of Molecular Biology. 311 (4): 693–708. CiteSeerX  10.1.1.121.1628. doi:10.1006 / jmbi.2001.4912. PMID  11518524.
  17. ^ A b Gaskell a Kostic (2015). „Nezastavitelná Sarah Teichmann o shromáždění komplexního programování, mateřství a bílkovin: vědec“. Buňka. Archivovány od originál dne 2016-04-15. Citováno 2015-11-25.
  18. ^ A b Anon (2015). „Dr. Sarah Teichmann FMedSci“. acmedsci.ac.uk. Londýn: Akademie lékařských věd. Archivovány od originál dne 06.07.2015.
  19. ^ A b „Dr. Sarah Teichmann, FMedSci, vedoucí buněčné genetiky“. Cambridge: sanger.ac.uk. Archivovány od originál dne 2016-04-15.
  20. ^ A b Marx, Vivien (2016). "Autorský soubor: Sarah Teichmann". Přírodní metody. 13 (4): 279. doi:10.1038 / nmeth.3808. ISSN  1548-7091. PMID  27203785. S2CID  205424792.
  21. ^ Anon (2013). „Pracovní pozice a povinnosti na University of Cambridge“. Univerzita v Cambridge. Archivovány od originál dne 03.07.2013.
  22. ^ Anon (2015). „Dr. Sarah Teichmann FMedSci“. tcm.phy.cam.ac.uk. Cambridge. Archivovány od originál dne 12. 9. 2015.
  23. ^ „Lidé - Churchill College“. www.chu.cam.ac.uk.
  24. ^ A b C d Anon (2015). „Sarah Teichmann: 40. FEBS Congress - The Biochemical Basis of Life - Berlin, Germany“. Federace evropských biochemických společností. Archivovány od originál dne 2015-02-20.
  25. ^ Chothia, C.; Gough, J; Vogel, C; Teichmann, S.A. (2003). „Vývoj proteinového repertoáru“. Věda. 300 (5626): 1701–3. Bibcode:2003Sci ... 300.1701C. doi:10.1126 / science.1085371. PMID  12805536. S2CID  27681885.
  26. ^ Teichmann, Sarah Amalia (1999). Evoluce genomu: analýza proteomů novými metodami (Disertační práce). Univerzita v Cambridge. OCLC  894602472. EThOS  uk.bl.ethos.624585.
  27. ^ Babu, M. M .; Luscombe, N. M .; Aravind, L; Gerstein, M; Teichmann, S.A. (2004). "Struktura a vývoj transkripčních regulačních sítí". Aktuální názor na strukturní biologii. 14 (3): 283–91. CiteSeerX  10.1.1.471.9692. doi:10.1016 / j.sbi.2004.05.004. PMID  15193307.
  28. ^ Luscombe, N. M .; Babu, M. M .; Yu, H; Snyder, M; Teichmann, S.A.; Gerstein, M (2004). „Genomická analýza dynamiky regulačních sítí odhaluje velké topologické změny“. Příroda. 431 (7006): 308–12. Bibcode:2004 Natur.431..308L. doi:10.1038 / nature02782. PMID  15372033. S2CID  4391278.
  29. ^ Sarah A. Teichmann stránka s profilem autora na ACM Digitální knihovna Upravte to na Wikidata
  30. ^ Sarah Teichmann na DBLP Bibliografický server Upravte to na Wikidata
  31. ^ Sarah Teichmann publikace indexované indexem Scopus bibliografická databáze. (vyžadováno předplatné)
  32. ^ Sarah Teichmann publikace od Evropa PubMed Central
  33. ^ Carninci, P; Kasukawa, T; Katayama, S; Gough, J; Frith, M. C .; Maeda, N; Oyama, R; Ravasi, T; Lenhard, B; Wells, C; Kodzius, R; Shimokawa, K; Bajic, V. B .; Brenner, S.E.; Batalov, S; Forrest, A. R .; Zavolan, M; Davis, M. J .; Wilming, L. G .; Aidinis, V; Allen, J. E .; Ambesi-Impiombato, A; Apweiler, R.; Aturaliya, R. N .; Bailey, T. L .; Bansal, M; Baxter, L; Beisel, K. W .; Bersano, T; et al. (2005). „Transkripční krajina savčího genomu“. Věda. 309 (5740): 1559–63. Bibcode:2005Sci ... 309.1559F. doi:10.1126 / science.1112014. PMID  16141072. S2CID  8712839.
  34. ^ Drosophila 12 Genomes, Consortium; Clark, A. G .; Eisen, M. B.; Smith, D. R.; Bergman, C. M .; Oliver, B; Markow, T. A .; Kaufman, T. C .; Kellis, M; Gelbart, W; Iyer, V. N .; Pollard, D. A .; Sackton, T. B .; Larracuente, A. M .; Singh, N. D .; Abad, J. P .; Abt, D. N .; Adryan, B; Aguade, M; Akashi, H; Anderson, W. W .; Aquadro, C. F .; Ardell, D. H .; Arguello, R; Artieri, C. G .; Barbash, D. A .; Barker, D; Barsanti, P; Batterham, P; et al. (2007). "Vývoj genů a genomů na fylogenezi Drosophila". Příroda. 450 (7167): 203–18. Bibcode:2007 Natur.450..203C. doi:10.1038 / nature06341. PMID  17994087.
  35. ^ Wilson, D; Charoensawan, V; Kummerfeld, S. K .; Teichmann, S.A. (2008). „DBD - taxonomically wide transcription factor predictions: New content and functionality“. Výzkum nukleových kyselin. 36 (Problém s databází): D88–92. doi:10,1093 / nar / gkm964. PMC  2238844. PMID  18073188.
  36. ^ Levy, E. D .; Teichmann, S (2013). "Strukturální, evoluční a montážní principy proteinové oligomerizace". Oligomerizace ve zdraví a nemocech. Pokrok v molekulární biologii a translační vědě. 117. s. 25–51. doi:10.1016 / B978-0-12-386931-9.00002-7. ISBN  9780123869319. PMID  23663964.
  37. ^ Perica, T; Kondo, Y; Tiwari, S. P .; McLaughlin, S. H .; Kemplen, K. R .; Zhang, X; Steward, A; Reuter, N; Clarke, J.; Teichmann, S.A. (2014). „Vývoj oligomerního stavu prostřednictvím alosterických drah, které napodobují vazbu ligandu“. Věda. 346 (6216): 1254346. doi:10.1126 / science.1254346. PMC  4337988. PMID  25525255.
  38. ^ „Teichmann group Research EMBL-EBI“. Evropský bioinformatický institut. 2013. Archivovány od originál dne 02.04.2013.
  39. ^ Anon (2015). „Granty britské vlády na výzkum uděleny Sarah Teichmannové“. Research Councils UK. Archivovány od originál dne 03.03.2015.
  40. ^ Teichmann, Sarah (2015). „Alumni from Sarah Teichmann's Group“. Evropský bioinformatický institut. Archivovány od originál dne 2015-02-20.
  41. ^ Charoensawan, Varodom (2011). Evoluce a dynamika transkripčních faktorů a vzorců genové exprese. ethos.bl.uk (Disertační práce). Univerzita v Cambridge. OCLC  890150091.
  42. ^ De, Subhajyoti (2008). Evoluce lidského genomu: zkoumání divergence proteinů, polymorfismů a genomického sousedství. ethos.bl.uk (Disertační práce). Univerzita v Cambridge. OCLC  890154864.
  43. ^ Han, Jay (2007). Struktura, funkce a vývoj interakcí protein-protein (Disertační práce). Univerzita v Cambridge.
  44. ^ Kummerfeld, Sarah Kay (2006). K porozumění proteinovému vesmíru: studie evoluce a regulace genů v měřítku genomu. ethos.bl.uk (Disertační práce). Univerzita v Cambridge.
  45. ^ Levy, Emmanuel Doram (2008). Klasifikace, vývoj a sestavování proteinových komplexů. ethos.bl.uk (Disertační práce). Univerzita v Cambridge.
  46. ^ Perica, Tina (2013). Evoluční a strukturální dynamika proteinových komplexů (Disertační práce). Univerzita v Cambridge. OCLC  890148231.
  47. ^ Su, Jing (2012). Výpočetní predikce regulačních prvků (Disertační práce). Univerzita v Cambridge.
  48. ^ Adryan, B; Teichmann, S.A. (2010). „Vývojová dynamika exprese transkripčních faktorů Drosophila melanogaster“. Genome Biology. 11 (4): R40. doi:10.1186 / gb-2010-11-4-r40. PMC  2884543. PMID  20384991.
  49. ^ Gsponer, J; Futschik, M. E .; Teichmann, S. A .; Babu, M. M. (2008). „Úzká regulace nestrukturovaných proteinů: Od syntézy transkriptů k degradaci proteinů“. Věda. 322 (5906): 1365–8. Bibcode:2008Sci ... 322.1365G. doi:10.1126 / science.1163581. PMC  2803065. PMID  19039133.
  50. ^ Hebenstreit, D; Gu, M; Haider, S; Turner, D. J .; Liò, P; Teichmann, S.A. (2011). „EpiChIP: Kvantifikace genů po genech úrovní epigenetické modifikace“. Výzkum nukleových kyselin. 39 (5): e27. doi:10.1093 / nar / gkq1226. PMC  3061070. PMID  21131282.
  51. ^ A b Anon (2012). „Čest a dědictví pro Sarah Teichmann“. Laboratoř molekulární biologie. Archivovány od originál dne 03.03.2015.CS1 maint: datum a rok (odkaz)
  52. ^ Anon (2015). „Ženy v Cambridge: Sarah Amalia Teichmann“. Univerzita v Cambridge. Archivovány od originál dne 2015-02-20.
  53. ^ „Příjemci ocenění Biofyzikální společnost za rok 2015“ (PDF). Biofyzikální společnost.
  54. ^ Franklin-Wallis, Oliver (23. května 2020). „Od pandemie k rakovině: seznam vědeckých zdrojů“. Časy. ISSN  0140-0460. Citováno 2020-05-26.
  55. ^ „Sarah Teichmann“. královská společnost. Citováno 20. září 2020.
  56. ^ Teichmann, Sarah; Teichmann, Virginie (1991). Cornelsen English Library - Beletrie: 8. Schuljahr, Stufe 1 - Teenage Detectives: Textheft. Mit Aufgaben und Činnosti. Německo: Cornelsen Verlag. ISBN  978-3464053362.
  57. ^ Anon. „The Honeycomb: Dr. Virginia Teichmann: Word Lover“ (PDF). expat-karlsruhe.com. Citováno 2015-12-07.