Andrej Šali - Andrej Šali
Andrej Šali | |
|---|---|
 Andrej Šali hovoří v ISMB 2012. | |
| Alma mater | Birkbeck College, University of London |
| Vědecká kariéra | |
| Instituce | University of California, San Francisco Harvardská Univerzita Rockefellerova univerzita Birkbeck College, University of London Univerzita v Lublani |
| Teze | Modelování trojrozměrné struktury proteinu z jeho aminokyselinové sekvence (1991) |
| Doktorský poradce | Tom Blundell |
| Pozoruhodné studenty | Ilya Vakser Roberto Sanchez Andras Fiser Bino John Maya Topf Francisco Melo SLEČNA. Madhusudhan Frank Alber Rachel Karchinová Dmitrij Korkin David Barkan |
| webová stránka | www |
Andrej Šali (narozen 1963, Kranj, Slovinsko ) je výpočetní struktura biolog. Od roku 2003 působí jako profesor na katedře bioinženýrství a terapeutických věd na Kalifornské univerzitě v San Francisku.[1] Působí také jako redaktor časopisu Struktura.
Vzdělávání
Šali přijal jeho Bakalář věd v oboru chemie z Univerzita v Lublani 1987; jeho Ph.D. v Molekulární biofyzika z Birkbeck College,[2] University of London, 1991 (práce s Tom Blundell ); a dělal postdoktorskou práci v Harvardská Univerzita (práce s Martin Karplus ).
Výzkum
Sali se připojil k fakultě Rockefellerova univerzita v roce 1995 po postdoktorandském výzkumu v Harvardská Univerzita. Používá výpočty založené na zákonech fyzika a vývoj studovat struktura a funkce bílkovin. Například se vyvinul srovnávací modelování proteinové struktury uspokojením prostorových omezení implementovaných v programu MODELÁŘ[3] a stanovení integrační struktury makromolekulárních sestav implementovaných v programu IMP.[4]
Dopad výzkumu
Sali významně přispívá ke strukturní biologii vývojem a používáním výpočetních metod pro strukturní modelování a analýzu proteinů. Mezi dva nejčastěji používané programy vyvinuté jeho výzkumnou skupinou patří MODELÁŘ pro srovnávací modelování struktury proteinů a IMP pro stanovení integrační struktury.
K červnu 2017 publikoval Šali přibližně 370 článků,[5] které byly citovány přibližně 56 000krát na Google Scholar. Jeho Hirschův index je 104 (tj. 104 publikací bylo citováno alespoň 104krát).
V roce 2018 byl Šali zvolen členem Národní akademie věd jako uznání jeho příspěvků k biofyzice a výpočetní biologii.[6]
Pozoruhodní absolventi ze Šali Lab
| název | Pozice laboratoře | Doba trvání | Současná pozice | Aktuální pozice |
|---|---|---|---|---|
| Frank Alber | Postdoktorandský kolega | University of California, Los Angeles, California, USA | Profesor | |
| Andras Fiser | Postdoktorandský kolega | Září 1997 až prosinec 2002 | Albert Einstein College of Medicine, Bronx, NY | Profesor |
| Rachel Karchinová | Postdoktorandský kolega | Od srpna 2003 do srpna 2006 | Univerzita Johna Hopkinse | Docent |
| Marc A. Marti-Renom | Postdoktorandský kolega Mimořádný odborný asistent | Února 1999 do června 2006 | Národní centrum pro genomickou analýzu (CNAG), Barcelona, Španělsko | Vůdce skupiny |
| SLEČNA. Madhusudhan | Postdoctoral Scholar | Února 2000 do března 2008 | IISER, Pune, Indie | Docent |
| David Barkan | Ph.D. Student | Září 2006 až říjen 2011 | Protagonist Therapeutics | Vědecký pracovník |
Reference
- ^ Seznam publikací z Microsoft Academic
- ^ Sali, Andrej (1984). Modelování trojrozměrné struktury proteinu z jeho aminokyselinové sekvence (Disertační práce). London, Birkbeck College.
- ^ Šali, A .; Blundell, T. L. (1993). "Srovnávací modelování proteinů uspokojením prostorových omezení". Journal of Molecular Biology. 234 (3): 779–815. doi:10.1006 / jmbi.1993.1626. PMID 8254673.
- ^ Russel, D .; Lasker, K .; Webb, B .; Velázquez-Muriel, J .; Tjioe, E .; Schneidman-Duhovny, D .; Peterson, B .; Sali, A. (2012). „Spojení: Software pro integrační modelovací platformu pro určování struktury makromolekulárních sestav“. Biologie PLoS. 10 (1): e1001244. doi:10.1371 / journal.pbio.1001244. PMC 3260315. PMID 22272186.
- ^ Publikace Andreje Šaliho
- ^ „Andrej Sali“. Národní akademie věd. Citováno 2018-07-23.
