Michael Waterman - Michael Waterman - Wikipedia

Michael Waterman
Michael Waterman.jpg
Michael Waterman v roce 2004
narozený
Michael Spencer Waterman

28. června 1942 (1942-06-28) (stáří78)[1]
Coquille, Oregon, USA
Alma materOregonská státní univerzita
Michiganská státní univerzita (PhD)
Známý jako
Ocenění
Vědecká kariéra
Pole
Instituce
TezeNěkteré ergodické vlastnosti vícerozměrných F-expanzí  (1969)
Doktorský poradceJohn Rankin Kinney[5]
Pozoruhodné studentyPavel Pevzner (postdoktorand)
VlivyTemple F. Smith
webová stránkadornsife.usc.edu/ laboratoře/ msw/

Michael Spencer Waterman (narozen 28. června 1942) je a Profesor z Biologie, Matematika a Počítačová věda na University of Southern California (USC),[2][6] kde je předsedou Endowed Associates v biologických vědách, matematice a informatice. Dříve[když? ] zastával pozice v Národní laboratoř Los Alamos a Idaho State University.

Vzdělání a časný život

Waterman vyrostl poblíž Bandon, Oregon,[7] a získal bakalářský titul z matematiky z Oregonská státní univerzita, následovaný a PhD v statistika a pravděpodobnost z Michiganská státní univerzita v roce 1969.[5][8]

Výzkum a kariéra

Waterman je jedním ze zakladatelů a současných lídrů v oblasti výpočetní biologie. Zaměřuje se na aplikaci matematiky, statistiky a technik počítačové vědy na různé problémy molekulární biologie. Jeho práce přispěla k některým z nejpoužívanějších nástrojů v této oblasti. Zejména Smith-Watermanův algoritmus (vyvinut s Temple F. Smith ) je základem pro mnohé zarovnání sekvence programy.[9] V roce 1988 Waterman and Eric Lander zveřejnil orientační článek popisující matematický model pro mapování otisků prstů.[10] Tato práce tvořila jeden z teoretických základních kamenů pro mnoho pozdějších projektů mapování a sekvenování DNA, zejména pro Projekt lidského genomu. Papír z roku 1995 od Iduryho a Watermana představil Eulerian-De Bruijnova sekvence montáž, která je široce používána v projektech sekvenování nové generace.[11]

S Pavel A. Pevzner, (bývalý postdoktorský výzkumník ve své laboratoři) zahájil mezinárodní konferenci Výzkum v oblasti výpočetní molekulární biologie (RECOMB),[12] a je zakládajícím redaktorem Journal of Computational Biology. Waterman také napsal jednu z prvních učebnic v oboru: Úvod do výpočetní biologie.[13]

Ceny a vyznamenání

S Cyrus Chothia a David Haussler, Waterman byl oceněn v roce 2015 Cena Dana Davida za jeho příspěvky v oboru bioinformatika.[4] Byl oceněn Čestný doktorát z Tel Avivská univerzita v roce 2011,[Citace je zapotřebí ] a Čestný doktorát z University of Southern Denmark v roce 2013.[Citace je zapotřebí ]

Waterman je členem USA Americká akademie umění a věd od roku 1995,[Citace je zapotřebí ] člen USA National Academy of Engineering od roku 2012,[Citace je zapotřebí ] člen Čínská akademie věd od roku 2013,[Citace je zapotřebí ] a člen USA Národní akademie věd od roku 2001.[Citace je zapotřebí ] Byl akademikem Francouzská akademie věd od roku 2005.[Citace je zapotřebí ]

Waterman byl zvolen Člen ISCB v roce 2009 Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii[3] a byla oceněna jejich Cena Senior Scientist ISCB v roce 2009.[6]

Osobní život

Waterman napsal monografii, Jít ven,[7] dětství stráveného na izolovaném ranči hospodářských zvířat na jižním pobřeží Oregonu v polovině dvacátého století.

Reference

  1. ^ Američtí vědci a muži, Thomson Gale 2005[ISBN chybí ]
  2. ^ A b C Anon (2017). „Michael S. Waterman: profesor biologických věd, matematiky, informatiky, University of Southern California“. dornsife.usc.edu/labs/msw. Archivovány od originál dne 02.02.2017.
  3. ^ A b Anon (2017). „Členové ISCB“. iscb.org. Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii. Archivovány od originál dne 2017-03-20.
  4. ^ A b Anon (2015). „Spoluzakladatel Wikipedie Jimmy Wales mezi vítězi ceny Dana Davida za rok 2015“. eurekalert.org. Citováno 13. února 2015.
  5. ^ A b Michael Waterman na Matematický genealogický projekt
  6. ^ A b Maisel, M. (2006). „Vyznamenání ISCB Michael S. Waterman a Mathieu Blanchette“. PLOS výpočetní biologie. 2 (8): e105. Bibcode:2006PLSCB ... 2..105M. doi:10.1371 / journal.pcbi.0020105. PMC  1526462.
  7. ^ A b Waterman, Michael (2016). Getting Outside: Far-Western Childhood. Platforma pro nezávislé publikování CreateSpace. ISBN  978-1530929344.
  8. ^ Waterman, Michael Smith (1969). Některé ergodické vlastnosti vícerozměrných F-expanzí (Disertační práce). Michiganská státní univerzita. OCLC  25799203. ProQuest  302449931. (vyžadováno předplatné)
  9. ^ Smith, T .; Waterman, M. S. (1981). Msgstr "Identifikace běžných molekulárních subsekvencí". Journal of Molecular Biology. 147 (1): 195–197. CiteSeerX  10.1.1.63.2897. doi:10.1016/0022-2836(81)90087-5. PMID  7265238.
  10. ^ Lander, E. S.; Waterman, M. S. (1988). "Genomické mapování pomocí otisků prstů náhodných klonů: Matematická analýza". Genomika. 2 (3): 231–239. doi:10.1016/0888-7543(88)90007-9. PMID  3294162.
  11. ^ Idury, Ramana M .; Waterman, Michael S. (1995). „Nový algoritmus pro sestavení sekvence DNA“ (PDF). Journal of Computational Biology. 2 (2): 291–306. CiteSeerX  10.1.1.79.6459. doi:10.1089 / cmb.1995.2.291. ISSN  1066-5277. PMID  7497130.
  12. ^ Anon (2017). „Konferenční seriál RECOMB“. recomb.org.
  13. ^ Waterman, Michael R .; Waterman, M. S. (1995). Úvod do výpočetní biologie: mapy, sekvence a genomy. London: Chapman & Hall. ISBN  978-0-412-99391-6.