Lior Pachter - Lior Pachter
Lior Pachter | |
---|---|
![]() Lior Pachter v roce 2013 | |
narozený | Lior Samuel Pachter 3. května 1973 |
Alma mater | Kalifornský technologický institut (BS) Massachusetts Institute of Technology (PhD) |
Ocenění | Člen ISCB (2017) |
Vědecká kariéra | |
Pole | Výpočetní biologie Bioinformatika Genomika Počítačová věda Matematika[1] |
Instituce | University of California, Berkeley |
Teze | Domino obklady, rozpoznávání genů a myši (1999) |
Doktorský poradce | Bonnie Berger[2] |
Doktorandi | Cole Trapnell[2][3] |
webová stránka | liorpachter |
Lior Samuel Pachter je výpočetní biolog. Pracuje v Kalifornský technologický institut, kde je Bren profesorem výpočetní biologie. Má velmi rozmanité výzkumné zájmy včetně genomika, kombinatorika, výpočetní geometrie, strojové učení, vědecké výpočty, a statistika.[1][4][5]
raný život a vzdělávání
Pachter se narodil v Izrael a vyrostl v Jižní Afrika.[6]Získal bakalářský titul z matematiky z Kalifornský technologický institut v roce 1994.[4] Doktorát z matematiky dokončil z Massachusetts Institute of Technology v roce 1999 pod dohledem Bonnie Berger,[2] s Eric Lander a Daniel Kleitman jako pomocní poradci.[4]
Kariéra a výzkum
Pachter byl u University of California, Berkeley fakulta od roku 1999 do roku 2018[7] a dostal Sackler Chair v roce 2012.[4]
Stejně jako pro své technické příspěvky je Pachter známý používáním nová média povýšit otevřená věda[8] a pro myšlenkový experiment zveřejnil na svém blogu, podle kterého je „nejbližší soused s„ dokonalým člověkem ““ Portoriko.[9] To dostalo značnou pozornost médií,[10] a odpověď byla zveřejněna v Scientific American.[11]
Ceny a vyznamenání
V roce 2017 byl Pachter zvolen a Chlapík z Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii (ISCB).[12]
Reference
- ^ A b Lior Pachter publikace indexované podle Google Scholar
- ^ A b C Lior Pachter na Matematický genealogický projekt
- ^ Trapnell, Cole; Pachter, Lior; Salzberg, Steven L. (2009). „TopHat: objevování spojovacích spojení pomocí RNA-Seq“. Bioinformatika. 25 (9): 1105–1111. doi:10.1093 / bioinformatika / btp120. ISSN 1460-2059. PMC 2672628. PMID 19289445.
- ^ A b C d Životopis: Lior Pachter (PDF), 2017, vyvoláno 2017-05-16.
- ^ Trapnell, Cole; Williams, Brian A; Pertea, Geo; Mortazavi, Ali; Kwan, Gordon; van Baren, Marijke J; Salzberg, Steven L; Wold, Barbara J; Pachter, Lior (2010). "Sestava transkriptu a kvantifikace pomocí RNA-Seq odhaluje bez poznámek transkripty a přepínání izoforem během buněčné diferenciace". Přírodní biotechnologie. 28 (5): 511–515. doi:10.1038 / nbt.1621. ISSN 1087-0156. PMC 3146043. PMID 20436464.
- ^ Eskenazi, Joe (14. června 2002), „Petice za odprodej Spojeného království znepokojuje proizraelské aktivisty“, Každý týden.
- ^ „UC Berkeley, fakulta katedry matematiky, Lior Pachter“. Citováno 8. června 2019.
- ^ Lesen, Amy E. (2015), „New paradigm for science communication? Social media, twitter, science, and public engagement: a literature review“, in Lesen, Amy E. (ed.), Vědci, odborníci a občanská angažovanost: Kráčíme po jemné hranici„Ashgate Studies in Environmental Policy and Practice, Ashgate Publishing, Ltd., str. 111–136, ISBN 9781472415240. Viz zejména str. 119–120.
- ^ Pachter, Lior (2. prosince 2014). „Perfektní člověk je Portoričan“. Kousky DNA - recenze a komentář k výpočetní biologii od Liora Pachtera. Citováno 11. prosince 2016.
- ^ Valdez, Maria G. (4. prosince 2014), „Nová studie odhaluje, že geneticky mluvící člověk je z tohoto karibského ostrova!“, Latin Times
- ^ Oleksyk, Taras K .; Martinez-Cruzado, Juan Carlos (5. února 2015). „Proč v Portoriku nebo kdekoli jinde neexistuje dokonalý člověk“. Scientific American..
- ^ „13. února 2017: Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii jmenuje sedm členů do třídy členů ISCB roku 2017“. www.iscb.org. Citováno 13. února 2017.
externí odkazy
Média související s Lior Pachter na Wikimedia Commons