Sandrine Dudoit - Sandrine Dudoit
Sandrine Dudoit | |
|---|---|
| Alma mater | Carleton University |
| Vědecká kariéra | |
| Instituce | Stanfordská Univerzita University of California, Berkeley |
| Teze | Analýza propojení komplexních lidských rysů pomocí údajů o totožnosti podle původu |
| Doktorský poradce | Terry Speed[1] |
| Ovlivněno | Katherine Pollard |
| webová stránka | www |
Sandrine Dudoit je profesorem statistiky a veřejného zdraví na University of California, Berkeley. Její výzkum se týká statistik microarray a genetické údaje; je známá jako jedna ze zakladatelek open-source Biovodič projekt vývoje bioinformatického softwaru.[2]
Vzdělání a kariéra
Dudoit studoval pro Francouze baccalauréat v matematice a fyzikálních vědách na Lycée Molière v Paříži. Pro vysokoškolské studium se přestěhovala do Kanady a v roce 1992 ukončila bakalářský titul z matematiky Carleton University.[3]
Jako začínající postgraduální student na katedře statistiky na Kalifornské univerzitě v Berkeley byl Dudoit příjemcem stipendia Gertrude Cox Americká statistická asociace Výbor pro ženy ve statistice.[4] Doktorát získala v Berkeley v roce 1999. Disertační práce, Analýza propojení komplexních lidských rysů pomocí údajů o totožnosti podle původu, byl pod dohledem Terry Speed.[1]
Kariéra a výzkum
Po postdoktorandském výzkumu s Patrick O. Brown v Stanfordská Univerzita, vstoupila do divize biostatistiky v UC Berkeley School of Public Health jako odborná asistentka v roce 2001. Společné jmenování na katedře statistiky doplnila v roce 2006.[3]
Ceny a vyznamenání
Dudoit byl zvolen jako Člen americké statistické asociace v roce 2010.[5][6] Stala se zvolenou členkou Mezinárodní statistický institut v roce 2014.[3][7]
Publikace
Dudoit a Mark van der Laan jsou autory knihy Několik testovacích postupů s aplikacemi na genomiku (Springer, 2008).[8] Dudoit je editorem knihy Vybraná díla Terryho rychlosti (Springer, 2012)[9] a spolueditorem Řešení pro bioinformatiku a výpočetní biologii pomocí R a Bioconductor (Springer, 2005).[10]
Její výzkumné publikace zahrnují:
- Dudoit, Sandrine; Yang, Yee Hwa; Callow, Matthew J .; Rychlost, Terence P. (2002), „Statistické metody pro identifikaci rozdílně exprimovaných genů v replikovaných cDNA microarray experimentech“, Statistica Sinica, 12 (1): 111–139, JSTOR 24307038, PAN 1894191
- Dudoit, Sandrine; Fridlyand, Jane; Rychlost, Terence P. (2002), „Srovnání diskriminačních metod pro klasifikaci nádorů pomocí údajů o genové expresi“, Journal of the American Statistical Association, 97 (457): 77–87, doi:10.1198/016214502753479248, PAN 1963389, S2CID 119479891
- Yang, Yee Hwa; Dudoit, Sandrine; Luu, Percy; Lin, David M .; Peng, Vivian; Ngai, Johne; Speed, Terence P. (2002), „Normisation for cDNA microarray data: a robust composite method addressing single and multiple slide systematic variation“, Výzkum nukleových kyselin, 30 (4): e15, doi:10.1093 / nar / 30.4.e15, PMC 100354, PMID 11842121
- Dudoit, Sandrine; Shaffer, Juliet Popper; Boldrick, Jennifer C. (2003), „Testování více hypotéz v microarray experimentech“, Statistická věda, 18 (1): 71–103, doi:10.1214 / ss / 1056397487, PAN 1997066
- Pán, Robert C.; Carey, Vincent J .; Bates, Douglas M .; Bolstad, Ben; Dettling, Marcel; Dudoit, Sandrine; Ellis, Byron; Gautier, Laurent; Ge, Yongchao; Gentry, Jeff; Hornik, Kurt; Hothorn, Torsten; Huber, Wolfgang; Iacus, Stefano; Irizarry, Rafael; Leisch, Friedrich; Li, Cheng; Maechler, Martin; Rossini, Anthony J .; Sawitzki, Gunther; Smith, Colin; Smyth, Gordon; Tierney, Luke; Yang, Jean Y. H.; Zhang, Jianhua (2004), „Bioconductor: otevřený vývoj softwaru pro výpočetní biologii a bioinformatiku“, Genome Biology, 5 (10): R80, doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r80, PMC 545600, PMID 15461798
- Bullard, James H .; Purdom, Elizabeth; Hansen, Kasper D .; Dudoit, Sandrine (2010), „Hodnocení statistických metod pro normalizaci a diferenciální expresi v mRNA-Seq experimentech“, BMC bioinformatika, 11 (1): 94, doi:10.1186/1471-2105-11-94, PMC 2838869, PMID 20167110
Reference
- ^ A b Sandrine Dudoit na Matematický genealogický projekt
- ^ Sandrine Dudoit publikace indexované podle Google Scholar
- ^ A b C Životopis (PDF), vyvoláno 26. května 2019
- ^ Příjemci stipendia Cox, Výbor americké statistické asociace pro ženy ve statistice, vyvoláno 27. května 2019
- ^ Členové ASA, Senátorský klub pro ženy ve statistikách, 2016-03-29, vyvoláno 27. května 2019
- ^ „Mnozí poctěni na projevu prezidenta, slavnostní předávání cen“, JSM Highlights, Zprávy AMSTAT, 1. října 2010
- ^ Jednotliví členové, Mezinárodní statistický institut, vyvoláno 27. května 2019
- ^ Recenze Několik testovacích postupů s aplikacemi na genomiku:
- Schwender, Holger (červen 2008), Statistické dokumenty, 50 (3): 681–682, doi:10.1007 / s00362-008-0144-1, S2CID 117038402CS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- Crowder, Martin (srpen 2008), Mezinárodní statistický přehled / Revue Internationale de Statistique, 76 (2): 309–310, doi:10.1111 / j.1751-5823.2008.00054_11.x, JSTOR 27919629CS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- Bar-Hen, Avner (2009), Matematické recenzeSpringerova série ve statistice, doi:10.1007/978-0-387-49317-6, ISBN 978-0-387-49316-9, PAN 2373771CS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- Heller, Ruth (březen 2009), BiometrieWiley, 65 (1): 333–334, doi:10.1111 / j.1541-0420.2009.01208_8.xCS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- Sperrin, Matthew (duben 2010), Journal of the Royal Statistical Society: Series A (Statistics in Society), 173 (2): 465, doi:10.1111 / j.1467-985x.2009.00634_7.xCS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- Läuter, Jürgen (září 2010), Biometrický deník, 52 (5): 699, doi:10.1002 / bimj.201000174CS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- ^ Recenze Vybraná díla Terryho rychlosti:
- Technometrics, 54 (4): 446, listopad 2012, doi:10.1080/00401706.2012.726001, JSTOR 41714940, S2CID 219593828CS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- Draper, Norman R. (duben 2013), Mezinárodní statistický přehled / Revue Internationale de Statistique, 81 (1): 170, doi:10.1111 / insr.12011_22, JSTOR 43298831CS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- ^ Recenze Bioinformatika a řešení výpočetní biologie s využitím R a Bioconductor:
- Doerge, R. W. (prosinec 2006), Biometrie, 62 (4): 1270–1271, doi:10.1111 / j.1541-0420.2006.00596_2.xCS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- Schadow, Gunther (prosinec 2006), Briefings in Bioinformatics, 8 (2): 136–137, doi:10.1093 / bib / bbl020CS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- Davis, J. Wade (březen 2007), Journal of the American Statistical Association, 102 (477): 388–389, doi:10.1198 / jasa.2007.s179, JSTOR 27639862, S2CID 117060196CS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- Hewson, Paul (červen 2007), Statistické metody v lékařském výzkumu, 16 (3): 299–300, doi:10.1177/0962280207079524, S2CID 123111725CS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- Rahnenführer, Jörg (březen 2008), Statistické dokumenty, 50 (2): 453–454, doi:10.1007 / s00362-008-0124-5, S2CID 117001775CS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)
- Freiberger, Walter (červen 2008), Quarterly of Applied Mathematics, 66 (2): 397, doi:10.1090 / s0033-569x-08-01097-4, JSTOR 43638832CS1 maint: periodikum bez názvu (odkaz)