Philip Bourne - Philip Bourne
Phil Bourne | |
---|---|
![]() Philip Eric Bourne | |
narozený | Philip Eric Bourne 1953 (věk 66–67)[1] |
Alma mater | Flinders University (PhD) |
Známý jako |
|
Manžel (y) | Roma Chalupa (m. 1983) |
Děti |
|
Ocenění | |
Vědecká kariéra | |
Pole | Data Science Výpočetní biologie Učená komunikace[9] Bioinformatika |
Instituce | |
Teze | Analýzy krystalové struktury: biologické komplexy kovů a stereochemie substituovaných phonylbicyklooktanů (1979) |
Pozoruhodné studenty | Werner G. Krebs |
webová stránka | datová věda |
Philip Eric Bourne (narozen 1953) je Australan bioinformatik,[10] spisovatel literatury faktu,[2] a podnikatel.[4] V současné době je Stephensonem předsedou Data Science a ředitelem School of Data Science a profesorem biomedicínského inženýrství[11] a byl prvním přidruženým ředitelem pro datovou vědu v Národní institut zdraví, kde jeho projekty zahrnují správu Velká data ke znalostem iniciativa a dříve přidružený vicekancléř ve společnosti UCSD.[12] Přispíval do učebnic a je silným zastáncem literatury a softwaru s otevřeným přístupem. Jeho rozmanité zájmy se rozšířily strukturní biologie, lékařská informatika, informační technologie, strukturální bioinformatika, vědecká komunikace a farmaceutické vědy.[10] Jeho práce jsou vysoce citované a on má h-index nad 50.[13][14][9]
Vzdělávání
Bourne byl vyškolen jako fyzikální chemik v polovině až konce 70. let a doktorát získal v roce 1979[1] na Flinders University.
Kariéra a výzkum
Po ukončení doktorského studia se Bourne přestěhoval do University of Sheffield dělat postdoktorský výzkum během 1979-1981,[15] následovaný přesunem do Columbia University V New Yorku v roce 1981. V roce 1995 se přestěhoval do University of California, San Diego, kde působil jako profesor na katedře farmakologie. V roce 2014 přešel do NIH a stal se jeho náměstkem pro datovou vědu. V lednu 2017 bylo oznámeno, že přijal místo ředitele společnosti University of Virginia institut pro datovou vědu.[16]
On je známý pro psaní knihy Unix pro VMS Uživatelé (1990)[2] a za to, že spoluvytvářel Kombinatorické rozšíření algoritmus pro trojrozměrné vyrovnání proteinových struktur,[17] společně s I. Shindyalovem (1998). V roce 1999 se stal spoluředitelem Proteinová datová banka.[18] Byl prezidentem ISCB (2002–2003).[19] Je to kolega z Americká asociace lékařské informatiky od roku 2002.[20] Zakládá šéfredaktora PLoS výpočetní biologie (2005-). V roce 2007 spoluzaložil SciVee.[4] Bourne je editor populárních Deset jednoduchých pravidel série úvodníků publikovaných v PLoS výpočetní biologie časopis.[21] Působil jako náměstek vicekancléře pro inovace a průmyslové aliance[12] a profesor farmakologie na Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences na University of California, San Diego (UCSD).[22][23]Je poradcem společnosti Hypotéza projekt[24] a spolupracovník ředitele pro datovou vědu na Národní institut zdraví kde jeho projekty zahrnují správu Velká data ke znalostem iniciativa.[25][26]
Publikace
Bourne je autorem mnoha vědeckých článků a kapitol knih a editorem časopisu Strukturální bioinformatika učebnice.[27][28] a Farmaceutická informatika[29] Další publikace[9] zahrnout:
- Strukturální bioinformatika 1. vydání [27]
- Strukturální bioinformatika 2. vydání[28]
- Farmaceutická informatika[29]
- Unix pro uživatele VMS[2]
- Bourne, Philip E. (01.01.1997). Kuchařka pro poskytování internetu pro UNIX. Prentice Hall. ISBN 9780135199923.
- Hart, David L .; Bourne, Philip E. (1998-08-12). Kuchařka webového serveru pro Mac OS 8 (1. vyd.). Prentice Hall PTR. ISBN 9780135200162.
- Bourne, Philip E. (01.01.2000). Podzemní průvodce Unix. Prentice Hall. ISBN 9780131844582.
- Berman, H. M .; Westbrook, J .; Feng, Z .; Gilliland, G .; Bhat, T. N .; Weissig, H .; Shindyalov, I.N .; Bourne, P. E. (2000-01-01). "Proteinová datová banka". Výzkum nukleových kyselin. 28 (1): 235–242. doi:10.1093 / nar / 28.1.235. ISSN 0305-1048. PMC 102472. PMID 10592235.
Ceny a vyznamenání
Byl zvolen Bourne Člen AAAS v rámci farmaceutických věd v roce 2011[5] a Chlapík z Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii (ISCB) v roce 2011.[6] V roce 2010 vyhrál společnost Microsoft Jim Gray e-věda cena[7] a v roce 2009 vyhrál Cena Benjamina Franklina (2009).[8][30]
Osobní život
Bourne je ženatý od roku 1983 s Romem Chalupou a mají dvě děti: Scott Bourne (1985-) a Melanie Bourne (1997-).[Citace je zapotřebí ] Mezi jeho zájmy patří motocykly,[31] létání a turistika
Reference
- ^ A b Bourne, Philip Eric (1979). Analýzy krystalové struktury: biologické komplexy kovů a stereochemie substituovaných phonylbicyklooktanů (Disertační práce). Flinders University. OCLC 708090572.
- ^ A b C d Bourne, Phil E (1990). Unix pro uživatele VMS. Digital Press Newton, MA, USA. ISBN 1-55558-034-3.
- ^ Berman, H. M.; Westbrook, J .; Feng, Z .; Gilliland, G .; Bhat, T .; Weissig, H .; Shindyalov, I .; Bourne, P. (2000). "Proteinová datová banka". Výzkum nukleových kyselin. 28 (1): 235–242. doi:10.1093 / nar / 28.1.235. PMC 102472. PMID 10592235.
- ^ A b C Fink, JL; Bourne, PE (2007). „Znovuobjevení vědecké komunikace pro elektronický věk“. CTWatch čtvrtletně. 3 (3).
- ^ A b „Dr. Phil Bourne zvolil kolegu AAAS v rámci farmaceutických věd“. Pharmacy.ucsd.edu. Citováno 2011-02-27.
- ^ A b „Stážisté ISCB“.
- ^ A b „Philip E. Bourne získal cenu Microsoft Jim eScience Award za rok 2010“. Eurekalert.org. 18. 10. 2010. Citováno 2011-02-27.
- ^ A b „Cena Benjamina Franklina“. Bioinformatics.org. Citováno 2011-02-27.
- ^ A b C Philip Bourne publikace indexované podle Google Scholar
- ^ A b Philip Bourne publikace indexované indexem Scopus bibliografická databáze. (vyžadováno předplatné)
- ^ https://engineering.virginia.edu/faculty/philip-e-bourne
- ^ A b http://pharmacy.ucsd.edu/news/Appointment-of-Associate-VC-for-Innovation-%20Industry-Alliances.pdf
- ^ stránka na University of Virginia
- ^ bournes starý web
- ^ Clegg, G. A .; Stansfield, R. F. D .; Bourne, P.E .; Harrison, P. M. (1980). "Helix balení a podjednotka konformace v koňské slezině apoferritinu". Příroda. 288 (5788): 298–300. doi:10.1038 / 288298a0. PMID 7432529.
- ^ https://www.news.virginia.edu/content/uva-names-nih-researcher-new-director-data-science-institute
- ^ Shindyalov, I.N .; Bourne, P. E. (1998). „Zarovnání struktury proteinů inkrementálním kombinatorickým prodloužením (CE) optimální cesty“. Návrh a výběr proteinového inženýrství. 11 (9): 739–747. doi:10.1093 / protein / 11.9.739. PMID 9796821.
- ^ Berman, H. M.; Westbrook, J .; Feng, Z .; Gilliland, G .; Bhat, T .; Weissig, H .; Shindyalov, I .; Bourne, P. (2000). "Proteinová datová banka". Výzkum nukleových kyselin. 28 (1): 235–242. doi:10.1093 / nar / 28.1.235. PMC 102472. PMID 10592235.
- ^ „ISCB - minulí prezidenti“. Archivovány od originál 3. září 2015. Citováno 3. září 2015.
- ^ Greenes, R. A .; Madsen, E .; Miller, R. A. (2003). „American College of Medical Informatics Fellows and International Associates, 2002“. Journal of the American Medical Informatics Association. 10 (3): 281–286. doi:10.1197 / jamia.M1326. PMC 400512.
- ^ Deset jednoduchých pravidel
- ^ http://www.sdsc.edu/pb/ Webová stránka laboratoře Bourne
- ^ http://www.sdsc.edu/~bourne/CV.pdf Philip E. Bourne Ph.D. životopis
- ^ Hypothes.is oficiální webové stránky
- ^ NIH jmenuje Dr. Philip E. Bourne prvním náměstkem ředitele pro datovou vědu
- ^ Margolis, R .; Derr, L .; Dunn, M .; Huerta, M .; Larkin, J .; Sheehan, J .; Guyer, M .; Green, E. D. (2014). „Iniciativa Big Data to Knowledge (BD2K) National Institutes of Health: vydělávání na biomedicínských velkých datech“. Journal of the American Medical Informatics Association. 21 (6): 957–8. doi:10.1136 / amiajnl-2014-002974. ISSN 1067-5027. PMC 4215061. PMID 25008006.
- ^ A b Bourne, Philip E .; Weissig, Helga (2003). Strukturální bioinformatika. John Wiley & Sons.
- ^ A b Gu, Jenny; Bourne, Philip E. (březen 2009). Strukturální bioinformatika (2. vyd.). Wiley-Blackwell. ISBN 0-470-18105-2.
- ^ A b Anderson, Philip O .; Bourne, Philip E. (prosinec 2009). Farmaceutická informatika. CRC Press. ISBN 1-4200-7175-0.
- ^ „The Bourne Commendation: Open Access Evangelist Wins 2009 Benjamin Franklin Award“. Bio-itworld.com. Citováno 2011-02-27.
- ^ OFL | Philip Bourne | Cestovní blog
Předcházet Russ Altman | Předseda Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii 2002 – 2003 | Uspěl Michael Gribskov |
'