Desmond G. Higgins - Desmond G. Higgins

Des Higgins
Des Higgins ISMB 2015.jpg
Des Higgins hovořící v ISMB konference v roce 2015.
narozený
Desmond Gerard Higgins

(1959-07-17) 17. července 1959 (věk 61)[1]
Alma materTrinity College v Dublinu (PhD)
Známý jako
Ocenění
Vědecká kariéra
Pole
Instituce
TezeNumerická taxonomie hmyzu Pterygote  (1988)
Akademičtí poradciPaul M. Sharp[10][11]
webová stránka

Desmond Gerard Higgins je Profesor z Bioinformatika v University College v Dublinu,[9][12][13][14] široce známý pro CLUSTAL,[15] řada počítačových programů pro provádění vícenásobné zarovnání sekvence. Podle Příroda, Higginsovy dokumenty popisující CLUSTAL[4][5] patří mezi deset nejuznávanějších vědecké práce všech dob.[16][17][18]

Vzdělání

Higgins byl vzděláván u Trinity College v Dublinu[19] kde mu byla udělena a PhD v roce 1988 pro výzkum numerická taxonomie z Pterygote hmyz.[20]

Výzkum

Výzkum v Higginsově laboratoři[9] se zaměřuje na vývoj nových bioinformatických a statistických nástrojů pro evoluční biologie. The CLUSTAL program pro vícenásobné zarovnání sekvence byl vyvinut v laboratoři Higgins a T-káva software byl původně vyvinut v laboratoři s Cedric Notredame. Statistiky s více proměnnými se používají k analýze microarray datové soubory a molekulární evoluce jako je vývoj promotéři, introny a nekódující RNA.[12][19]

Ocenění a vyznamenání

Higgins byl zvolen a Chlapík z Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii (ISCB) v roce 2015.[7] V roce 2018 Higgins obdržel Cena Benjamina Franklina za otevřený přístup v biologických vědách.[8]

Reference

  1. ^ Des Higgins v Knihovna Kongresu Úřady
  2. ^ Higgins, Desmond G .; Sharp, Paul M. (1988). "CLUSTAL: balíček pro provádění vícenásobného seřazení sekvencí na mikropočítači". Gen. 73 (1): 237–244. doi:10.1016/0378-1119(88)90330-7. PMID  3243435.
  3. ^ Higgins, Desmond G .; Sharp, Paul M. (1989). Msgstr "Rychlé a citlivé zarovnání více sekvencí na mikropočítači". Bioinformatika. 5 (2): 151–153. doi:10.1093 / bioinformatika / 5.2.151. PMID  2720464.
  4. ^ A b Thompson, J. D .; Gibson, T. J .; Plewniak, F .; Jeanmougin, F .; Higgins, D. G. (1997). „Rozhraní CLUSTAL_X Windows: Flexibilní strategie pro vícenásobné zarovnání sekvence podporované nástroji pro analýzu kvality“. Výzkum nukleových kyselin. 25 (24): 4876–4882. doi:10.1093 / nar / 25.24.4876. PMC  147148. PMID  9396791.
  5. ^ A b Thompson, J. D .; Higgins, D. G .; Gibson, T. J. (1994). "CLUSTAL W: Zlepšení citlivosti postupného vícenásobného seřazení sekvencí pomocí vážení sekvencí, penalizací mezer pro konkrétní pozici a volby matice hmotnosti". Výzkum nukleových kyselin. 22 (22): 4673–4680. doi:10.1093 / nar / 22.22.4673. PMC  308517. PMID  7984417.
  6. ^ A b Notredame, C. D .; Higgins, D. G .; Heringa, J. (2000). "T-coffee: Nová metoda pro rychlé a přesné zarovnání více sekvencí". Journal of Molecular Biology. 302 (1): 205–17. doi:10.1006 / jmbi.2000.4042. PMID  10964570.
  7. ^ A b „Členové ISCB“. Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii. Archivovány od originál dne 2015-04-15.
  8. ^ A b „Cena Benjamina Franklina - Bioinformatics.org“. www.bioinformatics.org. Citováno 16. března 2018.
  9. ^ A b C Desmond G. Higgins publikace indexované podle Google Scholar Upravte to na Wikidata
  10. ^ „Des Higgins, PhD: Strom výpočetní biologie“. academictree.org. Archivovány od originál dne 2017-07-14.
  11. ^ Sharp, Paul M .; Cowe, Elizabeth; Higgins, Desmond G.; Shields, Denis C .; Wolfe, Kenneth H.; Wright, Frank (1988). „Způsoby používání kodonů u Escherichia coli, Bacillus subtilis, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Drosophila melanogaster a Homo sapiens; přehled značné mezidruhové rozmanitosti“. Výzkum nukleových kyselin. 16 (17): 8207–8211. doi:10.1093 / nar / 16.17.8207. ISSN  0305-1048. PMC  338553. PMID  3138659.
  12. ^ A b „Profesor Desmond Gerard Higgins B.A. (Mod), PhD“. Dublin: University College Dubin. Archivovány od originál dne 2015-04-05.
  13. ^ „Des Higginsova laboratoř“. University College v Dublinu. Archivovány od originál dne 2014-12-14.
  14. ^ Desmond G. Higgins publikace od Evropa PubMed Central
  15. ^ Des Higgins: Vizualizace vícenásobných sekvenčních zarovnání na Youtube, Broad Institute
  16. ^ Van Noorden, R .; Maher, B .; Nuzzo, R. (2014). „100 nejlepších příspěvků: Příroda zkoumá nejcitovanější výzkum všech dob“. Příroda. 514 (7524): 550–3. doi:10.1038 / 514550a. PMID  25355343.
  17. ^ Gorey, Colm (2014). „Irský profesor Des Higgins v top 10 nejcitovanějších příspěvcích všech dob“. Dublin: siliconrepublic.com. Archivovány od originál dne 2015-06-05.
  18. ^ Desmond G. Higgins publikace indexované indexem Scopus bibliografická databáze. (vyžadováno předplatné)
  19. ^ A b Des Higgins ORCID  0000-0002-3952-3285
  20. ^ Higgins, Des (1981). Numerická taxonomie hmyzu pterygote (Disertační práce). Trinity College v Dublinu. OCLC  842505334. ProQuest  301410442.