JMJD6 - JMJD6

JMJD6
Protein JMJD6 PDB 3K2O.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyJMJD6, PSR, PTDSR, PTDSR1, arginin demethyláza a lysin hydroxyláza, doména jumonji obsahující 6, arginin demetyláza a lysin hydroxyláza
Externí IDOMIM: 604914 MGI: 1858910 HomoloGene: 9046 Genové karty: JMJD6
Umístění genu (člověk)
Chromozom 17 (lidský)
Chr.Chromozom 17 (lidský)[1]
Chromozom 17 (lidský)
Genomické umístění pro JMJD6
Genomické umístění pro JMJD6
Kapela17q25.1Start76,712,832 bp[1]
Konec76,726,799 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE JMJD6 215233 na fs.png

PBB GE JMJD6 212722 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001081461
NM_015167

NM_033398
NM_001363363

RefSeq (protein)

NP_001074930
NP_055982

NP_203971
NP_001350292

Místo (UCSC)Chr 17: 76,71 - 76,73 MbChr 11: 116,84 - 116,84 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Bifunkční arginin demetyláza a lysyl-hydroxyláza JMJD6 je enzym že u lidí je kódován JMJD6 gen.[5][6]

Funkce

Tento gen kóduje jaderný protein s a Doména JmjC. Proteiny obsahující doménu JmjC patří do alfa-ketoglutarát-dependentní hydroxyláza nadčeleď. Předpokládá se, že budou fungovat jako bílkoviny hydroxylázy nebo histon demetylázy. Tento protein byl poprvé identifikován jako domnělý fosfatidylserin receptor zapojený do fagocytóza z apoptotické buňky. Následující studie naznačují, že protein může křížově reagovat s monoklonální protilátkou, která rozpoznává fosfatidylserinový receptor a přímo nefunguje při clearance apoptotických buněk. Pro tento gen bylo nalezeno několik variant transkriptu kódujících různé izoformy.[6] Na fyziologické úrovni má JMJD6 roli v angiogenezi, procesu tvorby cév, zatímco byly zahrnuty další role JMJD6 v patofyziologických procesech, jako je tumorigeneze mléčné žlázy.[7] Zde byla nalezena zvýšená hladina JMJD6 u rakoviny prsu spojené s agresivitou a metastázami u myší.[8]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000070495 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000056962 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Vandivier RW, Fadok VA, Hoffmann PR, Bratton DL, Penvari C, Brown KK, Brain JD, Accurso FJ, Henson PM (březen 2002). „Štěpení receptoru fosfatidylserinu zprostředkované elastázou zhoršuje clearance apoptotických buněk při cystické fibróze a bronchiektázii“. The Journal of Clinical Investigation. 109 (5): 661–70. doi:10,1172 / JCI13572. PMC  150889. PMID  11877474.
  6. ^ A b „Entrez Gene: JMJD6 jumonji doména obsahující 6“.
  7. ^ Boeckel JN, Guarani V, Koyanagi M, Roexe T, Lengeling A, Schermuly RT, Gellert P, Braun T, Zeiher A, Dimmeler S (únor 2011). „Protein 6 obsahující Jumonji doménu (Jmjd6) je nezbytný pro angiogenní klíčení a reguluje sestřih VEGF-receptoru 1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 108 (8): 3276–81. doi:10.1073 / pnas.1008098108. PMC  3044381. PMID  21300889.
  8. ^ Aprelikova O, Chen K, El Touny LH, Brignatz-Guittard C, Han J, Qiu T, Yang HH, Lee MP, Zhu M, Green JE (14. dubna 2016). „Epigenetický modifikátor JMJD6 je amplifikován v nádorech mléčné žlázy a spolupracuje s c-Myc na zlepšení buněčné transformace, progrese nádoru a metastáz“. Klinická epigenetika. 8 (38): 38. doi:10.1186 / s13148-016-0205-6. PMC  4831179. PMID  27081402.

Další čtení