ASPH - ASPH

ASPH
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5APA
Identifikátory
Aliasy	ASPH, AAH, BAH, CASQ2BP1, FDLAB, HAAH, JCTN, junktin, aspartát beta-hydroxyláza
Externí ID	OMIM: 600582 MGI: 1914186 HomoloGene: 20910 Genové karty: ASPH
EC číslo	1.14.11.16
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	61,714,640 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	9,669,344 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontového kanálu; • aktivita dioxygenázy; • aktivita strukturních molekul; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita peptid-aspartát beta-dioxygenázy; • aktivita přenosu elektronů; • aktivita oxidoreduktázy; • strukturní složka svalu; • vazba iontů vápníku; • aktivita 3-dioxygenázy kyseliny peptidyl-asparagové;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • komplex vápníkového kanálu; • membrána; • buněčná membrána; • kortikální endoplazmatické retikulum; • junkční sarkoplazmatická retikulární membrána; • sarkoplazmatické retikulum; • integrální součást membrány endoplazmatického retikula; • sarkoplazmatická retikulární membrána; • lumen sarkoplazmatického retikula; • membrána endoplazmatického retikula; • endoplazmatické retikulum; • cytoplazma;
Biologický proces	• buněčná odpověď na iont vápníku; • pozitivní regulace intracelulárního transportu proteinů; • regulace aktivity kanálu uvolňujícího vápník citlivý na ryanodin; • regulace aktivity kanálu uvolňování vápníku citlivého na inositol 1,4,5-trisfosfát; • reakce na ATP; • regulace srdečního vedení; • svalová kontrakce; • pozitivní regulace transportu iontů vápníku do cytosolu; • regulace kontrakce srdečního svalu regulací uvolňování sekvestrovaného iontu vápníku; • modifikace peptidyl-aminokyseliny; • detekce iontu vápníku; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace aktivity kanálu uvolňujícího vápník, který je citlivý na ryanodin; • iontový transmembránový transport; • aktivace aktivity endopeptidázy cysteinového typu; • transmembránový transport vápenatých iontů; • pozitivní regulace proteolýzy; • regulace buněčné komunikace elektrickou vazbou; • regulace uvolňování sekvestrovaného iontu vápníku do cytosolu sarkoplazmatickým retikulem; • oxidačně-redukční proces; • aktivace aktivity vápníkového kanálu v obchodě; • proces specifikace vzoru; • negativní regulace buněčné proliferace; • regulace stability proteinu; • morfogeneze končetin; • hydroxylace kyseliny peptidyl-asparagové; • vývoj patra; • čelit morfogenezi; • regulace depolymerizace proteinů; • elektronový transportní řetězec;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	444
	65973
	ENSG00000198363
	ENSMUSG00000028207
	Q12797
	Q8BSY0
NM_001164750; NM_001164751; NM_001164752; NM_001164753; NM_001164754;
	NM_001164755; NM_001164756; NM_004318; NM_020164; NM_032466; NM_032467; NM_032468
NM_001177849; NM_001177850; NM_001177851; NM_001177852; NM_001177853;
	NM_001177854; NM_001177855; NM_001177856; NM_001290367; NM_023066; NM_133723
NP_001158222; NP_001158223; NP_001158224; NP_001158225; NP_001158226;
	NP_001158227; NP_001158228; NP_004309; NP_064549; NP_115855; NP_115856; NP_115857
NP_001171320; NP_001171321; NP_001171322; NP_001171323; NP_001171324;
	NP_001171325; NP_001171326; NP_001171327; NP_001277296; NP_075553; NP_598484
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Aspartyl / asparaginyl beta-hydroxyláza (HAAH) je enzym že u lidí je kódován ASPH gen.^[5]^[6]^[7] ASPH je alfa-ketoglutarát-dependentní hydroxyláza, nadčeleďové nehemové proteiny obsahující železo.

Funkce

Předpokládá se, že tento gen hraje důležitou roli vápník homeostáza. Alternativní sestřih tohoto genu vede k pěti variantám transkriptu, které se liší translací proteinu, kódováním katalytických domén a expresí tkáně. Variace mezi těmito přepisy ovlivňují jejich funkce, které zahrnují role v procesu ukládání a uvolňování vápníku v endoplazmatickém a sarkoplazmatickém retikulu, jakož i hydroxylaci kyseliny asparagové a asparaginu v doménách různých proteinů podobných epidermálnímu růstovému faktoru.^[7]

Klinický význam

Již v roce 1996 došlo k nadměrnému vyjádření HAAH byl uznán jako indikátor karcinomu u lidí. Další výzkum koreloval zvýšené HAAH hladiny (různě v postižené tkáni nebo krevní sérum ) s hepatocelulárními (játra ) karcinom^[8]^[9] adenokarcinom (rakovina slinivky ),^[10] kolorektální karcinom,^[11] rakovina prostaty.^[9] a rakovina plic.^[12] Studie pankreatu^[10] ukázal zvýšený HAAH pouze v nemocné tkáni, ale ne v sousední normální a zanícené tkáni.

Mutace v ASPH způsobit Traboulsiho syndrom.^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198363 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028207 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Korioth F, Gieffers C, Frey J (prosinec 1994). "Klonování a charakterizace lidského genu kódujícího aspartyl beta-hydroxylázu". Gen. 150 (2): 395–9. doi:10.1016 / 0378-1119 (94) 90460-X. PMID 7821814.
^ Lim KY, Hong CS, Kim DH (září 2000). "klonování cDNA a charakterizace lidského srdečního junktinu". Gen. 255 (1): 35–42. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00299-7. PMID 10974562.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ASPH aspartate beta-hydroxylase“.
^ Ince N, de la Monte SM, Wands JR (březen 2000). „Nadměrná exprese lidské aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxylázy je spojena s maligní transformací“. Výzkum rakoviny. 60 (5): 1261–6. PMID 10728685.
^ ^A ^b Xue T, Xue XP, Huang QS, Wei L, Sun K, Xue T (srpen 2009). „Monoklonální protilátky proti lidské aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxyláze vyvinuté imunizací DNA“. Hybridom. 28 (4): 251–7. doi:10.1089 / hyb.2009.0017. PMID 19663697.
^ ^A ^b Palumbo KS, Wands JR, Safran H, King T, Carlson RI, de la Monte SM (červenec 2002). "Lidské aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxyláza monoklonální protilátky: potenciální biomarkery pro karcinom pankreatu". Slinivka břišní. 25 (1): 39–44. doi:10.1097/00006676-200207000-00010. PMID 12131769. S2CID 2098747.
^ „CC Detect - k dispozici diagnostický test na rakovinu tlustého střeva založený na séru“.
^ Hampton T (listopad 2007). „Nové screeningové techniky ukazují potenciál pro včasné odhalení rakoviny plic“. JAMA. 298 (17): 1997. doi:10.1001 / jama.298.17.1997. PMID 17986689.
^ Patel N, Khan AO, Mansour A, Mohamed JY, Al-Assiri A, Haddad R a kol. (Květen 2014). „Mutace v ASPH způsobují dysmorfismus obličeje, dislokaci čočky, abnormality předního segmentu a spontánní filtrovací výkaly nebo Traboulsiho syndrom“. American Journal of Human Genetics. 94 (5): 755–9. doi:10.1016 / j.ajhg.2014.04.002. PMC 4067561. PMID 24768550.

externí odkazy

Člověk ASPH umístění genomu a ASPH stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q12797 (Aspartyl / asparaginyl beta-hydroxyláza) na PDBe-KB.

Další čtení

Hirota K, Semenza GL (prosinec 2005). „Regulace hypoxií indukovatelného faktoru 1 prolylem a asparaginylhydroxylázami“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 338 (1): 610–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.08.193. PMID 16154531.
Lavaissiere L, Jia S, Nishiyama M, de la Monte S, Stern AM, Wands JR, Friedman PA (září 1996). "Nadměrná exprese lidské aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxylázy v hepatocelulárním karcinomu a cholangiokarcinomu". The Journal of Clinical Investigation. 98 (6): 1313–23. doi:10,1172 / JCI118918. PMC 507557. PMID 8823296.
Zhang L, Kelley J, Schmeisser G, Kobayashi YM, Jones LR (září 1997). "Komplexní tvorba mezi junktinem, triadinem, kalsequestrinem a receptorem ryanodinu. Proteiny srdeční junkční sarkoplazmatické retikulární membrány". The Journal of Biological Chemistry. 272 (37): 23389–97. doi:10.1074 / jbc.272.37.23389. PMID 9287354.
Wetzel GT, Ding S, Chen F (březen 2000). "Molekulární klonování junktinu z člověka a vyvíjejícího se králičího srdce". Molekulární genetika a metabolismus. 69 (3): 252–8. doi:10,1006 / mgme. 2000,2966. PMID 10767180.
Dinchuk JE, Henderson NL, Burn TC, Huber R, Ho SP, Link J a kol. (Prosinec 2000). „Aspartyl beta-hydroxyláza (Asph) a evolučně konzervovaná izoforma Asph postrádající sdílené exony katalytické domény s junktinem“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (50): 39543–54. doi:10,1074 / jbc.M006753200. PMID 10956665.
Treves S, Feriotto G, Moccagatta L, Gambari R, Zorzato F (prosinec 2000). „Molekulární klonování, exprese, funkční charakterizace, chromozomální lokalizace a genová struktura junktátu, nového integrálního proteinu vázajícího vápník membrány sarco (endo) plazmatického retikula“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (50): 39555–68. doi:10,1074 / jbc.M005473200. PMID 11007777.
Kirchhefer U, Neumann J, Baba HA, Begrow F, Kobayashi YM, Reinke U a kol. (Únor 2001). "Srdeční hypertrofie a zhoršená relaxace u transgenních myší nadměrně exprimujících triadin 1". The Journal of Biological Chemistry. 276 (6): 4142–9. doi:10,1074 / jbc.M006443200. PMID 11069905.
Sepe PS, Lahousse SA, Gemelli B, Chang H, Maeda T, Wands JR, de la Monte SM (červenec 2002). „Role genu pro aspartyl-asparaginyl-beta-hydroxylázu v motilitě buněk neuroblastomu“. Laboratorní vyšetřování; Journal of Technical Methods and Pathology. 82 (7): 881–91. doi:10.1097 / 01.lab.0000020406.91689.7f. PMID 12118090.
Ho SP, Scully MS, Krauthauser CM, Wexler EJ, Stow MD, Dinchuk JE a kol. (Srpen 2002). „Antisense oligonukleotidy selektivně regulují aspartyl beta-hydroxylázu a její izoformu zkráceného proteinu in vitro, ale špatně se distribuují do nádorů A549 in vivo.“ The Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics. 302 (2): 795–803. doi:10.1124 / jpet.302.2.795. PMID 12130746.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS a kol. (Prosinec 2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Maeda T, Sepe P, Lahousse S, Tamaki S, Enjoji M, Wands JR, de la Monte SM (květen 2003). "Antisense oligodeoxynukleotidy namířené proti aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxyláze potlačují migraci buněk cholangiokarcinomu". Journal of Hepatology. 38 (5): 615–22. doi:10.1016 / S0168-8278 (03) 00052-7. PMID 12713872.
Treves S, Franzini-Armstrong C, Moccagatta L, Arnoult C, Grasso C, Schrum A a kol. (Srpen 2004). „Junctate je klíčovým prvkem vstupu vápníku vyvolaného aktivací receptorů InsP3 a / nebo vyčerpáním zásob vápníku“. The Journal of Cell Biology. 166 (4): 537–48. doi:10.1083 / jcb.200404079. PMC 1868564. PMID 15302852.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J a kol. (Srpen 2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Xian ZH, Zhang SH, Cong WM, Yan HX, Wang K, Wu MC (únor 2006). "Exprese aspartyl beta-hydroxylázy a její klinicko-patologický význam v hepatocelulárním karcinomu". Moderní patologie. 19 (2): 280–6. doi:10.1038 / modpathol.3800530. PMID 16341145.
de la Monte SM, Tamaki S, Cantarini MC, Ince N, Wiedmann M, Carter JJ a kol. (Květen 2006). „Aspartyl- (asparaginyl) -beta-hydroxyláza reguluje invazivitu hepatocelulárního karcinomu“. Journal of Hepatology. 44 (5): 971–83. doi:10.1016 / j.jhep.2006.01.038. PMID 16564107.
Feldmann G, Nattermann J, Nischalke HD, Gorschlüter M, Kuntzen T, Ahlenstiel G a kol. (Červen 2006). „Detekce lidské aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxylázy a homeoboxu B7 mRNA ve vzorcích cytologie štětcem od pacientů s rakovinou žlučovodů“. Endoskopie. 38 (6): 604–9. doi:10.1055 / s-2006-925065. PMID 16673309.
Gundogan F, Elwood G, Greco D, Rubin LP, Pinar H, Carlson RI a kol. (Leden 2007). "Role aspartyl- (asparaginyl) beta-hydroxylázy v implantaci placenty: Relevance k časné ztrátě těhotenství". Lidská patologie. 38 (1): 50–9. doi:10.1016 / j.humpath.2006.06.005. PMID 16949909.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198363 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028207 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7821814-5] Korioth F, Gieffers C, Frey J (prosinec 1994). "Klonování a charakterizace lidského genu kódujícího aspartyl beta-hydroxylázu". Gen. 150 (2): 395–9. doi:10.1016 / 0378-1119 (94) 90460-X. PMID 7821814.

[pmid10974562-6] Lim KY, Hong CS, Kim DH (září 2000). "klonování cDNA a charakterizace lidského srdečního junktinu". Gen. 255 (1): 35–42. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00299-7. PMID 10974562.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: ASPH aspartate beta-hydroxylase“.

[Ince_2000-8] Ince N, de la Monte SM, Wands JR (březen 2000). „Nadměrná exprese lidské aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxylázy je spojena s maligní transformací“. Výzkum rakoviny. 60 (5): 1261–6. PMID 10728685.

[Xue_2009-9] A ^b Xue T, Xue XP, Huang QS, Wei L, Sun K, Xue T (srpen 2009). „Monoklonální protilátky proti lidské aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxyláze vyvinuté imunizací DNA“. Hybridom. 28 (4): 251–7. doi:10.1089 / hyb.2009.0017. PMID 19663697.

[Palumbo_2002-10] A ^b Palumbo KS, Wands JR, Safran H, King T, Carlson RI, de la Monte SM (červenec 2002). "Lidské aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxyláza monoklonální protilátky: potenciální biomarkery pro karcinom pankreatu". Slinivka břišní. 25 (1): 39–44. doi:10.1097/00006676-200207000-00010. PMID 12131769. S2CID 2098747.

[urlCC_Detect_-_Serum-Based_Diagnostic_Test_For_Colon_Cancer_Available-11] „CC Detect - k dispozici diagnostický test na rakovinu tlustého střeva založený na séru“.

[pmid17986689-12] Hampton T (listopad 2007). „Nové screeningové techniky ukazují potenciál pro včasné odhalení rakoviny plic“. JAMA. 298 (17): 1997. doi:10.1001 / jama.298.17.1997. PMID 17986689.

[13] Patel N, Khan AO, Mansour A, Mohamed JY, Al-Assiri A, Haddad R a kol. (Květen 2014). „Mutace v ASPH způsobují dysmorfismus obličeje, dislokaci čočky, abnormality předního segmentu a spontánní filtrovací výkaly nebo Traboulsiho syndrom“. American Journal of Human Genetics. 94 (5): 755–9. doi:10.1016 / j.ajhg.2014.04.002. PMC 4067561. PMID 24768550.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

Oxidoreduktázy: dioxygenázy, počítaje v to steroidní hydroxylázy (ES 1.14)
1.14.11: 2-oxoglutarát	Prolylhydroxyláza HIF prolyl-hydroxyláza EGLN1 EGLN2 EGLN3 P4HTM Lysylhydroxyláza
1.14.13: NADH nebo NADPH	Monooxygenáza obsahující flavin FMO1 FMO2 FMO3 FMO4 FMO5 Syntáza oxidu dusnatého NOS1 NOS2 NOS3 Cholesterol 7 alfa-hydroxyláza Methan monooxygenáza 3A4 14α-demethyláza 24-hydroxycholesterol 7a-hydroxyláza
1.14.14: sníženo flavin nebo flavoprotein	19A1 2D6 2E1
1.14.15: sníženo železo-sirný protein	11B1 11B2 11A1
1.14.16: sníženo pteridin (BH4 závislé )	Fenylalanin hydroxyláza Tyrosin hydroxyláza Tryptofan hydroxyláza
1.14.17: sníženo askorbát	Dopamin beta-hydroxyláza
1.14.18 -19: jiný	Tyrosináza Stearoyl-CoA desaturáza-1
1.14.99 - různé	Cyklooxygenáza Hem oxygenáza (HMOX1 ) Skvalenmonooxygenáza 17A1 21A2 Ecdysone 20-monooxygenáza

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )