WWP2 - WWP2

WWP2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4Y07
Identifikátory
Aliasy	WWP2, AIP2, WWp2, WW doména obsahující E3 ubikvitinovou proteinovou ligázu 2
Externí ID	OMIM: 602308 MGI: 1914144 HomoloGene: 48490 Genové karty: WWP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	69,941,741 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	107,558,595 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba transkripčního faktoru RNA polymerázy II; • transkripční faktor vazba; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• membrána; • komplex ubikvitin ligázy; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• regulace membránového potenciálu; • regulace iontového transmembránového transportu; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • negativní regulace genové exprese; • proces modifikace buněčného proteinu; • negativní regulace transportu bílkovin; • regulace aktivity transmembránového transportéru iontů draslíku; • virový vstup; • GO: virový proces 0022415; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace aktivity transportéru; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • autoubiquitination bílkovin; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • ubikvitinace spojená s proteinem K63; • extracelulární transport; • ubikvitinace bílkovin; • polyubikvitinace bílkovin; • pozitivní regulace proteinového katabolického procesu; • negativní regulace signální dráhy Notch;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11060
	66894
	ENSG00000198373
	ENSMUSG00000031930
	O00308
	Q9DBH0
	NM_001270453; NM_001270454; NM_001270455; NM_007014; NM_199424
	NM_025830
	NP_001257382; NP_001257383; NP_001257384; NP_008945; NP_955456
	NP_080106
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

NEDD4 podobná E3 ubikvitin-protein ligáza WWP2 také známý jako protein interagující s atrofinem 1 (AIP2) nebo Protein obsahující WW doménu 2 (WWP2) je enzym že u lidí je kódován WWP2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny proteinů NEDD4. Je známo, že rodina proteinů vlastní ubikvitin-protein ligáza aktivita. Kódovaný protein obsahuje 4 tandem WW domény. WW doména je proteinový motiv skládající se z 35 až 40 aminokyselin a je charakterizován 4 konzervovanými aromatickými zbytky. WW doména může zprostředkovávat specifické interakce protein-protein. Pro tento gen byly nalezeny tři alternativně sestříhané varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[7] V neuronech myší ortolog Wwp2 a jeho homolog Wwp1 kontrolují získávání polarity, formování a větvení axonů, stejně jako migraci nově narozených nervových buněk do kortikální desky.^[8]

Interakce

WWP2 bylo prokázáno komunikovat s SCNN1B^[6]^[9] a ATN1.^[10]

Klinický význam

Celovečerní WWP2 (WWP2-FL) společně s N-terminál, (WWP2-N); C-terminál (WWP2-C) izoformy se váží SMAD bílkoviny. WWP2-FL interaguje s SMAD2, SMAD3 a SMAD7 v Dráha TGF-β. Izoforma WWP2-N interaguje s SMAD2 a SMAD3, zatímco WWP2-C interaguje pouze s SMAD7. Narušení interakcí mezi WWP2 a SMAD7 může stabilizovat hladiny proteinu SMAD7 a zabránit indukci TGF-β Epiteliálně-mezenchymální přechod. Inhibice WWP2 tedy může vést k deaktivaci inhibitoru, který normálně řídí růst buněk a tumorogeneze. V tkáňových kulturách bez inhibitoru SMAD7, rakovinné buňky se rychle šířily, takže umlčení WWP2 zabránilo šíření.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198373 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031930 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Pirozzi G, McConnell SJ, Uveges AJ, Carter JM, Sparks AB, Kay BK, Fowlkes DM (červen 1997). "Identifikace nových proteinů obsahujících lidskou WW doménu klonováním ligandových cílů". J Biol Chem. 272 (23): 14611–6. doi:10.1074 / jbc.272.23.14611. PMID 9169421.
^ ^A ^b McDonald FJ, Western AH, McNeil JD, Thomas BC, Olson DR, Snyder PM (srpen 2002). „Ubikvitin-proteinová ligáza WWP2 se váže na epiteliální Na (+) kanál a snižuje jeho hladinu“. Am J Physiol Renal Physiol. 283 (3): F431–6. doi:10.1152 / ajprenal.00080.2002. PMID 12167593.
^ ^A ^b „Entrez Gene: WWP2 WW doména obsahující E3 ubikvitinovou proteinovou ligázu 2“.
^ Ambrozkiewicz MC, Schwark M, Kishimoto-Suga M, Borisova E, Hori K, Salazar-Lázaro A, Rusanova A, Altas B, Piepkorn L, Bessa P, Schaub T, Zhang X, Rabe T, Ripamonti S, Rosário M, Akiyama H, Jahn O, Kobayashi T, Hoshino M, Tarabykin V, Kawabe H (prosinec 2018). „Získávání polarity u kortikálních neuronů je poháněno synergickým účinkem ubikvitinových ligas regulovaných na Sox9 a Wwp2 E3 a intronické miR-140“. Neuron. 100 (5): 1097–1115.e15. doi:10.1016 / j.neuron.2018.10.008. PMID 30392800.
^ Harvey KF, Dinudom A, Cook DI, Kumar S (březen 2001). „Protein podobný Nedd4 KIAA0439 je potenciálním regulátorem sodíkového kanálu epitelu“. J. Biol. Chem. 276 (11): 8597–601. doi:10,1074 / jbc.C000906200. PMID 11244092.
^ Wood JD, Yuan J, Margolis RL, Colomer V, Duan K, Kushi J, Kaminsky Z, Kleiderlein JJ, Sharp AH, Ross CA (červen 1998). „Atrophin-1, produkt genu DRPLA, interaguje se dvěma rodinami proteinů obsahujících WW doménu“. Mol. Buňka. Neurosci. 11 (3): 149–60. doi:10,1006 / mcne.1998.0677. PMID 9647693. S2CID 20003277.
^ Soond SM, Chantry A (2011). „Selektivní cílení na aktivační a inhibiční Smads odlišnými izoformami ubikvitin ligázy WWP2 odlišně moduluje signalizaci TGFβ a EMT“. Onkogen. 30 (21): 2451–62. doi:10.1038 / dne 2010.617. PMC 4073228. PMID 21258410. Shrnutí ležel – BBC novinky.

Další čtení

Jonsson AB (1998). „Identifikace lidského klonu cDNA, který zprostředkovává adherenci patogenní Neisserie k nevázaným buňkám“. FEMS Microbiol. Lett. 162 (1): 25–30. doi:10.1111 / j.1574-6968.1998.tb12974.x. PMID 9595660.
Wood JD, Yuan J, Margolis RL, Colomer V, Duan K, Kushi J, Kaminsky Z, Kleiderlein JJ, Sharp AH, Ross CA (1998). „Atrophin-1, produkt genu DRPLA, interaguje se dvěma rodinami proteinů obsahujících WW doménu“. Mol. Buňka. Neurosci. 11 (3): 149–60. doi:10,1006 / mcne.1998.0677. PMID 9647693. S2CID 20003277.
Winberg G, Matskova L, Chen F, Plant P, Rotin D, Gish G, Ingham R, Ernberg I, Pawson T (2000). „Latentní membránový protein 2A viru Epstein-Barrové váže proteinové ubikvitinové ligázy WW domény E3, které ubikvitinují tyrosinkinázy B-buněk“. Mol. Buňka. Biol. 20 (22): 8526–35. doi:10.1128 / MCB.20.22.8526-8535.2000. PMC 102158. PMID 11046148.
Harvey KF, Shearwin-Whyatt LM, Fotia A, Parton RG, Kumar S (2002). „N4WBP5, potenciální cíl pro ubikvitinaci proteinů rodiny Nedd4, je nový protein spojený s Golgi“ (PDF). J. Biol. Chem. 277 (11): 9307–17. doi:10,1074 / jbc.M110443200. PMID 11748237. S2CID 37817970.
Galinier R, Dna E, Lortat-Jacob H, Wood J, Chroboczek J (2003). „Adenovirový protein zapojený do internalizace viru získává ubikvitin-proteinové ligázy“. Biochemie. 41 (48): 14299–305. doi:10.1021 / bi020125b. PMID 12450395.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Shearwin-Whyatt LM, Brown DL, Wylie FG, Stow JL, Kumar S (2005). „N4WBP5A (Ndfip2), protein interagující s Nedd4, se lokalizuje do multivesikulárních těl a Golgi a má potenciální roli v obchodování s proteiny“. J. Cell Sci. 117 (Pt 16): 3679–89. doi:10.1242 / jcs.01212. PMID 15252135.
Rougier JS, van Bemmelen MX, Bruce MC, Jespersen T, Gavillet B, Apothéloz F, Cordonier S, Staub O, Rotin D, Abriel H (2005). "Molekulární determinanty napěťově řízené regulace sodíkových kanálů proteiny podobnými Nedd4 / Nedd4". Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 288 (3): C692–701. doi:10.1152 / ajpcell.00460.2004. PMID 15548568. S2CID 5342436.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198373 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031930 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9169421-5] Pirozzi G, McConnell SJ, Uveges AJ, Carter JM, Sparks AB, Kay BK, Fowlkes DM (červen 1997). "Identifikace nových proteinů obsahujících lidskou WW doménu klonováním ligandových cílů". J Biol Chem. 272 (23): 14611–6. doi:10.1074 / jbc.272.23.14611. PMID 9169421.

[pmid12167593-6] A ^b McDonald FJ, Western AH, McNeil JD, Thomas BC, Olson DR, Snyder PM (srpen 2002). „Ubikvitin-proteinová ligáza WWP2 se váže na epiteliální Na (+) kanál a snižuje jeho hladinu“. Am J Physiol Renal Physiol. 283 (3): F431–6. doi:10.1152 / ajprenal.00080.2002. PMID 12167593.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: WWP2 WW doména obsahující E3 ubikvitinovou proteinovou ligázu 2“.

[8] Ambrozkiewicz MC, Schwark M, Kishimoto-Suga M, Borisova E, Hori K, Salazar-Lázaro A, Rusanova A, Altas B, Piepkorn L, Bessa P, Schaub T, Zhang X, Rabe T, Ripamonti S, Rosário M, Akiyama H, Jahn O, Kobayashi T, Hoshino M, Tarabykin V, Kawabe H (prosinec 2018). „Získávání polarity u kortikálních neuronů je poháněno synergickým účinkem ubikvitinových ligas regulovaných na Sox9 a Wwp2 E3 a intronické miR-140“. Neuron. 100 (5): 1097–1115.e15. doi:10.1016 / j.neuron.2018.10.008. PMID 30392800.

[pmid11244092-9] Harvey KF, Dinudom A, Cook DI, Kumar S (březen 2001). „Protein podobný Nedd4 KIAA0439 je potenciálním regulátorem sodíkového kanálu epitelu“. J. Biol. Chem. 276 (11): 8597–601. doi:10,1074 / jbc.C000906200. PMID 11244092.

[pmid9647693-10] Wood JD, Yuan J, Margolis RL, Colomer V, Duan K, Kushi J, Kaminsky Z, Kleiderlein JJ, Sharp AH, Ross CA (červen 1998). „Atrophin-1, produkt genu DRPLA, interaguje se dvěma rodinami proteinů obsahujících WW doménu“. Mol. Buňka. Neurosci. 11 (3): 149–60. doi:10,1006 / mcne.1998.0677. PMID 9647693. S2CID 20003277.

[Soond_2011-11] Soond SM, Chantry A (2011). „Selektivní cílení na aktivační a inhibiční Smads odlišnými izoformami ubikvitin ligázy WWP2 odlišně moduluje signalizaci TGFβ a EMT“. Onkogen. 30 (21): 2451–62. doi:10.1038 / dne 2010.617. PMC 4073228. PMID 21258410. Shrnutí ležel – BBC novinky.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

Enzymy: CO CS a CN ligázy (ES 6.1-6.3)
6.1: Uhlík-kyslík	Aminoacyl tRNA syntetáza Alanin Arginin Asparagin Aspartát Cystein D-alanin - poly (fosforibitol) ligáza Glutamát Glutamin Glycin Histidin Isoleucin Leucin Lysin Methionin Fenylalanin Prolin Serine Threonin Tryptofan Tyrosin Valine
6.2: Uhlík-síra	Sukcinyl koenzym syntetáza Acetyl-CoA syntetáza Mastná kyselina s dlouhým řetězcem - CoA ligáza
6.3: Uhlík-dusík	Glutamin syntetáza Ubikvitin ligáza Cullin Von Hippel – Lindau nádorový supresor UBE3A Mdm2 Komplex podporující anafázu UBR1 Glutathion syntetáza CTP syntetáza Adenylosukcinát syntáza Argininosukcinát syntáza Holokarboxyláza syntetáza GMP syntáza Asparagin syntetáza Karbamoylfosfát syntetáza Já II Glutamát-cysteinová ligáza

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )