Termotoga - Thermotoga - Wikipedia

Termotoga
Thermotoga sketch.svg
Nástin a Thermotoga maritima část zobrazující „toga“
Vědecká klasifikace E
Doména:Bakterie
Kmen:Thermotogae
Objednat:Thermotogales
Rodina:Thermotogaceae
Rod:Termotoga
Druh

Thermotoga caldifontis[1]
Thermotoga elfii
Thermotoga hypogea
Thermotoga lettingae
Thermotoga maritima
Thermotoga naphthophila
Thermotoga neapolitana
Thermotoga petrophila
Thermotoga profunda[1]
Thermotoga subterranea
Thermotoga thermarum

Termotoga je rod kmene Thermotogae. Členové Termotoga jsou hypertermofilní bakterie jehož buňka je zabalena v jedinečné vnější membráně podobné pouzdru, nazývané „tóga“.

Členové kmene skvrna Gramnegativní protože mají hubenou peptidoglykan mezi dvěma lipidovými dvojvrstvy, i když oběmi zvláštními.[2] Peptidoglykan je neobvyklý, protože nejen zesíťování meso-diaminopimelát jak se vyskytuje v Proteobakterie, ale D-lysin.[Poznámka 1][3]

Druhy jsou anaeroby s různým stupněm tolerance vůči kyslíku. Jsou schopné redukovat elementární síru (S0) na sirovodík, který lze zase použít.[2]

Zda je termofilie inovací linie nebo vlastností předků, je nejasné a nelze ji určit.
Genom Thermotoga maritima byl sekvenován v roce 1999 a odhalil několik genů archaeálního původu, což možná umožnilo jeho termofilní adaptaci.[4] Obsah CG (cytosin-guanin) v T. maritima je 46,2%;[2] většina termofilů má ve skutečnosti vysoký obsah CG; to vedlo ke spekulacím, že obsah CG může být nepodstatným důsledkem termofilie a nikoli hnací silou termofilie.[5][6]

Členové a příbuzní

Typový druh rodu je T. maritima, poprvé popsáno v roce 1986.[2] V té době to byl první druh kmenů, který byl popsán. Rod Termotoga nyní obsahuje devět oficiálních druhů,[7] zatímco kmen obsahuje jednu rodinu (Thermotogaceae) s deseti úředními rody (Fervidobacterium, Geotoga, Kosmotoga, Marinitoga,Mezotoga, Petrotoga, Termokoky, Thermosipho, Termotoga a Oceanotoga ).

T. subterranea kmen SL1 byl nalezen v 70 ° C hlubokém kontinentu olej nádrž ve východní pařížské pánvi, Francie.[8]

Přesný vztah Thermotogae k dalšímu kmenu se diskutuje (proti. bakteriální kmen ): několik studií zjistilo, že je hluboce větvící (v Bergeyův manuál ve skutečnosti se objevil ve svazku „Volume I: The Archaea a hluboce se rozvětvující a fototrofní bakterie "),[9] zatímco ostatní našli Firmicutes být hluboce větvící se Thermotogae shlukování od základny.

název

Článek a kapitola v Bergeyho manuálu byly autorem několika autorů včetně mikrobiologů Karl Stetter a Carl Woese.[2]

The nová latina ženské jméno "thermotoga" znamená "horký svrchní oděv", který je kombinací řecký podstatné jméno θέρμη (Therme, teplo)[10] nebo přesněji adjektivum θερμός, ή, όν (termoska, e, on, horké)[11] a latinské ženské podstatné jméno tóga (římský svrchní oděv).[2]

Poznámky pod čarou

  1. ^ Všechny proteinogenní aminokyseliny mají L-konfiguraci; v peptidoglykanu jsou přítomny některé aminokyseliny s D-konfigurací.
    Lysin je syntetizován z meso-diaminopimelátu pomocí Diaminopimelát dekarboxyláza.

Reference

  1. ^ A b LPSN lpsn.dsmz.de
  2. ^ A b C d E F Huber, R .; T. A. Langworthy; H. Konig; M. Thomm; C. R. Woese; U. B. Sleytr; K. O. Stetter (1986). „Thermotoga maritima sp. Nov. Představuje nový rod jedinečných extrémně termofilních eubakterií rostoucích až do 90 ° C“ (PDF). Oblouk. Microbiol. 144 (4): 324–333. doi:10.1007 / BF00409880.
  3. ^ Boniface, A .; Parquet, C .; Arthur, M .; Mengin-Lecreulx, D .; Blanot, D. (2009). „Objasnění struktury peptidoglykanu Thermotoga maritima odhaluje dva nové typy síťování“. Journal of Biological Chemistry. 284 (33): 21856–21862. doi:10.1074 / jbc.M109.034363. PMC  2755910. PMID  19542229.
  4. ^ Fraser, C. M .; Clayton, K. E .; Gill, R. A .; Gwinn, S. R .; Dodson, M. L .; Haft, R. J .; Hickey, D. H .; Peterson, E. K .; Nelson, J. D .; Ketchum, W. C .; McDonald, K. A .; Utterback, L .; Malek, T. R .; Linher, J. A .; Garrett, K. D .; Stewart, M. M .; Cotton, A. M .; Pratt, M. D .; Phillips, M. S .; Richardson, C. A .; Heidelberg, D .; Sutton, J .; Fleischmann, G. G .; Eisen, R. D .; White, J. A .; Salzberg, O .; Smith, S.L .; Venter, H. O .; Fraser, J. C. (1999). "Důkazy pro laterální přenos genů mezi Archeaou a bakteriemi ze sekvence genomu Thermotoga maritima". Příroda. 399 (6734): 323–329. Bibcode:1999 Natur.399..323N. doi:10.1038/20601. PMID  10360571.
  5. ^ Pasamontes, A .; Garcia-Vallve, S. (2006). „Použití vícecestné metody k analýze aminokyselinového složení konzervované skupiny ortologních proteinů u prokaryot“. BMC bioinformatika. 7: 257. doi:10.1186/1471-2105-7-257. PMC  1489954. PMID  16709240.
  6. ^ Puigbò, P .; Pasamontes, A .; Garcia-Vallve, S. (2008). "Získání a ztráta termofilní adaptace u prokaryot". Trendy v genetice. 24 (1): 10–14. doi:10.1016 / j.tig.2007.10.005. PMID  18054113.
  7. ^ vstup termotoga v LPSN; Euzéby, J.P. (1997). „Seznam bakteriálních jmen se stálým názvoslovím: složka dostupná na internetu“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 47 (2): 590–2. doi:10.1099/00207713-47-2-590. PMID  9103655.
  8. ^ Li H, Yang SZ, Mu BZ, Rong ZF, Zhang J (2007). „Molekulární fylogenetická diverzita mikrobiální komunity spojená s vysokoteplotní ropnou nádrží na ropném poli na moři“. FEMS Microbiol Ecol. 60 (1): 74–84. doi:10.1111 / j.1574-6941.2006.00266.x. PMID  17286581.
  9. ^ Boone, David R .; Castenholz, Richard W. (18. května 2001) [1984 (Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (ed.). Archaea a hluboce se rozvětvující a fototrofní bakterie. Bergeyho příručka systematické bakteriologie. 1 (2. vyd.). New York: Springer. str.721. ISBN  978-0-387-98771-2. Britská knihovna č. GBA561951.
  10. ^ θέρμη. Liddell, Henry George; Scott, Robert; Řecko-anglický lexikon na Projekt Perseus
  11. ^ θερμός. Liddell, Henry George; Scott, Robert; Řecko-anglický lexikon na Projekt Perseus