Thermotoga elfii - Thermotoga elfii
Thermotoga elfii | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Doména: | |
Kmen: | |
Objednat: | |
Rodina: | |
Rod: | |
Druh: | T. elfii |
Binomické jméno | |
Thermotoga elfii Ravot a kol. 1995 |
Thermotoga elfii je ve tvaru tyče, glukóza-kvasící bakterie. Typ kmene T. elfii je SEBR 6459T.[1] Rod Termotoga původně byla považována za přísně nalezenou v okolí ponorky hydrotermální průduchy, ale tento organismus byl následně izolován v afrických ropných vrtech v roce 1995.[1] Ochranný vnější plášť umožňuje tomuto mikrobu být termofilní.[1] Tento organismus nemůže fungovat v přítomnosti kyslík dělat to přísně anaerobní.[1] Některé výzkumy naznačují, že thiosíran - snižování vlastností v tomto organismu by mohlo vést ke snížení biokoroze v ropném zařízení v průmyslovém prostředí.[2]
Dějiny
Objev
Rod Termotoga, o kterém se dříve myslelo, že se nachází jen kolem podmořských hydrotermálních průduchů, byl objeven v roce Severomorské ropné vrty.[1] Kvůli tomuto objevu začaly být vyšetřovány další vrty v této oblasti, což vedlo k objevu Thermotoga elfii v afrických ropných vrtech v dubnu 1995.[1] T. elfii byl shromážděn v jednolitrovém vzorku u hlava studny při 68 ° C.[1] Ravot a kol. izoloval tento druh pomocí pěstování na bazální médium obsahující mnoho různých živin a zdrojů (voda, sůl, glukóza, octan sodný atd.) v laboratoři a poté opakovanými zkouškami technika ředění na agaru.[1] Tito vědci dospěli k závěru stanovením čistoty vzorků pomocí mikroskopie.[1]
Taxonomie
Křestní jméno Thermotoga elfii je odvozen z řecký kořen „therm“, což znamená teplo.[3] „Toga,“ což je římský výraz pro svrchní oděv je místo, kde pochází druhá část názvu rodu.[3] To je způsobeno vnějším pláštěm, které obaluje bakterie, aby ji chránily před extrémní teplotou často spojenou s tímto termofilem.[1] Druhý název je odvozen od Elf-Akvitánie, francouzská ropná společnost, která vlastnila ropné vrty, kde T. elfii byl poprvé objeven.[1]
Fyziologie a metabolismus
Therotoga elfii kolonie 1 milimetr byly pozorovány v laboratorním prostředí, ale skutečná struktura tyčinkovitého tvaru T. elfii je mezi 0,5–3 mikrometry dlouhý.[1] Jeho ochranný vnější plášť je určující charakteristikou, která pomáhala při zajišťování T. elfii jeho jméno.[1] Tato struktura balónky přes každou stranu organismu a chrání jej před extrémním teplem.[1] Když Gramovo barvení se provádí na tomto organismu, a gramnegativní výsledek se očekává.[1] T. elfii má bičíky rovnoměrně rozloženo po celém těle, což z něj dělá peritrichózní bakterie.[1] Je to také obligátní anaerob, což znamená, že nemůže tolerovat kyslík.[1] Akceptory elektronů zahrnují thiosíran, arabinóza, bio-tryptikáza, fruktóza, glukóza, laktóza, sladový cukr, ribóza, sacharóza, a xylóza.[1] Dárci elektronů zahrnout acetát, oxid uhličitý, a vodík.[1]
Genom a fylogeneze
The 16s RNA gen je 1519 základny dlouho s Obsah GC 39,6 mol.%.[1] Kvůli T. elfiiRelativně nový stav, mnoho informací o počtu genů stále není znám.[1] Avšak 91,9% příbuzného tohoto druhu, Thermotoga maritima, bylo zdokumentováno, že má 1,86 milionu párů bází s 1,877 předpokládanými kódující oblasti.[4] Fylogenická rodina pro Thermotoga elfii obsahuje organismy jako např Thermotoga thermarum, Thermotoga maritima, a Thermosipho africanus, které mají zhruba 90% vztah k tomuto organismu.[1]
Ekologie
Rod Termotoga obsahuje jedny z nejvíce známých termofilních mikroorganismů.[5] Skládá se z druhů, které jsou termofilní a hypertermofilní, které mohou prospívat při teplotách až 80 ° C.[5] The optimální růst teplota pro Thermotoga elfii, nicméně, je 66 ° C.[1] Optimální pH je 7,5 a optimální slanost je 1,2%.[1]
Aplikace
Průmyslové aplikace
Objev T. elfii byla považována za významnou, protože vedla k dalším objevům methanogeny, termofily a redukující síran bakterie.[1] Tento organismus a ostatní objevení v tomto jedinečném prostředí mohou pomoci pokročit v procesech obnovy oleje pomocí mikrobů.[6] Thiosíran, často zapojený do koroze kovů používaných v ropovody, se redukuje na sulfid podle Thermotoga elfii, což vede mnoho vědců k přesvědčení, že má zásadní roli při ochraně zařízení na těžbu ropy.[1][6][2]
Environmentální aplikace
V mnoha anoxický termální mořské horké prameny, k oxidaci thiosíranu často nedochází nebo k němu dochází extrémně nízkou rychlostí.[2] Tyto termofilní reduktory thiosíranu mohou hrát klíčovou roli v mineralizace organických sloučenin do jednodušších forem přístupných rostlinám.[2]
Reference
- ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó p q r s t u proti w X y z RAVOT, G .; MAGOT, M .; FARDEAU, M.-L .; PATEL, B. K. C .; PRENSIER, G .; EGAN, A .; GARCIA, J.-L .; OLLIVIER, B. (01.04.1995). „Thermotoga elfii sp. Nov., Nová termofilní bakterie z africké studny produkující ropu“. International Journal of Systematic Bacteriology. 45 (2): 308–314. doi:10.1099/00207713-45-2-308. PMID 7537064.
- ^ A b C d Ravot, G .; Ollivier, B .; Magot, M .; Patel, B .; Crolet, J .; Fardeau, M .; Garcia, J. (1995-05-01). „Redukce thiosíranu, důležitý fyziologický rys sdílený členy řádu thermotogales“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 61 (5): 2053–2055. ISSN 0099-2240. PMC 1388453. PMID 16535035.
- ^ A b „Henry George Liddell, Robert Scott, přechodný řecko-anglický lexikon, ἀάατος“. www.perseus.tufts.edu. Citováno 2016-04-11.
- ^ Nelson, Karen E .; Clayton, Rebecca A .; Gill, Steven R.; Gwinn, Michelle L .; Dodson, Robert J .; Haft, Daniel H .; Hickey, Erin K .; Peterson, Jeremy D .; Nelson, William C. (1999-05-27). "Důkazy pro laterální přenos genů mezi Archeaou a bakteriemi ze sekvence genomu Thermotoga maritima". Příroda. 399 (6734): 323–329. Bibcode:1999 Natur.399..323N. doi:10.1038/20601. ISSN 0028-0836. PMID 10360571.
- ^ A b Frock, Andrew D .; Notey, Jaspreet S .; Kelly, Robert M. (01.09.2010). "Rod Thermotoga: nedávný vývoj". Environmentální technologie. 31 (10): 1169–1181. doi:10.1080/09593330.2010.484076. ISSN 0959-3330. PMC 3752655. PMID 20718299.
- ^ A b Bernard, F.P .; Connan, Jacques; Magot, Michel (1992). „Domorodé mikroorganismy v kondenzované vodě mnoha ropných polí: nový nástroj v průzkumných a těžebních technikách“. Výroční technická konference a výstava SPE. doi:10,2118 / 24811-ms.
Další čtení
- Dworkin, Martin a Stanley Falkow, eds. Prokaryotes: sv. 7: Proteobakterie: Delta a Epsilon podtřídy. Hluboce zakořeněné bakterie. Sv. 7. Springer, 2006.
- Devrije, T (2002). "Předčištění Miscanthus pro výrobu vodíku Thermotoga elfii". International Journal of Hydrogen Energy. 27 (11–12): 1381–1390. doi:10.1016 / S0360-3199 (02) 00124-6. ISSN 0360-3199.
- Fardeau, Marie-Laure; Goulhen, Florencie; Bruschi, Mireille; Khelifi, Nadia; Cayol, Jean-Luc; Ignatiadis, Ioannis; Guyot, François; Ollivier, Bernard (2009). „Archaeoglobus fulgidusandThermotoga elfii, termofilní izoláty z hlubinné geotermální vody v pařížské pánvi“. Geomikrobiologický deník. 26 (2): 119–130. doi:10.1080/01490450802674970. ISSN 0149-0451.