Kryptonie - Kryptonia

Kryptonie je bakteriální kmen s kandidát postavení. Je členem skupiny FCB.[1]

Kmen byl poprvé navržen v roce 2016 po obnovení genomů z rozsáhlého úsilí těžit metagenomické a jednobuněčný genomický datové sady pro novou bakteriální rozmanitost.[2] Rozsáhlá analýza 5,2 Tb metagenomických dat z celého světa naznačuje, že členové Kryptonie se vyskytují výhradně ve vysokoteplotních geotermálních pramenech pH-netural, jako je bazén Jinze (provincie Yunnan, Čína), pramen Dewar Creek (Britská Kolumbie, Kanada) a Great Boiling Spring (Nevada, USA).[2] Kvůli neshodám primerů byli členové tohoto kmene široce nedostatečně detekováni v průzkumech komunitního složení založených na sekvenování 16S rRNA.

Analýza prvních genomů získaných z této skupiny (ze čtyř různých rodů) naznačuje, že členové Kryptonie jsou heterotrofi s domnělou schopností dýchat železem.[2] Je z nich odvozeno, že nejsou schopné samy produkovat klíčové metabolické sloučeniny (např .: biotin, určité aminokyseliny), a proto mohou být metabolicky závislé na jiných mikrobech v jejich prostředí, i když povaha takového vztahu není známa.[2]

Název „Kryptonia“ je odvozen z řeckého díla „krupton“, což znamená „skrytý“ nebo „tajný“. Toto je kývnutí na kmen, který má dosud uniklou detekci kvůli předsudkům SSU rRNA primerů.

Reference

  1. ^ Eloe-Fadrosh, Emiley A .; Paez-Espino, David; Jarett, Jessica; Dunfield, Peter F .; Hedlund, Brian P .; Dekas, Anne E .; Grasby, Stephen E .; Brady, Allyson L .; Dong, Hailiang; Briggs, Brandon R .; Li, Wen-Jun (2016-01-27). „Globální metagenomický průzkum odhalil nový kmen bakterií v geotermálních pramenech“. Příroda komunikace. 7 (1): 10476. Bibcode:2016NatCo ... 710476E. doi:10.1038 / ncomms10476. ISSN  2041-1723. PMC  4737851. PMID  26814032.
  2. ^ A b C d Eloe-Fadrosh, Emiley A .; Paez-Espino, David; Jarett, Jessica; Dunfield, Peter F .; Hedlund, Brian P .; Dekas, Anne E .; Grasby, Stephen E .; Brady, Allyson L .; Dong, Hailiang; Briggs, Brandon R .; Li, Wen-Jun (2016-01-27). „Globální metagenomický průzkum odhalil nový bakteriální kandidát kmen v geotermálních pramenech“. Příroda komunikace. 7 (1): 10476. Bibcode:2016NatCo ... 710476E. doi:10.1038 / ncomms10476. ISSN  2041-1723. PMC  4737851. PMID  26814032.