Delfibakterie - Delphibacteria

Metabolická rekonstrukce člena kmene Delphibacteria phylum.[1] Jsou zobrazeny klíčové předpokládané metabolické a funkční vlastnosti. Geny zájmu jsou označeny zkratkami v barevných tvarech. Vyplněné tvary představují geny, u nichž se předpokládá přítomnost nebo pravděpodobnost, že budou přítomny, zatímco nevyplněné tvary představují geny, které nebyly identifikovány.

Delfibakterie je kandidát bakteriální kmen v Skupina FCB. Kmen byl poprvé navržen po analýze dvou genomů z úst dvou delfíny skákavé. „Dephibacteria“ byla navržena jako uznání prvních genomových zástupců, kteří byli získáni z tlamy delfínů. Členové kmene Delphibacteria phylum byli zpětně detekováni v různých prostředích.

Popis

Delphibacteria je a bakteriální kmen s kandidát status, což znamená, že nemá kultivovaný zástupci. Je součástí Skupina FCB.[1]

Dějiny

Kmen byl poprvé navržen po získání a analýze dvou genomů, každý z úst jiného delfín skákavý.[1] Tito delfíni byli součástí Program námořních savců amerického námořnictva, ačkoli Delphibacteria 16S rRNA geny byly také zjištěny v ústech divokých delfínů žijících u pobřeží Floridy v USA[1][2] První charakterizovaný člen kmene Delphibacteria phylum byl odvozen jako a heterotrofní organismus s genomovým potenciálem pro kyslík a s největší pravděpodobností redukcí dusičnanů.[1] Předpokládalo se, že schopnost provádět denitrifikaci může mít dopad na fyziologii a zdraví delfínů,[1] vzhledem k tomu, že u lidí může denitrifikace orálními bakteriemi ovlivnit tok krve ústní a žaludeční, signalizující interakce bakterie-bakterie a bakterie-hostitel a tloušťku hlenu v žaludku.[3][4]

Název „Dephibacteria“ byl navržen jako uznání prvních genomových zástupců, kteří byli získáni z tlamy delfínů (rodina Delphinidae ) a díky své všudypřítomnosti v ústech delfínů.[1][2] Členové kmene Delphibacteria phylum byli detekováni (zpětně) v různých prostředích, včetně spodní voda ze Severního Beringova moře (EU734960.1 ), mořský sediment z hydrotermálního odvzdušnění Logatchec (FN554086.1 ) a hlubinný sediment z Okinawa koryto (KX097792.1 ).[1]

Reference

  1. ^ A b C d E F G h Dudek, Nataša K .; Sun, Christine L .; Burstein, David; Kantor, Rose S .; Aliaga Goltsman, Daniela S .; Bik, Elisabeth M .; Thomas, Brian C .; Banfield, Jillian F .; Relman, David A. (2017-12-18). „Nová mikrobiální rozmanitost a funkční potenciál v ústním mikrobiomu mořských savců“. Aktuální biologie. 27 (24): 3752–3762.e6. doi:10.1016 / j.cub.2017.10.040. ISSN  1879-0445. PMID  29153320.
  2. ^ A b Bik, Elisabeth M .; Costello, Elizabeth K .; Switzer, Alexandra D .; Callahan, Benjamin J .; Holmes, Susan P .; Wells, Randall S .; Carlin, Kevin P .; Jensen, Eric D .; Venn-Watson, Stephanie; Relman, David A. (2016-02-03). „Mořští savci ukrývají jedinečné mikrobioty formované mořem a přesto odlišné od moře“. Příroda komunikace. 7 (1): 10516. Bibcode:2016NatCo ... 710516B. doi:10.1038 / ncomms10516. ISSN  2041-1723. PMC  4742810. PMID  26839246.
  3. ^ Schreiber, Frank; Stief, Peter; Gieseke, Armin; Heisterkamp, ​​Ines M .; Verstraete, Willy; de Beer, Dirk; Stoodley, Paul (2010-03-22). „Denitrifikace v lidském zubním plaku“. Biologie BMC. 8: 24. doi:10.1186/1741-7007-8-24. ISSN  1741-7007. PMC  2859859. PMID  20307293.
  4. ^ Lundberg, Jon O .; Weitzberg, Eddie; Gladwin, Mark T. (únor 2008). „Dusičnan – dusitan – oxid dusnatý ve fyziologii a terapeutice“. Recenze přírody Objev drog. 7 (2): 156–167. doi:10.1038 / nrd2466. ISSN  1474-1784. PMID  18167491.