Zixibakterie - Zixibacteria - Wikipedia

Zixibakterie je bakteriální kmen s kandidát status, což znamená, že neměl žádné kultivované zástupce.[1]. Je členem Skupina FCB[2]

Zixibakterie byly navrženy jako bakteriální kmen po získání genomu z reprezentativního RBG-1.[1]. Tento genom byl získán pomocí rozlišení genomu metagenomika ze vzorků sedimentu zvodnělé vrstvy přiléhající k řece Colorado (CO, USA) a naznačuje metabolickou všestrannost, která je pravděpodobně nezbytná pro život v rychle se měnícím prostředí, jako jsou usazeniny vodonosné vrstvy[1]

Od té doby, co byl v roce 2013 navržen jako kmen, byli členové kmene Zixibacteria detekováni v různých jiných prostředích (někdy zpětně), včetně podpovrchových sedimentů (WA, USA).[3]voda v ústí (NC, USA)[4], vklady jeskyně moonmilk (Comblain-au-Pont, Belgie)[5]a tekutiny hlubokého podpovrchového lomu ze zlatého dolu (SD, USA)[6]

Reference

  1. ^ A b C Castelle, Cindy J .; Hug, Laura A .; Wrighton, Kelly C .; Thomas, Brian C .; Williams, Kenneth H .; Wu, Dongying; Tringe, Susannah G .; Singer, Steven W .; Eisen, Jonathan A .; Banfield, Jillian F. (2013-08-27). „Mimořádná fylogenetická diverzita a metabolická všestrannost v sedimentu zvodnělé vrstvy“. Příroda komunikace. 4 (1): 2120. doi:10.1038 / ncomms3120. ISSN  2041-1723. PMC  3903129. PMID  23979677.
  2. ^ „Taxonomy - candidate division Zixibacteria“. Uniprot Taxonomy Server. 25. května 2018. Citováno 17. května 2020.
  3. ^ Lin, Xueju; Kennedy, David; Fredrickson, Jim; Bjornstad, Bruce; Konopka, Allan (2012). "Vertikální stratifikace složení podpovrchové mikrobiální komunity napříč geologickými formacemi na Hanfordově místě". Mikrobiologie prostředí. 14 (2): 414–425. doi:10.1111 / j.1462-2920.2011.02659.x. ISSN  1462-2920. PMID  22122741.
  4. ^ Baker, Brett J .; Lazar, Cassandre Sara; Teske, Andreas P .; Dick, Gregory J. (2015-04-13). „Genomické rozlišení vazeb v cyklech uhlíku, dusíku a síry mezi rozšířenými bakteriemi ústí sedimentů“. Mikrobiom. 3 (1): 14. doi:10.1186 / s40168-015-0077-6. ISSN  2049-2618. PMC  4411801. PMID  25922666.
  5. ^ Maciejewska, Marta; Całusińska, Magdalena; Cornet, Luc; Adam, Delphine; Pessi, Igor S .; Malchair, Sandrine; Delfosse, Philippe; Baurain, Denis; Barton, Hazel A .; Carnol, Monique; Rigali, Sébastien (2018-03-21). „Vysoce výkonná sekvenční analýza aktinobakteriální prostorové rozmanitosti v ložiskách měsíčního mléka“. Antibiotika. 7 (2): 27. doi:10,3390 / antibiotika7020027. ISSN  2079-6382. PMC  6023079. PMID  29561792.
  6. ^ Momper, Lily; Jungbluth, Sean P .; Lee, Michael D .; Změnit, Jan P. (říjen 2017). „Energetické a uhlíkové metabolismy v hluboké pozemské mikrobiální komunitě podpovrchových tekutin“. Časopis ISME. 11 (10): 2319–2333. doi:10.1038 / ismej.2017.94. ISSN  1751-7370. PMC  5607374. PMID  28644444.