Fermentibakterie - Fermentibacteria - Wikipedia

Fermentibakterie
Vědecká klasifikace
Doména:
Bakterie
Nadkmen:
Skupina FCB
Kmen:
Fermentibakterie

Fermentibakterie (dříve Hyd24-12) je a bakteriální kmen s kandidát postavení. Je součástí Skupina FCB.[1]

Původní klonová sekvence použitá k definování Fermentibacteria jako kmene (AJ535232 ) byl získán z prostředí chladného prosakování Hydrate Ridge (Cascadia Margin, offshore z OR, USA).[2] První genomy z tohoto kmene byly získány ze vzorků mezofilních anaerobních digestorů v dánském zařízení na čištění odpadních vod.[1] Všechny tři získané genomy byly odvozeny tak, aby představovaly organismy, které se spoléhají na fermentaci jednoduchých cukrů jako zdroje energie, a proto byl navržen název „Fermentibacteria“ (jako v „fermentovat“).[1]

Členové tohoto kmene byli detekováni v široké škále prostředí, včetně prosakování metanu,[3] korálový útes písek,[4] a ústa delfína.[5]

Navrhované druhy zahrnují Fermentibacter daniensis[1] a Sabulitectum ztichne[6]

Reference

  1. ^ A b C d Kirkegaard, Rasmus Hansen; Dueholm, Morten Simonsen; McIlroy, Simon Jon; Nierychlo, Marta; Kras, Søren Michael; Albertsen, Mads; Nielsen, Per Halkjær (říjen 2016). „Genomické poznatky o členech kandidátského kmene Hyd24-12 běžné v mezofilních anaerobních digestorech“. Časopis ISME. 10 (10): 2352–2364. doi:10.1038 / ismej.2016.43. ISSN  1751-7370. PMID  27058503.
  2. ^ Knittel, Katrin; Boetius, Antje; Lemke, Andreas; Eilers, Heike; Lochte, Karin; Pfannkuche, Olaf; Linke, Peter; Amann, Rudolf (červenec 2003). „Aktivita, distribuce a rozmanitost reduktorů síranů a jiných bakterií v sedimentech nad hydráty plynů (Cascadia Margin, Oregon)“. Geomikrobiologický deník. 20 (4): 269–294. doi:10.1080/01490450303896. ISSN  0149-0451.
  3. ^ Ruff, S. Emil; Biddle, Jennifer F .; Teske, Andreas P .; Knittel, Katrin; Boetius, Antje; Ramette, Alban (2015-03-16). „Globální disperze a lokální diverzifikace mikrobiomu prosakujícího metanu“. Sborník Národní akademie věd. 112 (13): 4015–4020. doi:10.1073 / pnas.1421865112. ISSN  0027-8424. PMC  4386351. PMID  25775520.
  4. ^ Schöttner, Sandra; Pfitzner, Barbara; Grünke, Stefanie; Rasheed, Mohammed; Wild, Christian; Ramette, Alban (09.05.2011). „Ovladače dynamiky bakteriální rozmanitosti v propustných karbonátových a silikátových korálových útesech z Rudého moře“. Mikrobiologie prostředí. 13 (7): 1815–1826. doi:10.1111 / j.1462-2920.2011.02494.x. ISSN  1462-2912. PMC  3207121. PMID  21554515.
  5. ^ Dudek, Nataša K .; Sun, Christine L .; Burstein, David; Kantor, Rose S .; Aliaga Goltsman, Daniela S .; Bik, Elisabeth M .; Thomas, Brian C .; Banfield, Jillian F .; Relman, David A. (2017-12-18). „Nová mikrobiální rozmanitost a funkční potenciál v ústním mikrobiomu mořských savců“. Aktuální biologie. 27 (24): 3752–3762.e6. doi:10.1016 / j.cub.2017.10.040. ISSN  1879-0445. PMID  29153320.
  6. ^ Saad, Sainab; Bhatnagar, Srijak; Tegetmeyer, Halina E .; Geelhoed, Jeanine S .; Strous, Marc; Ruff, S.Emil (2017). „Přechodná expozice kyslíku nebo dusičnanům odhaluje ekofyziologii fermentačních a síranem redukujících bentických mikrobiálních populací“. Mikrobiologie prostředí. 19 (12): 4866–4881. doi:10.1111/1462-2920.13895. ISSN  1462-2920. PMC  5763382. PMID  28836729.