Sepiapterin reduktáza - Sepiapterin reductase

Vyhledávání
PMC	článků
PubMed	článků
NCBI	bílkoviny

sepiapterin reduktáza
Identifikátory
EC číslo	1.1.1.153
Databáze
IntEnz	IntEnz pohled
BRENDA	Vstup BRENDA
EXPASY	Pohled NiceZyme
KEGG	Vstup KEGG
MetaCyc	metabolická cesta
PRIAM	profil
PDB struktur	RCSB PDB PDBe PDBsum
Genová ontologie	AmiGO / QuickGO
Vyhledávání
PMC	článků
PubMed	článků
NCBI	bílkoviny

SPR
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1Z6Z, 4HWK, 4J7U, 4J7X, 4XWY, 4Z3K
Identifikátory
Aliasy	SPR, SDR38C1, sepiapterin reduktáza (7,8-dihydrobiopterin: NADP + oxidoreduktáza), sepiapterin reduktáza
Externí ID	OMIM: 182125 MGI: 103078 HomoloGene: 37735 Genové karty: SPR
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	72,892,158 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	85,137,766 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita sepiapterin reduktázy; • aktivita aldo-keto reduktázy (NADP); • Vazba NADP; • aktivita oxidoreduktázy;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • extracelulární exosom; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• proces biosyntézy oxidu dusnatého; • regulace aktivity syntázy oxidu dusnatého; • proces biosyntézy tetrahydrobiopterinu; • oxidačně-redukční proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6697
	20751
	ENSG00000116096
	ENSMUSG00000033735
	P35270
	Q64105
	NM_003124
	NM_011467
	NP_003115
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Sepiapterin reduktáza je enzym že u lidí je kódován SPR gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Sepiapterin reduktáza (7,8-dihydrobiopterin: NADP⁺ oxidoreduktáza; EC 1.1.1.153) katalyzuje NADPH-závislou redukci různých karbonylových látek, včetně derivátů pteridinů, a patří do skupiny enzymů nazývaných aldo-keto reduktázy. SPR hraje důležitou roli v biosyntéze tetrahydrobiopterin.^[7]

Reakce

Sepiapterin reduktáza (SPR) katalyzuje the chemická reakce

L-erythro-7,8-dihydrobiopterin + NADP + ${ displaystyle rightleftharpoons}$ sepiapterin + NADPH + H +

Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou L-erythro-7,8-dihydrobiopterin a NADP⁺, zatímco jeho tři produkty jsou sepiapterin, NADPH a jeden vodíkový ion (H⁺).

Tento enzym patří do rodina z oxidoreduktázy konkrétně ty, které působí na CH-OH skupina z dárce s NAD⁺ nebo NADP⁺ tak jako akceptor. The systematické jméno této třídy enzymů je 7,8-dihydrobiopterin: NADP⁺ oxidoreduktáza. Tento enzym se účastní biosyntéza folátu.

^[8]

Klinický význam

Nedostatek sepiapterin reduktázy patří mezi vzácná onemocnění. Klinický fenotyp může zahrnovat progresivní psychomotorickou retardaci, změněný tón, záchvaty, choreoatetóza nestabilita teploty, hypersalivace, mikrocefalie, a podrážděnost. Projevují se také pacienti s nedostatkem sepiapterin reduktázy dystonie s denní variací, okulogyrické krize, třes, hypersomnolence, okulomotor apraxie, a slabost.^[9] Odpověď na léčbu je proměnlivá a dlouhodobý a funkční výsledek není znám. Za účelem poskytnutí základu pro lepší porozumění epidemiologii, korelaci genotypů a fenotypů a výsledku těchto chorob a jejich dopadu na kvalitu života pacientů a pro hodnocení diagnostických a terapeutických strategií byl nekomerčním registrem vytvořen registr pacientů Mezinárodní pracovní skupina pro poruchy související s neurotransmitery (iNTD).^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116096 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033735 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ichinose H, Katoh S, Sueoka T, Titani K, Fujita K, Nagatsu T (říjen 1991). „Klonování a sekvenování cDNA kódující lidskou sepiapterin reduktázu - enzym podílející se na biosyntéze tetrahydrobiopterinu“. Biochem Biophys Res Commun. 179 (1): 183–189. doi:10.1016 / 0006-291X (91) 91352-D. PMID 1883349.
^ Persson B, Kallberg Y, Bray JE, Bruford E, Dellaporta SL, Favia AD, Duarte RG, Jornvall H, Kavanagh KL, Kedishvili N, Kisiela M, Maser E, Mindnich R, Orchard S, Penning TM, Thornton JM, Adamski J , Oppermann U (únor 2009). „Iniciativa názvosloví SDR (dehydrogenáza / reduktáza s krátkým řetězcem a příbuzné enzymy)“. Chem Biol Interact. 178 (1–3): 94–98. doi:10.1016 / j.cbi.2008.10.040. PMC 2896744. PMID 19027726.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SPR sepiapterin reduktáza (7,8-dihydrobiopterin: NADP⁺ oxidoreduktáza) ".
^ http://brenda-enzymes.info/enzyme.php?ecno=1.1.1.153
^ Pearl PL, Taylor JL, Trzcinski S, Sokohl A (květen 2007). „Poruchy neurotransmiteru u dětí“. J Dítě Neurol. 22 (5): 606–616. doi:10.1177/0883073807302619. PMID 17690069. S2CID 10689202.
^ „Registr pacientů“.

Další čtení

Katoh S (1971). „Sepiapterinová reduktáza z koňských jater: čištění a vlastnosti enzymu“. Oblouk. Biochem. Biophys. 146 (1): 202–214. doi:10.1016 / S0003-9861 (71) 80057-7. PMID 4401291.
Matsubara M, Katoh S, Akino M, Kaufman S (1966). „Sepiapterinová reduktáza“. Biochim. Biophys. Acta. 122 (2): 202–212. doi:10.1016/0926-6593(66)90062-2. PMID 5969298.
Takikawa S, Curtius HC, Redweik U a kol. (1987). "Biosyntéza tetrahydrobiopterinu. Čištění a charakterizace 6-pyruvoyl-tetrahydropterin syntázy z lidských jater". Eur. J. Biochem. 161 (2): 295–302. doi:10.1111 / j.1432-1033.1986.tb10446.x. PMID 3536512.
Thöny B, Heizmann CW, Mattei MG (1995). „Gen lidské GTP-cyklohydrolázy I a genu pro sepiapterin reduktázu do oblasti 14q21-q22 a 2p14-p12 pomocí hybridizace in situ“. Genomika. 26 (1): 168–170. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80101-Q. PMID 7782081.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–174. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Maier J, Schott K, Werner T a kol. (1994). Northern blot analýza mRNA sepiapterin reduktázy v savčích buněčných liniích a tkáních. Adv. Exp. Med. Biol. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 338. str. 195–8. doi:10.1007/978-1-4615-2960-6_39. ISBN 978-1-4613-6287-6. PMID 8304109.
Maier J, Schott K, Werner T a kol. (1993). „Detekce nové mRNA sepiapterin reduktázy: stanovení mRNA v různých buňkách a tkáních různých druhů“. Exp. Cell Res. 204 (2): 217–222. doi:10.1006 / excr.1993.1027. PMID 8440319.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–156. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Blau N, Thöny B, Renneberg A a kol. (1998). "Nedostatek dihydropteridin reduktázy lokalizovaný v centrálním nervovém systému". J. Zdědit. Metab. Dis. 21 (4): 433–434. doi:10.1023 / A: 1005327313348. PMID 9700606. S2CID 20969872.
Ohye T, Hori TA, Katoh S a kol. (1998). "Genomická organizace a chromozomální lokalizace genu pro lidskou sepiapterin reduktázu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 251 (2): 597–602. doi:10.1006 / bbrc.1998.9503. PMID 9792819.
Blau N, Thöny B, Renneberg A a kol. (1999). "Varianta deficitu dihydropteridin reduktázy bez hyperfenylalaninémie: účinek orálního obsahu fenylalaninu". J. Zdědit. Metab. Dis. 22 (3): 216–220. doi:10.1023 / A: 1005584627797. PMID 10384371. S2CID 30670124.
Bonafé L, Thöny B, Penzien JM, et al. (2001). „Mutace v genu pro sepiapterin reduktázu způsobují nový nedostatek monoamin-neurotransmiteru závislý na tetrahydrobiopterinu bez hyperfenylalaninémie“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 69 (2): 269–277. doi:10.1086/321970. PMC 1235302. PMID 11443547.
Fujimoto K, Takahashi SY, Katoh S (2002). „Mutační analýza míst v sepiapterin reduktáze fosforylovaná Ca²⁺/ proteodináza II závislá na kalmodulinu ". Biochim. Biophys. Acta. 1594 (1): 191–8. doi:10.1016 / S0167-4838 (01) 00300-4. PMID 11825621.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Franscini N, Bachli EB, Blau N a kol. (2005). „Funkční syntéza tetrahydrobiopterinu v lidských krevních destičkách“. Oběh. 110 (2): 186–192. doi:10.1161 / 01.CIR.0000134281.82972.57. PMID 15197144.
Steinberger D, Blau N, Goriuonov D a kol. (2005). „Heterozygotní mutace v 5'-nepřekládané oblasti genu pro sepiapterin reduktázu (SPR) u pacienta s dystonií reagující na dopa“. Neurogenetika. 5 (3): 187–190. doi:10.1007 / s10048-004-0182-3. PMID 15241655. S2CID 4833737.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Sharma M, Mueller JC, Zimprich A a kol. (2006). „Oblast genu pro sepiapterin reduktázu odhaluje asociaci v lokusu PARK3: analýza familiární a sporadické Parkinsonovy choroby v evropských populacích“. J. Med. Genet. 43 (7): 557–562. doi:10.1136 / jmg.2005.039149. PMC 2593029. PMID 16443856.
Farrugia R, Scerri CA, Montalto SA a kol. (2007). „Molekulární genetika nedostatku tetrahydrobiopterinu (BH4) v maltské populaci“. Mol. Genet. Metab. 90 (3): 277–283. doi:10.1016 / j.ymgme.2006.10.013. PMID 17188538.
Tobin JE, Cui J, Wilk JB a kol. (2007). "Exprese sepiapterin reduktázy se zvyšuje v mozkové tkáni Parkinsonovy choroby". Brain Res. 1139: 42–47. doi:10.1016 / j.brainres.2007.01.001. PMC 1868471. PMID 17270157.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P35270 (Lidská Sepiapterin reduktáza) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q64105 (Mouse Sepiapterin reductase) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116096 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033735 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1883349-5] Ichinose H, Katoh S, Sueoka T, Titani K, Fujita K, Nagatsu T (říjen 1991). „Klonování a sekvenování cDNA kódující lidskou sepiapterin reduktázu - enzym podílející se na biosyntéze tetrahydrobiopterinu“. Biochem Biophys Res Commun. 179 (1): 183–189. doi:10.1016 / 0006-291X (91) 91352-D. PMID 1883349.

[pmid19027726-6] Persson B, Kallberg Y, Bray JE, Bruford E, Dellaporta SL, Favia AD, Duarte RG, Jornvall H, Kavanagh KL, Kedishvili N, Kisiela M, Maser E, Mindnich R, Orchard S, Penning TM, Thornton JM, Adamski J , Oppermann U (únor 2009). „Iniciativa názvosloví SDR (dehydrogenáza / reduktáza s krátkým řetězcem a příbuzné enzymy)“. Chem Biol Interact. 178 (1–3): 94–98. doi:10.1016 / j.cbi.2008.10.040. PMC 2896744. PMID 19027726.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SPR sepiapterin reduktáza (7,8-dihydrobiopterin: NADP⁺ oxidoreduktáza) ".

[8] ttp://brenda-enzymes.info/enzyme.php?ecno=1.1.1.153

[9] Pearl PL, Taylor JL, Trzcinski S, Sokohl A (květen 2007). „Poruchy neurotransmiteru u dětí“. J Dítě Neurol. 22 (5): 606–616. doi:10.1177/0883073807302619. PMID 17690069. S2CID 10689202.

[10] „Registr pacientů“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )