Ribosylpyrimidinová nukleosidáza - Ribosylpyrimidine nucleosidase - Wikipedia

v enzymologie, a ribosylpyrimidinová nukleosidáza (ES 3.2.2.8 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce

pyrimidinový nukleosid + H₂Ó ${ displaystyle rightleftharpoons}$ D-ribóza + pyrimidinová báze

Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou pyrimidinový nukleosid a H₂Ó, zatímco jeho dva produkty jsou D-ribóza a pyrimidinová báze.

Tento enzym patří do rodiny hydrolázy, konkrétně ty glykosylázy, které hydrolyzují N-glykosylové sloučeniny. The systematické jméno této třídy enzymů je pyrimidin-nukleosid ribohydroláza. Mezi další běžně používaná jména patří N-ribosylpyrimidinová nukleosidáza, pyrimidinová nukleosidáza, N-ribosylpyrimidin ribohydroláza, pyrimidinový nukleosid hydroláza, RihB, YeiK, a nukleosid ribohydroláza. Tento enzym se účastní metabolismus purinů a metabolismus pyrimidinu.

Strukturální studie

Ke konci roku 2007 dva struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1Q8F a 1YOE.

Reference

• Terada M, Tatibana M, Hayaishi O (1967). "Čištění a vlastnosti nukleosidové hydrolázy z Pseudomonas fluorescens". J. Biol. Chem. 242 (23): 5578–85. PMID  12325375.
• Petersen C, Moller LB (2001). "Ribonukleosidové hydrolázy RihA, RihB a RihC Escherichia coli. Specifičnost substrátu, genová exprese a regulace". J. Biol. Chem. 276 (2): 884–94. doi:10,1074 / jbc.M008300200. PMID  11027694.
• Giabbai B, Degano M (2004). „Klonování, čištění, krystalizace a rentgenová analýza pyrimidinové nukleosidové hydrolázy Escherichia coli YeiK“. Acta Crystallogr. D. 60 (Pt 3): 524–7. doi:10.1107 / S0907444903028488. PMID  14993681.
• Giabbai B, Degano M (2004). „Krystalová struktura 1,7 a pyrimidinové nukleosidové hydrolázy Escherichia coli YeiK, nového kandidáta na genovou terapii rakoviny“. Struktura. 12 (5): 739–49. doi:10.1016 / j.str.2004.03.018. PMID  15130467.