Strukturní biologie - Structural biology - Wikipedia

Část série na
Biochemie
Myoglobin.png
Klíčové komponenty
Dějiny biochemie
Glosáře
Portály: Biochemie

Strukturní biologie je pobočkou molekulární biologie, biochemie, a biofyzika zabývající se molekulární strukturou biologických makromolekuly (zvláště bílkoviny, tvořeny aminokyseliny, RNA nebo DNA, tvořeny nukleotidy, a membrány, tvořeny lipidy ), jak získávají struktury, které mají, a jak změny v jejich strukturách ovlivňují jejich funkci.[1] Toto téma je pro biology velmi zajímavé, protože makromolekuly plní většinu funkcí buňky, a pouze tyto funkce jsou schopny provádět navíjení do konkrétních trojrozměrných tvarů. Tato architektura,terciární struktura „molekul, komplikovaně závisí na základním složení každé molekuly, nebo“primární struktura."

Hemoglobin, protein transportující kyslík nacházející se v červených krvinkách

Biomolekuly jsou příliš malé na to, aby bylo možné je vidět podrobně i při nejpokročilejším světle mikroskopy. Metody, které strukturní biologové používají k určení svých struktur, obvykle zahrnují měření na obrovském počtu identických molekul současně. Mezi tyto metody patří:

Vědci je nejčastěji používají ke studiu „rodné státy "makromolekul. Ale varianty těchto metod se také používají ke sledování rodícího se nebo denaturovaný molekuly předpokládají nebo znovu předpokládají své původní stavy. Vidět skládání bílkovin.

Třetím přístupem, který strukturální biologové využívají k pochopení struktury, je bioinformatika hledat vzory mezi různými sekvence které dávají vzniknout zvláštním tvarům. Vědci často dokážou odvodit aspekty struktury integrální membránové proteiny založeno na topologie membrány předpovídal hydrofobní analýza. Vidět predikce proteinové struktury.

Příklady proteinových struktur z Proteinová datová banka (PDB)

V posledních několika letech se stala možná vysoce přesná fyzika molekulární modely doplnit in silico studium biologických struktur. Příklady těchto modelů naleznete v Proteinová datová banka.

Výpočetní techniky jako Molekulární dynamika simulace mohou být použity ve spojení s empirickými strategiemi určování struktury k rozšíření a studiu struktury, konformace a funkce proteinu.[2]

Viz také

Reference

  1. ^ Banaszak, Leonard J. (2000). Základy strukturní biologie. Burlington: Elsevier. ISBN  9780080521848.
  2. ^ Karplus, Martin; McCammon, J. Andrew (1. září 2002). "Simulace molekulární dynamiky biomolekul". Přírodní strukturní biologie. 9 (9): 646–652. doi:10.1038 / nsb0902-646. PMID  12198485.

externí odkazy