KDM4A - KDM4A

KDM4A
Protein JMJD2A PDB 2gf7.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyKDM4A, JHDM3A, JMJD2, JMJD2A, TDRD14A, lysin demethyláza 4A
Externí IDOMIM: 609764 MGI: 2446210 HomoloGene: 27780 Genové karty: KDM4A
Umístění genu (člověk)
Chromozom 1 (lidský)
Chr.Chromozom 1 (lidský)[1]
Chromozom 1 (lidský)
Genomické umístění pro KDM4A
Genomické umístění pro KDM4A
Kapela1p34.2-p34.1Start43,650,149 bp[1]
Konec43,705,518 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE JMJD2A 203205 na fs.png

PBB GE JMJD2A 203204 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

9682

230674

Ensembl

ENSG00000066135

ENSMUSG00000033326

UniProt

O75164

Q8BW72

RefSeq (mRNA)

NM_014663

NM_001161823
NM_172382

RefSeq (protein)

NP_055478

NP_001155295
NP_759014

Místo (UCSC)Chr 1: 43,65 - 43,71 MbChr 4: 118,14 - 118,18 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Lysin specifická demethyláza 4A je enzym že u lidí je kódován KDM4A gen.[5][6][7]

Funkce

Tento gen je členem rodiny Jumonji domény 2 (JMJD2) a kóduje protein s doménou JmjN, doménou JmjC, doménou JD2H, dvěma TUDOR domény a dva zinkové prsty typu PHD. Tento jaderný protein patří k alfa-ketoglutarát-dependentní hydroxyláza nadčeleď. Funguje jako trimethylace specifické demethyláza, převedením specifického trimethylovaného histonu na zbytcích histonu H3 lysinu 9 a 36 na dimethylovanou formu a lysinu 9 dimethylovaných zbytků na monomethyl a jako transkripční represor.[7]

Bylo zjištěno, že změny v tomto genu souvisejí s chromozomální nestabilitou, která vede k rakovině.[8]

U lidí je role Kdm4a jako onkogen nebo gen spojený s rakovinou je dobře zavedený. Podílí se na nádorech prostaty, kde je nadměrně exprimován,[9] a stimuluje buněčnou proliferaci v buňkách rakoviny tlustého střeva, kde podporuje tvorbu samotného nádoru.[10] V buněčných liniích rakoviny plic, kde Kdm4a je také nadměrně exprimován, koordinuje se s jinými onkogeny (jako Ras ) transformovat normální buňky na rakovinné buňky inhibicí nádorových supresorových cest, jako je p53.[11] Potlačení Kdm4a Ukázalo se, že buněčné linie rakoviny prsu snižují množení rakovinných buněk zastavením buněčného cyklu a snižují migraci a invazi nádorů.[12]

U modelů myší Kdm4a ovlivňuje různé procesy vedoucí k implantaci embrya.[13] Exprese tohoto genu je pozorována ve všech tkáních kritických pro ženský reprodukční systém, včetně hypotalamu, hypofýzy, vaječníků, vejcovodů a dělohy, stejně jako embryonálního vývoje. Vyřazení tohoto genu u samic myší ukázalo, že negativně narušuje udržování mateřského prostředí dělohy vhodného pro příjem a implantaci blastocyst. Rovněž zasahuje do časného embryonálního vývoje mláďat samic myší před implantací, což vede k neplodnosti. Zatímco mechanismy normální ovulace a oplodnění zůstávají nedotčeny, neplodnost může být také částečně způsobena sníženou hladinou Prolaktin, hormon rozhodující během těhotenství. Vyřazení z Kdm4a nemá žádný vliv na plodnost nebo životaschopnost štěňat samců.[13]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000066135 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033326 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (červen 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". Výzkum DNA. 5 (3): 169–76. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
  6. ^ Katoh M, Katoh M (červen 2004). "Identifikace a charakterizace genů rodiny JMJD2 in silico". International Journal of Oncology. 24 (6): 1623–8. doi:10,3892 / ijo.25.3.759. PMID  15138608.
  7. ^ A b „Entrez Gene: JMJD2A jumonji doména obsahující 2A“.
  8. ^ Black JC, Manning AL, Van Rechem C, Kim J, Ladd B, Cho J, Pineda CM, Murphy N, Daniels DL, Montagna C, Lewis PW, Glass K, Allis CD, Dyson NJ, Getz G, Whetstine JR (2013 ). „KDM4A lysin demethyláza indukuje lokálně specifické zesílení kopie a rereplikaci oblastí amplifikovaných v nádorech“. Buňka. 154: 541–55. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.051. PMC  3832053. PMID  23871696.
  9. ^ Cloos, Paul A; Christensen, Jesper; Agger, Karl; Maiolica, Alessio; Rappsilber, Juri; Torben, Antal; Hansen, Klaus H; Helin, Kristian (28. května 2006). „Předpokládaný onkogen GASC1 demetyláty tri- a dimethylovaného lysinu 9 na histonu H3“. Příroda. 442 (2006): 307–311. doi:10.1038 / nature04837. PMID  16732293.
  10. ^ Kim, Tae-Dong; Shin, Sook; Berry, William L .; Oh, Sangphil; Janknecht, Ralf (1. prosince 2011). "JMJD2A demethyláza reguluje apoptózu a proliferaci v buňkách rakoviny tlustého střeva". Journal of Cellular Biochemistry. 113 (4): 1368–1376. doi:10.1002 / jcb.24009.
  11. ^ Mallette, Frédérick A .; Richard, Stéphane (15. listopadu 2012). „JMJD2A podporuje buněčnou transformaci blokováním buněčné stárnutí prostřednictvím transkripční represe supresoru nádoru CHD5“. Zprávy buněk. 2 (5): 1233–1243. doi:10.1016 / j.celrep.2012.09.033. PMID  23168260.
  12. ^ Li, Bei-Xu; Zhang, Ming-Chang; Luo, Cheng-Liang; Yang, Peng; Li, Hui; Xu, Hong-Mei; Xu, Hong-Fei; Shen, Yi-Wen; Xue, Ai-Min; Zhao, Zi-Qin (3. října 2011). „Účinky umlčování genů JMJD2A zprostředkovaného RNA interferencí na buněčnou linii lidské rakoviny prsu MDA-MB-231 in vitro“. Journal of Experimental and Clinical Cancer Research. 30 (2011): 1. doi:10.1186/1756-9966-30-90.
  13. ^ A b Sankar, Aditya; Kooistra, Susanne Marije; Gonzalez, Javier Martin; Ohlsson, Claes; Poutanen, Matti; Helin, Kristian (2017). „Mateřská exprese histonové demetylázy Kdm4a je zásadní pro vývoj před implantací“. Development (Cambridge). 144 (2017): 3264–3277. doi:10.1242 / dev.155473.

Další čtení