Fibronektin typu III - Fibronectin type III domain
Fibronektin typu III | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() Desátá doména typu III fibronektinu | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
Symbol | fn3 | ||||||||
Pfam | PF00041 | ||||||||
Pfam klan | CL0159 | ||||||||
InterPro | IPR003961 | ||||||||
CHYTRÝ | FN3 | ||||||||
STRÁNKA | PDOC00214 | ||||||||
SCOP2 | 1ttf / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd00063 | ||||||||
Membranome | 66 | ||||||||
|
The Fibronektin typu III je evoluční konzervovaný proteinová doména který se běžně vyskytuje v živočišných bílkovinách. The fibronektin protein, ve kterém byla tato doména poprvé identifikována, obsahuje 16 kopií této domény. Doména je asi 100 aminokyseliny dlouhý a má a beta sendvič struktura. Ze tří domén typu fibronektinu je typ III jediný bez nich disulfidová vazba současnost, dárek. Fibronektinové domény se nacházejí v široké škále extracelulárních proteinů. Jsou široce distribuovány v živočišných druzích, ale také se sporadicky vyskytují v kvasinkách, rostlinných a bakteriálních bílkovinách.
Lidské proteiny obsahující tuto doménu
ABI3BP; ANKFN1; ASTN2; AXL; BOC; BZRAP1; C20orf75; CDON;CHL1; CMYA5; CNTFR; CNTN1; CNTN2; CNTN3; CNTN4; CNTN5;CNTN6; COL12A1; COL14A1; COL20A1; COL7A1; CRLF1; CRLF3; CSF2RB;CSF3R; DCC; DSCAM; DSCAML1; EBI3; EGFLAM; EPHA1; EPHA10;EPHA2; EPHA3; EPHA4; EPHA5; EPHA6; EPHA7; EPHA8; EPHB1;EPHB2; EPHB3; EPHB4; EPHB6; EPOR; FANK1; FLRT1; FLRT2;FLRT3; FN1; FNDC1; FNDC3A; FNDC3B; FNDC4; FNDC5; FNDC7;FNDC8; FSD1; FSD1L; FSD2; GHR; HCFC1; HCFC2; HUGO;IFNGR2; IGF1R; IGSF22; IGSF9; IGSF9B; IL4R; IL11RA; IL12B; IL12RB1;IL12RB2; IL20RB; IL23R; IL27RA; IL31RA; IL6R; IL6ST; IL7R;INSR; INSRR; ITGB4; Il6ST; KAL1; KALRN; L1CAM; LEPR;LIFR; LRFN2; LRFN3; LRFN4; LRFN5; LRIT1; LRRN1; LRRN3;MERTK; MID1; MID2; MPL; MYBPC1; MYBPC2; MYBPC3; MYBPH;MYBPHL; MYLK; MYOM1; MYOM2; MYOM3; NCAM1; NCAM2; NEO1;NFASC; ANI NÁHODOU; NPHS1; NRCAM; OBSCN; OBSL1; OSMR; FYHIP;PHYHIPL; PRLR; PRODH2; PTPRB; PTPRC; PTPRD; PTPRF; PTPRG;PTPRH; PTPRJ; PTPRK; PTPRM; PTPRO; PTPRS; PTPRT; PTPRU;PTPRZ1; PTPsigma; PUNC; RIMBP2; ROBO1; ROBO2; ROBO3; ROBO4;ROS1; SDK1; SDK2; SNED1; SORL1; SPEG; TEK; TIE1;TNC; TNN; TNR; TNXB; TRIM36; TRIM42; TRIM46; TRIM67;OBRÁZEK 9; TTN; TYRO3; UMODL1; USH2A; VASN; VWA1; dJ34F7.1;fmi;
Viz také
- Monobody jsou konstruovaná (syntetická) protilátková mimetika založená na doméně fibronektinu typu III (konkrétně 10. doména FN3 lidského fibronektinu). Monobody mají buď diverzifikované smyčky, nebo diverzifikované řetězce plochého povrchu beta listu, které slouží jako interakční epitopy. Monobody pojiva byla vybrána široká škála cílových molekul a rozšířila se nad potenciální rozsah vazebných rozhraní pozorovaných u přírodních i syntetických protilátek.
Reference
- Bazan JF (září 1990). „Strukturální design a molekulární evoluce nadrodiny cytokinových receptorů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 87 (18): 6934–8. doi:10.1073 / pnas.87.18.6934. PMC 54656. PMID 2169613.
- Little E, Bork P, Doolittle RF (prosinec 1994). "Sledování šíření domén fibronektinu typu III v bakteriálních glykohydrolázách". Journal of Molecular Evolution. 39 (6): 631–43. doi:10.1007 / bf00160409. PMID 7528812. S2CID 11909704.
- Kornblihtt AR, Umezawa K, Vibe-Pedersen K, Baralle FE (červenec 1985). „Primární struktura lidského fibronektinu: diferenciální sestřih může generovat alespoň 10 polypeptidů z jednoho genu“. Časopis EMBO. 4 (7): 1755–9. doi:10.1002 / j.1460-2075.1985.tb03847.x. PMC 554414. PMID 2992939.