FLRT3 - FLRT3

FLRT3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5 CMN, 5CMP
Identifikátory
Aliasy	FLRT3, HH21, transmembránový protein bohatý na fibronektin leucin 3
Externí ID	OMIM: 604808 MGI: 1918686 HomoloGene: 8322 Genové karty: FLRT3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	14,337,614 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	140,671,469 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na bílkoviny, přemostění; • aktivita homodimerizace proteinu; • vazba na receptor fibroblastového růstového faktoru; • aktivita inhibitoru proteinkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • chemorepellentní aktivita;
Buněčná složka	• cytoplazma; • axonový konec; • integrální součást membrány; • synaptická membrána; • buněčná projekce; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • mezibuněčné spojení; • ohnisková adheze; • axonální růstový kužel; • integrální součást plazmatické membrány; • extracelulární oblast; • axon; • endoplazmatické retikulum; • extracelulární; • cytosol; • buněčná membrána; • buněčné spojení; • extracelulární matrix; • glutamátergická synapse; • integrální součást postsynaptické membrány;
Biologický proces	• negativní chemotaxe; • negativní regulace aktivity proteinkinázy; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • vývoj hlavy; • rozšíření neuronové projekce; • axonové vedení; • vývoj mnohobuněčných organismů; • vývoj srdce; • buněčná adheze; • reakce na poranění axonu; • embryonální morfogeneze; • migrace buněk proepikardu podílející se na morfogenezi perikardu; • sestava synapse; • vývoj neuronové projekce; • negativní regulace kaskády JAK-STAT; • pozitivní regulace sestavy synapsí; • signální dráha receptoru pro růstový faktor fibroblastů; • buněčná adheze prostřednictvím molekul adheze plazmatickou membránou; • synaptická membrána adheze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23767
	71436
	ENSG00000125848
	ENSMUSG00000051379
	Q9NZU0
	Q8BGT1
	NM_013281; NM_198391
	NM_001172160; NM_178382
	NP_037413; NP_938205
	NP_001165631; NP_848469
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Opakovaný transmembránový protein bohatý na leucin FLRT3 je protein že u lidí je kódován FLRT3 gen.^[5]^[6]

FLRT1, FLRT2 a FLRT3 jsou členy fibronektin rodina transmembránových proteinů bohatých na leucin (FLRT). Mohou fungovat při buněčné adhezi a / nebo signalizaci receptoru. Jejich proteinové struktury připomínají malé leucin -bohatý proteoglykany nalezen v extracelulární matice. Akcie FLRT3 55% aminokyselina sekvenční identita s FLRT1 a 44% identita s FLRT2. FLRT3 je vyjádřen v ledviny, mozek, slinivka břišní, kosterní sval, plíce, játra, placenta, a srdce. Pro tento gen byly popsány dvě alternativně sestříhané varianty transkriptu kódující stejný protein.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125848 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000051379 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lacy SE, Bonnemann CG, Buzney EA, Kunkel LM (březen 2000). „Identifikace FLRT1, FLRT2 a FLRT3: nová rodina transmembránových proteinů bohatých na leucin“. Genomika. 62 (3): 417–26. doi:10.1006 / geno.1999,6033. PMID 10644439.
^ ^A ^b „Entrez Gene: FLRT3 fibronektin, leucin, transmembránový protein bohatý na 3“.

Další čtení

Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2007). „Signální sekvence a lapač klíčových slov in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA s oligopohraničením“. DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), rozsáhlá snaha o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Nagase T, Kikuno R, Ishikawa K a kol. (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (2): 143–50. doi:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID 10819331.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125848 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000051379 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10644439-5] Lacy SE, Bonnemann CG, Buzney EA, Kunkel LM (březen 2000). „Identifikace FLRT1, FLRT2 a FLRT3: nová rodina transmembránových proteinů bohatých na leucin“. Genomika. 62 (3): 417–26. doi:10.1006 / geno.1999,6033. PMID 10644439.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: FLRT3 fibronektin, leucin, transmembránový protein bohatý na 3“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]