MID2 - MID2

MID2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2DJA, 2DMK
Identifikátory
Aliasy	MID2, FXY2, MRX101, RNF60, TRIM1, středová čára 2
Externí ID	OMIM: 300204 MGI: 1344333 HomoloGene: 8028 Genové karty: MID2
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	107,927,193 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	140,767,715 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita homodimerizace proteinu; • vazba mikrotubulů; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů; • vazba fosfoproteinů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • identická vazba na protein; • aktivita transferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • intracelulární; • mikrotubuly; • extracelulární exosom; • cytoskelet;
Biologický proces	• pozitivní regulace autofagie; • pozitivní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • lokalizace proteinu do mikrotubulů; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • ubikvitinace bílkovin; • pozitivní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • vrozený imunitní systém; • negativní regulace virové transkripce; • negativní regulace vstupu viru do hostitelské buňky; • negativní regulace uvolňování viru z hostitelské buňky;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11043
	23947
	ENSG00000080561
	ENSMUSG00000000266
	Q9UJV3
	Q9QUS6
	NM_012216; NM_052817; NM_001382751; NM_001382752
	NM_011845; NM_001358366; NM_001358367
	NP_036348; NP_438112; NP_001369680; NP_001369681
	NP_035975; NP_001345295; NP_001345296
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Střední čára-2 je protein že u lidí je kódován MID2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny tripartitních motivů (TRIM). Motiv TRIM zahrnuje tři domény vázající zinek, RING, B-box typu 1 a B-box typu 2 a oblast stočené cívky. Protein se lokalizuje do mikrotubulárních struktur v cytoplazmě. Jeho funkce nebyla identifikována. Alternativní sestřih tohoto genu vede ke dvěma variantám transkriptu kódujícím různé izoformy.^[6]

Interakce

MID2 bylo prokázáno komunikovat s MID1.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000080561 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000266 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Buchner G, Montini E, Andolfi G, Quaderi N, Cainarca S, Messali S, Bassi MT, Ballabio A, Meroni G, Franco B (září 1999). „MID2, homolog genu pro Opitzův syndrom MID1: podobnosti v subcelulární lokalizaci a rozdíly v expresi během vývoje“. Hum Mol Genet. 8 (8): 1397–407. doi:10,1093 / hmg / 8.8.1397. PMID 10400986.
^ ^A ^b „Entrez Gene: MID2 midline 2“.
^ Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (květen 2001). „Rodina trojdílných motivů identifikuje buněčné oddíly“. EMBO J.. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
^ Krátký KM, Hopwood B, Yi Z, Cox TC (2002). „MID1 a MID2 homo- a heterodimerizují k upoutání regulační podjednotky PP2A citlivé na rapamycin, alfa 4, k mikrotubulům: důsledky pro klinickou variabilitu X-vázaného Opitzova syndromu GBBB a dalších vývojových poruch“. BMC Cell Biol. 3: 1. doi:10.1186/1471-2121-3-1. PMC 64779. PMID 11806752.

Další čtení

Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
Jehee FS, Rosenberg C, Krepischi-Santos AC, Kok F, Knijnenburg J, Froyen G, Vianna-Morgante AM, Opitz JM, Passos-Bueno MR (2006). „Duplikace Xq22.3 detekovaná srovnávací genomickou hybridizační microarray (Array-CGH) definuje nový lokus (FGS5) pro FG syndrom“. Dopoledne. J. Med. Genet. A. 139 (3): 221–6. doi:10,1002 / ajmg.a. 30991. PMID 16283679.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Yap MW, Nisole S, Lynch C, Stoye JP (2004). „Protein Trim5alpha omezuje jak virus HIV-1, tak virus myší leukémie“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (29): 10786–91. Bibcode:2004PNAS..10110786Y. doi:10.1073 / pnas.0402876101. PMC 490012. PMID 15249690.
Krátký KM, Hopwood B, Yi Z, Cox TC (2002). „MID1 a MID2 homo- a heterodimerizují k upoutání regulační podjednotky PP2A citlivé na rapamycin, alfa 4, k mikrotubulům: důsledky pro klinickou variabilitu X-vázaného Opitzova syndromu GBBB a dalších vývojových poruch“. BMC Cell Biol. 3: 1. doi:10.1186/1471-2121-3-1. PMC 64779. PMID 11806752.
Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (2001). „Rodina trojdílných motivů identifikuje buněčné oddíly“. EMBO J.. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
Perry J, Short KM, Romer JT, Swift S, Cox TC, Ashworth A (2000). „FXY2 / MID2, gen související s genem FXY / MID1 vázaným na X-Opitzův syndrom, se mapuje na Xq22 a kóduje protein obsahující doménu FNIII, který se asociuje s mikrotubuly“. Genomika. 62 (3): 385–94. doi:10.1006 / geno.1999,6043. PMID 10644436.
Cainarca S, Messali S, Ballabio A, Meroni G (1999). „Funkční charakterizace produktu genu pro Opitzův syndrom (midin): důkazy homodimerizace a asociace s mikrotubuly během buněčného cyklu“. Hučení. Mol. Genet. 8 (8): 1387–96. doi:10,1093 / hmg / 8.8.1387. PMID 10400985.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000080561 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000266 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10400986-5] Buchner G, Montini E, Andolfi G, Quaderi N, Cainarca S, Messali S, Bassi MT, Ballabio A, Meroni G, Franco B (září 1999). „MID2, homolog genu pro Opitzův syndrom MID1: podobnosti v subcelulární lokalizaci a rozdíly v expresi během vývoje“. Hum Mol Genet. 8 (8): 1397–407. doi:10,1093 / hmg / 8.8.1397. PMID 10400986.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: MID2 midline 2“.

[pmid11331580-7] Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (květen 2001). „Rodina trojdílných motivů identifikuje buněčné oddíly“. EMBO J.. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.

[pmid11806752-8] Krátký KM, Hopwood B, Yi Z, Cox TC (2002). „MID1 a MID2 homo- a heterodimerizují k upoutání regulační podjednotky PP2A citlivé na rapamycin, alfa 4, k mikrotubulům: důsledky pro klinickou variabilitu X-vázaného Opitzova syndromu GBBB a dalších vývojových poruch“. BMC Cell Biol. 3: 1. doi:10.1186/1471-2121-3-1. PMC 64779. PMID 11806752.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]