ACTL6B - ACTL6B

ACTL6B
Identifikátory
Aliasy	ACTL6B, ACTL6, BAF53B, arpNalpha, aktin jako 6B, EIEE76, IDDSSAD
Externí ID	OMIM: 612458 MGI: 1933548 HomoloGene: 81844 Genové karty: ACTL6B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	100,656,448 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	137,569,582 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• strukturní složka cytoskeletu; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • vazba chromatinu;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • jádro; • komplex nBAF; • Komplex SWI / SNF; • Komplex NuA4 histon-acetyltransferáza;
Biologický proces	• vývoj nervového systému; • regulace transkripce, DNA-šablony; • vývoj míchy; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • remodelace chromatinu; • organizace cytoskeletu; • organizace chromatinu; • pozitivní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou; • Remodelace chromatinu závislá na ATP; • acetylace histonu H4;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51412
	83766
	ENSG00000077080
	ENSMUSG00000029712
	O94805
	Q99MR0
	NM_016188
	NM_031404
	NP_057272
	NP_113581
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein podobný aktinu 6B je protein že u lidí je kódován ACTL6B gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny proteinů souvisejících s aktinem (ARP), které sdílejí významnou identitu aminokyselinové sekvence s běžnými aktiny. Aktiny i ARP mají jako společnou vlastnost aktinový záhyb, což je rozštěp vázající ATP. ARP jsou zapojeny do různých buněčných procesů, včetně vezikulárního transportu, orientace vřetena, jaderné migrace a remodelace chromatinu. Tento gen kóduje podjednotku komplexu BAF (BRG1 / brm-associated factor) u savců, který je funkčně příbuzný komplexu SWI / SNF u S. cerevisiae a Drosophila; předpokládá se, že posledně jmenovaný usnadňuje transkripční aktivaci specifických genů antagonizací transkripční represe zprostředkované chromatinem. Tato podjednotka může být zapojena do regulace genů strukturální modulací jejich chromatinu, konkrétně v mozku.^[6]

Interakce

ACTL6B bylo prokázáno komunikovat s CTBP1.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000077080 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029712 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Glöckner G, Scherer S, Schattevoy R, Boright A, Weber J, Tsui LC, Rosenthal A (prosinec 1998). „Rozsáhlé sekvenování dvou oblastí v lidském chromozomu 7q22: analýza 650 kb genomové sekvence kolem lokusů EPO a CUTL1 odhalila 17 genů“. Genome Res. 8 (10): 1060–73. doi:10.1101 / gr.8.10.1060. PMC 310788. PMID 9799793.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ACTL6B jako aktin 6B“.
^ Oma Y, Nishimori K, Harata M (únor 2003). „Mozkový specifický protein související s aktinem ArpN alfa interaguje s transkripčním ko-represorem CtBP“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (2): 521–528. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03073-5. PMID 12565893.

externí odkazy

Člověk ACTL6B umístění genomu a ACTL6B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Schafer DA, Schroer TA (2000). "Proteiny související s aktinem". Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 15: 341–363. doi:10.1146 / annurev.cellbio.15.1.341. PMID 10611965.
Sanger Center, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (1999). „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Genome Res. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.
Harata M, Mochizuki R, Mizuno S (1999). „Dvě izoformy lidského proteinu souvisejícího s aktinem ukazují nukleární lokalizaci a vzájemně selektivní expresi mezi mozkem a jinými tkáněmi“. Biosci. Biotechnol. Biochem. 63 (5): 917–923. doi:10,1271 / bbb.63,917. PMID 10380635.
Olave I, Wang W, Xue Y, Kuo A, Crabtree GR (2002). "Identifikace polymorfního neuronově specifického komplexu pro remodelaci chromatinu". Genes Dev. 16 (19): 2509–2517. doi:10,1101 / gad.992102. PMC 187451. PMID 12368262.
Kuroda Y, Oma Y, Nishimori K, Ohta T, Harata M (2003). „Mozková specifická exprese proteinu ArpNalpha souvisejícího s jaderným aktinem a jeho zapojení do savčího komplexu remodelace SWI / SNF chromatinu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 299 (2): 328–334. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02637-2. PMID 12437990.
Oma Y, Nishimori K, Harata M (2003). „Mozkový specifický protein související s aktinem ArpN alfa interaguje s transkripčním ko-represorem CtBP“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (2): 521–528. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03073-5. PMID 12565893.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000077080 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029712 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9799793-5] Glöckner G, Scherer S, Schattevoy R, Boright A, Weber J, Tsui LC, Rosenthal A (prosinec 1998). „Rozsáhlé sekvenování dvou oblastí v lidském chromozomu 7q22: analýza 650 kb genomové sekvence kolem lokusů EPO a CUTL1 odhalila 17 genů“. Genome Res. 8 (10): 1060–73. doi:10.1101 / gr.8.10.1060. PMC 310788. PMID 9799793.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ACTL6B jako aktin 6B“.

[pmid12565893-7] Oma Y, Nishimori K, Harata M (únor 2003). „Mozkový specifický protein související s aktinem ArpN alfa interaguje s transkripčním ko-represorem CtBP“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (2): 521–528. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03073-5. PMID 12565893.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]