IKZF4 - IKZF4

IKZF4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2MA7
Identifikátory
Aliasy	IKZF4, EOS, ZNFN1A4, zinkový prst rodiny IKAROS 4
Externí ID	OMIM: 606239 MGI: 1343139 HomoloGene: 69103 Genové karty: IKZF4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	56,038,435 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	128,669,358 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba nukleové kyseliny; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • vazba transkripčního faktoru bHLH; • aktivita homodimerizace proteinu; • vazba kovových iontů; • aktivita heterodimerizace proteinu; • vazba iontů zinku; • specifické vazby na proteinovou doménu; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • jaderné těleso; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • homooligomerizace bílkovin; • heterooligomerizace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	64375
	22781
	ENSG00000123411
	ENSMUSG00000002578
	Q9H2S9
	Q8C208
	NM_022465; NM_001351089; NM_001351090; NM_001351091; NM_001351092
	NM_011772; NM_001358536; NM_001358537
	NP_071910; NP_001338018; NP_001338019; NP_001338020; NP_001338021
	NP_035902; NP_001345465; NP_001345466
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein se zinkovým prstem Eos je protein že u lidí je kódován IKZF4 gen.^[5]^[6]

Členové rodiny transkripčních faktorů Ikaros (ZNFN1A1; MIM 603023), která zahrnuje Eos, jsou exprimováni v lymfocytech a podílejí se na kontrole vývoje lymfoidů. [Dodává OMIM]^[6]

Interakce

IKZF4 bylo prokázáno komunikovat s CTBP1^[7] a IKZF1.^[5]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123411 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002578 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Perdomo J, Holmes M, Chong B, Crossley M (leden 2001). „Eos a pegasus, dva členové rodiny proteinů Ikaros se zřetelnými aktivitami vázání DNA“. J Biol Chem. 275 (49): 38347–54. doi:10,1074 / jbc.M005457200. PMID 10978333.
^ ^A ^b „Entrez Gene: IKZF4 IKAROS family zinkový prst 4 (Eos)“.
^ Perdomo, José; Crossley Merlin (prosinec 2002). „Protein rodiny Ekaros Eos se asociuje s proteinovými corepresory vázajícími C-terminál“. Eur. J. Biochem. Německo. 269 (23): 5885–92. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.03313.x. ISSN 0014-2956. PMID 12444977.
^ Honma, Y; Kiyosawa H; Mori T; Oguri A; Nikaido T; Kanazawa K; Tojo M; Takeda J; Tanno Y; Yokoya S; Kawabata I; Ikeda H; Wanaka A (březen 1999). „Eos: nový člen rodiny genů Ikaros exprimovaný převážně ve vyvíjejícím se nervovém systému“. FEBS Lett. HOLANDSKO. 447 (1): 76–80. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00265-3. ISSN 0014-5793. PMID 10218586. S2CID 28898354.

Další čtení

Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Bao J, Lin H, Ouyang Y a kol. (2005). "Regulace transkripce závislá na aktivitě PSD-95 neuregulinem-1 a Eos". Nat. Neurosci. 7 (11): 1250–8. doi:10.1038 / nn1342. PMID 15494726. S2CID 1964177.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Perdomo J, Crossley M (2003). „Protein rodiny Ekaros Eos se asociuje s proteinovými corepresory vázajícími C-terminál“. Eur. J. Biochem. 269 (23): 5885–92. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.03313.x. PMID 12444977.
Koipally J, Georgopoulos K (2002). „Molekulární disekce represivních obvodů Ikarosu“. J. Biol. Chem. 277 (31): 27697–705. doi:10,1074 / jbc.M201694200. PMID 12015313.
Nagase T, Nakayama M, Nakajima D a kol. (2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 8 (2): 85–95. doi:10.1093 / dnares / 8.2.85. PMID 11347906.
Honma Y, Kiyosawa H, Mori T a kol. (1999). „Eos: nový člen rodiny genů Ikaros exprimovaný převážně ve vyvíjejícím se nervovém systému“. FEBS Lett. 447 (1): 76–80. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00265-3. PMID 10218586. S2CID 28898354.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123411 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002578 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10978333-5] A ^b Perdomo J, Holmes M, Chong B, Crossley M (leden 2001). „Eos a pegasus, dva členové rodiny proteinů Ikaros se zřetelnými aktivitami vázání DNA“. J Biol Chem. 275 (49): 38347–54. doi:10,1074 / jbc.M005457200. PMID 10978333.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: IKZF4 IKAROS family zinkový prst 4 (Eos)“.

[pmid12444977-7] Perdomo, José; Crossley Merlin (prosinec 2002). „Protein rodiny Ekaros Eos se asociuje s proteinovými corepresory vázajícími C-terminál“. Eur. J. Biochem. Německo. 269 (23): 5885–92. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.03313.x. ISSN 0014-2956. PMID 12444977.

[pmid10218586-8] Honma, Y; Kiyosawa H; Mori T; Oguri A; Nikaido T; Kanazawa K; Tojo M; Takeda J; Tanno Y; Yokoya S; Kawabata I; Ikeda H; Wanaka A (březen 1999). „Eos: nový člen rodiny genů Ikaros exprimovaný převážně ve vyvíjejícím se nervovém systému“. FEBS Lett. HOLANDSKO. 447 (1): 76–80. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00265-3. ISSN 0014-5793. PMID 10218586. S2CID 28898354.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]