Rodina pomocných aktivit 9 - Auxiliary Activity family 9
| Rodina pomocných aktivit 9 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Aux_Act_9 | ||||||||
| Pfam | PF03443 | ||||||||
| InterPro | IPR005103 | ||||||||
| CAZy | AA9 | ||||||||
| |||||||||
Rodina pomocných aktivit 9 (dříve GH61) je a rodina lytického polysacharidu monooxygenázy. Rodina byla dříve nesprávně klasifikována jako rodina 61 glykosidhydrolázy, nicméně v březnu 2013 byla znovu klasifikována.[1][2]
Je známo, že AA9 je oxidační enzym závislý na mědi schopný štěpit krystalickou celulózu.[3] Aktivita velmi závisí na přítomnosti dvojmocného iontu mědi a redukčního činidla, jako je gallát nebo askorbát. Oxidační účinek AA9 může fungovat buď na redukčním nebo neredukujícím konci glukózových skupin.[Citace je zapotřebí ] Přestože enzymy AA9 lze nalézt ve velkém spektru hub degradujících biomasu, je výzkum této rodiny relativně nový.[4] Tato klasifikace je k dispozici na internetu CAZy webová stránka,[5][6] a také diskutována na CAZypedii, online encyklopedii sacharidově aktivních enzymů.[7][8][9]
Reference
- ^ Levasseur, Anthony; Drula, Elodie; Lombard, Vincent; Coutinho, Pedro M .; Henrissat, Bernard (2013-03-21). „Rozšíření enzymatického repertoáru databáze CAZy o integraci pomocných redoxních enzymů“. Biotechnologie pro biopaliva. 6 (1): 41. doi:10.1186/1754-6834-6-41. ISSN 1754-6834. PMC 3620520. PMID 23514094.
- ^ Hemsworth, Glyn R; Davies, Gideon J; Walton, Paul H (2013). „Nedávné poznatky o lytických polysacharidových mono-oxygenázách obsahujících měď“. Aktuální názor na strukturní biologii. 23 (5): 660–668. doi:10.1016 / j.sbi.2013.05.006. PMID 23769965.
- ^ Vaaje-Kolstad, Gustav; Westereng, Bjørge; Horn, Svein J .; Liu, Zhanliang; Zhai, Hong; Sørlie, Morten; Eijsink, Vincent G. H. (10. 10. 2010). „Oxidační enzym zvyšující enzymatickou přeměnu vzpurných polysacharidů“. Věda. 330 (6001): 219–222. Bibcode:2010Sci ... 330..219V. doi:10.1126 / science.1192231. ISSN 0036-8075. PMID 20929773. S2CID 206527624.
- ^ Bey, Mathieu; Zhou, Simeng; Poidevin, Laetitia; Henrissat, Bernard; Coutinho, Pedro M .; Berrin, Jean-Guy; Sigoillot, Jean-Claude (2013-01-15). „Oxidace cello-oligosacharidů odhaluje rozdíly mezi dvěma lytickými polysacharidovými monooxygenázami (rodina GH61) z Podospora anserina“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 79 (2): 488–496. doi:10.1128 / aem.02942-12. ISSN 0099-2240. PMC 3553762. PMID 23124232.
- ^ "Domov". CAZy.org. Citováno 2018-03-06.
- ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (leden 2014). „Databáze enzymů aktivních ze sacharidů (CAZy) v roce 2013“. Výzkum nukleových kyselin. 42 (Problém s databází): D490–5. doi:10.1093 / nar / gkt1178. PMC 3965031. PMID 24270786.
- ^ „Rodina pomocných aktivit 9“. CAZypedia.org. Citováno 2018-03-08.
- ^ "Glykosid Hydroláza Rodina 61". CAZypedia.org. Citováno 2018-03-06.
- ^ Konsorcium CAZypedia (prosinec 2018). „Deset let CAZypedie: živá encyklopedie enzymů aktivních ze sacharidů“ (PDF). Glykobiologie. 28 (1): 3–8. doi:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
