UDP-glukóza-6-dehydrogenáza - UDP-glucose 6-dehydrogenase
UDP-glukóza-6-dehydrogenáza je cytosol enzym že u lidí je kódován UGDH gen.[5][6][7]
Protein kódovaný tímto genem převádí UDP-glukózu na UDP-glukuronát a podílí se tak na biosyntéze glykosaminoglykanů, jako je hyaluronan, chondroitin sulfát a heparan sulfát. Tyto glykosylované sloučeniny jsou běžnými složkami extracelulární matrice a pravděpodobně hrají roli v signální transdukci, buněčné migraci a růstu a metastázování rakoviny. Exprese tohoto genu je up-regulována transformací růstového faktoru beta a down-regulována hypoxií.[7]
Tento enzym se účastní 4 metabolické cesty: interverze pentózy a glukuronátu, metabolismus askorbátu a aldarátu, metabolismus škrobu a sacharózy, a metabolismus nukleotidových cukrů.
Ztráta UGDH se nedávno podílela na epileptické encefalopatii u lidí[8]
Nomenklatura
Tento enzym patří do rodiny oxidoreduktázy, konkrétně těch, které působí na CH-OH skupinu dárce s NAD+ nebo NADP+ jako akceptor. The systematické jméno této třídy enzymů je UDP-glukóza: NAD+ 6-oxidoreduktáza.
Mezi další běžně používaná jména patří:
- UDP-glukóza dehydrogenáza,
- uridin difosfoglukóza dehydrogenáza,
- UDPG dehydrogenáza,
- UDPG: NAD oxidoreduktáza,
- UDP-alfa-D-glukóza: NAD oxidoreduktáza,
- UDP-glukóza: NAD+ oxidoreduktáza,
- uridin difosfát glukóza dehydrogenáza,
- UDP-D-glukóza dehydrogenáza a
- uridin difosfát D-glukóza dehydrogenáza.
Biochemie
| UDP-glukóza-6-dehydrogenáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 1.1.1.22 | ||||||||
| Číslo CAS | 9028-26-6 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
v enzymologie, a UDP-glukóza-6-dehydrogenáza (ES 1.1.1.22 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce
- UDP-glukóza + 2 NAD+ + H2Ó UDP-glukuronát + 2 NADH + 2 H+
3 substráty tohoto enzymu jsou UDP-glukóza, NAD+, a H2Ó, zatímco jeho 3 produkty jsou UDP-glukuronát, NADH, a H+
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000109814 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029201 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Spicer AP, Kaback LA, Smith TJ, Seldin MF (září 1998). "Molekulární klonování a charakterizace lidských a myších genů UDP-glukózadehydrogenázy". The Journal of Biological Chemistry. 273 (39): 25117–24. doi:10.1074 / jbc.273.39.25117. PMID 9737970.
- ^ Marcu O, Stathakis DG, Marsh JL (leden 2000). "Přiřazení lokusu UGDH kódujícího UDP-glukózodehydrogenázu do pásma lidského chromozomu 4p15.1 radiačním hybridním mapováním". Cytogenetika a genetika buněk. 86 (3–4): 244–5. doi:10.1159/000015350. PMID 10575217. S2CID 25740995.
- ^ A b „Entrez Gene: UGDH UDP-glukóza dehydrogenáza“.
- ^ Hengel, H., Bosso-Lefèvre, C., Grady, G. a kol. Mutace ztráty funkce UDP-glukóza 6-dehydrogenázy způsobují recesivní vývojovou epileptickou encefalopatii. Nat Commun 11, 595 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-14360-7
- ^ Druzhinina TN, Kusov YY, Shibaev VN, Kochetkov NK, Bielý P, Kucár S, Bauer S (únor 1975). "Uridin difosfát 2-deoxyglukóza. Chemická syntéza, enzymatická oxidace a epimerizace". Biochimica et Biophysica Acta. 381 (2): 301–7. doi:10.1016/0304-4165(75)90236-6. PMID 1091296.
- ^ Kalckar HM, Maxwell ES, Strominger JL (listopad 1956). "Některé vlastnosti uridin difosfoglukóza dehydrogenázy". Archivy biochemie a biofyziky. 65 (1): 2–10. doi:10.1016/0003-9861(56)90171-0. PMID 13373402.
- ^ Strominger JL, Mapson LW (srpen 1957). "Uridin difosfoglukóza dehydrogenáza sazenic hrachu". The Biochemical Journal. 66 (4): 567–72. doi:10.1042 / bj0660567. PMC 1200063. PMID 13459898.
- ^ Axelrod J, Kalckar HM, Maxwell ES, Strominger JL (leden 1957). "Enzymatická tvorba kyseliny uridindifosfoglukuronové". The Journal of Biological Chemistry. 224 (1): 79–90. PMID 13398389.
Další čtení
- Peng HL, Lou MD, Chang ML, Chang HY (Říjen 1998). "cDNA klonování a analýza exprese lidské UDPglukózy dehydrogenázy". Sborník Národní rady pro vědu, Čínská republika. Část B, vědy o živé přírodě. 22 (4): 166–72. PMID 9850599.
- Bontemps Y, Maquart FX, Wegrowski Y (září 2000). "Lidský gen UDP-glukózy dehydrogenázy: kompletní klonování a začátek mapování transkripce". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 275 (3): 981–5. doi:10,1006 / bbrc.2000.3389. PMID 10973831.
- Bontemps Y, Vuillermoz B, Antonicelli F, Perreau C, Danan JL, Maquart FX, Wegrowski Y (červen 2003). „Specifický protein-1 je univerzálním regulátorem exprese UDP-glukózy dehydrogenázy: jeho pozitivní účast na transformaci signalizace a inhibice růstového faktoru beta při hypoxii“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (24): 21566–75. doi:10,1074 / jbc.M209366200. PMID 12682078.
- Sommer BJ, Barycki JJ, Simpson MA (květen 2004). „Charakterizace lidské UDP-glukózodehydrogenázy. CYS-276 je vyžadován pro druhou ze dvou po sobě následujících oxidací“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (22): 23590–6. doi:10,1074 / jbc.M401928200. PMID 15044486.
- Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (červen 2004). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Přírodní biotechnologie. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
- Huh JW, Yoon HY, Lee HJ, Choi WB, Yang SJ, Cho SW (září 2004). „Důležitost Gly-13 pro vazbu koenzymu lidské UDP-glukózodehydrogenázy“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (36): 37491–8. doi:10,1074 / jbc.M404234200. PMID 15247292.
- Huh JW, Lee HJ, Choi MM, Yang SJ, Yoon SY, Kim DW, Kim SY, Choi SY, Cho SW (2005). „Identifikace vazebného místa UDP-glukózy lidské UDP-glukózodehydrogenázy pomocí fotoafinitního značení a kazetové mutageneze“. Biokonjugovaná chemie. 16 (3): 710–6. doi:10.1021 / bc0500387. PMID 15898741.
- Vatsyayan J, Peng HL, Chang HY (červen 2005). „Analýza promotoru genu lidské UDP-glukózadehydrogenázy: identifikace vazebného místa Sp1 rozhodujícího pro expresi velkého transkriptu“. Journal of Biochemistry. 137 (6): 703–9. doi:10.1093 / jb / mvi082. PMID 16002992.
- Wang L, Zhu YF, Guo XJ, Huo R, Ma X, Lin M, Zhou ZM, Sha JH (říjen 2005). "Dvojrozměrná referenční mapa elektroforézy lidského vaječníku". Journal of Molecular Medicine. 83 (10): 812–21. doi:10.1007 / s00109-005-0676-r. PMID 16021519. S2CID 6644433.
- Vatsyayan J, Lin CT, Peng HL, Chang HY (únor 2006). "Identifikace cis-působícího prvku odpovědného za negativní regulaci exprese genu lidské UDP-glukóza dehydrogenázy". Bioscience, biotechnologie a biochemie. 70 (2): 401–10. doi:10,1271 / bbb.70,401. PMID 16495656. S2CID 25853385.
- Huh JW, Robinson RC, Lee HS, Lee JI, Heo YS, Kim HT, Lee HJ, Cho SW, Choe H (2006). "Exprese, čištění, krystalizace a předběžná rentgenová analýza lidské UDP-glukózodehydrogenázy". Proteinové a peptidové dopisy. 13 (8): 859–62. doi:10.2174/092986606777841253. PMID 17073734. S2CID 28298102.
- Easley KE, Sommer BJ, Boanca G, Barycki JJ, Simpson MA (leden 2007). „Charakterizace lidské UDP-glukózodehydrogenázy odhaluje kritické katalytické role lysinu 220 a aspartátu 280“. Biochemie. 46 (2): 369–78. doi:10.1021 / bi061537d. PMID 17209547.
