Kobaltová chelatáza - Cobalt chelatase
| kobaltová chelatáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Předpokládaný kobalt chelatasový monomer z Desulvobrio vulgaris.[1] | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 6.6.1.2 | ||||||||
| Číslo CAS | 81295-49-0 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Kobaltová chelatáza, podjednotka CobT | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | CobT | ||||||||
| Pfam | PF06213 | ||||||||
| InterPro | IPR006538 | ||||||||
| |||||||||
Kobaltová chelatáza (ES 6.6.1.2 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce
- ATP + a, c-diamid + kyselina hydrogenobyrinová + Co2+ + H2Ó ADP + fosfát + cob (II) kyselina yrinová a, c-diamid + H+
Čtyři substráty tohoto enzymu jsou ATP, a, c-diamid kyseliny hydrogenobyrinové, Spol2+, a H2Ó; jeho čtyři produkty jsou ADP, fosfát, cob (II) kyselina yrinová a, c-diamid, a H+.
Aerobní kobaltová chelatáza (aerobní cesta biosyntézy kobalaminu)[2][3] skládá se ze tří podjednotek, CobT, CobN (InterPro: IPR003672 ) a CobS (InterPro: IPR006537 ).
The makrocyklus z vitamin B12 mohou být komplexovány s kovem prostřednictvím reakcí závislých na ATP v aerobní dráze (např. v Pseudomonas denitrificans ) nebo prostřednictvím reakcí nezávislých na ATP sirohydrochlorin v anaerobní cestě (např. v Salmonella typhimurium ).[4][5] Odpovídající kobaltové chelatázy nejsou homologní. Aerobní kobaltové chelatasové podjednotky CobN a CobS jsou však homologní s Mg-chelatasovými podjednotkami BchH a BchI.[5] Bylo také zjištěno, že CobT je vzdáleně příbuzný třetí podjednotce Mg-chelatázy, BchD (podílí se na syntéze bakteriochlorofylů, např. U Rhodobacter capsulatus).[5]
Tento enzym patří do rodiny ligázy, konkrétně těch, které tvoří vazby dusík-D-kov v koordinačních komplexech. The systematické jméno této třídy enzymů je kyselina hydrogenobyrinová-a, c-diamid: kobalt kobalt-ligáza (tvořící ADP). Mezi další běžně používaná jména patří kobaltochelatáza a, c-diamid, kyselina hydrogenobyrinová, CobNST, a CobNCobST. Tento enzym je součástí biosyntetické dráhy ke kobalaminu (vitamin B12) v aerobní bakterie.
Viz také
Reference
- ^ Romão, Célia V .; Ladakis, Dimitrios; Lobo, Susana A. L .; Carrondo, Maria A .; Brindley, Amanda A .; Deery, Evelyne; Matias, Pedro M .; Pickersgill, Richard W .; Saraiva, Lígia M .; Warren, Martin J. (4. ledna 2011). „Evoluce v rodině chelatáz usnadněná zavedením asymetrie aktivního místa a proteinové oligomerizace“. Sborník Národní akademie věd. 108 (1): 97–102. doi:10.1073 / pnas.1014298108.
- ^ Crouzet J, Cameron B, Cauchois L, Rigault S, Blanche F, Guilhot C, Levy-schil S, Rouyez MC (1991). „Genetická a sekvenční analýza fragmentu DNA Pseudomonas denitrificans obsahující dva geny klasu“. J. Bacteriol. 173 (19): 6058–6065. doi:10.1128 / jb.173.19.6058-6065.1991. PMC 208352. PMID 1917840.
- ^ Crouzet J, Cameron B, Blanche F, Thibaut D, Debussche L, Couder M (1992). „Test, čištění a charakterizace kobaltochelatázy, jedinečného komplexního enzymu katalyzujícího inzerci kobaltu v a, c-diamidu kyseliny hydrogenobyrinové a během biosyntézy koenzymu B12 u Pseudomonas denitrificans“. J. Bacteriol. 174 (22): 7445–7451. doi:10.1128 / jb.174.22.7445-7451.1992. PMC 207441. PMID 1429466.
- ^ Roth JR, Lawrence JG, Bobik TA (1996). "Cobalamin (koenzym B12): syntéza a biologický význam" (PDF). Annu. Rev. Microbiol. 50: 137–181. doi:10.1146 / annurev.micro.50.1.137. PMID 8905078.
- ^ A b C Willows RD, Al-Karadaghi S, Hansson M, Fodje MN, Hansson A, Olsen JG, Gough S (2001). „Souhra mezi modulem AAA a doménou integrinu I může regulovat funkci chelatázy hořečnaté“. J. Mol. Biol. 311 (1): 111–122. doi:10.1006 / jmbi.2001.4834. PMID 11469861.
Další čtení
- Debussche L, Couder M, Thibaut D, Cameron B, Crouzet J, Blanche F (1992). „Test, čištění a charakterizace kobaltochelatázy, jedinečného komplexního enzymu katalyzujícího inzerci kobaltu v a, c-diamidu kyseliny hydrogenobyrinové a během biosyntézy koenzymu B12 u Pseudomonas denitrificans“. J. Bacteriol. 174 (22): 7445–51. doi:10.1128 / JB.174.22.7445-7451.1992. PMC 207441. PMID 1429466.
- Warren MJ, Raux E, Schubert HL, Escalante-Semerena JC (2002). "Biosyntéza adenosylkobalaminu (vitamin B12)". Nat. Prod. Rep. 19 (4): 390–412. doi:10.1039 / b108967f. PMID 12195810.
| Tento ligáza článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |