UBQLN1 - UBQLN1
Ubichilin-1 je protein že u lidí je kódován UBQLN1 gen.[5][6][7]
Ubikiliny obsahují a N-terminál ubikvitin podobný doména a a C-terminál doména spojená s ubikvitinem. Fyzicky se stýkají s oběma proteazomy a ubikvitin ligázy, a proto se o nich předpokládá, že funkčně spojují ubikvitinační aparát s proteazomem za účelem degradace proteinu in vivo.
Možná role v prevenci Alzheimerovy choroby
Ukázalo se také, že ubichilin moduluje akumulaci presenilinových proteinů a nachází se v lézích spojených s Alzheimerova choroba a Parkinsonova choroba choroba. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.[7]
Vyšší hladiny ubichilinu-1 v mozku snížily malformaci molekuly APP, která hraje klíčovou roli při spouštění Alzheimerovy choroby.[8] Naopak nižší hladiny ubichilinu-1 v mozku byly spojeny se zvýšenou malformací APP.[8]
Podobnost s jinými proteiny
Lidský UBQLN1 sdílí vysoký stupeň podobnosti s příbuznými ubikiliny včetně UBQLN2 a UBQLN4.[9]
Interakce
UBQLN1 bylo prokázáno komunikovat s
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135018 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000005312 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Ozaki T, Hishiki T, Toyama Y, Yuasa S, Nakagawara A, Sakiyama S (říjen 1997). "Identifikace nového buněčného proteinu, který může specificky interagovat s DAN". DNA Cell Biol. 16 (8): 985–91. doi:10.1089 / dna.1997.16.985. PMID 9303440.
- ^ Hanaoka E, Ozaki T, Ohira M, Nakamura Y, Suzuki M, Takahashi E, Moriya H, Nakagawara A, Sakiyama S (červenec 2000). "Molekulární klonování a analýza exprese lidského genu DA41 a jeho mapování na chromozom 9q21.2-q21.3". J Hum Genet. 45 (3): 188–91. doi:10,1007 / s100380050209. PMID 10807547.
- ^ A b „Entrez Gene: UBQLN1 ubikilin 1“.
- ^ A b Stieren ES, El Ayadi A, Xiao Y, Siller E, Landsverk ML, Oberhauser AF, Barral JM, Boehning D (srpen 2011). „Ubichilin-1 je molekulární chaperon pro protein amyloidového prekurzoru“. J Biol Chem. 286 (41): 35689–98. doi:10.1074 / jbc.M111.243147. PMC 3195644. PMID 21852239. Shrnutí ležel – Věda denně.
- ^ Marín I (březen 2014). „Rodina genů ubikilinu: evoluční vzorce a funkční poznatky“. BMC Evol Biol. 14: 63. doi:10.1186/1471-2148-14-63. PMC 4230246. PMID 24674348.
- ^ Kim TY, Kim E, Yoon SK, Yoon JB (květen 2008). „Herp zvyšuje odbourávání proteinů souvisejících s ER náborem ubikilinů“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 369 (2): 741–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2008.02.086. PMID 18307982.
- ^ Wu S, Mikhailov A, Kallo-Hosein H, Hara K, Yonezawa K, Avruch J (leden 2002). "Charakterizace ubichilinu 1, proteinu interagujícího s mTOR". Biochim. Biophys. Acta. 1542 (1–3): 41–56. doi:10.1016 / S0167-4889 (01) 00164-1. PMID 11853878.
- ^ Ko HS, Uehara T, Nomura Y (září 2002). „Role ubikilinu spojená s protein-disulfidovou izomerázou v endoplazmatickém retikulu při apoptotické buněčné smrti vyvolané stresem“. J. Biol. Chem. 277 (38): 35386–92. doi:10,1074 / jbc.M203412200. PMID 12095988.
- ^ A b Mah AL, Perry G, Smith MA, Monteiro MJ (listopad 2000). „Identifikace ubichilinu, nového interakčního faktoru presenilinu, který zvyšuje akumulaci proteinů presenilinu“. J. Cell Biol. 151 (4): 847–62. doi:10.1083 / jcb.151.4.847. PMC 2169435. PMID 11076969.
- ^ Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P, Kumar S, Soccio RE, Kedersha NL, Gill G, Howley PM (srpen 2000). „HPLIC proteiny mohou poskytovat spojení mezi ubikvitinačním aparátem a proteazomem.“ Mol. Buňka. 6 (2): 409–19. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00040-X. PMID 10983987.
- ^ Rolland T, Taşan M, Charloteaux B, Pevzner SJ, Zhong Q, Sahni N, Yi S, Lemmens I, Fontanillo C, Mosca R, Kamburov A, Ghiassian SD, Yang X, Ghamsari L, Balcha D, Begg BE, Braun P , Brehme M, Broly MP, Carvunis AR, Convery-Zupan D, Corominas R, Coulombe-Huntington J, Dann E, Dreze M, Dricot A, Fan C, Franzosa E, Gebreab F, Gutierrez BJ, Hardy MF, Jin M, Kang S, Kiros R, Lin GN, Luck K, MacWilliams A, Menche J, Murray RR, Palagi A, Poulin MM, Rambout X, Rasla J, Reichert P, Romero V, Ruyssinck E, Sahalie JM, Scholz A, Shah AA , Sharma A, Shen Y, Spirohn K, Tam S, Tejeda AO, Trigg SA, Twizere JC, Vega K, Walsh J, Cusick ME, Xia Y, Barabási AL, Iakoucheva LM, Aloy P, De Las RJ, Tavernier J, Calderwood MA, Hill DE, Hao T, Roth FP, Vidal M (2014). "Mapa proteomové sítě lidské interakční sítě". Buňka. 159 (5): 1212–26. doi:10.1016 / j.cell.2014.10.050. PMC 4266588. PMID 25416956.
Další čtení
- Ozaki T, Kondo K, Nakamura Y a kol. (1997). „Interakce DA41, proteinu vázajícího DAN, s proteinem podobným epidermálnímu růstovému faktoru, S (1-5)“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 237 (2): 245–50. doi:10.1006 / bbrc.1997.7122. PMID 9268694.
- Ozaki T, Hanaoka E, Naka M a kol. (1999). "Klonování a charakterizace krysí BAT3 cDNA". DNA Cell Biol. 18 (6): 503–12. doi:10.1089/104454999315222. PMID 10390159.
- Wu AL, Wang J, Zheleznyak A, Brown EJ (1999). "Proteiny související s ubikvitinem regulují interakci vimentinových intermediálních vláken s plazmatickou membránou". Mol. Buňka. 4 (4): 619–25. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80212-9. PMID 10549293.
- Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P a kol. (2000). „HPLIC proteiny mohou poskytovat spojení mezi ubikvitinačním aparátem a proteazomem.“ Mol. Buňka. 6 (2): 409–19. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00040-X. PMID 10983987.
- Mah AL, Perry G, Smith MA, Monteiro MJ (2000). „Identifikace ubichilinu, nového interakčního faktoru presenilinu, který zvyšuje akumulaci proteinů presenilinu“. J. Cell Biol. 151 (4): 847–62. doi:10.1083 / jcb.151.4.847. PMC 2169435. PMID 11076969.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Bedford FK, Kittler JT, Muller E a kol. (2001). „Počet povrchů buněk receptoru GABA (A) a stabilita podjednotky jsou regulovány ubikvitinovým proteinem Plic-1“. Nat. Neurosci. 4 (9): 908–16. doi:10.1038 / nn0901-908. PMID 11528422. S2CID 13078743.
- Wu S, Mikhailov A, Kallo-Hosein H a kol. (2002). "Charakterizace ubichilinu 1, proteinu interagujícího s mTOR". Biochim. Biophys. Acta. 1542 (1–3): 41–56. doi:10.1016 / S0167-4889 (01) 00164-1. PMID 11853878.
- Ko HS, Uehara T, Nomura Y (2002). „Role ubikilinu spojená s protein-disulfidovou izomerázou v endoplazmatickém retikulu při apoptotické buněčné smrti vyvolané stresem“. J. Biol. Chem. 277 (38): 35386–92. doi:10,1074 / jbc.M203412200. PMID 12095988.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Gao L, Tu H, Shi ST a kol. (2003). „Interakce s ubikvitinovým proteinem zvyšuje ubikvitinaci a degradaci RNA polymerázy závislé na viru hepatitidy C“. J. Virol. 77 (7): 4149–59. doi:10.1128 / JVI.77.7.4149-4159.2003. PMC 150629. PMID 12634373.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Massey LK, Mah AL, Ford DL a kol. (2004). „Nadměrná exprese ubichilinu snižuje ubikvitinaci a degradaci presenilinových proteinů“. J. Alzheimer's Dis. 6 (1): 79–92. doi:10.3233 / jad-2004-6109. PMID 15004330.
- Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomika mapující cestu lidské signalizace". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Persson P, Stockhausen MT, Påhlman S, Axelson H (2005). „Ubichilin-1 je nový protein tvořící komplex HASH-1, který reguluje hladiny neuronálních transkripčních faktorů bHLH v lidských buňkách neuroblastomu“. Int. J. Oncol. 25 (5): 1213–21. doi:10,3892 / ijo.25.5.1213. PMID 15492808.
- Bertram L, Hiltunen M, Parkinson M a kol. (2005). "Rodinná asociace mezi Alzheimerovou chorobou a variantami v UBQLN1". N. Engl. J. Med. 352 (9): 884–94. doi:10.1056 / NEJMoa042765. PMID 15745979.