NLRP1 - NLRP1

NLRP1
PDB 1pn5 EBI.jpg
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyNLRP1, CARD7, CIDED, CLR17.1, DEFCAP, DEFCAP-L / S, NAC, NALP1, PP1044, SLEV1, VAMAS1, rodina NLR, doména pyrinu obsahující 1, doména pyrinu rodiny NLR obsahující 1, MSPC, AIADK, JRRP
Externí IDOMIM: 606636 MGI: 3582959 HomoloGene: 19080 Genové karty: NLRP1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 17 (lidský)
Chr.Chromozom 17 (lidský)[1]
Chromozom 17 (lidský)
Genomické umístění pro NLRP1
Genomické umístění pro NLRP1
Kapela17p13.2Start5,499,427 bp[1]
Konec5,619,424 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE NLRP1 210113 s na fs.png

PBB GE NLRP1 211824 x na fs.png

PBB GE NLRP1 211822 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

22861

637515

Ensembl

ENSG00000091592

ENSMUSG00000070390

UniProt

Q9C000

Q2LKV5
Q2LKV2
Q2LKW6
Q0GKD5

RefSeq (mRNA)

NM_033007
NM_001033053
NM_014922
NM_033004
NM_033006

NM_001039680
NM_001040696
NM_001162414

RefSeq (protein)

NP_001028225
NP_055737
NP_127497
NP_127499
NP_127500

NP_001035786
NP_001155886

Místo (UCSC)Chr 17: 5,5 - 5,62 MbChr 11: 71,15 - 71,23 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

NLRP1 kóduje NACHT, LRR, FIIND, CARD doména a PYD domény obsahující protein 1 u lidí.[5][6][7] NLRP1 byl první protein ukázáno, že tvoří inflammasome.[8] NLRP1 je vyjádřen řadou buňka typy, které jsou převážně krvetvorné. Exprese je také vidět ve strukturách žlázového epitelu, včetně výstelky tenké střevo, žaludek.[9] Polymorfismy NLRP1 jsou spojeny s kožními mimostřevními projevy u CD.[9] Jeho nejvyšší exprese byla detekována v lidské kůži, v psoriáza a ve vitiligo. Polymorfismy NLRP1 byly nalezeny v lupus erythematodes a diabetes typu 1.[10] Bylo zjištěno, že varianty myšího NLRP1 jsou aktivovány po N-terminálním štěpení proteáza v antrax smrtelný faktor.[8]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny Ced-4 z apoptóza bílkoviny. Členové rodiny CED obsahují a doména náboru kaspázy (KARTA) a je o nich známo, že jsou klíčovými zprostředkovateli programovaná buněčná smrt. Zakódováno protein obsahuje zřetelný N-terminál pyrinový motiv, který je případně zapojen do interakce protein-protein. Protein NLRP1 silně interaguje s kaspáza 2 a slabě s kaspáza 9. Nadměrná exprese tohoto gen Bylo prokázáno, že indukuje apoptózu v buňkách. Násobek alternativně sestříhané Byly nalezeny varianty transkriptu kódující odlišné izoformy pro tento gen, ale biologická platnost některých variant nebyla stanovena.[7]

Mechanismus aktivace

NLRP1 aktivuje antibakteriální látku imunitní odpověď. Antibakteriální imunitní odpověď kompenzuje ztrátu MAP kináza Odezva. Lidé produkují NLRP1, ale lidský NLRP1 není aktivován letálním faktorem.[8] NLRP1 by mohl být aktivován proteolytickým štěpením vedoucím k odstranění autoinhibičního PYD a uvolnění CARD domény, odpovědné za nábor a aktivaci pro-kaspázy-1 v aktivní formě kaspázy-1.[8] Ale mechanismus lidské aktivace NLRP1 a funkce v imunita není jasné.[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že NLRP1 komunikovat s kaspáza 9[11][12] a APAF1.[11]

Varianty NLRP1 u myší

Myši mají tři paralogy z Nlrp1 gen (Nlrp1a, b, c). Nlrp1c je pseudogen.[13] Myš NLRP1B není aktivována mechanismem typu receptor-ligand. Varianty NLRP1B z určitých inbredních myších kmenů, BALB / c a 129, lze aktivovat letálním faktorem (LF) proteáza. Smrtící faktor proteáza je produkován a vylučován Bacillus anthracis, agent antrax.[14] Spolu s ochranným antigenem (PA) tvoří LF bipartitní toxin, smrtelný toxin. Úlohou PA je tvořit a přemístění kanál, který dodává LF do hostitelské buňky cytosol, kde LF hrají roli v imunitní odpovědi štěpením a inaktivací MAP kináz.[15][16] LF také přímo štěpí NLRP1B proximálně k jeho N-konec je pro NLRP1B nezbytný a postačující inflammasome tvorba a aktivace CASP1.[17] Aktivace závislá na NLRP1B inflammasome odpovědi se objevují v obraně hostitele s mechanismy jako IL-1β a neutrofily.[18][19] NLRP1B může fungovat jako senzor bakteriální proteázy, imunitní odpovědi jsou specificky aktivovány virulence faktory.[20][21]

Není jasné, jaké stimuly mohou aktivovat NLRP1A, další známý funkční myší paralog NLRP1. Studie identifikovala myš nesoucí zisk funkce z missense mutace v NLRP1A (Q593P), který je aktivní inflammasome odpovědi. Mechanismus divoký typ Aktivace NLRP1A je nejasná.[22]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000091592 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000070390 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Thorpe KL, Abdulla S, Kaufman J, Trowsdale J, Beck S (říjen 1996). "Fylogeneze a struktura genu RING3". Imunogenetika. 44 (5): 391–6. doi:10.1007 / BF02602785. PMID  8781126. S2CID  44613743.
  6. ^ Tschopp J, Martinon F, Burns K (únor 2003). "NALP: nová rodina proteinů podílejících se na zánětu". Recenze přírody. Molekulární buněčná biologie. 4 (2): 95–104. doi:10.1038 / nrm1019. PMID  12563287. S2CID  31417018.
  7. ^ A b „Entrez Gene: NLRP1 NLR rodina, pyrinová doména obsahující 1“.
  8. ^ A b C d E Chavarría-Smith J, Mitchell PS, Ho AM, Daugherty MD, Vance RE (prosinec 2016). „Funkční a evoluční analýzy identifikují proteolýzu jako obecný mechanismus aktivace inflammasomu NLRP1“. PLOS patogeny. 12 (12): e1006052. doi:10.1371 / journal.ppat.1006052. PMC  5142783. PMID  27926929. CC-BY icon.svg Materiál byl zkopírován z tohoto zdroje, který je k dispozici pod a Mezinárodní licence Creative Commons Attribution 4.0.
  9. ^ A b Kummer JA, Broekhuizen R, Everett H, Agostini L, Kuijk L, Martinon F a kol. (Květen 2007). „Složky inflammasomu NALP 1 a 3 vykazují odlišné, ale oddělené profily exprese v lidských tkáních, což naznačuje místně specifickou roli v zánětlivé odpovědi“. The Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 55 (5): 443–52. doi:10.1369 / jhc.6A7101.2006. PMID  17164409.
  10. ^ Grandemange S, Sanchez E, Louis-Plence P, Tran Mau-Them F, Bessis D, Coubes C a kol. (Červenec 2017). "Nový autoinflamatorní a autoimunitní syndrom spojený s mutacemi NLRP1: NAIAD (NLRP1 související autoinflamation s artritidou a dyskeratózou)". Annals of the Revmatic Diseases. 76 (7): 1191–1198. doi:10.1136 / annrheumdis-2016-210021. PMID  27965258. S2CID  206852426.
  11. ^ A b Chu ZL, Pio F, Xie Z, Welsh K, Krajewska M, Krajewski S, Godzik A, Reed JC (březen 2001). „Nový enhancer apoptosomu Apaf1 zapojený do aktivace a apoptózy kaspázy závislé na cytochromu c“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (12): 9239–45. doi:10,1074 / jbc.M006309200. PMID  11113115.
  12. ^ Hlaing T, Guo RF, Dilley KA, Loussia JM, Morrish TA, Shi MM, Vincenz C, Ward PA (březen 2001). "Molekulární klonování a charakterizace DEFCAP-L a -S, dvou izoforem nového člena savčí rodiny Ced-4 proteinů apoptózy". The Journal of Biological Chemistry. 276 (12): 9230–8. doi:10,1074 / jbc.M009853200. PMID  11076957.
  13. ^ Sastalla I, Crown D, Masters SL, McKenzie A, Leppla SH, Moayeri M (březen 2013). „Transkripční analýza tří paralogů Nlrp1 u myší“. BMC Genomics. 14 (1): 188. doi:10.1186/1471-2164-14-188. PMC  3641005. PMID  23506131.
  14. ^ Boyden ED, Dietrich WF (únor 2006). „Nalp1b řídí citlivost makrofágů myší na smrtelný toxin antraxu“. Genetika přírody. 38 (2): 240–4. doi:10.1038 / ng1724. PMID  16429160. S2CID  23316987.
  15. ^ Turk BE (březen 2007). "Manipulace hostitelských signálních drah toxiny antraxu". The Biochemical Journal. 402 (3): 405–17. doi:10.1042 / BJ20061891. PMID  17313374.
  16. ^ Moayeri M, Leppla SH (prosinec 2009). "Buněčné a systémové účinky smrtelného toxinu antraxu a otoku toxinu". Molekulární aspekty medicíny. 30 (6): 439–55. doi:10.1016 / j.mam.2009.07.003. PMC  2784088. PMID  19638283.
  17. ^ Chavarría-Smith J, Vance RE (2013). „Přímé proteolytické štěpení NLRP1B je nezbytné a dostatečné pro aktivaci inflammasomu letálním faktorem antraxu“. PLOS patogeny. 9 (6): e1003452. doi:10.1371 / journal.ppat.1003452. PMC  3688554. PMID  23818853.
  18. ^ Terra JK, Cote CK, France B, Jenkins AL, Bozue JA, Welkos SL, LeVine SM, Bradley KA (leden 2010). „Špička: odolnost vůči infekci Bacillus anthracis zprostředkovaná smrtící alelou citlivou na toxiny Nalp1b / Nlrp1b“. Journal of Immunology. 184 (1): 17–20. doi:10,4049 / jimmunol.0903114. PMC  2811128. PMID  19949100.
  19. ^ Moayeri M, Crown D, Newman ZL, Okugawa S, Eckhaus M, Cataisson C, Liu S, Sastalla I, Leppla SH (prosinec 2010). „Inflammasomový senzor Nlrp1b závislá rezistence na antrax je zprostředkována kaspázou-1, signalizací IL-1 a náborem neutrofilů“. PLOS patogeny. 6 (12): e1001222. doi:10.1371 / journal.ppat.1001222. PMC  3000361. PMID  21170303.
  20. ^ de Zoete MR, Bouwman LI, Keestra AM, van Putten JP (březen 2011). „Štěpení a aktivace Toll-like receptoru mikrobiálními proteázami“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 108 (12): 4968–73. doi:10.1073 / pnas.1018135108. PMC  3064367. PMID  21383168.
  21. ^ Sarris PF, Duxbury Z, Huh SU, Ma Y, Segonzac C, Sklenar J, Derbyshire P, Cevik V, Rallapalli G, Saucet SB, Wirthmueller L, Menke FL, Sohn KH, Jones JD (květen 2015). „Imunitní receptor rostlin detekuje patogenní efektory, které cílí na WRKY transkripční faktory“. Buňka. 161 (5): 1089–1100. doi:10.1016 / j.cell.2015.04.024. PMID  26000484.
  22. ^ Masters SL, Gerlic M, Metcalf D, Preston S, Pellegrini M, O'Donnell JA a kol. (Prosinec 2012). „NLRP1 aktivace inflammasomu indukuje pyroptózu hematopoetických progenitorových buněk“. Imunita. 37 (6): 1009–23. doi:10.1016 / j.immuni.2012.08.027. PMC  4275304. PMID  23219391.

Další čtení

externí odkazy

  • Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9C000 (Protein 1 obsahující domény NACHT, LRR a PYD) na PDBe-KB.