Seznam sekvenovaných zvířecích genomů - List of sequenced animal genomes

Tento seznam sekvenovaných zvířecích genomů obsahuje živočišné druhy, pro které byly sestaveny, anotovány a publikovány úplné sekvence genomu. Zahrnuty jsou v podstatě úplné koncepty genomů, ale nikoli parciální sekvence genomu nebo sekvence pouze pro organely.

Tento seznam je neúplný; můžete pomoci přidání chybějících položek s spolehlivé zdroje.

Porifera

Ctenophora

Placozoa

Cnidaria

Deuterostomie

Hemichordáty

Ostnokožci

Pláštěnci

Cephalochordates

Cyklostomy

Paryby

Kostnatá ryba

Obojživelníci

Plazi

Ptactvo

Savci

Protostomie

Hmyz

Korýši

Chelicerates

Z toho pavoukovci:

Myriapoda

Tardigrades

Měkkýši

Platyhelminthes

Nematody

Annelids

Brachiopoda

Rotifera

Viz také

Reference

  1. ^ Srivastava M, Simakov O, Chapman J, Fahey B, Gauthier ME, Mitros T a kol. (Srpen 2010). „Genom Amphimedon queenslandica a vývoj složitosti zvířat“. Příroda. 466 (7307): 720–6. Bibcode:2010Natur.466..720S. doi:10.1038 / nature09201. PMC  3130542. PMID  20686567.
  2. ^ A b Ryu T, Seridi L, Moitinho-Silva L, Oates M, Liew YJ, Mavromatis C a kol. (Únor 2016). „Analýza hologenomu dvou mořských hub s různými mikrobiomy“. BMC Genomics. 17 (1): 158. doi:10.1186 / s12864-016-2501-0. PMC  4772301. PMID  26926518.
  3. ^ Kenny N, Francis, W a kol. (Červenec 2020). „Sledování evoluce genomu zvířat pomocí chromozomální úrovně sladkovodní houby Ephydatia muelleri“. Příroda komunikace. 11 (1): 720–6. Bibcode:2020NatCo..11,3676 tis. doi:10.1038 / s41467-020-17397-w. PMC  7385117. PMID  32719321.
  4. ^ Národní institut pro výzkum lidského genomu (2012). „Projekt genomu NHGRI Mnemiopsis“. Citováno 2013-02-05.
  5. ^ Ryan JF, Pang K, Schnitzler CE, Nguyen AD, Moreland RT, Simmons DK a kol. (Prosinec 2013). „Genom ctenoforu Mnemiopsis leidyi a jeho důsledky pro vývoj buněčného typu“. Věda. 342 (6164): 1242592. doi:10.1126 / science.1242592. PMC  3920664. PMID  24337300.
  6. ^ Moroz LL, Kocot KM, Citarella MR, Dosung S, Norekian TP, Povolotskaya IS a kol. (Červen 2014). „Genom ctenoforu a evoluční počátky neurálních systémů“. Příroda. 510 (7503): 109–14. Bibcode:2014 Natur.510..109M. doi:10.1038 / příroda13400. PMC  4337882. PMID  24847885.
  7. ^ Srivastava M, Begovic E, Chapman J, Putnam NH, Hellsten U, Kawashima T a kol. (Srpen 2008). „Trichoplax genom a povaha placozoanů“. Příroda. 454 (7207): 955–60. Bibcode:2008Natur.454..955S. doi:10.1038 / nature07191. PMID  18719581. S2CID  4415492.
  8. ^ Eitel M, Francis WR, Varoqueaux F, Daraspe J, Osigus HJ, Krebs S, et al. (Červenec 2018). „Srovnávací genomika a povaha druhů placozoanů“. PLOS Biology. 16 (7): e2005359. doi:10.1371 / journal.pbio.2005359. PMC  6067683. PMID  30063702.
  9. ^ Chapman JA, Kirkness EF, Simakov O, Hampson SE, Mitros T, Weinmaier T a kol. (Březen 2010). „Dynamický genom Hydry“. Příroda. 464 (7288): 592–6. Bibcode:2010Natur.464..592C. doi:10.1038 / nature08830. PMC  4479502. PMID  20228792.
  10. ^ Putnam NH, Srivastava M, Hellsten U, Dirks B, Chapman J, Salamov A a kol. (Červenec 2007). „Genom mořských sasanek odhaluje rodový repertoár genů eumetazoanů a genomovou organizaci“. Věda. 317 (5834): 86–94. Bibcode:2007Sci ... 317 ... 86P. doi:10.1126 / science.1139158. PMID  17615350. S2CID  9868191.
  11. ^ Baumgarten S, Simakov O, Esherick LY, Liew YJ, Lehnert EM, Michell CT a kol. (Září 2015). „Genom Aiptasie, model mořské sasanky pro korálovou symbiózu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 112 (38): 11893–8. Bibcode:2015PNAS..11211893B. doi:10.1073 / pnas.1513318112. PMC  4586855. PMID  26324906.
  12. ^ Shinzato C, Shoguchi E, Kawashima T, Hamada M, Hisata K, Tanaka M a kol. (Červenec 2011). „Používání genomu Acropora digitifera k pochopení odezvy korálů na změnu prostředí“. Příroda. 476 (7360): 320–3. Bibcode:2011Natur.476..320S. doi:10.1038 / příroda10249. PMID  21785439. S2CID  4364757.
  13. ^ Jiang J (2017). „Genilla Renilla muelleri“. reefgenomika.
  14. ^ Jiang JB, Quattrini AM, Francis WR, Ryan JF, Rodríguez E, McFadden CS (duben 2019). „Hybridní de novo sestava genomu mořské macešky (Renilla muelleri)“. GigaScience. 8 (4). doi:10.1093 / gigascience / giz026. PMC  6446218. PMID  30942866.
  15. ^ Voolstra CR, Li Y, Liew YJ, Baumgarten S, Zoccola D, Flot JF a kol. (Prosinec 2017). „Srovnávací analýza genomů Stylophora pistillata a Acropora digitifera poskytuje důkazy o rozsáhlých rozdílech mezi druhy korálů“. Vědecké zprávy. 7 (1): 17583. Bibcode:2017NatSR ... 717583V. doi:10.1038 / s41598-017-17484-x. PMC  5730576. PMID  29242500.
  16. ^ Gold DA, Katsuki T, Li Y, Yan X, Regulski M, Ibberson D a kol. (Leden 2019). „Genom medúzy Aurelia a vývoj složitosti zvířat“ (PDF). Ekologie a evoluce přírody. 3 (1): 96–104. doi:10.1038 / s41559-018-0719-8. PMID  30510179. S2CID  54437176.
  17. ^ Leclère L, Horin C, Chevalier S, Lapébie P, Dru P, Peron S a kol. (Květen 2019). „Genom medúzy Clytia hemisphaerica a vývoj cnidarského životního cyklu“. Ekologie a evoluce přírody. 3 (5): 801–810. doi:10.1038 / s41559-019-0833-2. PMID  30858591. S2CID  73728941.
  18. ^ Cunning R, Bay RA, Gillette P, Baker AC, Traylor-Knowles a kol. (2018). „Srovnávací analýza genomu Pocillopora damicornis zdůrazňuje roli imunitního systému v evoluci korálů“. Vědecké zprávy. 8 (1): 16134. Bibcode:2018NatSR ... 816134C. doi:10.1038 / s41598-018-34459-8. PMC  6208414. PMID  30382153.
  19. ^ Prada C, Hanna B, Budd AF, Woodley CM, Schmutz J, Grimwood J, Iglesias-Prieto R, Pandolfi JM, Levitan D, Johnson KG, DiGiorgio M a kol. (2016). „Prázdné mezery 2016 po vyhynutí zvyšují velikost populace moderních korálů“. Aktuální biologie. 1 (26): 3190–3194. doi:10.1016 / j.cub.2016.09.039. PMID  27866895. S2CID  188206.
  20. ^ Kim HM, Weber JA, Lee N, Park SG, Cho YS, Bhak Y a kol. (Březen 2019). „Genom medúzy Nomury vrhá světlo na časný vývoj aktivní predace“. Biologie BMC. 17 (1): 28. doi:10.1186 / s12915-019-0643-7. PMC  6441219. PMID  30925871.
  21. ^ Li Y, Gao L, Pan Y, Tian M, Li Y, He C a kol. (Duben 2020). „Referenční genom na úrovni chromozomu medúzy Rhopilema esculentum“. GigaScience. 9 (4). doi:10.1093 / gigascience / giaa036. PMC  7172023. PMID  32315029.
  22. ^ A b C Ohdera A, Ames CL, Dikow RB, Kayal E, Chiodin M, Busby B a kol. (Červenec 2019). „Box, stopkatý a vzhůru nohama? Tažené genomy z různých rodů medúz (Cnidaria, Acraspeda): Alatina alata (Cubozoa), Calvadosia cruxmelitensis (Staurozoa) a Cassiopea xamachana (Scyphozoa).“. GigaScience. 8 (7). doi:10.1093 / gigascience / giz069. PMC  6599738. PMID  31257419.
  23. ^ Jeon Y, Park SG, Lee N, Weber JA, Kim HS, Hwang SJ a kol. (Březen 2019). „Návrh genomu oktokorálu, Dendronephthya gigantea“. Biologie genomu a evoluce. 11 (3): 949–953. doi:10.1093 / gbe / evz043. PMC  6447388. PMID  30825304.
  24. ^ Cooke, Ira; Ying, Hua; Forêt, Sylvain; Bongaerts, Pim; Strugnell, Jan M .; Simakov, Oleg; Zhang, Jia; Field, Matt A .; Rodriguez-Lanetty, Mauricio; Bell, Sara C .; Bourne, David G. (01.01.2020). „Genomické podpisy v korálovém holobiontu odhalují adaptace hostitele vyvolané holocénními změnami podnebí a symbionty útesů. Vědecké zálohy. 6 (48): eabc6318. doi:10.1126 / sciadv.abc6318. ISSN  2375-2548. PMID  33246955 Šek | pmid = hodnota (Pomoc). S2CID  227179581.
  25. ^ A b Simakov O, Kawashima T, Marlétaz F, Jenkins J, Koyanagi R, Mitros T a kol. (Listopad 2015). „Hemichordátové genomy a původ deuterostomu“. Příroda. 527 (7579): 459–65. Bibcode:2015 Natur.527..459S. doi:10.1038 / příroda16150. PMC  4729200. PMID  26580012.
  26. ^ Baughman KW, McDougall C, Cummins SF, Hall M, Degnan BM, Satoh N, Shoguchi E (prosinec 2014). „Genomická organizace klastrů Hox a ParaHox v ostnokožci, Acanthaster planci“. Genesis. 52 (12): 952–8. doi:10.1002 / dvg.22840. PMID  25394327. S2CID  32809575.
  27. ^ Jo J, Oh J, Lee HG, Hong HH, Lee SG, Cheon S a kol. (Leden 2017). „Návrh genomu mořské okurky Apostichopus japonicus a genetický polymorfismus mezi barevnými variantami“. GigaScience. 6 (1): 1–6. doi:10.1093 / gigascience / giw006. PMC  5437941. PMID  28369350.
  28. ^ Sodergren E, Weinstock GM, Davidson EH, Cameron RA, Gibbs RA, Angerer RC a kol. (Listopad 2006). "Genom mořského ježka Strongylocentrotus purpuratus". Věda. 314 (5801): 941–52. Bibcode:2006Sci ... 314..941S. doi:10.1126 / science.1133609. PMC  3159423. PMID  17095691.
  29. ^ Dehal P, Satou Y, Campbell RK, Chapman J, Degnan B, De Tomaso A a kol. (Prosinec 2002). „Návrh genomu Ciona intestinalis: pohledy na strunatce a původ obratlovců“. Věda. 298 (5601): 2157–67. Bibcode:2002Sci ... 298.2157D. doi:10.1126 / science.1080049. PMID  12481130. S2CID  15987281.
  30. ^ Malý KS, Brudno M, Hill MM, Sidow A (2007). „Zarovnání haplomu a referenční sekvence vysoce polymorfního genomu Ciona savignyi“. Genome Biology. 8 (3): R41. doi:10.1186 / gb-2007-8-3-r41. PMC  1868934. PMID  17374142.
  31. ^ Seo HC, Kube M, Edvardsen RB, Jensen MF, Beck A, Spriet E a kol. (Prosinec 2001). "Miniaturní genom v mořském strunatci Oikopleura dioica". Věda. 294 (5551): 2506. doi:10.1126 / science.294.5551.2506. PMID  11752568.
  32. ^ Putnam NH, Butts T, Ferrier DE, Furlong RF, Hellsten U, Kawashima T a kol. (Červen 2008). „Amphioxus genom a vývoj karyotypu strunatců“. Příroda. 453 (7198): 1064–71. Bibcode:2008 Natur.453.1064P. doi:10.1038 / nature06967. PMID  18563158. S2CID  4418548.
  33. ^ Libants S, Carr K, Wu H, Teeter JH, Chung-Davidson YW, Zhang Z, Wilkerson C, Li W (červenec 2009). „Genom mořského mihule Petromyzon marinus odhaluje časný původ několika rodin chemosenzorických receptorů v linii obratlovců“. BMC Evoluční biologie. 9: 180. doi:10.1186/1471-2148-9-180. PMC  2728731. PMID  19646260.
  34. ^ Smith JJ, Kuraku S, Holt C, Sauka-Spengler T, Jiang N, Campbell MS a kol. (Duben 2013). „Sekvenování genomu mihule mořské (Petromyzon marinus) poskytuje poznatky o vývoji obratlovců“. Genetika přírody. 45 (4): 415–21, 421e1-2. doi:10.1038 / ng.2568. PMC  3709584. PMID  23435085.
  35. ^ Venkatesh B, Kirkness EF, Loh YH, Halpern AL, Lee AP, Johnson J a kol. (Duben 2007). „Sekvenování průzkumu a srovnávací analýza genomu žraloka sloního (Callorhinchus milii)“. PLOS Biology. 5 (4): e101. doi:10.1371 / journal.pbio.0050101. PMC  1845163. PMID  17407382.
  36. ^ Přečtěte si TD, Petit RA, Joseph SJ, Alam MT, Weil MR, Ahmad M a kol. (Červenec 2017). „Návrh sekvenování a shromáždění genomu největší ryby na světě, velrybího žraloka: Rhincodon typus Smith 1828“. BMC Genomics. 18 (1): 532. doi:10.1186 / s12864-017-3926-9. PMC  5513125. PMID  28709399.
  37. ^ Marra NJ, Stanhope MJ, Jue NK, Wang M, Sun Q, Pavinski Bitar P a kol. (Únor 2019). „Genom bílý žralok odhaluje starodávné adaptace elasmobranchů spojené s hojením ran a udržováním stability genomu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 116 (10): 4446–4455. doi:10.1073 / pnas.1819778116. PMC  6410855. PMID  30782839.
  38. ^ A b Hara Y, Yamaguchi K, Onimaru K, Kadota M, Koyanagi M, Keeley SD a kol. (Listopad 2018). „Žraločí genomy poskytují poznatky o vývoji elasmobranch a původu obratlovců“. Ekologie a evoluce přírody. 2 (11): 1761–1771. doi:10.1038 / s41559-018-0673-5. PMID  30297745. S2CID  52944566.
  39. ^ Fan G, Chan J, Ma K, Yang B, Zhang H, Yang X a kol. (Listopad 2018). „Referenční genom na úrovni chromozomu bojovnice pestrá Betta splendens, modelový druh pro studium agresivity“. GigaScience. 7 (11). doi:10.1093 / gigascience / giy087. PMC  6251983. PMID  30010754.
  40. ^ A b C d E F G h i j Fan, Guangyi; Song, Yue; Yang, Liandong; Huang, Xiaoyun; Zhang, Suyu; Zhang, Mengqi; Yang, Xianwei; Chang, Yue; Zhang, He; Li, Yongxin; Liu, Shanshan (01.08.2020). „První vydání dat a oznámení o projektu 10 000 ryb Genomes (Fish10K)“. GigaScience. 9 (8). doi:10.1093 / gigascience / giaa080. PMC  7433795. PMID  32810278.
  41. ^ Guangyi, fanoušek; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; On, Zhang (2020), Genomická data líbajících se gourami, Helostoma temminkii, GigaScience Database, doi:10.5524/102190, vyvoláno 2020-08-19
  42. ^ Kasahara M, Naruse K, Sasaki S, Nakatani Y, Qu W, Ahsan B a kol. (Červen 2007). „Medakový návrh genomu a pohledy na vývoj genomu obratlovců“. Příroda. 447 (7145): 714–9. Bibcode:2007Natur.447..714K. doi:10.1038 / nature05846. PMID  17554307. S2CID  4419559.
  43. ^ Zima, Sven; Prost, Stefan; Raad, Jordi de; Coimbra, Raphael T. F .; Vlk, Magnus; Nebenführ, Marcel; Drženo, Annika; Kurzawe, Melina; Papapostolou, Ramona; Tessien, Jade; Bludau, Julian (2020). „Shromáždění genomu na úrovni chromozomu bentického asociovaného druhu Syngnathiformes: dragonet společná, Callionymus lyra“. Gigabyte. 2020: 1–10. doi:10,46471 / gigabajt. 6..
  44. ^ Xiao Y, Xiao Z, Ma D, Liu J, Li J (březen 2019). "Sekvence genomu promlčeného nože Oplegnathus fasciatus (Temminck & Schlegel, 1844): první koncept genomu na úrovni chromozomu v rodině Oplegnathidae". GigaScience. 8 (3). doi:10.1093 / gigascience / giz013. PMC  6423371. PMID  30715332.
  45. ^ McGaugh SE, Gross JB, Aken B, Blin M, Borowsky R, Chalopin D a kol. (Říjen 2014). „Genóm jeskynních ryb odhaluje kandidátské geny pro ztrátu očí. Příroda komunikace. 5 (1): 5307. Bibcode:2014NatCo ... 5,5307 mil. doi:10.1038 / ncomms6307. PMC  4218959. PMID  25329095.
  46. ^ A b Conte MA, Joshi R, Moore EC, Nandamuri SP, Gammerdinger WJ, Roberts RB, et al. (Duben 2019). „Sestavy v měřítku chromozomu odhalují strukturální vývoj genomů afrických cichlíd“. GigaScience. 8 (4). doi:10.1093 / gigascience / giz030. PMC  6447674. PMID  30942871.
  47. ^ Í Kongsstovu S, Dahl HA, Gislason H, Í Homrum E, Jacobsen JA, Flicek P, Mikalsen SO (duben 2020). "Identifikace mužských heterogametických oblastí určujících pohlaví na atlantickém sledě genomu Clupea harengus". Journal of Fish Biology. 97 (1): 190–201. doi:10.1111 / jfb.14349. PMC  7115899. PMID  32293027. S2CID  215774454.
  48. ^ Xu G, Bian C, Nie Z, Li J, Wang Y, Xu D a kol. (Leden 2020). „Sekvenování genomu a populace sestavy genomu na úrovni chromozomů sardele čínské (Coilia nasus) poskytuje nový pohled na migrační adaptaci“. GigaScience. 9 (1). doi:10.1093 / gigascience / giz157. PMC  6939831. PMID  31895412.
  49. ^ Louro B, De Moro G, Garcia C, Cox CJ, Veríssimo A, Sabatino SJ a kol. (Květen 2019). „Návrh haplotypu genomu evropské sardinky (Sardina pilchardus)“. GigaScience. 8 (5). doi:10.1093 / gigascience / giz059. PMC  6528745. PMID  31112613.
  50. ^ Amemiya CT, Alföldi J, Lee AP, Fan S, Philippe H, Maccallum I a kol. (Duben 2013). „Genom afrického coelacanthu poskytuje pohled na vývoj tetrapodů“. Příroda. 496 (7445): 311–6. Bibcode:2013Natur.496..311A. doi:10.1038 / příroda12027. PMC  3633110. PMID  23598338.
  51. ^ Vstup do souboru
  52. ^ Jiang W, Qiu Y, Pan X, Zhang Y, Wang X, Lv Y a kol. (2018). „Anabarilius grahami (Regan) a jeho evoluční a genetické aplikace“. Frontiers in Genetics. 9: 614. doi:10.3389 / fgene.2018.00614. PMC  6288284. PMID  30564274.
  53. ^ „Prohlížeč genomu souboru Ensembl 59: Danio rerio - Popis - Hledat Ensembl Zebrafish“. Ensembl.org. Citováno 2010-08-27.
  54. ^ A b van Kruistum H, van den Heuvel J, Travis J, Kraaijeveld K, Zwaan BJ, Groenen MA a kol. (Červenec 2019). „Genom živých ryb Heterandria formosa implikuje roli konzervovaných genů obratlovců ve vývoji placentálních ryb“. BMC Evoluční biologie. 19 (1): 156. doi:10.1186 / s12862-019-1484-2. PMC  6660938. PMID  31349784.
  55. ^ Liu HP, Xiao SJ, Wu N, Wang D, Liu YC, Zhou CW a kol. (Únor 2019). "Sekvence a de novo shromáždění genomu Oxygymnocypris stewartii". Vědecké údaje. 6: 190009. Bibcode:2019NatSD ... 690009L. doi:10.1038 / sdata.2019.9. PMC  6362891. PMID  30720802.
  56. ^ Liu H, Chen C, Gao Z, Min J, Gu Y, Jian J a kol. (Červenec 2017). „Návrh genomu tupého čenichu (Megalobrama amblycephala) odhaluje vývoj intermuskulární kosti a adaptaci na býložravou stravu“. GigaScience. 6 (7): 1–13. doi:10.1093 / gigascience / gix039. PMC  5570040. PMID  28535200.
  57. ^ Guangyi, fanoušek; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; On, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Near J .; Rod, křídlo A .; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, He (2020). „Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102192 - genomická data růžového hořká, Rhodeus ocellatus“. Databáze GigaScience. doi:10.5524/102192. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  58. ^ Guangyi, fanoušek; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; On, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Near J .; Rod, křídlo A .; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, He (2020). "Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102191 - genomická data Pseudobrama simoni". Databáze GigaScience. doi:10.5524/102191. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  59. ^ A b C d Johnson, Lisa K; Sahasrabudhe, Ruta; Gill, James Anthony; Roach, Jennifer L; Froenicke, Lutz; Brown, C Titus; Whitehead, Andrew (01.06.2020). „Navrhujte genomové sestavy pomocí sekvenčních čtení z platforem Oxford Nanopore Technology a Illumina pro čtyři druhy severoamerického fundulus killifish“. GigaScience. 9 (6). doi:10.1093 / gigascience / giaa067. ISSN  2047-217X. PMC  7301629. PMID  32556169.
  60. ^ Shao, Feng; Ludwig, Arne; Mao, Yang; Liu, Ni; Peng, Zuogang (01.08.2020). "Shromáždění genomu na úrovni chromozomu samice západního komára (Gambusia affinis)". GigaScience. 9 (8). doi:10.1093 / gigascience / giaa092. ISSN  2047-217X. PMC  7450667. PMID  32852039.
  61. ^ Schartl M, Walter RB, Shen Y, Garcia T, Catchen J, Amores A a kol. (Květen 2013). „Genom platyfish, Xiphophorus maculatus, poskytuje pohledy na evoluční adaptaci a několik složitých znaků“. Genetika přírody. 45 (5): 567–72. doi:10,1038 / ng.2604. PMC  3677569. PMID  23542700.
  62. ^ Harel I, Benayoun BA, Machado B, Singh PP, Hu CK, Pech MF, Valenzano DR, Zhang E, Sharp SC, Artandi SE, Brunet A (únor 2015). „Platforma pro rychlé zkoumání stárnutí a nemocí u přirozeně krátkodobých obratlovců“. Buňka. 160 (5): 1013–1026. doi:10.1016 / j.cell.2015.01.038. PMC  4344913. PMID  25684364.
  63. ^ Reichwald K, Petzold A, Koch P, Downie BR, Hartmann N, Pietsch S a kol. (Prosinec 2015). „Pohledy na vývoj a stárnutí pohlavních chromozomů z genomu ryby s krátkým životem“. Buňka. 163 (6): 1527–38. doi:10.1016 / j.cell.2015.10.071. PMID  26638077. S2CID  16423362.
  64. ^ Valenzano DR, Benayoun BA, Singh PP, Zhang E, Etter PD, Hu CK, Clément-Ziza M, Willemsen D, Cui R, Harel I, Machado BE, Yee MC, Sharp SC, Bustamante CD, Beyer A, Johnson EA, Brunet A (prosinec 2015). „Africký tyrkysový zabijácký genom poskytuje pohled na evoluci a genetickou architekturu života“. Buňka. 163 (6): 1539–54. doi:10.1016 / j.cell.2015.11.008. PMC  4684691. PMID  26638078.
  65. ^ Rondeau EB, Minkley DR, Leong JS, Messmer AM, Jantzen JR, von Schalburg KR, et al. (2014). „Mapa genomu a vazeb štiky severní (Esox lucius): odhalena konzervovaná synteny mezi sesterskou skupinou lososovitých a Neoteleostei“. PLOS ONE. 9 (7): e102089. Bibcode:2014PLoSO ... 9j2089R. doi:10.1371 / journal.pone.0102089. PMC  4113312. PMID  25069045.
  66. ^ Soubor Před vstupem[trvalý mrtvý odkaz ]
  67. ^ Jones FC, Grabherr MG, Chan YF, Russell P, Mauceli E, Johnson J a kol. (Duben 2012). „Genomický základ adaptivní evoluce u trojhlavých lipňáků“. Příroda. 484 (7392): 55–61. Bibcode:2012Natur.484 ... 55.. doi:10.1038 / nature10944. PMC  3322419. PMID  22481358.
  68. ^ Guangyi, fanoušek; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; On, Zhang (2020), Genomická data mramorového goby, Oxyeleotris marmorata, GigaScience Database, doi:10.5524/102185, vyvoláno 2020-08-19
  69. ^ Gallant JR, Traeger LL, Volkening JD, Moffett H, Chen PH, Novina CD a kol. (Červen 2014). "Nehumánní genetika. Genomický základ pro konvergentní vývoj elektrických orgánů". Věda. 344 (6191): 1522–5. doi:10.1126 / science.1254432. PMC  5541775. PMID  24970089.
  70. ^ "Strakatý gar". Ensembl. Citováno 11. září 2014.
  71. ^ Liu K, Xu D, Li J, Bian C, Duan J, Zhou Y a kol. (Duben 2017). "Celá genomová sekvence čínských ledových ryb, Protosalanx hyalocranius". GigaScience. 6 (4): 1–6. doi:10.1093 / gigascience / giw012. PMC  5530312. PMID  28327943.
  72. ^ Guangyi, fanoušek; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; On, Zhang (2020), Údaje o genomu afrického bonytongue, Heterotis niloticus, GigaScience Database, doi:10.5524/102184, vyvoláno 2020-08-19
  73. ^ Bian, Chao; Hu, Yinchang; Ravi, Vydianathan; Kuzněcovová, Inna S .; Shen, Xueyan; Mu, Xidong; Sun, Ying; Ty, Xinxin; Li, Jia; Li, Xiaofeng; Qiu, Ying (2016-04-19). „Genom asijské arowany (Scleropages formosus) poskytuje nový pohled na vývoj rané linie teleostů“. Vědecké zprávy. 6 (1): 24501. Bibcode:2016NatSR ... 624501B. doi:10.1038 / srep24501. ISSN  2045-2322. PMC  4835728. PMID  27089831.
  74. ^ Guangyi, fanoušek; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; On, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Near J .; Rod, křídlo A .; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, He (2020). „Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102187 - genomická data motýla melounového, Chaetodon trifasciatus“. Databáze GigaScience. doi:10.5524/102187. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  75. ^ Xu J, Bian C, Chen K, Liu G, Jiang Y, Luo Q a kol. (Duben 2017). „Návrh genomu hadí hlavy severní, Channa argus“. GigaScience. 6 (4): 1–5. doi:10.1093 / gigascience / gix011. PMC  5530311. PMID  28327946.
  76. ^ Guangyi, fanoušek; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; On, Zhang (2020), Genomická data motýlů měděných, Chelmon rostratus, GigaScience Database, doi:10.5524/102189, vyvoláno 2020-08-19
  77. ^ A b Chen L, Lu Y, Li W, Ren Y, Yu M, Jiang S a kol. (Duben 2019). „Genomický základ pro kolonizaci mrznoucího Jižního oceánu odhalený antarktickým zubáčem a patagonskými robalo genomy“. GigaScience. 8 (4). doi:10.1093 / gigascience / giz016. PMC  6457430. PMID  30715292.
  78. ^ Wu C, Zhang D, Kan M, Lv Z, Zhu A, Su Y a kol. (Listopad 2014). „Koncept genomu velkého žlutého pekla odhaluje dobře vyvinutou vrozenou imunitu.“. Příroda komunikace. 5: 5227. Bibcode:2014NatCo ... 5,5227 W.. doi:10.1038 / ncomms6227. PMC  4263168. PMID  25407894.
  79. ^ Norrell AE, Jones KL, Saillant EA (2020-04-29). "Development and characterization of genomic resources for a non-model marine teleost, the red snapper (Lutjanus campechanus, Lutjanidae): Construction of a high-density linkage map, anchoring of genome contigs and comparative genomic analysis". PLOS ONE. 15 (4): e0232402. Bibcode:2020PLoSO..1532402N. doi:10.1371/journal.pone.0232402. PMC  7190162. PMID  32348345.
  80. ^ Guangyi, Fan; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; He, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Near J.; Rod, Wing A.; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, He (2020). "GigaDB Dataset - DOI 10.5524/102188 - Genomic data of the bignose unicornfish, Naso vlamingii". Databáze GigaScience. doi:10.5524/102188. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  81. ^ Ahn DH, Shin SC, Kim BM, Kang S, Kim JH, Ahn I, Park J, Park H (August 2017). "Draft genome of the Antarctic dragonfish, Parachaenichthys charcoti". GigaScience. 6 (8): 1–6. doi:10.1093/gigascience/gix060. PMC  5597851. PMID  28873966.
  82. ^ Sarropoulou E, Sundaram AY, Kaitetzidou E, Kotoulas G, Gilfillan GD, Papandroulakis N, et al. (Prosinec 2017). "Full genome survey and dynamics of gene expression in the greater amberjack Seriola dumerili". GigaScience. 6 (12): 1–13. doi:10.1093/gigascience/gix108. PMC  5751066. PMID  29126158.
  83. ^ Xu S, Xiao S, Zhu S, Zeng X, Luo J, Liu J, et al. (Září 2018). "A draft genome assembly of the Chinese sillago (Sillago sinica), the first reference genome for Sillaginidae fishes". GigaScience. 7 (9). doi:10.1093/gigascience/giy108. PMC  6143730. PMID  30202912.
  84. ^ Lu, Liang; Zhao, Jinliang; Li, Chenhong (2020-03-01). "High-Quality Genome Assembly and Annotation of the Big-Eye Mandarin Fish (Siniperca knerii)". G3: Genes, Genomes, Genetics. 10 (3): 877–880. doi:10.1534/g3.119.400930. ISSN  2160-1836. PMC  7056987. PMID  31953307.
  85. ^ Pauletto M, Manousaki T, Ferraresso S, Babbucci M, Tsakogiannis A, Louro B, et al. (2018-08-17). "Sparus aurata reveals the evolutionary dynamics of sex-biased genes in a sequential hermaphrodite fish". Komunikační biologie. 1 (1): 119. doi:10.1038/s42003-018-0122-7. PMC  6123679. PMID  30271999.
  86. ^ Lien S, Koop BF, Sandve SR, Miller JR, Kent MP, Nome T, et al. (Květen 2016). "The Atlantic salmon genome provides insights into rediploidization". Příroda. 533 (7602): 200–5. Bibcode:2016Natur.533..200L. doi:10.1038/nature17164. PMID  27088604. S2CID  4398298.
  87. ^ Berthelot C, Brunet F, Chalopin D, Juanchich A, Bernard M, Noël B, et al. (Duben 2014). "The rainbow trout genome provides novel insights into evolution after whole-genome duplication in vertebrates". Příroda komunikace. 5: 3657. Bibcode:2014NatCo...5.3657B. doi:10.1038/ncomms4657. PMC  4071752. PMID  24755649.
  88. ^ Christensen KA, Leong JS, Sakhrani D, Biagi CA, Minkley DR, Withler RE, et al. (2018-04-05). "Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) genome and transcriptome". PLOS ONE. 13 (4): e0195461. Bibcode:2018PLoSO..1395461C. doi:10.1371/journal.pone.0195461. PMC  5886536. PMID  29621340.
  89. ^ Narum SR, Di Genova A, Micheletti SJ, Maass A (July 2018). "Genomic variation underlying complex life-history traits revealed by genome sequencing in Chinook salmon". Řízení. Biologické vědy. 285 (1883): 20180935. doi:10.1098/rspb.2018.0935. PMC  6083255. PMID  30051839.
  90. ^ He Y, Chang Y, Bao L, Yu M, Li R, Niu J, et al. (Květen 2019). "A chromosome-level genome of black rockfish, Sebastes schlegelii, provides insights into the evolution of live birth" (PDF). Zdroje molekulární ekologie. 0 (5): 1309–1321. doi:10.1111/1755-0998.13034. PMID  31077549. S2CID  149454779.
  91. ^ Liu Z, Liu S, Yao J, Bao L, Zhang J, Li Y, et al. (Červen 2016). "The channel catfish genome sequence provides insights into the evolution of scale formation in teleosts". Příroda komunikace. 7: 11757. Bibcode:2016NatCo...711757L. doi:10.1038/ncomms11757. PMC  4895719. PMID  27249958.
  92. ^ Ozerov, Mikhail Yu; Flajšhans, Martin; Noreikiene, Kristina; Vasemägi, Anti; Gross, Riho (2020-11-01). "Draft Genome Assembly of the Freshwater Apex Predator Wels Catfish (Silurus glanis) Using Linked-Read Sequencing". G3: Genes, Genomes, Genetics. 10 (11): 3897–3906. doi:10.1534/g3.120.401711. ISSN  2160-1836. PMID  32917720. S2CID  221636677.
  93. ^ Guangyi, Fan; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; He, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Near J.; Rod, Wing A.; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, He (2020). "GigaDB Dataset - DOI 10.5524/102186 - Genomic data of the Siamese tigerfish, Datnioides pulcher". Databáze GigaScience. doi:10.5524/102186. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  94. ^ Sun, Shuai; Wang, Yue; Zeng, Wenhong; Du, Xiao; Li, Lei; Hong, Xiaoning; Huang, Xiaoyun; Zhang, He; Zhang, Mengqi; Fan, Guangyi; Liu, Xin (2020-05-18). "The genome of Mekong tiger perch ( Datnioides undecimradiatus ) provides insights into the phylogenetic position of Lobotiformes and biological conservation". Vědecké zprávy. 10 (1): 8164. Bibcode:2020NatSR..10.8164S. doi:10.1038/s41598-020-64398-2. ISSN  2045-2322. PMC  7235238. PMID  32424221. S2CID  218670972.
  95. ^ Guangyi, Fan; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; He, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Near J.; Rod, Wing A.; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, He (2020). "GigaDB Dataset - DOI 10.5524/102183 - Genome data of the long-spine porcupinefish, Diodon holocanthus". Databáze GigaScience. doi:10.5524/102183. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  96. ^ Pan H, Yu H, Ravi V, Li C, Lee AP, Lian MM, et al. (Září 2016). "The genome of the largest bony fish, ocean sunfish (Mola mola), provides insights into its fast growth rate". GigaScience. 5 (1): 36. doi:10.1186/s13742-016-0144-3. PMC  5016917. PMID  27609345.
  97. ^ "Fourth Genome Assembly". Fugu Genome Project. International Fugu Genome Consortium. Archivovány od originál dne 31. 1. 2010.
  98. ^ Aparicio S, Chapman J, Stupka E, Putnam N, Chia JM, Dehal P, et al. (Srpen 2002). "Whole-genome shotgun assembly and analysis of the genome of Fugu rubripes". Věda. 297 (5585): 1301–10. Bibcode:2002Sci...297.1301A. doi:10.1126/science.1072104. PMID  12142439. S2CID  10310355.
  99. ^ Jaillon O, Aury JM, Brunet F, Petit JL, Stange-Thomann N, Mauceli E, et al. (Říjen 2004). "Genome duplication in the teleost fish Tetraodon nigroviridis reveals the early vertebrate proto-karyotype". Příroda. 431 (7011): 946–57. Bibcode:2004Natur.431..946J. doi:10.1038/nature03025. PMID  15496914. S2CID  4414316.
  100. ^ Nowoshilow S, Schloissnig S, Fei JF, Dahl A, Pang AW, Pippel M, et al. (Únor 2018). "The axolotl genome and the evolution of key tissue formation regulators". Příroda. 554 (7690): 50–55. Bibcode:2018Natur.554...50N. doi:10.1038/nature25458. PMID  29364872.
  101. ^ Li J, Yu H, Wang W, Fu C, Zhang W, Han F, Wu H (December 2019). "Genomic and transcriptomic insights into molecular basis of sexually dimorphic nuptial spines in Leptobrachium leishanense". Příroda komunikace. 10 (1): 5551. Bibcode:2019NatCo..10.5551L. doi:10.1038/s41467-019-13531-5. PMC  6895153. PMID  31804492.
  102. ^ Li, Qiye; Guo, Qunfei; Zhou, Yang; Tan, Huishuang; Bertozzi, Terry; Zhu, Yuanzhen; Li, Ji; Donnellan, Stephen; Zhang, Guojie. "A draft genome assembly of the eastern banjo frog Limnodynastes dumerilii dumerilii (Anura: Limnodynastidae)". gigabytejournal.com. Citováno 2020-11-17.
  103. ^ Sun YB, Xiong ZJ, Xiang XY, Liu SP, Zhou WW, Tu XL, et al. (Březen 2015). "Whole-genome sequence of the Tibetan frog Nanorana parkeri and the comparative evolution of tetrapod genomes". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 112 (11): E1257-62. Bibcode:2015PNAS..112E1257S. doi:10.1073/pnas.1501764112. PMC  4371989. PMID  25733869.
  104. ^ Rogers RL, Zhou L, Chu C, Márquez R, Corl A, Linderoth T, et al. (December 2018). "Genomic Takeover by Transposable Elements in the Strawberry Poison Frog". Molekulární biologie a evoluce. 35 (12): 2913–2927. doi:10.1093/molbev/msy185. PMC  6278860. PMID  30517748.
  105. ^ Denton, Robert D.; Kudra, Randal S.; Malcom, Jacob W.; Preez, Louis Du; Malone, John H. (2018-11-20). "The African Bullfrog (Pyxicephalus adspersus) genome unites the two ancestral ingredients for making vertebrate sex chromosomes". bioRxiv: 329847. doi:10.1101/329847. S2CID  90800869.
  106. ^ Hammond SA, Warren RL, Vandervalk BP, Kucuk E, Khan H, Gibb EA, Pandoh P, Kirk H, Zhao Y, Jones M, Mungall AJ, Coope R, Pleasance S, Moore RA, Holt RA, Round JM, Ohora S, Walle BV, Veldhoen N, Helbing CC, Birol I (November 2017). "The North American bullfrog draft genome provides insight into hormonal regulation of long noncoding RNA". Příroda komunikace. 8 (1): 1433. Bibcode:2017NatCo...8.1433H. doi:10.1038/s41467-017-01316-7. PMC  5681567. PMID  29127278.
  107. ^ Edwards RJ, Tuipulotu DE, Amos TG, O'Meally D, Richardson MF, Russell TL, et al. (Srpen 2018). "Draft genome assembly of the invasive cane toad, Rhinella marina". GigaScience. 7 (9). doi:10.1093/gigascience/giy095. PMC  6145236. PMID  30101298.
  108. ^ Li Y, Ren Y, Zhang D, Jiang H, Wang Z, Li X, Rao D (September 2019). "Chromosome-level assembly of the mustache toad genome using third-generation DNA sequencing and Hi-C analysis". GigaScience. 8 (9). doi:10.1093/gigascience/giz114. PMC  6755253. PMID  31544214.
  109. ^ Hellsten U, Harland RM, Gilchrist MJ, Hendrix D, Jurka J, Kapitonov V, et al. (Duben 2010). "The genome of the Western clawed frog Xenopus tropicalis". Věda. 328 (5978): 633–6. Bibcode:2010Sci...328..633H. doi:10.1126/science.1183670. PMC  2994648. PMID  20431018.
  110. ^ A b C St John JA, Braun EL, Isberg SR, Miles LG, Chong AY, Gongora J, et al. (Leden 2012). "Sequencing three crocodilian genomes to illuminate the evolution of archosaurs and amniotes". Genome Biology. 13 (1): 415. doi:10.1186/gb-2012-13-1-415. PMC  3334581. PMID  22293439.
  111. ^ Wan QH, Pan SK, Hu L, Zhu Y, Xu PW, Xia JQ, et al. (Září 2013). "Genome analysis and signature discovery for diving and sensory properties of the endangered Chinese alligator". Cell Research. 23 (9): 1091–105. doi:10.1038/cr.2013.104. PMC  3760627. PMID  23917531.
  112. ^ Wan QH, Pan SK, Hu L, Zhu Y, Xu PW, Xia JQ, et al. (March 28, 2014). "Genomic data of the Chinese alligator (Alligator sinensis)". GigaScience Database. doi:10.5524/100077. | kapitola = ignorováno (Pomoc)
  113. ^ Gemmell, Neil J .; Rutherford, Kim; Prost, Stefan; Tollis, Marc; Winter, David; Macey, J. Robert; Adelson, David L.; Suh, Alexander; Bertozzi, Terry; Grau, José H.; Organ, Chris (2020-08-20). "The tuatara genome reveals ancient features of amniote evolution". Příroda. 584 (7821): 403–409. doi:10.1038/s41586-020-2561-9. ISSN  1476-4687. PMC  7116210. PMID  32760000.
  114. ^ Alföldi J, Di Palma F, Grabherr M, Williams C, Kong L, Mauceli E, et al. (Srpen 2011). "The genome of the green anole lizard and a comparative analysis with birds and mammals". Příroda. 477 (7366): 587–91. Bibcode:2011Natur.477..587A. doi:10.1038/nature10390. PMC  3184186. PMID  21881562.
  115. ^ Song B, Cheng S, Sun Y, Zhong X, Jin J, Guan R, Murphy RW, Che J, Zhang Y, Liu X (2015). "A genome draft of the legless anguid lizard, Ophisaurus gracilis". GigaScience. 4: 17. doi:10.1186/s13742-015-0056-7. PMC  4391233. PMID  25859342.
  116. ^ A b C d Kishida T, Go Y, Tatsumoto S, Tatsumi K, Kuraku S, Toda M (2019). "Loss of olfaction in sea snakes provides new perspectives on the aquatic adaptation of amniotes". Sborník Královské společnosti B: Biologické vědy. 286 (1910): 20191828. doi:10.1098/rspb.2019.1828. PMC  6742997. PMID  31506057.
  117. ^ Xiong Z, Li F, Li Q, Zhou L, Gamble T, Zheng J, et al. (Říjen 2016). "Draft genome of the leopard gecko, Eublepharis macularius". GigaScience. 5 (1): 47. doi:10.1186/s13742-016-0151-4. PMC  5080775. PMID  27784328.
  118. ^ Vonk FJ, Casewell NR, Henkel CV, Heimberg AM, Jansen HJ, McCleary RJ, et al. (Prosinec 2013). "The king cobra genome reveals dynamic gene evolution and adaptation in the snake venom system". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (51): 20651–6. Bibcode:2013PNAS..11020651V. doi:10.1073/pnas.1314702110. PMC  3870661. PMID  24297900.
  119. ^ Ullate-Agote A, Milinkovitch MC, Tzika AC (2015-07-02). "The genome sequence of the corn snake (Pantherophis guttatus), a valuable resource for EvoDevo studies in squamates". International Journal of Developmental Biology. 58 (10–12): 881–8. doi:10.1387/ijdb.150060at. PMID  26154328.
  120. ^ Georges A, Li Q, Lian J, O'Meally D, Deakin J, Wang Z, et al. (2015-12-01). "High-coverage sequencing and annotated assembly of the genome of the Australian dragon lizard Pogona vitticeps". GigaScience. 4 (1): 45. doi:10.1186/s13742-015-0085-2. PMC  4585809. PMID  26421146.
  121. ^ Castoe TA, de Koning AP, Hall KT, Card DC, Schield DR, Fujita MK, et al. (Prosinec 2013). "The Burmese python genome reveals the molecular basis for extreme adaptation in snakes". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (51): 20645–50. Bibcode:2013PNAS..11020645C. doi:10.1073/pnas.1314475110. PMC  3870669. PMID  24297902.
  122. ^ Roscito JG, Sameith K, Pippel M, Francoijs KJ, Winkler S, Dahl A, et al. (December 2018). "The genome of the tegu lizard Salvator merianae: combining Illumina, PacBio, and optical mapping data to generate a highly contiguous assembly". GigaScience. 7 (12). doi:10.1093/gigascience/giy141. PMC  6304105. PMID  30481296.
  123. ^ Gao J, Li Q, Wang Z, Zhou Y, Martelli P, Li F, et al. (Červenec 2017). "Sequencing, de novo assembling, and annotating the genome of the endangered Chinese crocodile lizard Shinisaurus crocodilurus". GigaScience. 6 (7): 1–6. doi:10.1093/gigascience/gix041. PMC  5569961. PMID  28595343.
  124. ^ A b Wang Z, Pascual-Anaya J, Zadissa A, Li W, Niimura Y, Huang Z, et al. (Červen 2013). "The draft genomes of soft-shell turtle and green sea turtle yield insights into the development and evolution of the turtle-specific body plan". Genetika přírody. 45 (6): 701–706. doi:10.1038/ng.2615. PMC  4000948. PMID  23624526.
  125. ^ Shaffer HB, Minx P, Warren DE, Shedlock AM, Thomson RC, Valenzuela N, et al. (Březen 2013). "The western painted turtle genome, a model for the evolution of extreme physiological adaptations in a slowly evolving lineage". Genome Biology. 14 (3): R28. doi:10.1186/gb-2013-14-3-r28. PMC  4054807. PMID  23537068.
  126. ^ Cao D, Wang M, Ge Y, Gong S (May 2019). "Draft genome of the big-headed turtle Platysternon megacephalum". Vědecké údaje. 6 (1): 60. Bibcode:2019NatSD...6...60C. doi:10.1038/s41597-019-0067-9. PMC  6522511. PMID  31097710.
  127. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó p q r s t u proti w X y z aa ab ac inzerát ae af ag ah ai aj ak al dopoledne an ao ap vod Jarvis ED, Mirarab S, Aberer AJ, Li B, Houde P, Li C, et al. (Prosinec 2014). „Analýzy celého genomu řeší rané větve ve stromu života moderních ptáků“. Věda. 346 (6215): 1320–31. Bibcode:2014Sci ... 346.1320J. doi:10.1126 / science.1253451. PMC  4405904. PMID  25504713.
  128. ^ "Golden Eagle Genome Sequenced".
  129. ^ Huang Y, Li Y, Burt DW, Chen H, Zhang Y, Qian W, et al. (Červenec 2013). "The duck genome and transcriptome provide insight into an avian influenza virus reservoir species". Genetika přírody. 45 (7): 776–783. doi:10.1038/ng.2657. PMC  4003391. PMID  23749191.
  130. ^ Le Duc, Diana; Renaud, Gabriel; Krishnan, Arunkumar; Almén, Markus Sällman; Huynen, Leon; Prohaska, Sonja J.; Ongyerth, Matthias; Bitarello, Bárbara D.; Schiöth, Helgi B.; Hofreiter, Michael; Stadler, Peter F. (2015-07-23). "Kiwi genome provides insights into evolution of a nocturnal lifestyle". Genome Biology. 16 (1): 147. doi:10.1186/s13059-015-0711-4. ISSN  1465-6906. PMC  4511969. PMID  26201466.
  131. ^ A b C d Galla SJ, Forsdick NJ, Brown L, Hoeppner MP, Knapp M, Maloney RF, et al. (December 2018). "Reference Genomes from Distantly Related Species Can Be Used for Discovery of Single Nucleotide Polymorphisms to Inform Conservation Management". Geny. 10 (1): 9. doi:10.3390/genes10010009. PMC  6356778. PMID  30583569.
  132. ^ Li S, Li B, Cheng C, Xiong Z, Liu Q, Lai J, et al. (2014-12-11). "Genomic signatures of near-extinction and rebirth of the crested ibis and other endangered bird species". Genome Biology. 15 (12): 557. doi:10.1186/s13059-014-0557-1. PMC  4290368. PMID  25496777.
  133. ^ A b Zhan X, Pan S, Wang J, Dixon A, He J, Muller MG, et al. (Květen 2013). "Peregrine and saker falcon genome sequences provide insights into evolution of a predatory lifestyle". Genetika přírody. 45 (5): 563–6. doi:10.1038/ng.2588. PMID  23525076. S2CID  10858993.
  134. ^ Zhou, Chuang; Tu, Hongmei; Yu, Haoran; Zheng, Shuai; Dai, Bo; Price, Megan; Wu, Yongjie; Yang, Nan; Yue, Bisong; Meng, Yang (September 5, 2019). "The Draft Genome of the Endangered Sichuan Partridge (Arborophila rufipectus) with Evolutionary Implications". Geny. 10 (9): 677. doi:10.3390/genes10090677. ISSN  2073-4425. PMC  6770966. PMID  31491910.
  135. ^ International Chicken Genome Sequencing Consortium. (Prosinec 2004). "Sequence and comparative analysis of the chicken genome provide unique perspectives on vertebrate evolution". Příroda. 432 (7018): 695–716. Bibcode:2004Natur.432..695C. doi:10.1038/nature03154. PMID  15592404. S2CID  4405203.
  136. ^ Dalloul RA, Long JA, Zimin AV, Aslam L, Beal K, Blomberg L, et al. (Září 2010). "Multi-platform next-generation sequencing of the domestic turkey (Meleagris gallopavo): genome assembly and analysis". PLOS Biology. 8 (9): e10000475. doi:10.1371/journal.pbio.1000475. PMC  2935454. PMID  20838655.
  137. ^ Vignal, Alain; Boitard, Simon; Thébault, Noémie; Dayo, Guiguigbaza-Kossigan; Yapi-Gnaore, Valentine; Youssao Abdou Karim, Issaka; Berthouly-Salazar, Cécile; Pálinkás-Bodzsár, Nóra; Guémené, Daniel; Thibaud-Nissen, Francoise; Warren, Wesley C. (July 2019). "A guinea fowl genome assembly provides new evidence on evolution following domestication and selection in galliformes". Zdroje molekulární ekologie. 19 (4): 997–1014. doi:10.1111/1755-0998.13017. ISSN  1755-0998. PMC  6579635. PMID  30945415.
  138. ^ Jaiswal SK, Gupta A, Saxena R (5 May 2018). "Genome Sequence of Indian Peacock Reveals the Peculiar Case of a Glittering Bird". bioRxiv. doi:10.1101/315457. S2CID  196632443.
  139. ^ Liu, Yang; Liu, Simin; Zhang, Nan; Chen, De; Que, Pinjia; Liu, Naijia; Höglund, Jacob; Zhang, Zhengwang; Wang, Biao (2019-12-01). "Genome Assembly of the Common Pheasant Phasianus colchicus: A Model for Speciation and Ecological Genomics". Biologie genomu a evoluce. 11 (12): 3326–3331. doi:10.1093/gbe/evz249. PMC  7145668. PMID  31713630.
  140. ^ Lee CY, Hsieh PH, Chiang LM, Chattopadhyay A, Li KY, Lee YF, et al. (Květen 2018). "Whole-genome de novo sequencing reveals unique genes that contributed to the adaptive evolution of the Mikado pheasant". GigaScience. 7 (5). doi:10.1093/gigascience/giy044. PMC  5941149. PMID  29722814.
  141. ^ Wang B, Ekblom R, Bunikis I, Siitari H, Höglund J (March 2014). "Whole genome sequencing of the black grouse (Tetrao tetrix): reference guided assembly suggests faster-Z and MHC evolution". BMC Genomics. 15: 180. doi:10.1186/1471-2164-15-180. PMC  4022176. PMID  24602261.
  142. ^ Sutton JT, Helmkampf M, Steiner CC, Bellinger MR, Korlach J, Hall R, et al. (Srpen 2018). "A High-Quality, Long-Read De Novo Genome Assembly to Aid Conservation of Hawaii's Last Remaining Crow Species". Geny. 9 (8): 393. doi:10.3390/genes9080393. PMC  6115840. PMID  30071683.
  143. ^ Gan HM, Falk S, Morales HE, Austin CM, Sunnucks P, Pavlova A (September 2019). "Genomic evidence of neo-sex chromosomes in the eastern yellow robin". GigaScience. 8 (9). doi:10.1093/gigascience/giz111. PMC  6736294. PMID  31494668.
  144. ^ A b Ellegren H, Smeds L, Burri R, Olason PI, Backström N, Kawakami T, et al. (Listopad 2012). "The genomic landscape of species divergence in Ficedula flycatchers". Příroda. 491 (7426): 756–60. Bibcode:2012Natur.491..756E. doi:10.1038/nature11584. PMID  23103876. S2CID  4414084.
  145. ^ Formenti G, Chiara M, Poveda L, Francoijs KJ, Bonisoli-Alquati A, Canova L, et al. (Leden 2019). „Dlouhá čtení SMRT a optické mapy Direct Label a Stain umožňují generování vysoce kvalitního genomového souboru pro vlaštovku evropskou (Hirundo rustica rustica)“. GigaScience. 8 (1). doi:10.1093 / gigascience / giy142. PMC  6324554. PMID  30496513.
  146. ^ Colquitt BM, Mets DG, Brainard MS (březen 2018). „Návrh sestavy genomu bengálského pěnkavy, Lonchura striata domestica, model variability motorických dovedností a učení“. GigaScience. 7 (3): 1–6. doi:10.1093 / gigascience / giy008. PMC  5861438. PMID  29618046.
  147. ^ Alexander S, Bent P, Brett BW, Eleftheria P, Ellie AE, Gregg TW a kol. (2019). "Genomický". Datová sada GigaDB - Údaje o genomu ptáka ráje, Lycocorax pyrrhopterus. gigadb.org. Databáze GigaScience. doi:10.5524/102158. Citováno 2019-06-14.
  148. ^ A b C d Prost S, Armstrong EE, Nylander J, Thomas GW, Suh A, Petersen B a kol. (Květen 2019). „Srovnávací analýzy identifikují genomické rysy potenciálně zapojené do vývoje rajských ptáků“. GigaScience. 8 (5). doi:10.1093 / gigascience / giz003. PMC  6497032. PMID  30689847.
  149. ^ de Villemereuil, Pierre; Rutschmann, Alexis; Lee, Kate D .; Ewen, John G .; Brekke, Patricia; Santure, Anna W. (03.03.2019). „Malý adaptivní potenciál u ohroženého pěvce“. Aktuální biologie. 29 (5): 889–894.e3. doi:10.1016 / j.cub.2019.01.072. ISSN  0960-9822. PMID  30799244. S2CID  72334429.
  150. ^ Alexander S, Bent P, Brett BW, Eleftheria P, Ellie AE, Gregg TW a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - Údaje o genomu rajského ptáka, Paradisaea rubra. Databáze GigaScience. doi:10.5524/102160.
  151. ^ Alexander S, Bent P, Brett BW, Eleftheria P, Ellie AE, Gregg TW a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - Údaje o genomu ptáka ráje, Pteridophora alberti. Databáze GigaScience. doi:10.5524/102161.
  152. ^ Alexander S, Bent P, Brett BW, Eleftheria P, Ellie AE, Gregg TW a kol. (2019). „Genomický“. Údaje o genomu ptáka ráje, Ptiloris paradiseus. Databáze GigaScience. doi:10.5524/102159.
  153. ^ Warren WC, Clayton DF, Ellegren H, Arnold AP, Hillier LW, Künstner A a kol. (Duben 2010). „Genom zpěvného ptáka“. Příroda. 464 (7289): 757–62. Bibcode:2010Natur.464..757W. doi:10.1038 / nature08819. PMC  3187626. PMID  20360741.
  154. ^ A b Kolchanova S, Kliver S, Komissarov A, Dobrinin P, Tamazian G, Grigorev K a kol. (Leden 2019). „Genomy tří úzce souvisejících karibských Amazonek poskytují pohled na historii a ochranu druhů“. Geny. 10 (1): 54. doi:10,3390 / geny10010054. PMC  6356210. PMID  30654561.
  155. ^ Oleksyk TK, Pombert JF, Siu D, Mazo-Vargas A, Ramos B, Guiblet W a kol. (Září 2012). „Projekt sekvenování genomu portorického papouška (Amazona vittata) financovaného z místních zdrojů zvyšuje ptačí data a podporuje vzdělávání mladých výzkumných pracovníků“. GigaScience. 1 (1): 14. doi:10.1186 / 2047-217X-1-14. PMC  3626513. PMID  23587420.
  156. ^ Seabury CM, Dowd SE, Seabury PM, Raudsepp T, Brightsmith DJ, Liboriussen P a kol. (8. 5. 2013). „Multiplatformní sestava de novo genomu a komparativní analýza pro Scarlet Macaw (Ara macao)“. PLOS ONE. 8 (5): e62415. Bibcode:2013PLoSO ... 862415S. doi:10.1371 / journal.pone.0062415. PMC  3648530. PMID  23667475.
  157. ^ Galla SJ, Moraga R, Brown L, Cleland S, Hoeppner MP, Maloney RF, Richardson A, Slater L, Santure AW, Steeves TE (2020). „Srovnání rodokmenu, genetických a genomických odhadů příbuznosti pro informování o rozhodnutích o párování u dvou kriticky ohrožených ptáků: důsledky pro celosvětové programy šlechtění. Evoluční aplikace. 13 (5): 991–1008. doi:10.1111 / eva.12916. PMC  7232769. PMID  32431748.
  158. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó p q r s Pan H, Cole TL, Bi X, Fang M, Zhou C, Yang Z a kol. (Září 2019). „Genomy s vysokým pokrytím k objasnění vývoje tučňáků“. GigaScience. 8 (9). doi:10.1093 / gigascience / giz117. PMC  6904868. PMID  31531675.
  159. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102182 - genomická data od tučňáka královského (Aptenodytes patagonicus). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102182.
  160. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102170 - genomická data od tučňáka západního (Eudyptes chrysocome). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102170.
  161. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102165 - genomická data od tučňáka makaronského (Eudyptes chrysolophus chrysolophus). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102165.
  162. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102164 - genomická data z tučňáka královského (Eudyptes chrysolophus schlegeli). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102164.
  163. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102169 - genomická data od tučňáka východního (Eudyptes filholi). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102169.
  164. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102171 - Genomická data od tučňáka skalního (Eudyptes moseleyi). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102171.
  165. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102166 - genomická data od tučňáka chocholatého (Eudyptes pachyrhynchus). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102166.
  166. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102167 - Genomická data od tučňáka chocholatého (Eudyptes robustus). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102167.
  167. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102168 - genomická data od tučňáka vzpřímeného (Eudyptes sclateri). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102168.
  168. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102177 - Genomická data z tučňáka běločelého (Eudyptula minor albosignata). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102177.
  169. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102178 - genomická data od tučňáka malého (Eudyptula minor minor). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102178.
  170. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102179 - genomická data od tučňáka víla (Eudyptula novaehollandiae). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102179.
  171. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102172 - genomická data od tučňáka žlutookého (Megadyptes antipodes antipodes). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102172.
  172. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102181 - genomická data od tučňáka bradavičnatého (Pygoscelis antarctica). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102181.
  173. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102180 - genomická data od tučňáka Gentoo (Pygoscelis papua). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102180.
  174. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102176 - genomická data od tučňáka Humboldtova (Spheniscus humboldti). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102176.
  175. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102173 - genomická data od tučňáka magellanského (Spheniscus magellanicus). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102173.
  176. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT a kol. (2019). „Genomický“. Datová sada GigaDB - DOI 10.5524 / 102175 - Genomická data od tučňáka galapágského (Spheniscus mendiculus). Databáze GigaScience. doi:10.5524/102175.
  177. ^ A b Hanna ZR, Henderson JB, Wall JD, Emerling CA, Fuchs J, Runckel C a kol. (Říjen 2017). „Sova severní (Strix occidentalis caurina) Genom: Divergence se sovou liškou (Strix varia) a charakteristika genů spojených se světlem“. Biologie genomu a evoluce. 9 (10): 2522–2545. doi:10.1093 / gbe / evx158. PMC  5629816. PMID  28992302.
  178. ^ A b C d Burga A, Wang W, Ben-David E, Wolf PC, Ramey AM, Verdugo C, Lyons K, Parker PG, Kruglyak L (červen 2017). „Genetický podpis vývoje ztráty letu v kormoránu Galapágy“. Věda. 356 (6341): eaal3345. doi:10.1126 / science.aal3345. PMC  5567675. PMID  28572335.
  179. ^ Warren WC, Hillier LW, Marshall Graves JA, Birney E, Ponting CP, Grützner F a kol. (Květen 2008). „Analýza genomu ptakopysků odhaluje jedinečné podpisy evoluce“. Příroda. 453 (7192): 175–83. Bibcode:2008 Natur.453..175 W.. doi:10.1038 / nature06936. PMC  2803040. PMID  18464734.
  180. ^ Mikkelsen TS, Wakefield MJ, Aken B, Amemiya CT, Chang JL, Duke S a kol. (Květen 2007). „Genom vačnatce Monodelphis domestica odhaluje inovace v nekódujících sekvencích“. Příroda. 447 (7141): 167–77. Bibcode:2007 Natur.447..167M. doi:10.1038 / nature05805. PMID  17495919. S2CID  4337232.
  181. ^ Brandies, Parice A .; Tang, Simon; Johnson, Robert S. P .; Hogg, Carolyn J .; Belov, Katherine (2020). „První referenční genom Antechinus poskytuje zdroj pro zkoumání genetického základu semelparity a neuropatologií souvisejících s věkem“. Gigabyte. 2020: 1–22. doi:10,46471 / gigabajt.7. Citováno 2020-11-17.
  182. ^ Vstup do souboru
  183. ^ Feigin CY, Newton AH, Doronina L, Schmitz J, Hipsley CA, Mitchell KJ a kol. (Leden 2018). „Genom tasmánského tygra poskytuje náhled na vývoj a demografii vyhynulého masožravce vačnatec“. Ekologie a evoluce přírody. 2 (1): 182–192. doi:10.1038 / s41559-017-0417-r. PMID  29230027. S2CID  4630578.
  184. ^ Renfree MB, Papenfuss AT, Deakin JE, Lindsay J, Heider T, Belov K a kol. (Srpen 2011). „Sekvence genomu australského klokana, Macropus eugenii, poskytuje vhled do vývoje reprodukce a vývoje savců“. Genome Biology. 12 (8): R81. doi:10.1186 / gb-2011-12-8-r81. PMC  3277949. PMID  21854559.
  185. ^ Davey, M. (10. dubna 2013). „Australané prolomili kód genetického plánu koaly“. Věk. Citováno 25. června 2013.
  186. ^ A b „Projekt genomu savců“. MIT. Archivovány od originál dne 06.01.2009. Citováno 2012-05-23.
  187. ^ Grigorev K, Kliver S, Dobrynin P, Komissarov A, Wolfsberger W, Krasheninnikova K a kol. (Červen 2018). „Inovativní montážní strategie přispívá k pochopení evoluce a zachování genetiky ohroženého paradoxu Solenodon z ostrova Hispaniola.“. GigaScience. 7 (6). doi:10.1093 / gigascience / giy025. PMC  6009670. PMID  29718205.
  188. ^ A b C d Parker J, Tsagkogeorga G, Cotton JA, Liu Y, Provero P, Stupka E, Rossiter SJ (říjen 2013). „Podpisy konvergenční evoluce u echolokačních savců v celém genomu“. Příroda. 502 (7470): 228–31. Bibcode:2013Natur.502..228P. doi:10.1038 / příroda12511. PMC  3836225. PMID  24005325.
  189. ^ A b Lindblad-Toh K, Garber M, Zuk O, Lin MF, Parker BJ, Washietl S, et al. (Říjen 2011). „Mapa lidského evolučního omezení s vysokým rozlišením využívající 29 savců“. Příroda. 478 (7370): 476–82. Bibcode:2011Natur.478..476.. doi:10.1038 / příroda10530. PMC  3207357. PMID  21993624.
  190. ^ Vstup do souboru
  191. ^ A b C d E Gutiérrez-Guerrero, Yocelyn T .; Ibarra-Laclette, Enrique; Martínez del Río, Carlos; Barrera-Redondo, Josué; Rebollar, Eria A .; Ortega, Jorge; León-Paniagua, Livia; Urrutia, Araxi; Aguirre-Planter, Erika; Eguiarte, Luis E. (01.06.2020). "Genomické důsledky dietní diverzifikace a paralelního vývoje v důsledku nektarivory u listonosých netopýrů". GigaScience. 9 (6). doi:10.1093 / gigascience / giaa059. PMC  7276932. PMID  32510151.
  192. ^ Vstup do souboru
  193. ^ Gibbs RA, Rogers J, Katze MG, Bumgarner R, Weinstock GM, Mardis ER, et al. (Duben 2007). „Evoluční a biomedicínské poznatky z genomu makaka rhesus“. Věda. 316 (5822): 222–34. Bibcode:2007Sci ... 316..222.. doi:10.1126 / science.1139247. PMID  17431167. S2CID  10535839.
  194. ^ A b Yan G, Zhang G, Fang X, Zhang Y, Li C, Ling F a kol. (Říjen 2011). „Sekvenování genomu a srovnání dvou zvířecích modelů jiných než lidských primátů, makaků cynomolgus a rhesus čínských“. Přírodní biotechnologie. 29 (11): 1019–23. doi:10.1038 / nbt.1992. PMID  22002653. S2CID  9218360.
  195. ^ Wang L, Wu J, Liu X, Di D, Liang Y, Feng Y a kol. (Srpen 2019). „Vysoce kvalitní genomové seskupení pro ohroženou opici nosorožce zlatého (Rhinopithecus roxellana)“. GigaScience. 8 (8). doi:10.1093 / gigascience / giz098. PMC  6705546. PMID  31437279.
  196. ^ Locke DP, Hillier LW, Warren WC, Worley KC, Nazareth LV, Muzny DM a kol. (Leden 2011). „Srovnávací a demografická analýza genomů orangutanů“. Příroda. 469 (7331): 529–33. Bibcode:2011Natur.469..529L. doi:10.1038 / nature06887. PMC  3060778. PMID  21270892.
  197. ^ Scally A, Dutheil JY, Hillier LW, Jordan GE, Goodhead I, Herrero J a kol. (Březen 2012). „Pohledy na vývoj hominidů ze sekvence genomu gorily“. Příroda. 483 (7388): 169–75. Bibcode:2012Natur.483..169S. doi:10.1038 / příroda 10842. PMC  3303130. PMID  22398555.
  198. ^ McPherson JD, Marra M, Hillier L, Waterston RH, Chinwalla A, Wallis J a kol. (Únor 2001). "Fyzická mapa lidského genomu". Příroda. 409 (6822): 934–41. Bibcode:2001 Natur.409..934M. doi:10.1038/35057157. PMID  11237014. S2CID  186244510.
  199. ^ Venter JC, Adams MD, Myers EW, Li PW, Mural RJ, Sutton GG a kol. (Únor 2001). "Sekvence lidského genomu". Věda. 291 (5507): 1304–51. Bibcode:2001Sci ... 291.1304V. doi:10.1126 / science.1058040. PMID  11181995. S2CID  85981305.
  200. ^ „Psst, lidský genom nebyl nikdy úplně sekvenován“. STAT. 2017-06-20. Citováno 2017-10-23.
  201. ^ Green RE, Krause J, Briggs AW, Maricic T, Stenzel U, Kircher M a kol. (Květen 2010). „Návrh sekvence neandertálského genomu“. Věda. 328 (5979): 710–722. Bibcode:2010Sci ... 328..710G. doi:10.1126 / science.1188021. PMC  5100745. PMID  20448178.
  202. ^ Konsorcium pro sekvenování a analýzu šimpanzů. (Září 2005). "Počáteční sekvence šimpanzího genomu a srovnání s lidským genomem". Příroda. 437 (7055): 69–87. Bibcode:2005 Natur.437 ... 69.. doi:10.1038 / nature04072. PMID  16136131. S2CID  2638825.
  203. ^ Prüfer K, Munch K, Hellmann I, Akagi K, Miller JR, Walenz B a kol. (Červen 2012). „Bonobo genom ve srovnání s šimpanzem a lidskými genomy“. Příroda. 486 (7404): 527–31. Bibcode:2012Natur.486..527P. doi:10.1038 / příroda11128. PMC  3498939. PMID  22722832.
  204. ^ Vstup do souboru
  205. ^ Worley KC, Warren WC, Rogers J, Locke D, Muzny DM, Mardis ER a kol. (Konsorcium pro sekvenování a analýzu genomu kosmanů) (srpen 2014). „Společný genom kosmanů poskytuje vhled do biologie a evoluce primátů“. Genetika přírody. 46 (8): 850–7. doi:10.1038 / ng.3042. PMC  4138798. PMID  25038751.
  206. ^ Dobrynin P, Liu S, Tamazian G, Xiong Z, Yurchenko AA, Krasheninnikova K a kol. (Prosinec 2015). „Genomické dědictví afrického geparda, Acinonyx jubatus“. Genome Biology. 16 (1): 277. doi:10.1186 / s13059-015-0837-4. PMC  4676127. PMID  26653294.
  207. ^ Pontius JU, Mullikin JC, Smith DR, Lindblad-Toh K, Gnerre S, Clamp M a kol. (Listopad 2007). "Počáteční sekvence a srovnávací analýza genomu kočky". Výzkum genomu. 17 (11): 1675–89. doi:10,1101 / gr. 6380007. PMC  2045150. PMID  17975172.
  208. ^ A b C d Cho YS, Hu L, Hou H, Lee H, Xu J, Kwon S a kol. (2013). „Tygří genom a srovnávací analýza s genomy lva a leoparda sněžného“. Příroda komunikace. 4: 2433. Bibcode:2013NatCo ... 4.2433C. doi:10.1038 / ncomms3433. PMC  3778509. PMID  24045858.
  209. ^ A b Kim S, Cho YS, Kim HM, Chung O, Kim H, Jho S a kol. (Říjen 2016). „Srovnání genomů savců masožravců, všežravců a býložravců s novým leopardím shromážděním“. Genome Biology. 17 (1): 211. doi:10.1186 / s13059-016-1071-4. PMC  5090899. PMID  27802837.
  210. ^ Lindblad-Toh K, Wade CM, Mikkelsen TS, Karlsson EK, Jaffe DB, Kamal M a kol. (Prosinec 2005). "Sekvence genomu, komparativní analýza a haplotypová struktura domácího psa". Příroda. 438 (7069): 803–19. Bibcode:2005 Natur.438..803L. doi:10.1038 / příroda04338. PMID  16341006. S2CID  4338513.
  211. ^ Gopalakrishnan S, Samaniego Castruita JA, Sinding MS, Kuderna LF, Räikkönen J, Petersen B a kol. (Červen 2017). „Sekvence referenčního genomu vlka (Canis lupus lupus) a její důsledky pro genomiku populace Canis spp.“. BMC Genomics. 18 (1): 495. doi:10.1186 / s12864-017-3883-3. PMC  5492679. PMID  28662691.
  212. ^ Armstrong EE, Taylor RW, Prost S, Blinston P, van der Meer E, Madzikanda H a kol. (Únor 2019). „Nákladově efektivní shromáždění genomu afrického divokého psa (Lycaon pictus) pomocí propojených čtení“. GigaScience. 8 (2). doi:10.1093 / gigascience / giy124. PMC  6350039. PMID  30346553.
  213. ^ Li R, Fan W, Tian G, Zhu H, He L, Cai J a kol. (Leden 2010). „Sekvence a de novo shromáždění genomu pandy obrovské“. Příroda. 463 (7279): 311–7. Bibcode:2010Natur.463..311L. doi:10.1038 / nature08696. PMC  3951497. PMID  20010809.
  214. ^ Taylor GA, Kirk H, Coombe L, Jackman SD, Chu J, Tse K a kol. (Listopad 2018). „Genom severoamerického medvěda hnědého nebo Grizzly: Ursus arctos ssp. Horribilis“. Geny. 9 (12): 598. doi:10,3390 / geny9120598. PMC  6315469. PMID  30513700.
  215. ^ Srivastava A, Kumar Sarsani V, Fiddes I, Sheehan SM, Seger RL, Barter ME a kol. (Únor 2019). „Shromáždění genomu a genová exprese u amerického černého medvěda poskytuje nový pohled na renální reakci na režim hibernace. Výzkum DNA. 26 (1): 37–44. doi:10.1093 / dnares / dsy036. PMC  6379037. PMID  30395234.
  216. ^ Liu S, Lorenzen ED, Fumagalli M, Li B, Harris K, Xiong Z a kol. (Květen 2014). „Populační genomika odhaluje nedávnou speciaci a rychlou evoluční adaptaci u ledních medvědů“. Buňka. 157 (4): 785–94. doi:10.1016 / j.cell.2014.03.054. PMC  4089990. PMID  24813606.
  217. ^ Li B, Zhang G, Willersleve E, Wang J, Wang J (2011). „Genomická data od ledního medvěda (Ursus maritimus)". GigaScience. doi:10.5524/100008. Citováno 2019-06-21. | kapitola = ignorováno (Pomoc)
  218. ^ A b C Foote AD, Liu Y, Thomas GW, Vinař T, Alföldi J, Deng J a kol. (Březen 2015). „Konvergentní vývoj genomů mořských savců“. Genetika přírody. 47 (3): 272–5. doi:10,1038 / ng.3198. PMC  4644735. PMID  25621460.
  219. ^ Jones SJ, Haulena M, Taylor GA, Chan S, Bilobram S, Warren RL a kol. (Prosinec 2017). „Genom vydry severní (Enhydra lutris kenyoni)“. Geny. 8 (12): 379. doi:10,3390 / geny8120379. PMC  5748697. PMID  29232880.
  220. ^ Colella JP, Lan T, Schuster SC, Talbot SL, Cook JA, Lindqvist C (2018-05-31). „Mustela erminea zjistila, že pulzní hybridizace ovlivňuje vývoj ve vysokých nadmořských výškách“. Komunikační biologie. 1 (1): 51. doi:10.1038 / s42003-018-0058-r. PMC  6123727. PMID  30271934.
  221. ^ Peng X, Alföldi J, Gori K, Eisfeld AJ, Tyler SR, Tisoncik-Go J a kol. (Prosinec 2014). „Návrh sekvence genomu fretky (Mustela putorius furo) usnadňuje studium onemocnění dýchacích cest člověka“. Přírodní biotechnologie. 32 (12): 1250–5. doi:10,1038 / nbt.3079. PMC  4262547. PMID  25402615.
  222. ^ Beichman AC, Koepfli KP, Li G, Murphy W, Dobrynin P, Kilver S a kol. (Červen 2019). „Vodní adaptace a vyčerpaná rozmanitost: hluboký ponor do genomů vydry mořské a vydry obrovské“. Molekulární biologie a evoluce. 36 (12): 2631–2655. doi:10.1093 / molbev / msz101. PMID  31212313.
  223. ^ Dastjerdi A, Robert C, Watson M (2014). „Nízké pokrytí sekvence dvou genomů slonů asijských (Elephas maximus)“. GigaScience. 3: 12. doi:10.1186 / 2047-217X-3-12. PMC  4106201. PMID  25053995.
  224. ^ Položka prohlížeče UCSC
  225. ^ Wade CM, Giulotto E, Sigurdsson S, Zoli M, Gnerre S, Imsland F a kol. (Listopad 2009). "Sekvence genomu, srovnávací analýza a populační genetika domácího koně". Věda. 326 (5954): 865–7. Bibcode:2009Sci ... 326..865W. doi:10.1126 / science.1178158. PMC  3785132. PMID  19892987.
  226. ^ Kalbfleisch TS, Rice ES, DePriest MS, Walenz BP, Hestand MS, Vermeesch JR a kol. (2018-11-16). „Vylepšený referenční genom pro domácího koně zvyšuje souvislost a složení montáže“. Komunikační biologie. 1 (1): 197. doi:10.1038 / s42003-018-0199-z. PMC  6240028. PMID  30456315.
  227. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó p q r s t u proti w X y z aa ab ac inzerát ae af ag ah ai aj ak al Chen L, Qiu Q, Jiang Y, Wang K, Lin Z, Li Z a kol. (Červen 2019). „Rozsáhlé sekvenování genomu přežvýkavců poskytuje náhled na jejich vývoj a odlišné vlastnosti“. Věda. 364 (6446): eaav6202. Bibcode:2019Sci ... 364.6202C. doi:10.1126 / science.aav6202. PMID  31221828. S2CID  195191415.
  228. ^ Keane, Michael; Semeiks, Jeremy; Webb, Andrew E .; Li, Yang I .; Quesada, Víctor; Craig, Thomas; Madsen, Lone Bruhn; van Dam, Sipko; Brawand, David; Marques, Patrícia I .; Michalak, Pawel (2015). „Pohledy na vývoj dlouhověkosti z genomu velryby Bowhead“. Zprávy buněk. 10 (1): 112–122. doi:10.1016 / j.celrep.2014.12.008. PMC  4536333. PMID  25565328.
  229. ^ A b C d E Árnason, Úlfur; Lammers, Fritjof; Kumar, Vikas; Nilsson, Maria A .; Janke, Axel (2018). „Sekvenování modré velryby a dalších rorquálů v celém genomu najde podpisy pro introgresivní tok genů“. Vědecké zálohy. 4 (4): eaap9873. Bibcode:2018SciA .... 4.9873A. doi:10.1126 / sciadv.aap9873. ISSN  2375-2548. PMC  5884691. PMID  29632892.
  230. ^ A b C Yim HS, Cho YS, Guang X, Kang SG, Jeong JY, Cha SS a kol. (Leden 2014). „Genom velrybí a adaptace na vodní prostředí u kytovců“. Genetika přírody. 46 (1): 88–92. doi:10,1038 / ng.2835. PMC  4079537. PMID  24270359.
  231. ^ Wang K, Wang L, Lenstra JA, Jian J, Yang Y, Hu Q a kol. (Duben 2017). „Sekvence genomu wisenta (Bison bonasus)“. GigaScience. 6 (4): 1–5. doi:10.1093 / gigascience / gix016. PMC  5530314. PMID  28327911.
  232. ^ Dong J, Hu Z, Wu C, Guo H, Zhou B, Lv J a kol. (Červenec 2012). „Analýzy asociací identifikují několik nových lokusů náchylnosti k rakovině plic a jejich interakce s kouřením v čínské populaci“. Genetika přírody. 44 (8): 895–9. doi:10,1038 / ng.2351. PMC  6628171. PMID  22797725.
  233. ^ Canavez FC, Luche DD, Stothard P, Leite KR, Sousa-Canavez JM, Plastow G a kol. (2012). "Sekvence genomu a shromáždění Bos indicus". The Journal of Heredity. 103 (3): 342–8. doi:10.1093 / jhered / esr153. PMID  22315242.
  234. ^ Elsik CG, Tellam RL, Worley KC, Gibbs RA, Muzny DM, Weinstock GM a kol. (Duben 2009). „Sekvence genomu skotu taurinu: okno do biologie a evoluce přežvýkavců“. Věda. 324 (5926): 522–8. Bibcode:2009Sci ... 324..522A. doi:10.1126 / science.1169588. PMC  2943200. PMID  19390049.
  235. ^ Williams JL, Iamartino D, Pruitt KD, Sonstegard T, Smith TP, Low WY a kol. (Říjen 2017). „Sestavení genomu a zdroj transkriptomu pro buvola říčního, Bubalus bubalis (2n = 50)“. GigaScience. 6 (10): 1–6. doi:10.1093 / gigascience / gix088. PMC  5737279. PMID  29048578.
  236. ^ Koepfli KP, Tamazian G, Wildt D, Dobrynin P, Kim C, Frandsen PB a kol. (Červen 2019). „in situ populace“. G3. 9 (6): 1785–1793. doi:10,1534 / g3,119,400084. PMC  6553546. PMID  31000506.
  237. ^ Farré M, Li Q, Zhou Y, Damas J, Chemnick LG, Kim J a kol. (Únor 2019). „Shromáždění genomu gemsboku (Oryx gazella) v téměř chromozomovém měřítku: ikonická antilopa pouště Kalahari“. GigaScience. 8 (2). doi:10.1093 / gigascience / giy162. PMC  6351727. PMID  30649288.
  238. ^ Yang Y, Wang Y, Zhao Y, Zhang X, Li R, Chen L a kol. (Prosinec 2017). „Návrh genomu ovcí Marco Polo (Ovis ammon polii)“. GigaScience. 6 (12): 1–7. doi:10.1093 / gigascience / gix106. PMC  5740985. PMID  29112761.
  239. ^ Zhang C, Chen L, Zhou Y, Wang K, Chemnick LG, Ryder OA a kol. (Únor 2018). „Návrh genomu milu (Elaphurus davidianus)“. GigaScience. 7 (2). doi:10.1093 / gigascience / gix130. PMC  5824821. PMID  29267854.
  240. ^ Li Z, Lin Z, Ba H, Chen L, Yang Y, Wang K a kol. (Prosinec 2017). „Návrh genomu sobů (Rangifer tarandus)“. GigaScience. 6 (12): 1–5. doi:10.1093 / gigascience / gix102. PMC  5726476. PMID  29099922.
  241. ^ Ming Y, Jian J, Yu X, Wang J, Liu W (květen 2019). „Zdroje genomu pro ochranu delfína keporkaků indicko-tichomořského, Sousa chinensis“. Vědecké údaje. 6 (1): 68. Bibcode:2019 NatSD ... 6 ... 68 mil. doi:10.1038 / s41597-019-0078-6. PMC  6531461. PMID  31118413.
  242. ^ Farré M, Li Q, Darolti I, Zhou Y, Damas J, Proskuryakova AA a kol. (Srpen 2019). „Integrované shromáždění genomu chromozomové žirafy (Giraffa camelopardalis tippelskirchi) v měřítku“. GigaScience. 8 (8). doi:10.1093 / gigascience / giz090. PMC  6669057. PMID  31367745.
  243. ^ Ip S (12. prosince 2017). "Genóm velryby Beluga poprvé sekvenován ve Vancouveru". Vancouver Sun.
  244. ^ Fan Z, Li W, Jin J, Cui K, Yan C, Peng C a kol. (Duben 2018). „Sekvence návrhu genomu lesních pižmových jelenů (Moschus berezovskii)“. GigaScience. 7 (4). doi:10.1093 / gigascience / giy038. PMC  5906906. PMID  29635287.
  245. ^ Fan G, Zhang Y, Liu X, Wang J, Sun Z, Sun S a kol. (Červenec 2019). „První genom na úrovni chromozomu pro mořského savce jako prostředek ke studiu ekologie a evoluce“. Zdroje molekulární ekologie. 19 (4): 944–956. doi:10.1111/1755-0998.13003. PMID  30735609. S2CID  73451140.
  246. ^ Groenen MA, Archibald AL, Uenishi H, Tuggle CK, Takeuchi Y, Rothschild MF a kol. (Listopad 2012). „Analýzy genomů prasat poskytují pohled na demografii a vývoj prasat“. Příroda. 491 (7424): 393–8. Bibcode:2012Natur.491..393G. doi:10.1038 / příroda11622. PMC  3566564. PMID  23151582.
  247. ^ Herrera-Alvarez S, Karlsson E, Ryder OA, Lindblad-Toh K, Crawford AJ (2018-09-23). „Jak vyrobit obří hlodavce: Genomický základ a kompromisy gigantismu v kapybaru, největším hlodavci na světě“. bioRxiv  10.1101/424606. doi:10.1101/424606. S2CID  92321538. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  248. ^ Long AD, Baldwin-Brown J, Tao Y, Cook VJ, Balderrama-Gutierrez G, Crobett-Detig R, Mortazavi R, Barbour AG (červenec 2019). "Genom Peromyscus leucopus, přirozený hostitel pro boreliózu a další vznikající infekce ". Vědecké zálohy. 5 (7): eaaw6441. Bibcode:2019SciA .... 5,6441L. doi:10.1126 / sciadv.aaw6441. PMC  6656541. PMID  31355335.
  249. ^ Hardin A, Nevonen KA, Eckalbar WL, Carbone L, Ahituv N (srpen 2019). "Srovnávací genomová charakterizace multimamatické myši Mastomys coucha". Molekulární biologie a evoluce. 36 (12): 2805–2812. doi:10.1093 / molbev / msz188. PMC  6878952. PMID  31424545.
  250. ^ Waterston RH, Lindblad-Toh K, Birney E, Rogers J, Abril JF, Agarwal P a kol. (Prosinec 2002). "Počáteční sekvenování a komparativní analýza myšího genomu". Příroda. 420 (6915): 520–62. Bibcode:2002 Natur.420..520W. doi:10.1038 / nature01262. PMID  12466850.
  251. ^ Gibbs RA, Weinstock GM, Metzker ML, Muzny DM, Sodergren EJ, Scherer S a kol. (Duben 2004). "Sekvence genomu krysy hnědého Norska poskytuje pohled na vývoj savců". Příroda. 428 (6982): 493–521. Bibcode:2004 Natur.428..493G. doi:10.1038 / nature02426. PMID  15057822. S2CID  4415600.
  252. ^ Vstup do souboru
  253. ^ A b Harrison MC, Jongepier E, Robertson HM, Arning N, Bitard-Feildel T, Chao H a kol. (Březen 2018). "Hemimetabolous genomy odhalují molekulární základ termitů eusociality". Ekologie a evoluce přírody. 2 (3): 557–566. doi:10.1038 / s41559-017-0459-1. PMC  6482461. PMID  29403074.
  254. ^ Li S, Zhu S, Jia Q, Yuan D, Ren C, Li K a kol. (Březen 2018). „Genomická a funkční krajina vývojové plasticity u amerického švába“. Příroda komunikace. 9 (1): 1008. Bibcode:2018NatCo ... 9.1008L. doi:10.1038 / s41467-018-03281-1. PMC  5861062. PMID  29559629.
  255. ^ Terrapon N, Li C, Robertson HM, Ji L, Meng X, Booth W a kol. (Květen 2014). "Molekulární stopy alternativní sociální organizace v genomu termitů". Příroda komunikace. 5: 3636. Bibcode:2014NatCo ... 5.3636T. doi:10.1038 / ncomms4636. PMID  24845553.
  256. ^ Poulsen M, Hu H, Li C, Chen Z, Xu L, Otani S a kol. (Říjen 2014). „Doplňkové příspěvky symbiontu k rozkladu rostlin u termitů chovaných na houby“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 111 (40): 14500–5. Bibcode:2014PNAS..11114500P. doi:10.1073 / pnas.1319718111. PMC  4209977. PMID  25246537.
  257. ^ Keeling CI, Yuen MM, Liao NY, Docking TR, Chan SK, Taylor GA a kol. (Březen 2013). „Návrh genomu borovice horské, Dendroctonus ponderosae Hopkins, hlavní lesní škůdce“. Genome Biology. 14 (3): R27. doi:10.1186 / gb-2013-14-3-r27. PMC  4053930. PMID  23537049.
  258. ^ A b Fallon TR, Lower SE, Chang CH, Bessho-Uehara M, Martin GJ, Bewick AJ a kol. (Říjen 2018). Waterhouse R, Tautz D (eds.). "Světlušky genomy osvětlují paralelní počátky bioluminiscence u brouků". eLife. 7: e36495. doi:10,7554 / eLife.36495. PMC  6191289. PMID  30324905.
  259. ^ Wang K, Li P, Gao Y, Liu C, Wang Q, Yin J a kol. (Duben 2019). „Sestavení genomu de novo bílého skvrnitého postranního květu (Protaetia brevitarsis)“. GigaScience. 8 (4). doi:10.1093 / gigascience / giz019. PMC  6449472. PMID  30949689.
  260. ^ Richards S, Gibbs RA, Weinstock GM, Brown SJ, Denell R, Beeman RW a kol. (Duben 2008). „Genom brouka a škůdce Tribolium castaneum“ (PDF). Příroda. 452 (7190): 949–55. Bibcode:2008Natur.452..949R. doi:10.1038 / nature06784. PMID  18362917. S2CID  4402128.
  261. ^ Meng F, Liu Z, Han H, Finkelbergs D, Jiang Y, Zhu M a kol. (Březen 2020). „Shromáždění genomu na úrovni chromozomu Aldrichina grahami, forenzně důležitá muška“. GigaScience. 9 (3). doi:10.1093 / gigascience / giaa020. PMC  7081965. PMID  32191812.
  262. ^ Drukewitz SH, Bokelmann L, Undheim EA, von Reumont BM (červenec 2019). "Toxiny od nuly? Různorodý, multimodální genový původ v dravé lupičské mušce Dasypogon diadema naznačuje dynamický vývoj jedu u hmyzu dvojkřídlého". GigaScience. 8 (7). doi:10.1093 / gigascience / giz081. PMC  6615979. PMID  31289835.
  263. ^ Kim S, Oh M, Jung W, Park J, Choi HG, Shin SC (březen 2017). „Sekvenování genomu okřídleného hřebene, Parochlus steinenii, z Antarktického poloostrova“. GigaScience. 6 (3): 1–8. doi:10.1093 / gigascience / giw009. PMC  5467013. PMID  28327954.
  264. ^ Dikow RB, Frandsen PB, Turcatel M, Dikow T (2017-01-31). „Proctacanthus coquilletti (Insecta: Diptera: Asilidae) a 16 reprezentativních transkriptomů“. PeerJ. 5: e2951. doi:10,7717 / peerj.2951. PMC  5289110. PMID  28168115.
  265. ^ Nene V, Wortman JR, Lawson D, Haas B, Kodira C, Tu ZJ a kol. (Červen 2007). „Sekvence genomu Aedes aegypti, hlavního vektoru arboviru“. Věda. 316 (5832): 1718–23. Bibcode:2007Sci ... 316.1718N. doi:10.1126 / science.1138878. PMC  2868357. PMID  17510324.
  266. ^ Chen XG, Jiang X, Gu J, Xu M, Wu Y, Deng Y a kol. (Listopad 2015). „Sekvence genomu komára asijského tygra, Aedes albopictus, odhaluje poznatky o jeho biologii, genetice a evoluci“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 112 (44): E5907-15. Bibcode:2015PNAS..112E5907C. doi:10.1073 / pnas.1516410112. PMC  4640774. PMID  26483478.
  267. ^ Holt RA, Subramanian GM, Halpern A, Sutton GG, Charlab R, Nusskern DR, et al. (Říjen 2002). „Sekvence genomu malarického komára Anopheles gambiae“. Věda. 298 (5591): 129–49. Bibcode:2002Sci ... 298..129H. doi:10.1126 / science.1076181. PMID  12364791. S2CID  4512225.H
  268. ^ A b Lawniczak MK, Emrich SJ, Holloway AK, Regier AP, Olson M, White B a kol. (Říjen 2010). „Rozšířená divergence mezi počínajícími druhy Anopheles gambiae odhalená sekvencemi celého genomu“. Věda. 330 (6003): 512–4. Bibcode:2010Sci ... 330..512L. doi:10.1126 / science.1195755. PMC  3674514. PMID  20966253.
  269. ^ Zhou D, Zhang D, Ding G, Shi L, Hou Q, Ye Y a kol. (Leden 2014). „Sekvence genomu Anopheles sinensis poskytuje vhled do genetického základu kompetence komárů pro parazity malárie“. BMC Genomics. 15 (1): 42. doi:10.1186/1471-2164-15-42. PMC  3901762. PMID  24438588.
  270. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó Neafsey DE, Waterhouse RM, Abai MR, Aganezov SS, Alekseyev MA, Allen JE a kol. (Leden 2015). „Genomika komárů. Vysoce vyvíjející se vektory malárie: genomy 16 komárů Anopheles“. Věda. 347 (6217): 1258522. doi:10.1126 / science.1258522. PMC  4380271. PMID  25554792.
  271. ^ Ghurye J, Koren S, Small ST, Redmond S, Howell P, Phillippy AM, Besansky NJ (červen 2019). „Shromáždění hlavního vektoru africké malárie Anopheles funestus v měřítku chromozomu“. GigaScience. 8 (6). doi:10.1093 / gigascience / giz063. PMC  6545970. PMID  31157884.
  272. ^ Arensburger P, Megy K, Waterhouse RM, Abrudan J, Amedeo P, Antelo B a kol. (Říjen 2010). „Sekvenování Culex quinquefasciatus vytváří platformu pro komparativní genomiku komárů“. Věda. 330 (6000): 86–8. Bibcode:2010Sci ... 330 ... 86A. doi:10.1126 / science.1191864. PMC  3740384. PMID  20929810.
  273. ^ Zhou Q, Zhu HM, Huang QF, Zhao L, Zhang GJ, Roy SW a kol. (Březen 2012). „Dešifrování neo-pohlaví a evoluce chromozomů B konceptem genomu Drosophila albomicans“. BMC Genomics. 13: 109. doi:10.1186/1471-2164-13-109. PMC  3353239. PMID  22439699.
  274. ^ A b C d E F G h i j Clark AG, Eisen MB, Smith DR, Bergman CM, Oliver B, Markow TA a kol. (Listopad 2007). "Vývoj genů a genomů na fylogenezi Drosophila". Příroda. 450 (7167): 203–18. Bibcode:2007 Natur.450..203C. doi:10.1038 / nature06341. PMID  17994087. S2CID  2416812.
  275. ^ A b C d E F G h „Drosophila modENCODE Project BCM-HGSC“. Baylor College of Medicine, centrum pro sekvenování lidského genomu.
  276. ^ Adams MD, Celniker SE, Holt RA, Evans CA, Gocayne JD, Amanatides PG a kol. (Březen 2000). "Sekvence genomu Drosophila melanogaster". Věda. 287 (5461): 2185–95. Bibcode:2000Sci ... 287.2185.. doi:10.1126 / science.287.5461.2185. PMID  10731132.
  277. ^ Hamilton PT, Leong JS, Koop BF, Perlman SJ (březen 2014). „Transkripční reakce u obranné symbiózy Drosophila“. Molekulární ekologie. 23 (6): 1558–70. doi:10.1111 / mec.12603. PMID  24274471. S2CID  2964885.
  278. ^ Richards S, Liu Y, Bettencourt BR, Hradecký P, Letovský S, Nielsen R a kol. (Leden 2005). "Srovnávací genomové sekvenování Drosophila pseudoobscura: vývoj chromozomů, genů a cis-prvků". Výzkum genomu. 15 (1): 1–18. doi:10,1101 / gr. 3059305. PMC  540289. PMID  15632085.
  279. ^ „Genom Drosophila santomea - vydání 1.0“. Andolfatto Lab. Univerzita Princeton.
  280. ^ A b Jiménez-Guri E, Huerta-Cepas J, Cozzuto L, Wotton KR, Kang H, Himmelbauer H a kol. (Únor 2013). „Srovnávací transkriptomika raného vývoje dipteranů“. BMC Genomics. 14: 123. doi:10.1186/1471-2164-14-123. PMC  3616871. PMID  23432914.
  281. ^ Martinson EO, Peyton J, Kelkar YD, Jennings EC, Benoit JB, Werren JH, Denlinger DL (květen 2019). "Sarcophaga bullata". G3. 9 (5): 1313–1320. doi:10,1534 / g3,119,400148. PMC  6505164. PMID  30926723.
  282. ^ Lemke S, Antonopoulos DA, Meyer F, Domanus MH, Schmidt-Ott U (květen 2011). "Signální komponenty BMP v embryonálních transkriptomech vznášející se mouchy Episyrphus balteatus (Syrphidae)". BMC Genomics. 12: 278. doi:10.1186/1471-2164-12-278. PMC  3224130. PMID  21627820.
  283. ^ International Aphid Genomics Consortium (únor 2010). "Sekvence genomu mšice hrachu Acyrthosiphon pisum". PLOS Biology. 8 (2): e1000313. doi:10.1371 / journal.pbio.1000313. PMC  2826372. PMID  20186266.
  284. ^ Yang P, Yu S, Hao J, Liu W, Zhao Z, Zhu Z a kol. (Září 2019). „Sekvence genomu čínského hmyzu z bílého vosku Ericerus pela: první návrh genomu pro rodinu šupinatého hmyzu Coccidae“. GigaScience. 8 (9). doi:10.1093 / gigascience / giz113. PMC  6743827. PMID  31518402.
  285. ^ Zhu J, Jiang F, Wang X, Yang P, Bao Y, Zhao W a kol. (Prosinec 2017). „Sekvence genomu malého hnědého saranče, Laodelphax striatellus“. GigaScience. 6 (12): 1–12. doi:10.1093 / gigascience / gix109. PMC  5740986. PMID  29136191.
  286. ^ Kingan SB, Urban J, Lambert CC, Baybayan P, Childers AK, Coates B a kol. (Říjen 2019). „Vysoce kvalitní genomové seskupení z jediného lucerny skvrnité (Lycorma delicatula) shromážděné v terénu pomocí systému PacBio Sequel II“. GigaScience. 8 (10). doi:10.1093 / gigascience / giz122. PMC  6791401. PMID  31609423.
  287. ^ Mesquita RD, Vionette-Amaral RJ, Lowenberger C, Rivera-Pomar R, Monteiro FA, Minx P a kol. (Prosinec 2015). „Genom Rhodnius prolixus, hmyzí vektor Chagasovy choroby, odhaluje jedinečné úpravy hematofagie a parazitární infekce“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 112 (48): 14936–41. Bibcode:2015PNAS..11214936M. doi:10.1073 / pnas.1506226112. PMC  4672799. PMID  26627243.
  288. ^ Chen W, Shakir S, Bigham M, Richter A, Fei Z, Jander G (duben 2019). "Sekvence genomu mšice kukuřičného listu (Rhopalosiphum maidis Fitch)". GigaScience. 8 (4). doi:10.1093 / gigascience / giz033. PMC  6451198. PMID  30953568.
  289. ^ Chen J, Fan J, Zhang Y, Li Q, Zhang S, Yin H a kol. (01.08.2019). „Tahový genom na úrovni chromozomů obilí mšice Sitobion miscanthi“. GigaScience. 8 (8). doi:10.1093 / gigascience / giz101. PMC  6701489. PMID  31430367.
  290. ^ Liu Q, Guo Y, Zhang Y, Hu W, Li Y, Zhu D a kol. (Srpen 2019). „Sestava genomu na chromozomální úrovni pro vektor hmyzu pro Chagasovu chorobu, Triatoma rubrofasciata“. GigaScience. 8 (8). doi:10.1093 / gigascience / giz089. PMC  6699579. PMID  31425588.
  291. ^ Nygaard S, Zhang G, Schiøtt M, Li C, Wurm Y, Hu H a kol. (Srpen 2011). „Genom mravence Acromyrmex echinatior naznačuje klíčové adaptace na vyspělý společenský život a pěstování hub“. Výzkum genomu. 21 (8): 1339–48. doi:10.1101 / gr.121392.111. PMC  3149500. PMID  21719571.
  292. ^ Konsorcium pro sekvenování genomu včel včel (říjen 2006). „Pohledy na sociální hmyz z genomu včely Apis mellifera“. Příroda. 443 (7114): 931–49. Bibcode:2006Natur.443..931T. doi:10.1038 / nature05260. PMC  2048586. PMID  17073008.
  293. ^ Suen G, Teiling C, Li L, Holt C, Abouheif E, Bornberg-Bauer E a kol. (Únor 2011). Copenhaver G (ed.). „Sekvence genomu mravence Atta cephalotes odhaluje poznatky o jeho povinném symbiotickém životním stylu“. Genetika PLOS. 7 (2): e1002007. doi:10.1371 / journal.pgen.1002007. PMC  3037820. PMID  21347285.
  294. ^ A b Bonasio R, Zhang G, Ye C, Mutti NS, Fang X, Qin N a kol. (Srpen 2010). „Genomické srovnání mravenců Camponotus floridanus a Harpegnathos saltator“. Věda. 329 (5995): 1068–71. Bibcode:2010Sci ... 329.1068B. doi:10.1126 / science.1192428. PMC  3772619. PMID  20798317.
  295. ^ Oxley PR, Ji L, Fetter-Pruneda I, McKenzie SK, Li C, Hu H, Zhang G, Kronauer DJ (únor 2014). „Genom mravenčího lupiče Cerapachys biroi“. Aktuální biologie. 24 (4): 451–8. doi:10.1016 / j.cub.2014.01.018. PMC  3961065. PMID  24508170.
  296. ^ Konorov EA, Nikitin MA, Mikhailov KV, Lysenkov SN, Belenky M, Chang PL, Nuzhdin SV, Scobeyeva VA (únor 2017). „Genomická exaptace umožňuje adaptaci Lasius niger na městské prostředí“. BMC Evoluční biologie. 17 (Suppl 1): 39. doi:10.1186 / s12862-016-0867-x. PMC  5333191. PMID  28251870.
  297. ^ Smith CD, Zimin A, Holt C, Abouheif E, Benton R, Cash E a kol. (Duben 2011). „Návrh genomu globálně rozšířeného a invazivního argentinského mravence (Linepithema humile)“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 108 (14): 5673–8. Bibcode:2011PNAS..108,5673S. doi:10.1073 / pnas.1008617108. PMC  3078359. PMID  21282631.
  298. ^ A b C Werren JH, Richards S, Desjardins CA, Niehuis O, Gadau J, Colbourne JK a kol. (Leden 2010). „Funkční a evoluční poznatky z genomů tří parazitoidů druhu Nasonia“. Věda. 327 (5963): 343–8. Bibcode:2010Sci ... 327..343.. doi:10.1126 / science.1178028. PMC  2849982. PMID  20075255.
  299. ^ Kapheim KM, Pan H, Li C, Blatti C, Harpur BA, Ioannidis P a kol. (Březen 2019). „Nomia melanderi)“. G3. 9 (3): 625–634. doi:10,1534 / g3.118.200865. PMC  6404593. PMID  30642875.
  300. ^ Smith CR, Smith CD, Robertson HM, Helmkampf M, Zimin A, Yandell M a kol. (Duben 2011). "Návrh genomu mravence červeného kombajnu Pogonomyrmex barbatus". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 108 (14): 5667–72. Bibcode:2011PNAS..108,5667S. doi:10.1073 / pnas.1007901108. PMC  3078412. PMID  21282651.
  301. ^ Wurm Y, Wang J, Riba-Grognuz O, Corona M, Nygaard S, Hunt BG a kol. (Duben 2011). „Genom požárního mravence Solenopsis invicta“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 108 (14): 5679–84. Bibcode:2011PNAS..108,5679W. doi:10.1073 / pnas.1009690108. PMC  3078418. PMID  21282665.
  302. ^ Kim SR, Kwak W, Kim H, Caetano-Anolles K, Kim KY, Kim SB a kol. (Leden 2018). „Sekvence genomu hedvábné můry japonského dubu, Antheraea yamamai: první genom tahu v rodině Saturniidae“. GigaScience. 7 (1): 1–11. doi:10.1093 / gigascience / gix113. PMC  5774507. PMID  29186418.
  303. ^ Yen, Eugenie C; McCarthy, Shane A; Galarza, Juan A; Generalovič, Tomáš N; Pelan, Sarah; Nguyen, Petr; Meier, Joana I; Warren, Ian A; Mappes, Johanna; Durbin, Richard; Jiggins, Chris D (01.08.2020). „Sestava genomu de novo vyřešená haplotypem pro můru dřeva (Arctia plantaginis) skrze třídění“. GigaScience. 9 (8). doi:10.1093 / gigascience / giaa088. ISSN  2047-217X. PMC  7433188. PMID  32808665.
  304. ^ Nowell RW, Elsworth B, Oostra V, Zwaan BJ, Wheat CW, Saastamoinen M a kol. (Červenec 2017). „Vysoký rozsah genomu mycalesinového motýla Bicyclus anynana“. GigaScience. 6 (7): 1–7. doi:10.1093 / gigascience / gix035. PMC  5493746. PMID  28486658.
  305. ^ Mita K, Kasahara M, Sasaki S, Nagayasu Y, Yamada T, Kanamori H, Namiki N, Kitagawa M, Yamashita H, Yasukochi Y, Kadono-Okuda K, Yamamoto K, Ajimura M, Ravikumar G, Shimomura M, Nagamura Y, Shin-I T, Abe H, Shimada T, Morishita S, Sasaki T (únor 2004). „Sekvence genomu bource morušového, Bombyx mori“. Výzkum DNA. 11 (1): 27–35. doi:10.1093 / dnares / 11.1.27. PMID  15141943.
  306. ^ Wan F, Yin C, Tang R, Chen M, Wu Q, Huang C a kol. (Září 2019). „Shromáždění genomu Cydia pomonella na úrovni chromozomů poskytuje poznatky o chemické ekologii a rezistenci vůči insekticidům.“. Příroda komunikace. 10 (1): 4237. Bibcode:2019NatCo..10,4237W. doi:10.1038 / s41467-019-12175-9. PMC  6748993. PMID  31530873.
  307. ^ Zhan S, Merlin C, Boore JL, Reppert SM (listopad 2011). „Genom monarchového motýla přináší poznatky o migraci na velké vzdálenosti“. Buňka. 147 (5): 1171–85. doi:10.1016 / j.cell.2011.09.052. PMC  3225893. PMID  22118469.
  308. ^ Dasmahapatra KK (červenec 2012). „Motýlí genom odhaluje promiskuitní výměnu adaptací mimikry mezi druhy“. Příroda. 487 (7405): 94–8. Bibcode:2012Natur.487 ... 94T. doi:10.1038 / příroda11041. PMC  3398145. PMID  22722851.
  309. ^ Ahola V, Lehtonen R, Somervuo P, Salmela L, Koskinen P, Rastas P a kol. (Září 2014). „Fritilární genom Glanville si zachovává starodávný karyotyp a odhaluje selektivní chromozomální fúze v Lepidoptera“. Příroda komunikace. 5 (1): 4737. Bibcode:2014NatCo ... 5.4737A. doi:10.1038 / ncomms5737. PMC  4164777. PMID  25189940.
  310. ^ Cong Q, Li W, Borek D, Otwinowski Z, Grishin NV (únor 2019). „Genom Bear Giant-Skipper naznačuje genetické adaptace na život uvnitř kořenů juky“. Molekulární genetika a genomika. 294 (1): 211–226. doi:10.1007 / s00438-018-1494-6. PMC  6436644. PMID  30293092.
  311. ^ Lu S, Yang J, Dai X, Xie F, He J, Dong Z a kol. (Listopad 2019). „Referenční genom na úrovni chromosomů motýla čínského (Papilio bianor) na základě sekvenování DNA třetí generace a Hi-C analýzy“. GigaScience. 8 (11). doi:10.1093 / gigascience / giz128. PMC  6827417. PMID  31682256.
  312. ^ Shen J, Cong Q, Kinch LN, Borek D, Otwinowski Z, Grishin NV (03.11.2016). „Pieris rapae, odolný mimozemšťan, škůdce zelí a zdroj protinádorových proteinů“. F1000Výzkum. 5: 2631. doi:10.12688 / F1000Research.9765.1. PMC  5247789. PMID  28163896.
  313. ^ Vy M, Yue Z, He W, Yang X, Yang G, Xie M a kol. (Únor 2013). „Heterozygotní genom můry poskytuje pohled na herbivorii a detoxikaci“. Genetika přírody. 45 (2): 220–5. doi:10,1038 / ng. 2524. PMID  23313953. S2CID  645600.
  314. ^ Gouin A, Bretaudeau A, Nam K, Gimenez S, Aury JM, Duvic B a kol. (Září 2017). „Dva genomy vysoce polyfágních škůdců lepidopteranů (Spodoptera frugiperda, Noctuidae) s různými rozsahy hostitelských rostlin“. Vědecké zprávy. 7 (1): 11816. Bibcode:2017NatSR ... 711816G. doi:10.1038 / s41598-017-10461-4. PMC  5613006. PMID  28947760.
  315. ^ Kakumani PK, Malhotra P, Mukherjee SK, Bhatnagar RK (srpen 2014). „Návrh genomu armádního červa, Spodoptera frugiperda“. Genomika. 104 (2): 134–43. doi:10.1016 / j.ygeno.2014.06.005. PMID  24984256.
  316. ^ Sivasankaran K, Mathew P, Anand S, Ceasar SA, Mariapackiam S, Ignacimuthu S (2017). "Kompletní sekvence mitochondriálního genomu můry pronikající do ovoce Eudocima phalonia (Linnaeus, 1763) Lepidoptera: Noctuoidea)". Genomická data. 14: 66–81. doi:10.1016 / j.gdata.2017.09.004. PMC  5633087. PMID  29021958.
  317. ^ Wang X, Fang X, Yang P, Jiang X, Jiang F, Zhao D a kol. (14. ledna 2014). „Akátový genom poskytuje vhled do formování roje a letu na dlouhé vzdálenosti“. Příroda komunikace. 5 (1): 2957. Bibcode:2014NatCo ... 5.2957W. doi:10.1038 / ncomms3957. PMC  3896762. PMID  24423660.
  318. ^ Verlinden H, Sterck L, Li J, Li Z, Yssel A, Gansemans Y a kol. (27. července 2020). „První sestava genomu pouště kobylky, Schistocerca gregaria“. F1000Výzkum. 9: 775. doi:10.12688 / F1000Research.25148.1. PMC  7607483. PMID  33163158.
  319. ^ Kirkness EF, Haas BJ, Sun W, Braig HR, Perotti MA, Clark JM a kol. (Červenec 2010). "Genome sequences of the human body louse and its primary endosymbiont provide insights into the permanent parasitic lifestyle". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 107 (27): 12168–73. Bibcode:2010PNAS..10712168K. doi:10.1073/pnas.1003379107. PMC  2901460. PMID  20566863.
  320. ^ Luo S, Tang M, Frandsen PB, Stewart RJ, Zhou X (December 2018). "The genome of an underwater architect, the caddisfly Stenopsyche tienmushanensis Hwang (Insecta: Trichoptera)". GigaScience. 7 (12). doi:10.1093/gigascience/giy143. PMC  6302954. PMID  30476205.
  321. ^ Jørgensen TS, Petersen B, Petersen HC, Browne PD, Prost S, Stillman JH, et al. (Květen 2019). "The Genome and mRNA Transcriptome of the Cosmopolitan Calanoid Copepod Acartia tonsa Dana Improve the Understanding of Copepod Genome Size Evolution". Biologie genomu a evoluce. 11 (5): 1440–1450. doi:10.1093/gbe/evz067. PMC  6526698. PMID  30918947.
  322. ^ "The Daphnia Genomics Consortium". Archivovány od originál dne 09.01.2010. Citováno 2012-05-23.
  323. ^ "Daphnia pulex v1.0". Společný institut pro genom DOE. Citováno 2009-11-29.
  324. ^ Colbourne JK, Pfrender ME, Gilbert D, Thomas WK, Tucker A, Oakley TH, et al. (Únor 2011). "The ecoresponsive genome of Daphnia pulex". Věda. 331 (6017): 555–61. Bibcode:2011Sci...331..555C. doi:10.1126/science.1197761. PMC  3529199. PMID  21292972.
  325. ^ Baldwin-Brown JG, Weeks SC, Long AD (January 2018). "A New Standard for Crustacean Genomes: The Highly Contiguous, Annotated Genome Assembly of the Clam Shrimp Eulimnadia texana Reveals HOX Gene Order and Identifies the Sex Chromosome". Biologie genomu a evoluce. 10 (1): 143–156. doi:10.1093/gbe/evx280. PMC  5765565. PMID  29294012.
  326. ^ Kenny NJ, Sin YW, Shen X, Zhe Q, Wang W, Chan TF, et al. (Březen 2014). "Genomic sequence and experimental tractability of a new decapod shrimp model, Neocaridina denticulata". Marine Drugs. 12 (3): 1419–37. doi:10.3390/md12031419. PMC  3967219. PMID  24619275.
  327. ^ Kao D, Lai AG, Stamataki E, Rosic S, Konstantinides N, Jarvis E, et al. (Listopad 2016). "Parhyale hawaiensis, a model for animal development, regeneration, immunity and lignocellulose digestion". eLife. 5: e20062. doi:10.7554/eLife.20062. PMC  5111886. PMID  27849518.
  328. ^ Tang B, Zhang D, Li H, Jiang S, Zhang H, Xuan F, et al. (Leden 2020). „Shromáždění genomu na úrovni chromozomu odhaluje jedinečnou evoluci genomu plaveckého kraba (Portunus trituberculatus)“. GigaScience. 9 (1). doi:10.1093 / gigascience / giz161. PMC  6944217. PMID  31904811.
  329. ^ Gutekunst J, Andriantsoa R, Falckenhayn C, Hanna K, Stein W, Rasamy J, Lyko F (March 2018). "Clonal genome evolution and rapid invasive spread of the marbled crayfish". Ekologie a evoluce přírody. 2 (3): 567–573. doi:10.1038/s41559-018-0467-9. PMID  29403072. S2CID  3354026.
  330. ^ Kang S, Ahn DH, Lee JH, Lee SG, Shin SC, Lee J, et al. (Leden 2017). "The genome of the Antarctic-endemic copepod, Tigriopus kingsejongensis". GigaScience. 6 (1): 1–9. doi:10.1093/gigascience/giw010. PMC  5467011. PMID  28369352.
  331. ^ Nossa CW, Havlak P, Yue JX, Lv J, Vincent KY, Brockmann HJ, et al. (2014). "Joint assembly and genetic mapping of the Atlantic horseshoe crab genome reveals ancient whole genome duplication". GigaScience. 3: 9. doi:10.1186/2047-217X-3-9. PMC  4066314. PMID  24987520.
  332. ^ Shingate P, Ravi V, Prasad A, Tay BH, Garg KM, Chattopadhyay B, et al. (2020). "Chromosome-level assembly of the horseshoe crab genome provides insights into its genome evolution". Příroda komunikace. 11 (1): 2322. Bibcode:2020NatCo..11.2322S. doi:10.1038/s41467-020-16180-1. PMC  7210998. PMID  32385269.
  333. ^ A b Sanggaard KW, Bechsgaard JS, Fang X, Duan J, Dyrlund TF, Gupta V, et al. (Květen 2014). "Spider genomes provide insight into composition and evolution of venom and silk". Příroda komunikace. 5: 3765. Bibcode:2014NatCo...5.3765S. doi:10.1038/ncomms4765. PMC  4273655. PMID  24801114.
  334. ^ Sánchez-Herrero JF, Frías-López C, Escuer P, Hinojosa-Alvarez S, Arnedo MA, Sánchez-Gracia A, Rozas J (August 2019). "The draft genome sequence of the spider Dysdera silvatica (Araneae, Dysderidae): A valuable resource for functional and evolutionary genomic studies in chelicerates". GigaScience. 8 (8). doi:10.1093/gigascience/giz099. PMC  6701490. PMID  31430368.
  335. ^ Gulia-Nuss M, Nuss AB, Meyer JM, Sonenshine DE, Roe RM, Waterhouse RM, et al. (Únor 2016). "Genomic insights into the Ixodes scapularis tick vector of Lyme disease". Příroda komunikace. 7: 10507. Bibcode:2016NatCo...710507G. doi:10.1038/ncomms10507. PMC  4748124. PMID  26856261.
  336. ^ Cao Z, Yu Y, Wu Y, Hao P, Di Z, He Y, et al. (2013). "The genome of Mesobuthus martensii reveals a unique adaptation model of arthropods". Příroda komunikace. 4: 2602. Bibcode:2013NatCo...4.2602C. doi:10.1038/ncomms3602. PMC  3826648. PMID  24129506.
  337. ^ Babb PL, Lahens NF, Correa-Garhwal SM, Nicholson DN, Kim EJ, Hogenesch JB, et al. (Květen 2017). "The Nephila clavipes genome highlights the diversity of spider silk genes and their complex expression". Genetika přírody. 49 (6): 895–903. doi:10.1038/ng.3852. PMID  28459453. S2CID  1221097.
  338. ^ Schwager EE, Sharma PP, Clarke T, Leite DJ, Wierschin T, Pechmann M, et al. (Červenec 2017). "The house spider genome reveals an ancient whole-genome duplication during arachnid evolution". Biologie BMC. 15 (1): 62. doi:10.1186/s12915-017-0399-x. PMC  5535294. PMID  28756775.
  339. ^ Grbić M, Van Leeuwen T, Clark RM, Rombauts S, Rouzé P, Grbić V, et al. (Listopad 2011). "The genome of Tetranychus urticae reveals herbivorous pest adaptations". Příroda. 479 (7374): 487–92. Bibcode:2011Natur.479..487G. doi:10.1038/nature10640. PMC  4856440. PMID  22113690.
  340. ^ Dong X, Armstrong SD, Xia D, Makepeace BL, Darby AC, Kadowaki T (1 March 2017). "Draft genome of the honey bee ectoparasitic mite, Tropilaelaps mercedesae, is shaped by the parasitic life history". Gigascience. 6 (3): 1–17. doi:10.1093/gigascience/gix008. PMC  5467014. PMID  28327890.
  341. ^ Chipman AD, Ferrier DE, Brena C, Qu J, Hughes DS, Schröder R, et al. (Listopad 2014). "The first myriapod genome sequence reveals conservative arthropod gene content and genome organisation in the centipede Strigamia maritima". PLOS Biology. 12 (11): e1002005. doi:10.1371/journal.pbio.1002005. PMC  4244043. PMID  25423365.
  342. ^ Boothby TC, Tenlen JR, Smith FW, Wang JR, Patanella KA, Nishimura EO, et al. (Prosinec 2015). "Evidence for extensive horizontal gene transfer from the draft genome of a tardigrade". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 112 (52): 15976–81. Bibcode:2015PNAS..11215976B. doi:10.1073/pnas.1510461112. PMC  4702960. PMID  26598659.
  343. ^ Koutsovoulos G, Kumar S, Laetsch DR, Stevens L, Daub J, Conlon C, Maroon H, Thomas F, Aboobaker A, Blaxter M (2015). "The genome of the tardigrade Hypsibius dujardini". bioRxiv  10.1101/033464.
  344. ^ Guo Y, Zhang Y, Liu Q, Huang Y, Mao G, Yue Z, et al. (Říjen 2019). "A chromosomal-level genome assembly for the giant African snail Achatina fulica". GigaScience. 8 (10). doi:10.1093/gigascience/giz124. PMC  6802634. PMID  31634388.
  345. ^ Brejova B, Albertin CB, Silva F, Gardner P, Baril T, Hayward A, et al. (2020-01-01). "A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux". GigaScience. 9 (1). doi:10.1093/gigascience/giz152. PMC  6962438. PMID  31942620.
  346. ^ Li C, Liu X, Liu B, Ma B, Liu F, Liu G, et al. (Duben 2018). "Draft genome of the Peruvian scallop Argopecten purpuratus". GigaScience. 7 (4). doi:10.1093/gigascience/giy031. PMC  5905365. PMID  29617765.
  347. ^ A b Sun J, Zhang Y, Xu T, Zhang Y, Mu H, Zhang Y, et al. (Duben 2017). "Adaptation to deep-sea chemosynthetic environments as revealed by mussel genomes". Ekologie a evoluce přírody. 1 (5): 121. doi:10.1038/s41559-017-0121. PMID  28812709. S2CID  26405671.
  348. ^ Adema CM, Hillier LW, Jones CS, Loker ES, Knight M, Minx P, et al. (Květen 2017). "Whole genome analysis of a schistosomiasis-transmitting freshwater snail". Příroda komunikace. 8: 15451. Bibcode:2017NatCo...815451A. doi:10.1038/ncomms15451. PMC  5440852. PMID  28508897.
  349. ^ Li Y, Sun X, Hu X, Xun X, Zhang J, Guo X, et al. (Listopad 2017). "Scallop genome reveals molecular adaptations to semi-sessile life and neurotoxins". Příroda komunikace. 8 (1): 1721. Bibcode:2017NatCo...8.1721L. doi:10.1038/s41467-017-01927-0. PMC  5700196. PMID  29167427.
  350. ^ Zhang G, Fang X, Guo X, Li L, Luo R, Xu F, et al. (Říjen 2012). "The oyster genome reveals stress adaptation and complexity of shell formation". Příroda. 490 (7418): 49–54. Bibcode:2012Natur.490...49Z. doi:10.1038/nature11413. hdl:10722/251007. PMID  22992520. S2CID  52853995.
  351. ^ Calcino AD, Luiz de Oliveira A, Simakov O, Schwaha T, Zieger E, Wollesen T, et al. (Říjen 2019). "The quagga mussel genome and the evolution of freshwater tolerance". Výzkum DNA. 26 (5): 411–422. doi:10.1093/dnares/dsz019. PMC  6796509. PMID  31504356.
  352. ^ Belcaid M, Casaburi G, McAnulty SJ, Schmidbaur H, Suria AM, Moriano-Gutierrez S, et al. (Únor 2019). "Symbiotic organs shaped by distinct modes of genome evolution in cephalopods". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 116 (8): 3030–3035. doi:10.1073/pnas.1817322116. PMC  6386654. PMID  30635418.
  353. ^ Cai H, Li Q, Fang X, Li J, Curtis NE, Altenburger A, et al. (Únor 2019). "A draft genome assembly of the solar-powered sea slug Elysia chlorotica". Vědecké údaje. 6: 190022. Bibcode:2019NatSD...690022C. doi:10.1038/sdata.2019.22. PMC  6380222. PMID  30778257.
  354. ^ Nam BH, Kwak W, Kim YO, Kim DG, Kong HJ, Kim WJ, et al. (Květen 2017). "Genome sequence of pacific abalone (Haliotis discus hannai): the first draft genome in family Haliotidae". GigaScience. 6 (5): 1–8. doi:10.1093/gigascience/gix014. PMC  5439488. PMID  28327967.
  355. ^ Whitelaw, Brooke L; Cooke, Ira R; Finn, Julian; da Fonseca, Rute R; Ritschard, Elena A; Gilbert, M T P; Simakov, Oleg; Strugnell, Jan M (November 2020). "Adaptive venom evolution and toxicity in octopods is driven by extensive novel gene formation, expansion, and loss". GigaScience. 9 (11). doi:10.1093/gigascience/giaa120. ISSN  2047-217X. PMC  7656900. PMID  33175168.
  356. ^ A b C Simakov O, Marletaz F, Cho SJ, Edsinger-Gonzales E, Havlak P, Hellsten U, et al. (Leden 2013). "Insights into bilaterian evolution from three spiralian genomes". Příroda. 493 (7433): 526–31. Bibcode:2013Natur.493..526S. doi:10.1038/nature11696. PMC  4085046. PMID  23254933.
  357. ^ Uliano-Silva M, Dondero F, Dan Otto T, Costa I, Lima NC, Americo JA, et al. (Únor 2018). "A hybrid-hierarchical genome assembly strategy to sequence the invasive golden mussel, Limnoperna fortunei". GigaScience. 7 (2). doi:10.1093/gigascience/gix128. PMC  5836269. PMID  29267857.
  358. ^ Murgarella M, Puiu D, Novoa B, Figueras A, Posada D, Canchaya C (2016-03-15). "A First Insight into the Genome of the Filter-Feeder Mussel Mytilus galloprovincialis". PLOS ONE. 11 (3): e0151561. Bibcode:2016PLoSO..1151561M. doi:10.1371/journal.pone.0151561. PMC  4792442. PMID  26977809.
  359. ^ Albertin CB, Simakov O, Mitros T, Wang ZY, Pungor JR, Edsinger-Gonzales E, et al. (August 2015). "The octopus genome and the evolution of cephalopod neural and morphological novelties". Příroda. 524 (7564): 220–4. Bibcode:2015Natur.524..220A. doi:10.1038/nature14668. PMC  4795812. PMID  26268193.
  360. ^ Kim BM, Kang S, Ahn DH, Jung SH, Rhee H, Yoo JS, et al. (Listopad 2018). "The genome of common long-arm octopus Octopus minor". GigaScience. 7 (11). doi:10.1093/gigascience/giy119. PMC  6279123. PMID  30256935.
  361. ^ Zarrella I, Herten K, Maes GE, Tai S, Yang M, Seuntjens E, et al. (Duben 2019). "The survey and reference assisted assembly of the Octopus vulgaris genome". Vědecké údaje. 6 (1): 13. Bibcode:2019NatSD...6...13Z. doi:10.1038/s41597-019-0017-6. PMC  6472339. PMID  30931949.
  362. ^ Wang S, Zhang J, Jiao W, Li J, Xun X, Sun Y, et al. (Duben 2017). "Scallop genome provides insights into evolution of bilaterian karyotype and development". Ekologie a evoluce přírody. 1 (5): 120. doi:10.1038/s41559-017-0120. PMID  28812685. S2CID  10331741.
  363. ^ Kenny NJ, McCarthy SA, Dudchenko O, James K, Betteridge E, Corton C, et al. (May 2020). "The gene-rich genome of the scallop Pecten maximus". GigaScience. 9 (5). doi:10.1093/gigascience/giaa037. PMC  7191990. PMID  32352532.
  364. ^ Takeuchi T, Kawashima T, Koyanagi R, Gyoja F, Tanaka M, Ikuta T, et al. (Duben 2012). "Draft genome of the pearl oyster Pinctada fucata: a platform for understanding bivalve biology". Výzkum DNA. 19 (2): 117–30. doi:10.1093/dnares/dss005. PMC  3325083. PMID  22315334.
  365. ^ Liu C, Zhang Y, Ren Y, Wang H, Li S, Jiang F, et al. (Září 2018). "The genome of the golden apple snail Pomacea canaliculata provides insight into stress tolerance and invasive adaptation". GigaScience. 7 (9). doi:10.1093/gigascience/giy101. PMC  6129957. PMID  30107526.
  366. ^ Mun S, Kim YJ, Markkandan K, Shin W, Oh S, Woo J, et al. (Červen 2017). "The Whole-Genome and Transcriptome of the Manila Clam (Ruditapes philippinarum)". Biologie genomu a evoluce. 9 (6): 1487–1498. doi:10.1093/gbe/evx096. PMC  5499747. PMID  28505302.
  367. ^ Powell D, Subramanian S, Suwansa-Ard S, Zhao M, O'Connor W, Raftos D, Elizur A (December 2018). "The genome of the oyster Saccostrea offers insight into the environmental resilience of bivalves". Výzkum DNA. 25 (6): 655–665. doi:10.1093/dnares/dsy032. PMC  6289776. PMID  30295708.
  368. ^ Bai CM, Xin LS, Rosani U, Wu B, Wang QC, Duan XK, et al. (Červenec 2019). "Chromosomal-level assembly of the blood clam, Scapharca (Anadara) broughtonii, using long sequence reads and Hi-C". GigaScience. 8 (7). doi:10.1093/gigascience/giz067. PMC  6615981. PMID  31289832.
  369. ^ Renaut S, Guerra D, Hoeh WR, Stewart DT, Bogan AE, Ghiselli F, et al. (Červenec 2018). "Genome Survey of the Freshwater Mussel Venustaconcha ellipsiformis (Bivalvia: Unionida) Using a Hybrid De Novo Assembly Approach". Biologie genomu a evoluce. 10 (7): 1637–1646. doi:10.1093/gbe/evy117. PMC  6054159. PMID  29878181.
  370. ^ Wang X, Chen W, Huang Y, Sun J, Men J, Liu H, et al. (Říjen 2011). "The draft genome of the carcinogenic human liver fluke Clonorchis sinensis". Genome Biology. 12 (10): R107. doi:10.1186/gb-2011-12-10-r107. PMC  3333777. PMID  22023798.
  371. ^ A b C d Tsai IJ, Zarowiecki M, Holroyd N, Garciarrubio A, Sánchez-Flores A, Brooks KL, et al. (Duben 2013). "The genomes of four tapeworm species reveal adaptations to parasitism". Příroda. 496 (7443): 57–63. Bibcode:2013Natur.496...57.. doi:10.1038/nature12031. PMC  3964345. PMID  23485966.
  372. ^ Zheng H, Zhang W, Zhang L, Zhang Z, Li J, Lu G, et al. (Říjen 2013). "The genome of the hydatid tapeworm Echinococcus granulosus". Genetika přírody. 45 (10): 1168–75. doi:10.1038/ng.2757. PMID  24013640. S2CID  205347630.
  373. ^ Young ND, Jex AR, Li B, Liu S, Yang L, Xiong Z, et al. (Leden 2012). "Whole-genome sequence of Schistosoma haematobium". Genetika přírody. 44 (2): 221–5. doi:10.1038/ng.1065. hdl:10072/45821. PMID  22246508. S2CID  13309839.
  374. ^ A b Stroehlein AJ, Korhonen PK, Chong TM, Lim YL, Chan KG, Webster B, et al. (Září 2019). "High-quality Schistosoma haematobium genome achieved by single-molecule and long-range sequencing". GigaScience. 8 (9). doi:10.1093/gigascience/giz108. PMC  6736295. PMID  31494670.
  375. ^ The Schistosoma japonicum Genome Sequencing and Functional Analysis Consortium (July 2009). "The Schistosoma japonicum genome reveals features of host-parasite interplay". Příroda. 460 (7253): 345–51. Bibcode:2009Natur.460..345Z. doi:10.1038/nature08140. PMC  3747554. PMID  19606140.
  376. ^ Berriman M, Haas BJ, LoVerde PT, Wilson RA, Dillon GP, Cerqueira GC, et al. (Červenec 2009). "The genome of the blood fluke Schistosoma mansoni". Příroda. 460 (7253): 352–8. Bibcode:2009Natur.460..352B. doi:10.1038/nature08160. PMC  2756445. PMID  19606141.
  377. ^ Protasio AV, Tsai IJ, Babbage A, Nichol S, Hunt M, Aslett MA, et al. (Leden 2012). "A systematically improved high quality genome and transcriptome of the human blood fluke Schistosoma mansoni". PLOS opomíjené tropické nemoci. 6 (1): e1455. doi:10.1371/journal.pntd.0001455. PMC  3254664. PMID  22253936.
  378. ^ "Projekt". Archivovány od originál dne 08.03.2012. Citováno 2012-05-23.
  379. ^ "SmedGD".
  380. ^ Schwarz EM, Hu Y, Antoshechkin I, Miller MM, Sternberg PW, Aroian RV (April 2015). "The genome and transcriptome of the zoonotic hookworm Ancylostoma ceylanicum identify infection-specific gene families". Genetika přírody. 47 (4): 416–22. doi:10.1038/ng.3237. PMC  4617383. PMID  25730766.
  381. ^ Jex AR, Liu S, Li B, Young ND, Hall RS, Li Y, et al. (Říjen 2011). "Ascaris suum draft genome". Příroda. 479 (7374): 529–33. Bibcode:2011Natur.479..529J. doi:10.1038/nature10553. PMID  22031327. S2CID  205226683.
  382. ^ Ghedin E, Wang S, Spiro D, Caler E, Zhao Q, Crabtree J, et al. (Září 2007). "Draft genome of the filarial nematode parasite Brugia malayi". Věda. 317 (5845): 1756–60. Bibcode:2007Sci ... 317.1756G. doi:10.1126 / science.1145406. PMC  2613796. PMID  17885136.
  383. ^ Kikuchi T, Cotton JA, Dalzell JJ, Hasegawa K, Kanzaki N, McVeigh P, et al. (Září 2011). "Genomic insights into the origin of parasitism in the emerging plant pathogen Bursaphelenchus xylophilus". PLOS patogeny. 7 (9): e1002219. doi:10.1371/journal.ppat.1002219. PMC  3164644. PMID  21909270.
  384. ^ Mortazavi A, Schwarz EM, Williams B, Schaeffer L, Antoshechkin I, Wold BJ, et al. (Prosinec 2010). "Scaffolding a Caenorhabditis nematode genome with RNA-seq". Výzkum genomu. 20 (12): 1740–7. doi:10.1101/gr.111021.110. PMC  2990000. PMID  20980554.
  385. ^ "GSC: Caenorhabditis n. sp. PB2801". Archivovány od originál dne 18. srpna 2007. Citováno 28. dubna 2007.
  386. ^ "Wormbase". Citováno 4. září 2015.
  387. ^ Stein LD, Bao Z, Blasiar D, Blumenthal T, Brent MR, Chen N, et al. (Listopad 2003). "The genome sequence of Caenorhabditis briggsae: a platform for comparative genomics". PLOS Biology. 1 (2): E45. doi:10.1371/journal.pbio.0000045. PMC  261899. PMID  14624247.
  388. ^ C. elegans Sequencing Consortium. (Prosinec 1998). „Sekvence genomu hlístice C. elegans: platforma pro zkoumání biologie“. Věda. 282 (5396): 2012–8. Bibcode:1998Sci...282.2012.. doi:10.1126 / science.282.5396.2012. PMID  9851916.
  389. ^ "GSC: Caenorhabditis remanei". Archivovány od originál dne 13. března 2007. Citováno 28. dubna 2007.
  390. ^ Haag ES, Chamberlin H, Coghlan A, Fitch DH, Peters AD, Schulenburg H (March 2007). "Caenorhabditis evolution: if they all look alike, you aren't looking hard enough" (PDF). Trendy v genetice. 23 (3): 101–4. doi:10.1016/j.tig.2007.01.002. PMID  17275130.
  391. ^ Godel C, Kumar S, Koutsovoulos G, Ludin P, Nilsson D, Comandatore F, et al. (Listopad 2012). "The genome of the heartworm, Dirofilaria immitis, reveals drug and vaccine targets". FASEB Journal. 26 (11): 4650–61. doi:10.1096/fj.12-205096. PMC  3475251. PMID  22889830.
  392. ^ Cotton JA, Lilley CJ, Jones LM, Kikuchi T, Reid AJ, Thorpe P, et al. (Březen 2014). "The genome and life-stage specific transcriptomes of Globodera pallida elucidate key aspects of plant parasitism by a cyst nematode". Genome Biology. 15 (3): R43. doi:10.1186/gb-2014-15-3-r43. PMC  4054857. PMID  24580726.
  393. ^ Laing R, Kikuchi T, Martinelli A, Tsai IJ, Beech RN, Redman E, et al. (Srpen 2013). "The genome and transcriptome of Haemonchus contortus, a key model parasite for drug and vaccine discovery". Genome Biology. 14 (8): R88. doi:10.1186/gb-2013-14-8-r88. PMC  4054779. PMID  23985316.
  394. ^ Masonbrink R, Maier TR, Muppirala U, Seetharam AS, Lord E, Juvale PS, et al. (9 February 2019). "The genome of the soybean cyst nematode (Heterodera glyciny) reveals complex patterns of duplications involved in the evolution of parasitism genes". BMC Genomics. 20 (1): 119. doi:10.1186/s12864-019-5485-8. PMC  6367775. PMID  30732586.
  395. ^ Bai X, Adams BJ, Ciche TA, Clifton S, Gaugler R, Kim KS, et al. (18 July 2013). "A lover and a fighter: the genome sequence of an entomopathogenic nematode Heterorhabditis bacteriophora". PLOS ONE. 8 (7): e69618. Bibcode:2013PLoSO...869618B. doi:10.1371/journal.pone.0069618. PMC  3715494. PMID  23874975.
  396. ^ Desjardins CA, Cerqueira GC, Goldberg JM, Dunning Hotopp JC, Haas BJ, Zucker J, et al. (Květen 2013). "Genomics of Loa loa, a Wolbachia-free filarial parasite of humans". Genetika přírody. 45 (5): 495–500. doi:10.1038/ng.2585. PMC  4238225. PMID  23525074.
  397. ^ Opperman CH, Bird DM, Williamson VM, Rokhsar DS, Burke M, Cohn J, et al. (Září 2008). "Sequence and genetic map of Meloidogyne hapla: A compact nematode genome for plant parasitism". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 105 (39): 14802–7. Bibcode:2008PNAS..10514802O. doi:10.1073/pnas.0805946105. PMC  2547418. PMID  18809916.
  398. ^ Abad P, Gouzy J, Aury JM, Castagnone-Sereno P, Danchin EG, Deleury E, et al. (Srpen 2008). "Genome sequence of the metazoan plant-parasitic nematode Meloidogyne incognita". Přírodní biotechnologie. 26 (8): 909–15. doi:10.1038/nbt.1482. PMID  18660804. S2CID  8836601.
  399. ^ Tang YT, Gao X, Rosa BA, Abubucker S, Hallsworth-Pepin K, Martin J, et al. (Březen 2014). "Genome of the human hookworm Necator americanus". Genetika přírody. 46 (3): 261–269. doi:10.1038/ng.2875. PMC  3978129. PMID  24441737.
  400. ^ A b "Filarial worms Database". 2015-06-04. Citováno 5. června 2015.
  401. ^ Dieterich C, Clifton SW, Schuster LN, Chinwalla A, Delehaunty K, Dinkelacker I, et al. (Říjen 2008). "The Pristionchus pacificus genome provides a unique perspective on nematode lifestyle and parasitism". Genetika přírody. 40 (10): 1193–8. doi:10.1038/ng.227. PMC  3816844. PMID  18806794.
  402. ^ Schiffer PH, Kroiher M, Kraus C, Koutsovoulos GD, Kumar S, Camps JI, et al. (Prosinec 2013). "The genome of Romanomermis culicivorax: revealing fundamental changes in the core developmental genetic toolkit in Nematoda". BMC Genomics. 14 (1): 923. doi:10.1186/1471-2164-14-923. PMC  3890508. PMID  24373391.
  403. ^ Jex AR, Nejsum P, Schwarz EM, Hu L, Young ND, Hall RS, et al. (Červenec 2014). "Genome and transcriptome of the porcine whipworm Trichuris suis". Genetika přírody. 46 (7): 701–6. doi:10.1038/ng.3012. PMC  4105696. PMID  24929829.
  404. ^ A b Foth BJ, Tsai IJ, Reid AJ, Bancroft AJ, Nichol S, Tracey A, et al. (Červenec 2014). "Whipworm genome and dual-species transcriptome analyses provide molecular insights into an intimate host-parasite interaction". Genetika přírody. 46 (7): 693–700. doi:10.1038/ng.3010. PMC  5012510. PMID  24929830.
  405. ^ "JGI: Capitella teleta".
  406. ^ "JGI: Helobdella robusta".
  407. ^ "WhitneyLab: Eisenia fetida".
  408. ^ Zwarycz AS, Nossa CW, Putnam NH, Ryan JF (December 2015). "Timing and Scope of Genomic Expansion within Annelida: Evidence from Homeoboxes in the Genome of the Earthworm Eisenia fetida". Biologie genomu a evoluce. 8 (1): 271–81. doi:10.1093/gbe/evv243. PMC  4758240. PMID  26659921.
  409. ^ Luo YJ, Takeuchi T, Koyanagi R, Yamada L, Kanda M, Khalturina M, et al. (Září 2015). "The Lingula genome provides insights into brachiopod evolution and the origin of phosphate biomineralization". Příroda komunikace. 6: 8301. Bibcode:2015NatCo...6.8301L. doi:10.1038/ncomms9301. PMC  4595640. PMID  26383154.
  410. ^ Flot JF, Hespeels B, Li X, Noel B, Arkhipova I, Danchin EG, et al. (Srpen 2013). "Genomic evidence for ameiotic evolution in the bdelloid rotifer Adineta vaga". Příroda. 500 (7463): 453–7. Bibcode:2013Natur.500..453F. doi:10.1038/nature12326. PMID  23873043. S2CID  1706158.