DDX20 - DDX20

DDX20
Dostupné struktury PDB Hledání ortologu: PDBe RCSB Seznam id kódů PDB 2OXC, 3B7G
Identifikátory
Aliasy	DDX20, DP103, GEMIN3, DEAD-box helicase 20
Externí ID	OMIM: 606168 MGI: 1858415 HomoloGene: 5214 Genové karty: DDX20
Umístění genu (člověk) Chr. Chromozom 1 (lidský)[1] Kapela 1p13.2 Start 111,755,245 bp[1] Konec 111,768,000 bp[1]
Umístění genu (myš) Chr. Chromozom 3 (myš)[2] Kapela 3 | 3 F2.2 Start 105,678,270 bp[2] Konec 105,687,574 bp[2]
Exprese RNA vzor Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie Molekulární funkce • Vazba DNA • vazba na bílkoviny, přemostění • vazba nukleotidů • GO: Aktivita helikázy 0008026 • specifické vazby na proteinovou doménu • vazba histon-deacetylázy • GO: 0001948 vazba na proteiny • vazba nukleové kyseliny • potlačující vazbu transkripčního faktoru • aktivita hydrolázy • ATP vazba Buněčná složka • SMN-Sm proteinový komplex • cytosol • membrána • transkripční represorový komplex • nukleoplazma • Komplex SMN • Kompresor transkripce represoru RNA polymerázy II • cytoskelet • buněčné jádro • Blíženci svinutých těl • cytoplazma • jaderné těleso • jádro Biologický proces • Zpracování RNA • sestava spliceosomálního tri-snRNP komplexu • Zpracování mRNA • regulace procesu biosyntézy steroidů • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • oogeneze • sestava spliceosomal snRNP • Odvíjení sekundární struktury RNA • Sestřih RNA • pozitivní regulace apoptotického procesu • negativní regulace transkripce, chráněná DNA • negativní regulace buněčné proliferace • jaderný dovoz Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
Druh	Člověk	Myš
Entrez	11218	53975
Ensembl	ENSG00000064703	ENSMUSG00000027905
UniProt	Q9UHI6	Q9JJY4
RefSeq (mRNA)	NM_007204	NM_017397
RefSeq (protein)	NP_009135	NP_059093
Místo (UCSC)	Chr 1: 111,76 - 111,77 Mb	Chr 3: 105,68 - 105,69 Mb
PubMed Vyhledávání	[3]	[4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověka Zobrazit / upravit myš

Pravděpodobná ATP závislá RNA helikáza DDX20, také známý jako DEAD-box helicase 20 a protein spojený s drahokamy 3 (GEMIN3), je enzym že u lidí je kódován DDX20 gen.^[5][6]

Funkce

DEAD box proteiny, charakterizované konzervovaným motivem Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), jsou domnělé RNA helikázy. Jsou zapojeny do řady buněčných procesů zahrnujících změnu sekundární struktury RNA, jako je iniciace translace, nukleární a mitochondriální sestřih a ribozom a spliceosome shromáždění. Na základě jejich distribučních vzorců se někteří členové této rodiny považují za členy embryogeneze, spermatogeneze a buněčný růst a dělení. Tento gen kóduje DEAD box protein, který má ATPáza činnost a je součástí přežití motorického neuronu (SMN) komplex.^[6] SMN je produkt genu spinální svalové atrofie a může hrát katalytickou roli ve funkci komplexu SMN na RNP.^[6]

Biologické důsledky

Předchozí výzkum ukázal, že DDX20 může působit jako supresor nádoru hepatocelulární karcinom a jako nádor promotér v rakovina prsu. Nedostatek DDX20 se zvyšuje NF-kB aktivitu snížením NF-κB-supresivního působení mikroRNA, a naznačují, že dysregulace složek mikroRNA mechanismu může být také zapojena do patogeneze u různých lidských onemocnění.^[7] Jako je miRNA-140, která působí jako supresor jaterních nádorů, a kvůli nedostatku DDX20 dochází k narušení funkce miRNA-140, toto následné funkční poškození miRNA by mohlo vést k hepatokarcinogenezi. Podobně,^[8] DDX20 může podporovat postup Rakovina prostaty (PCa) cestou NF-κB.^[9] V klinicky založené studii bylo pozorováno, že pozitivní zpětnovazební smyčka DP103 / NF-kB podporuje konstitutivní aktivaci NF-kB při invazivních rakovinách prsu a aktivace této cesty je spojena s progresí rakoviny a získáváním chemoterapie odpor. Díky tomu má DP103 potenciál jako terapeutický cíl pro léčbu rakoviny prsu.^[10]

Interakce

DDX20 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

Další čtení