Proteiny spojené s drahokamy 2 - Gem-associated protein 2

GEMIN2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2LEH, 3S6N
Identifikátory
Aliasy	GEMIN2, SIP1, SIP1-delta, Přežití proteinu 1 interagujícího s motorickými neurony, protein 2 spojený s drahokamovými organelami
Externí ID	OMIM: 602595 MGI: 1913853 HomoloGene: 37827 Genové karty: GEMIN2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	39,136,973 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	59,028,470 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• Komplex SMN; • SMN-Sm proteinový komplex; • cytosol; • spliceosomální komplex; • jádro; • intracelulární; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytoplazma; • jaderné těleso; • Blíženci svinutých těl;
Biologický proces	• Sestřih RNA prostřednictvím transesterifikačních reakcí; • Zpracování mRNA; • sestava spliceozomálního komplexu; • Sestřih RNA; • sestava spliceosomal snRNP; • jaderný dovoz;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8487
	66603
	ENSG00000092208
	ENSMUSG00000060121
	O14893
	Q9CQQ4
	NM_001009182; NM_001009183; NM_003616
	NM_025656
	NP_001009182; NP_001009183; NP_003607
	NP_079932
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteiny spojené s drahokamy 2 (GEMIN2), také zvaný přežití proteinu interagujícího s motorickými neurony 1 (SIP1), je protein že u lidí je kódován GEMIN2 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

Ukázalo se, že protein 2 spojený s drahokamy komunikovat s DDX20^[8]^[9] a SMN1.^[6]^[10]^[11]

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000092208 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000060121 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fischer U, Liu Q, Dreyfuss G (říjen 1997). „Komplex SMN-SIP1 má zásadní roli v biogenezi spliceozomálních snRNP“. Buňka. 90 (6): 1023–9. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80368-2. PMID 9323130.
^ ^A ^b Liu Q, Fischer U, Wang F, Dreyfuss G (říjen 1997). „Produkt genu pro spinální muskulární atrofii, SMN, a jeho přidružený protein SIP1 jsou v komplexu s proteiny spliceosomal snRNP.“ Buňka. 90 (6): 1013–21. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80367-0. PMID 9323129.
^ „Entrez Gene: SIP1 přežití proteinu 1 interagujícího s motorickým neuronem.
^ Mourelatos, Zissimos; Dostie Josée; Paushkin Sergey; Sharma Anup; Charroux Bernard; Abel Linda; Rappsilber Juri; Mann Matthias; Dreyfuss Gideon (březen 2002). „miRNP: nová třída ribonukleoproteinů obsahujících četné mikroRNA“. Genes Dev. 16 (6): 720–8. doi:10,1101 / gad.974702. ISSN 0890-9369. PMC 155365. PMID 11914277.
^ Charroux, B; Pellizzoni L; Perkinson RA; Ševčenko A; Mann M; Dreyfuss G (prosinec 1999). „Gemin3: Nový protein mrtvého boxu, který interaguje se Smn, produktem genů spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. ISSN 0021-9525. PMC 2168095. PMID 10601333.
^ Carnegie, Graeme K; Sleeman Judith E; Morrice Nick; Hastie C James; Peggie Mark W; Philp Amanda; Lamond Angus I; Cohen Patricia T W (květen 2003). „Proteinová fosfatáza 4 interaguje s přežitím komplexu motorických neuronů a zvyšuje časovou lokalizaci snRNP“. J. Cell Sci. 116 (Pt 10): 1905–13. doi:10.1242 / jcs.00409. ISSN 0021-9533. PMID 12668731.
^ Meister, G; Bühler D; Laggerbauer B; Zobawa M; Lottspeich F; Fischer U (srpen 2000). „Charakterizace jaderného komplexu 20S obsahujícího přežití proteinu motorických neuronů (SMN) a specifické podskupiny proteinů spliceozomálního Sm“. Hučení. Mol. Genet. 9 (13): 1977–86. doi:10,1093 / hmg / 9,13.1977. ISSN 0964-6906. PMID 10942426.

Další čtení

Wang Z, Wu X, Friedberg EC (1997). "Molekulární mechanismus opravy bazální excize DNA obsahující uracil v extraktech bez kvasinek". J. Biol. Chem. 272 (38): 24064–71. doi:10.1074 / jbc.272.38.24064. PMID 9295360.
Zhang WJ, Wu JY (1998). „Sip1, nový protein s obsahem domény RS, který je nezbytný pro spojování pre-mRNA“. Mol. Buňka. Biol. 18 (2): 676–84. doi:10,1128 / mcb.18.2.676. PMC 108778. PMID 9447963.
Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA a kol. (2000). „Gemin3: Nový protein mrtvého boxu, který interaguje se Smn, produktem genů spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. PMC 2168095. PMID 10601333.
Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA a kol. (2000). „Gemin4: nová součást smn komplexu, který se nachází jak v drahokamech, tak v Nucleoli“. J. Cell Biol. 148 (6): 1177–86. doi:10.1083 / jcb.148.6.1177. PMC 2174312. PMID 10725331.
Helmken C, Wetter A, Rudnik-Schöneborn S, et al. (2000). „Esenciální protein interagující se SMN (SIP1) se nepodílí na fenotypové variabilitě spinální svalové atrofie (SMA).“. Eur. J. Hum. Genet. 8 (7): 493–9. doi:10.1038 / sj.ejhg.5200479. PMID 10909848.
Meister G, Bühler D, Laggerbauer B a kol. (2000). „Charakterizace jaderného komplexu 20S obsahujícího přežití proteinu motorických neuronů (SMN) a specifické podskupiny proteinů spliceozomálního Sm“. Hučení. Mol. Genet. 9 (13): 1977–86. doi:10,1093 / hmg / 9,13.1977. PMID 10942426.
Young PJ, Man NT, Lorson CL a kol. (2001). „Oblast exonu 2b proteinu spinální svalové atrofie, SMN, je zapojena do vlastní asociace a vazby na SIP1“. Hučení. Mol. Genet. 9 (19): 2869–77. doi:10,1093 / hmg / 9,19,2869. PMID 11092763.
Selenko P, Sprangers R, Stier G a kol. (2001). "Struktura domény SMN tudor a její interakce s proteiny Sm". Nat. Struct. Biol. 8 (1): 27–31. doi:10.1038/83014. PMID 11135666.
Pellizzoni L, Charroux B, Rappsilber J a kol. (2001). „Funkční interakce mezi komplexem motorických neuronů pro přežití a RNA polymerázou II“. J. Cell Biol. 152 (1): 75–85. doi:10.1083 / jcb.152.1.75. PMC 2193649. PMID 11149922.
Jablonka S, Bandilla M, Wiese S a kol. (2001). „Koregulace přežití proteinu motorických neuronů (SMN) a jeho interakčních látek SIP1 během vývoje a při spinální svalové atrofii“. Hučení. Mol. Genet. 10 (5): 497–505. doi:10,1093 / hmg / 10,5,497. PMID 11181573.
Friesen WJ, Massenet S, Paushkin S a kol. (2001). „SMN, produkt genu pro spinální svalovou atrofii, se přednostně váže na proteinové cíle obsahující dimethylarginin“. Mol. Buňka. 7 (5): 1111–7. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00244-1. PMID 11389857.
Park JW, Voss PG, Grabski S a kol. (2001). „Sdružení galektinu-1 a galektinu-3 s Gemin4 v komplexech obsahujících protein SMN“. Nucleic Acids Res. 29 (17): 3595–602. doi:10.1093 / nar / 29.17.3595. PMC 55878. PMID 11522829.
Friesen WJ, Paushkin S, Wyce A a kol. (2001). „Methylosom, komplex 20S obsahující JBP1 a pICln, produkuje proteiny Sm dimethylargininem“. Mol. Buňka. Biol. 21 (24): 8289–300. doi:10.1128 / MCB.21.24.8289-8300.2001. PMC 99994. PMID 11713266.
Gubitz AK, Mourelatos Z, Abel L a kol. (2002). „Gemin5, nová složka proteinu WD repetice komplexu SMN, která váže proteiny Sm“. J. Biol. Chem. 277 (7): 5631–6. doi:10,1074 / jbc.M109448200. PMID 11714716.
Pellizzoni L, Baccon J, Rappsilber J a kol. (2002). „Čištění přirozeného přežití komplexů motorických neuronů a identifikace Gemin6 jako nové složky“. J. Biol. Chem. 277 (9): 7540–5. doi:10,1074 / jbc.M110141200. PMID 11748230.
Aerbajinai W, Ishihara T, Arahata K, Tsukahara T (2002). "Zvýšená úroveň exprese sestřihové varianty SIP1 u onemocnění motorických neuronů". Int. J. Biochem. Cell Biol. 34 (6): 699–707. doi:10.1016 / S1357-2725 (01) 00150-9. PMID 11943600.
Baccon J, Pellizzoni L, Rappsilber J a kol. (2002). „Identifikace a charakterizace Gemin7, nové složky přežití komplexu motorických neuronů“. J. Biol. Chem. 277 (35): 31957–62. doi:10,1074 / jbc.M203478200. PMID 12065586.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000092208 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000060121 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9323130-5] Fischer U, Liu Q, Dreyfuss G (říjen 1997). „Komplex SMN-SIP1 má zásadní roli v biogenezi spliceozomálních snRNP“. Buňka. 90 (6): 1023–9. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80368-2. PMID 9323130.

[pmid9323129-6] A ^b Liu Q, Fischer U, Wang F, Dreyfuss G (říjen 1997). „Produkt genu pro spinální muskulární atrofii, SMN, a jeho přidružený protein SIP1 jsou v komplexu s proteiny spliceosomal snRNP.“ Buňka. 90 (6): 1013–21. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80367-0. PMID 9323129.

[entrez-7] „Entrez Gene: SIP1 přežití proteinu 1 interagujícího s motorickým neuronem.

[pmid11914277-8] Mourelatos, Zissimos; Dostie Josée; Paushkin Sergey; Sharma Anup; Charroux Bernard; Abel Linda; Rappsilber Juri; Mann Matthias; Dreyfuss Gideon (březen 2002). „miRNP: nová třída ribonukleoproteinů obsahujících četné mikroRNA“. Genes Dev. 16 (6): 720–8. doi:10,1101 / gad.974702. ISSN 0890-9369. PMC 155365. PMID 11914277.

[pmid10601333-9] Charroux, B; Pellizzoni L; Perkinson RA; Ševčenko A; Mann M; Dreyfuss G (prosinec 1999). „Gemin3: Nový protein mrtvého boxu, který interaguje se Smn, produktem genů spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. ISSN 0021-9525. PMC 2168095. PMID 10601333.

[pmid12668731-10] Carnegie, Graeme K; Sleeman Judith E; Morrice Nick; Hastie C James; Peggie Mark W; Philp Amanda; Lamond Angus I; Cohen Patricia T W (květen 2003). „Proteinová fosfatáza 4 interaguje s přežitím komplexu motorických neuronů a zvyšuje časovou lokalizaci snRNP“. J. Cell Sci. 116 (Pt 10): 1905–13. doi:10.1242 / jcs.00409. ISSN 0021-9533. PMID 12668731.

[pmid10942426-11] Meister, G; Bühler D; Laggerbauer B; Zobawa M; Lottspeich F; Fischer U (srpen 2000). „Charakterizace jaderného komplexu 20S obsahujícího přežití proteinu motorických neuronů (SMN) a specifické podskupiny proteinů spliceozomálního Sm“. Hučení. Mol. Genet. 9 (13): 1977–86. doi:10,1093 / hmg / 9,13.1977. ISSN 0964-6906. PMID 10942426.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]