Coilin - Coilin

CÍVKA
Identifikátory
Aliasy	CÍVKA, Coil, C79982, Cln80, p80, p80-coilin, coilin
Externí ID	OMIM: 600272 MGI: 104842 HomoloGene: 3413 Genové karty: CÍVKA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	56,961,050 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	88,991,613 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • vazba na C-konec proteinu; • Vazba U1 snRNA; • Vazba sn2NA na U2;
Buněčná složka	• Cajal tělo; • jádro; • membrána; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • fibrilární centrum; • jaderné těleso;
Biologický proces	• sestava spliceosomal snRNP;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8161
	12812
	ENSG00000121058
	ENSMUSG00000033983
	P38432
	Q5SU73
	NM_004645
	NM_016706
	NP_004636
	NP_057915
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Coilin je protein že u lidí je kódován CÍVKA gen.^[5]^[6] Coilin dostal své jméno podle stočeného tvaru Cajalská těla ve kterém se nachází. Poprvé byl identifikován pomocí lidského autoimunitního séra.

Funkce

Coilinový protein je jednou z hlavních molekulárních složek Cajalových těl. Cajal těla nejsou vázána na membránu jaderná tělesa různého počtu a složení, které jsou součástí post-transkripční modifikace malých jaderných a malé nukleolární RNA. Kromě své strukturální role působí coilin jako lepidlo pro připojení CB k jádro. The N-konec coilinového proteinu řídí jeho vlastní oligomerizaci, zatímco C-konec ovlivňuje počet jaderných těles shromážděných na buňku. Rozdíl methylace a fosforylace coilinu pravděpodobně ovlivňuje jeho lokalizaci mezi jadernými tělesy a složení a montáž Cajalových těles. Tento gen má pseudogeny na chromozomu 4 a chromozomu 14.^[6]

Ke studiu CB lze coilin kombinovat s GFP (Zelený fluorescenční protein ) za vzniku Coilin-GFP hybridní protein. Hybridní protein lze poté použít k lokalizaci CB pod mikroskopem, obvykle v blízkosti jádra buňky. Mezi další proteiny, které tvoří CB, patří snRNP a nukleolární snoRNP.

Ukázalo se, že coilin komunikovat s ataxin 1,^[7]^[8] nukleolární fosfoprotein p130,^[9] SMN,^[10]^[11] a SNRPB.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000121058 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033983 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Chan EK, Takano S, Andrade LE, Hamel JC, Matera AG (prosinec 1994). "Struktura, exprese a chromozomální lokalizace lidského genu pro p80-coilin". Nucleic Acids Res. 22 (21): 4462–9. doi:10.1093 / nar / 22.21.4462. PMC 308480. PMID 7971277.
^ ^A ^b „Entrez Gene: COIL coilin“.
^ Hong S, Ka S, Kim S, Park Y, Kang S (květen 2003). „p80 coilin, svinutý protein specifický pro tělo, interaguje s ataxinem-1, produktem genu SCA1“. Biochim. Biophys. Acta. 1638 (1): 35–42. doi:10.1016 / s0925-4439 (03) 00038-3. PMID 12757932.
^ Hong S, Lee S, Cho SG, Kang S (červen 2008). „UbcH6 interaguje s ubikvitinuje produkt genu SCA1 ataxin-1“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 371 (2): 256–60. doi:10.1016 / j.bbrc.2008.04.066. PMID 18439907.
^ Isaac C, Yang Y, Meier UT (červenec 1998). „Nopp140 funguje jako molekulární vazba mezi jádrem a stočenými těly“. J. Cell Biol. 142 (2): 319–29. doi:10.1083 / jcb.142.2.319. PMC 2133063. PMID 9679133.
^ Hebert MD, Shpargel KB, Ospina JK, Tucker KE, Matera AG (září 2002). "Methylace Coilin reguluje tvorbu jaderných těles". Dev. Buňka. 3 (3): 329–37. doi:10.1016 / s1534-5807 (02) 00222-8. PMID 12361597.
^ ^A ^b Hebert MD, Szymczyk PW, Shpargel KB, Matera AG (říjen 2001). „Coilin tvoří most mezi Cajalovými těly a SMN, proteinem spinální svalové atrofie“. Genes Dev. 15 (20): 2720–9. doi:10,1101 / gad.908401. PMC 312817. PMID 11641277.

Další čtení

Ogg SC, Lamond AI (14. října 2002). "Cajal těla a coilin - směrem k funkci". J. Cell Biol. 159 (1): 17–21. doi:10.1083 / jcb.200206111. PMC 2173504. PMID 12379800.
Andrade LE, Chan EK, Raska I, Peebles CL, Roos G, Tan EM (1991). „Lidská autoprotilátka proti novému proteinu jaderného spirálového těla: imunologická charakterizace a klonování cDNA p80-coilinu“. J. Exp. Med. 173 (6): 1407–19. doi:10.1084 / jem.173.6.1407. PMC 2190846. PMID 2033369.
Bohmann K, Ferreira JA, Lamond AI (1996). „Mutační analýza p80 coilinu naznačuje funkční interakci mezi stočenými těly a jádrem“. J. Cell Biol. 131 (4): 817–31. doi:10.1083 / jcb.131.4.817. PMC 2200013. PMID 7490287.
Carmo-Fonseca M, Ferreira J, Lamond AI (1993). „Sestavení stočených těles obsahujících snRNP je regulováno v mezifázi a mitóze - důkaz, že stočené těleso je kinetická jaderná struktura“. J. Cell Biol. 120 (4): 841–52. doi:10.1083 / jcb.120.4.841. PMC 2200076. PMID 7679389.
Robertson NG, Khetarpal U, Gutiérrez-Espeleta GA, Bieber FR, Morton CC (1995). „Izolace nových a známých genů z knihovny lidského kochleárního cDNA pomocí subtraktivní hybridizace a diferenciálního screeningu“. Genomika. 23 (1): 42–50. doi:10.1006 / geno.1994.1457. PMID 7829101.
Kusuda J, Tanuma R, Gotoh E, Toyoda A, Hashimoto K (1995). „Přiřazení lidského autoimunitního antigenu, genu p80-coilinu k chromozomu 17q21-q23 a jeho možného pseudogenu k chromozomu 14“. Hučení. Genet. 95 (2): 233–4. doi:10.1007 / BF00209411. PMID 7860074. S2CID 20006429.
Lyon CE, Bohmann K, Sleeman J, Lamond AI (1997). „Inhibice defosforylace proteinů vede k akumulaci sestřihu snRNP a stočených těl v jádře“. Exp. Cell Res. 230 (1): 84–93. doi:10.1006 / excr.1996.3380. PMID 9013710.
Parfenov VN, Davis DS, Pochukalina GN, Kostyuchek D, Murti KG (1998). "Dynamika distribuce sestřihových složek vzhledem k transkripčnímu stavu lidských oocytů z antrálních folikulů". J. Cell. Biochem. 69 (1): 72–80. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19980401) 69: 1 <72 :: AID-JCB8> 3.0.CO; 2-S. PMID 9513048.
Pochukalina GN, Davis DS, Kostiuchek DF, Murti KG, Parfenov VN (1998). "[Faktory sestřihu v jádrech oocytů z lidských antrálních folikulů]". Tsitologiia. 40 (4): 239–47. PMID 9644758.
Isaac C, Yang Y, Meier UT (1998). „Nopp140 funguje jako molekulární vazba mezi jádrem a stočenými těly“. J. Cell Biol. 142 (2): 319–29. doi:10.1083 / jcb.142.2.319. PMC 2133063. PMID 9679133.
Liu J, MD Hebert, Ye Y, Templeton DJ, Kung H, Matera AG (2000). "Lokalizace komplexu CDK2-cyklin E v Cajalových (stočených) tělech závislá na buněčném cyklu". J. Cell Sci. 113 (9): 1543–52. PMID 10751146.
Hebert MD, Matera AG (2001). „Vlastní sdružení coilinu odhaluje společné téma v lokalizaci jaderných těles“. Mol. Biol. Buňka. 11 (12): 4159–71. doi:10,1091 / mbc.11.12.4159. PMC 15064. PMID 11102515.
Young PJ, Le TT, Dunckley M, Nguyen TM, Burghes AH, Morris GE (2001). „Nukleární drahokamy a Cajal (stočená) těla ve tkáních plodu: nukleolární distribuce proteinu spinální svalové atrofie, SMN“. Exp. Cell Res. 265 (2): 252–61. doi:10.1006 / excr.2001.5186. PMID 11302690.
Hebert MD, Szymczyk PW, Shpargel KB, Matera AG (2001). „Coilin tvoří most mezi Cajalovými těly a SMN, proteinem spinální svalové atrofie“. Genes Dev. 15 (20): 2720–9. doi:10,1101 / gad.908401. PMC 312817. PMID 11641277.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Sleeman JE, Ajuh P, Lamond AI (2002). „Exprese proteinu snRNP zvyšuje tvorbu Cajalových těl obsahujících p80-coilin a SMN“. J. Cell Sci. 114 (Pt 24): 4407–19. PMID 11792806.
Hebert MD, Shpargel KB, Ospina JK, Tucker KE, Matera AG (2002). "Methylace Coilin reguluje tvorbu jaderných těles". Dev. Buňka. 3 (3): 329–37. doi:10.1016 / S1534-5807 (02) 00222-8. PMID 12361597.
Shpargel KB, Ospina JK, Tucker KE, Matera AG, Hebert MD (2003). „Kontrola nad Cajalovým číslem těla je zprostředkována C-koncem cívky“. J. Cell Sci. 116 (Pt 2): 303–12. doi:10.1242 / jcs.00211. PMID 12482916.
Sleeman JE, Trinkle-Mulcahy L, Prescott AR, Ogg SC, Lamond AI (2004). „Cajal body protein SMN and Coilin show different dynamic behavior in vivo“. J. Cell Sci. 116 (Pt 10): 2039–50. doi:10,1242 / jcs.00400. PMID 12679382.
Hearst SM, Gilder AS, Negi SS, Davis MD, George EM, Whittom AA, Toyota CG, Husedzinovic A, Gruss OJ, Hebert MD (2009). „Tvorba Cajal-těla koreluje s diferenciální fosforylací coilinu v primárních a transformovaných buněčných liniích“. J. Cell Sci. 122 (Pt 11): 1872–1881. doi:10.1242 / jcs.044040. PMC 2684838. PMID 19435804.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000121058 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033983 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7971277-5] Chan EK, Takano S, Andrade LE, Hamel JC, Matera AG (prosinec 1994). "Struktura, exprese a chromozomální lokalizace lidského genu pro p80-coilin". Nucleic Acids Res. 22 (21): 4462–9. doi:10.1093 / nar / 22.21.4462. PMC 308480. PMID 7971277.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: COIL coilin“.

[pmid12757932-7] Hong S, Ka S, Kim S, Park Y, Kang S (květen 2003). „p80 coilin, svinutý protein specifický pro tělo, interaguje s ataxinem-1, produktem genu SCA1“. Biochim. Biophys. Acta. 1638 (1): 35–42. doi:10.1016 / s0925-4439 (03) 00038-3. PMID 12757932.

[pmid18439907-8] Hong S, Lee S, Cho SG, Kang S (červen 2008). „UbcH6 interaguje s ubikvitinuje produkt genu SCA1 ataxin-1“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 371 (2): 256–60. doi:10.1016 / j.bbrc.2008.04.066. PMID 18439907.

[pmid9679133-9] Isaac C, Yang Y, Meier UT (červenec 1998). „Nopp140 funguje jako molekulární vazba mezi jádrem a stočenými těly“. J. Cell Biol. 142 (2): 319–29. doi:10.1083 / jcb.142.2.319. PMC 2133063. PMID 9679133.

[pmid12361597-10] Hebert MD, Shpargel KB, Ospina JK, Tucker KE, Matera AG (září 2002). "Methylace Coilin reguluje tvorbu jaderných těles". Dev. Buňka. 3 (3): 329–37. doi:10.1016 / s1534-5807 (02) 00222-8. PMID 12361597.

[pmid11641277-11] A ^b Hebert MD, Szymczyk PW, Shpargel KB, Matera AG (říjen 2001). „Coilin tvoří most mezi Cajalovými těly a SMN, proteinem spinální svalové atrofie“. Genes Dev. 15 (20): 2720–9. doi:10,1101 / gad.908401. PMC 312817. PMID 11641277.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]